Protein

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Genbank accession
ABD63844.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,83
Protein sequence
MIINVLNKDLVPVTFIDNDIPGLPSYYKDTLIDYLSLGTASFEFTILKSKNNIIQDYSRFFNDETCFSFEKNGKQYAVFPAGSDGFYETDTEITYKCLSLDRELSLEYVDKFDNSSTHTLQWYIDYFELISNNQIEIGRNDVADYTRVIKYDSQDTKLNRLLSLINNFDAEFEFITKLTNNGAVDKIILNIVKKRDDSGKGGIGAIRDDVELVYGKNVKGIERTYNFEFFNASKVIGKDGTNWNSSEFSYINSDGVEEFYKRKNDDTAFAPLSAQKYPAHLRKDSSDIWLRKNFETEYTTPAQMWGYIVQQFKSYAYPQITYKIKTNSNLVSQALDGKLPIQIGDTVTIEDDNFSNEQGDFGLILRARATEIKSSDSNPETNEITFENFVELQNDLSDDLMTQVNQLVDAATPYRAELTTTNGTQFKNGTGSTTLSAHIFKGSATAETIADSYEWSKDGTIVAPTQTITVDASGVTDKAVYSFKATVAGKVVANQSVTITNVDDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGLRSTTVTYTISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGNDGIAGKDGVGITATTITYAQSTSGTIAPSSGWTSTVPTVAEGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAKMGSDGAIGPQGPQGNTGPQGPAGSNGDPGKVVSDTEPTTRFKGLTWKYSGTSDLTASDGTVIHPNTEYYYNGTHWMINYLSANNLEANSITADLIDAKNLKITDGEFVSTTTNGLVTTSTEIKDNHIAISKKDGTVNTRNDIALDSEQGLAQKFTNINTGFYRTAGINYQGPFTSDSDGNYAQLTPQGTKLSTDVPWTKLSLMNNFNGNIEYAIINGTVYISASGVGVPAMTAGQWKQAAQLPTGSSAIPIRANRIAAGDSGDGLSWALLSNQAGGIFIRCSANKAPTPNLFNATLPYPIG
Physico‐chemical
properties
protein length:1027 AA
molecular weight: 111889,06610 Da
isoelectric point:4,80468
aromaticity:0,10224
hydropathy:-0,44576

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–746
DC_0690
PTHR24637
Unmapped
575–756
PTHR24637
DC_1328
STR
655–1012
DC_1328
G3DSA:1.20.5.320
STR
728–788
G3DSA:1.20.5.320
ABD63844.1
1 1027
Architecture
STR
STR 2-1012 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage ul36.t1k1
[NCBI] 		374529 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus lactis
[NCBI] 		1358 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABD63844.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ394809.1 [NCBI]
CDS location
range 29505 -> 32588
strand +
CDS
TTGATTATTAATGTTTTAAATAAAGACTTAGTTCCAGTAACTTTCATTGATAATGATATTCCCGGTTTACCAAGTTATTACAAAGATACTTTGATTGATTATCTAAGTCTAGGTACAGCATCATTTGAATTTACGATATTAAAATCCAAAAACAACATCATTCAAGACTACTCCAGATTTTTTAATGATGAGACATGCTTCTCTTTCGAGAAAAATGGTAAACAATATGCAGTTTTTCCTGCTGGTTCAGATGGGTTCTATGAAACAGACACAGAAATAACGTATAAATGTTTATCACTAGACCGTGAATTGTCTTTAGAATATGTTGATAAGTTTGATAATTCATCAACTCATACTCTGCAATGGTATATCGATTATTTTGAATTAATTTCAAACAATCAAATTGAAATTGGAAGGAATGATGTTGCTGATTATACAAGAGTCATAAAATATGATTCCCAAGATACAAAACTAAATCGCCTTTTATCTTTAATTAACAACTTTGATGCCGAGTTTGAGTTTATTACAAAACTAACCAATAATGGCGCGGTTGATAAAATAATTTTAAATATCGTTAAAAAACGCGATGATTCAGGCAAAGGTGGTATAGGGGCAATCAGGGATGATGTTGAGCTTGTATATGGAAAGAACGTTAAGGGGATTGAGAGAACTTATAATTTTGAGTTCTTTAATGCGTCTAAAGTTATAGGTAAAGATGGAACTAATTGGAATTCAAGTGAATTTTCCTATATTAATTCAGATGGAGTTGAGGAGTTTTATAAAAGAAAAAATGACGATACAGCATTTGCTCCACTTTCTGCTCAGAAATATCCAGCTCATCTTAGAAAAGACTCTTCAGATATATGGCTTAGGAAAAATTTTGAAACCGAGTATACTACTCCTGCTCAAATGTGGGGATATATTGTTCAACAATTTAAGTCATACGCTTATCCTCAGATTACTTATAAAATCAAAACAAATAGCAATTTAGTATCGCAAGCTCTCGATGGAAAACTTCCTATTCAGATTGGTGATACAGTAACCATTGAAGATGATAATTTTTCAAATGAGCAAGGTGATTTCGGATTAATTTTAAGAGCGAGAGCAACTGAAATTAAATCATCCGATAGTAATCCAGAAACAAACGAAATCACCTTTGAAAATTTCGTTGAATTGCAAAATGATTTATCAGATGACCTAATGACACAAGTCAATCAGTTAGTTGATGCAGCTACTCCATACCGAGCAGAGCTTACAACCACAAACGGCACACAGTTCAAAAATGGCACTGGTTCAACAACTTTATCAGCTCATATTTTCAAAGGTTCTGCAACGGCTGAAACAATCGCAGACAGTTACGAATGGTCGAAAGATGGGACTATTGTCGCTCCAACTCAGACTATCACAGTTGATGCCAGCGGAGTAACTGATAAGGCAGTTTATAGTTTTAAAGCAACGGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCAAATCAGTCGGTTACCATCACTAATGTAGATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGGAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGACTACGTTCAACCACAGTTACATATACTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACGAAAACAGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGGAACAACGGTAATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGAGTAGGAATTACAGCAACTACAATAACTTATGCACAATCAACAAGCGGAACGATAGCACCAAGCAGTGGCTGGACTTCCACAGTTCCAACAGTTGCAGAAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACCGTTTGGGCTTATACGGACAATACCAGCGAAACAGGATATTCCGTTGCGAAAATGGGAAGCGATGGAGCAATAGGGCCGCAAGGTCCTCAGGGGAATACTGGACCACAAGGCCCTGCTGGAAGTAATGGTGACCCAGGTAAAGTTGTTTCTGATACTGAGCCGACCACTCGATTCAAAGGTTTGACTTGGAAATATTCAGGCACCTCTGACCTTACAGCGAGTGATGGAACAGTTATCCATCCTAACACTGAGTACTACTACAATGGCACTCACTGGATGATTAACTATTTAAGTGCGAATAATCTTGAAGCTAACTCAATAACCGCTGACTTAATTGATGCAAAAAATTTAAAAATTACTGATGGTGAGTTCGTAAGTACAACAACTAATGGTCTAGTTACAACCTCTACAGAAATTAAAGATAATCATATTGCAATTTCAAAGAAAGATGGAACTGTTAATACTAGAAATGATATAGCACTTGATTCTGAACAAGGATTAGCTCAGAAATTTACGAACATTAATACAGGATTCTACAGAACAGCTGGGATTAATTATCAAGGACCATTCACAAGCGACTCAGATGGAAACTATGCTCAACTTACACCTCAAGGCACGAAGTTATCAACTGATGTTCCTTGGACCAAGCTTAGTTTAATGAATAATTTTAATGGAAATATTGAGTATGCGATTATCAATGGGACTGTCTATATATCAGCATCAGGAGTTGGCGTACCAGCAATGACTGCTGGTCAATGGAAGCAAGCGGCTCAATTGCCAACAGGAAGTTCAGCAATTCCAATTAGAGCAAATCGAATTGCAGCAGGAGATAGCGGAGATGGTCTAAGTTGGGCATTGCTTTCTAATCAGGCTGGAGGAATATTCATTCGATGCAGTGCTAATAAAGCACCAACACCTAACTTATTCAATGCCACATTACCATATCCAATAGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cfaf387d7a960685564922009ed137b43fe81cff2ad4070f980df46b87636d51
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,8144
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50