Protein

Genbank accession
XUL00555.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDDTRAYTKDFIVLYDNRFYQALSDIPAPAGPFSLAKWKATRTDADWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGTDINFTLPQNPLDGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAEAQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSKMVFIFSNRLWQMYVSDYERNAVTVTPAKPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVDLDKLNPLYHTIVKTYDDTTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLRPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQDETNAGIDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATVRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQTGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQTETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISSPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQDETVTGTSTNTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTVFEAGDETGYHFYSQRASDNKVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTVRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 138691,25860 Da
isoelectric point:5,04005
aromaticity:0,07596
hydropathy:-0,34667

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
969–1089
IPR048390 IPR048391
XUL00555.1
1 1277
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage LF82-2
[NCBI] 		3424139 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XUL00555.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV648360 [NCBI]
CDS location
range 53517 -> 57350
strand +
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGATACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAGCGATATTCCAGCTCCGGCAGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGATTGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATTGCGGTTGATACTTCAGCTGGCACTGATATTAATTTCACTTTGCCTCAAAATCCTTTAGATGGCGATACAGTTATTTTGTCTGATATTGGTGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGAGGCTCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATGGTCTTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAATGTATGTTTCTGATTACGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCTAAGCCATATCAGGCGCAACCTAACGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGCAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTTGATTTAGACAAATTAAACCCGTTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGATACAACTTCTATACGAGAAGCCGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCGGAAGCATTCTTTGTTTATGATTCTGCTAATAGCTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACGCCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGTGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGCTGGAATTTAATGGCGATACTTCGTATGTACCTGTACTTGAGTTAGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACTGTAACCGTCGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACAACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCGCAAGCAAATGTCGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTTGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGATGAAACTAATGCTGGCATAGATGATACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCGGCTACTGTTCGTGGTAATGCTGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCCTACTCAACAGGGCGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGTGAATCACAAACCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACCCCTGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAACAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCGTCTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACTCAGGCAGAATCTAATGCCGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAACTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTGATTAAGGTTGCTACTCAAGATGAAACTGTAACGGGAACTTCCACTAATACCGCTGTATCACCTAAGAATTTAAAATGGATTGTTCAATCAGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTGACGATACTCAAGGTAGTACCCAGGATCTGAATCTTTACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATCTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGATCTGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCCGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACCCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGTGATACAGTATTTGAAGCTGGTGACGAAACCGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTTCTGATAATAAAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGCATTGTTTCTACAAATGGATTAAATGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACCGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAATGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATTACGATTAACAATGCCACAGGATTGGTTCGTCTTGACAACGGTGTTCAAATCACAAGTGGCGCAACAATAACTACCGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGGATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCTACGGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTTGGTAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGTATTCGTTATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCATCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTGTTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACCGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
77738d7abaf0b3556e94fb8ad671e16d60000a8821a78cbd91598a08a4729588
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2266
Evidence 0,2266
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of Novel Phages Infecting Escherichia coli LF82 Steczynska,J.P. and Williams,K.P. 2025-10-09 — GenBank