Protein

Genbank accession
UYE98569.1 [GenBank]
Protein name
putative structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MAYVIKGDVNVTGNITVQSKNVGTSITTTGNSTVYLADTSGHVDLPLPSKSDVDYILKQLPLSQYGALNNNAPGVAGTFDGGSTLAYYSAMPVLLEADGSLVYLRPGTNGSSVNYYYTYINNPNASMQPFTTINSYYTGSWKTILFHDSDAKTCLTFEEVGNNVLHLVLTNGTLTKANHQSATIARNLIPYTIMNSIVIGSYMYIVTLYSSVNDLNNPTGIYYNGNDPFEFVLYRIPVSQIQTGSVTTVEQISGITGNTLYGDSQGSQGYIRIADLWQSTIESGNKSWIRYSSALNGVAGYTYTIIGSVKCIFDGTNLIISMNNNTFVRNNSLRSDTRPAFRIFYNVSTKAFTTDLTTGSPLVATGGVSGNITWTHPYSVNSSNIFGNGTAVSDSLNGTWYITENGTQYYIREKYVLSDNYYVYSGKINNFTNKVDAYNVRGRTFNSVVQYNVYADYASRVGDQLMGGIPISTSRVLFSGTGTYEGTKYLKYSKGISDIGTTRTYTYNSFKRGTITGYGPQATRLPLPTATENATYGGVSYCDSSGNVTFFGTVFVEGSVLSAGYQLNPTTLLYDKTISISNTVLTNLKNSILSNQGLSPSSSTIALYYSPNTSYFASVACVTSLNSGGGGNMILASVNCTADTSSVLTATLNTVINNYSDASFISTSTNGTATSEMRRHGGLCVVNYSDFTYVSLPHLINVGVAGDSREYSYAGVKSGNTLTSLIMSNSYHAPDISPGSREYSYIPNYGFGYYVFQDTDQGTKLIFKRCGSTLSEFNSNMASGTGTDTVILAQDVPQGFYLYFTEVTPLFLSGQYFDVPITAIDLSTVQANPGNTTFYVYIKLALGTPSYVVSTTTLPETDTQMFLGTIVTDGTKVATLNIKKVSRLDTYRPSTTQIGSAFPVSTGNPTQTGTITW
Physico‐chemical
properties
protein length:917 AA
molecular weight: 99110,14900 Da
isoelectric point:5,95556
aromaticity:0,11778
hydropathy:-0,11592

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Xanthomonas phage XbC2
[NCBI]
2978503 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE98569.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP292654 [NCBI]
CDS location
range 79167 -> 81920
strand +
CDS
ATGGCATATGTCATTAAAGGTGATGTGAATGTCACCGGAAATATAACAGTACAAAGTAAAAATGTAGGTACTAGTATCACAACCACTGGTAATAGTACTGTTTACTTGGCTGATACATCTGGACACGTAGACTTACCTTTACCGTCCAAATCTGATGTAGATTACATTTTAAAACAACTTCCTCTATCACAATATGGTGCGTTGAATAACAACGCACCTGGTGTGGCAGGAACATTTGATGGTGGTAGCACACTGGCATACTATTCAGCTATGCCAGTTCTATTAGAAGCTGATGGTTCTTTGGTTTATCTTCGCCCAGGAACTAATGGTAGTTCTGTAAATTATTACTACACTTATATAAACAATCCAAATGCTTCAATGCAACCATTCACCACTATTAATTCTTATTATACTGGTTCGTGGAAGACAATTTTGTTTCATGATAGTGATGCAAAAACATGCTTAACATTTGAAGAAGTGGGGAATAATGTACTTCATTTAGTACTTACGAATGGTACTTTAACTAAAGCAAATCATCAATCAGCAACTATTGCTCGTAACCTTATACCGTACACTATTATGAATTCTATAGTTATTGGTTCATATATGTACATCGTTACACTTTATTCATCAGTTAATGATCTTAATAATCCAACTGGAATATACTATAATGGCAATGATCCATTTGAATTTGTTTTATACAGAATACCTGTTTCACAGATTCAGACAGGTTCAGTAACAACGGTTGAACAAATATCTGGAATAACCGGTAATACACTATATGGTGATTCACAAGGTTCACAAGGTTATATTCGTATAGCAGATTTATGGCAAAGCACAATTGAAAGTGGTAATAAATCTTGGATTAGATACAGTTCAGCACTCAATGGAGTTGCTGGATATACATACACAATTATTGGTTCAGTAAAATGTATTTTTGATGGAACAAATTTAATTATCTCTATGAACAATAACACATTTGTTAGAAATAATTCATTACGTTCTGATACTAGACCAGCTTTTAGAATTTTCTATAATGTTAGTACTAAAGCATTTACTACAGATTTAACAACTGGTTCGCCTCTAGTTGCTACTGGTGGTGTTAGTGGTAATATCACATGGACACATCCATATTCTGTAAACAGTTCAAATATATTCGGTAATGGTACAGCGGTATCAGATAGTTTAAATGGAACTTGGTATATTACTGAAAATGGAACACAATATTACATTCGAGAAAAATATGTTCTTAGTGATAACTATTACGTATATTCTGGTAAAATTAATAACTTCACTAATAAAGTAGATGCTTATAATGTTCGTGGTAGAACATTTAATAGTGTGGTACAATATAATGTATACGCAGATTATGCTTCACGTGTTGGTGATCAACTGATGGGTGGGATTCCTATTAGTACTAGTAGAGTGTTGTTTAGCGGTACTGGTACATATGAAGGTACAAAATATTTGAAATATTCTAAAGGTATTTCTGATATTGGCACAACAAGAACATACACATATAATTCATTTAAACGAGGTACTATTACTGGTTATGGACCACAAGCTACTCGCTTACCATTACCAACTGCTACTGAAAATGCAACATATGGTGGTGTATCATATTGTGATTCTTCAGGAAATGTAACATTCTTTGGAACTGTATTCGTTGAAGGCTCTGTATTATCCGCAGGTTATCAATTGAATCCAACAACTTTGTTGTATGATAAAACTATTTCTATTTCAAATACGGTACTAACTAATTTAAAAAATAGCATATTATCAAACCAAGGATTATCACCATCTTCTAGTACTATTGCGTTGTATTATTCTCCTAATACTTCATATTTTGCGAGTGTTGCGTGTGTAACCAGCCTTAATTCTGGTGGTGGCGGTAATATGATTTTAGCATCAGTTAACTGTACTGCTGATACTTCTTCAGTACTGACGGCAACCCTAAACACTGTAATTAATAATTATAGTGATGCTTCATTTATATCAACATCAACAAACGGTACAGCAACATCAGAGATGCGTAGACATGGTGGTTTGTGTGTAGTTAATTATAGTGATTTTACATATGTATCTTTACCACACTTAATAAATGTTGGAGTGGCAGGTGATTCTCGTGAATATTCATACGCTGGTGTTAAATCAGGAAATACTTTAACTTCATTGATAATGTCTAATAGCTATCATGCACCAGACATTTCACCAGGTTCTCGTGAATATAGCTATATCCCTAACTATGGTTTTGGATATTATGTATTCCAAGACACAGATCAAGGAACAAAACTTATATTCAAACGTTGTGGTAGTACGCTATCAGAGTTCAATTCAAATATGGCTTCTGGTACAGGAACAGATACAGTAATTCTAGCTCAAGATGTTCCTCAAGGATTTTATTTGTATTTTACTGAAGTAACTCCATTATTCCTAAGTGGGCAATACTTTGATGTTCCTATTACAGCAATTGACTTAAGTACAGTACAAGCTAACCCAGGAAATACAACATTCTATGTTTATATAAAATTGGCGTTAGGAACTCCATCTTATGTAGTAAGTACTACAACCTTACCTGAAACTGATACGCAAATGTTTTTAGGAACAATTGTCACGGATGGTACAAAAGTTGCTACGTTAAATATAAAGAAGGTTTCTAGACTAGACACATACAGGCCAAGTACTACCCAAATTGGTTCTGCGTTCCCTGTCAGTACTGGTAATCCTACACAAACAGGAACAATTACCTGGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
d958255cc61558a23961ced1f3e5e5a56cc114fafea05d78d60a0be8ed9878f0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2313
Evidence 0,2313

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of two novel jumbo bacteriophages infecting Xanthomonas vesicatoria isolated from agricultural regions in Mexico Rubi-Rangel,L., Villicana,C., Leon-Felix,J., Amarillas,L., Carrillo-Fasio,A. and Lightbourn-Rojas,L. 2024-07-15 GenBank