Protein

Genbank accession
AIT74611.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGVFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFFDGNSRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGSESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSISSPQILTDKVITNGKKAGDYDIYSLANNTPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYAGDGLEAYLWSFTWSGGLKAGHSISIGTPGGPKGYSELGTASIVLGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPRETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGINNSSTLLFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFTNPSVGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYVQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEINSGTFVLHHLKEDGTQGHTSRFNQDGTVNFPDNVQVGGGEATIARNGNIFSDIWKPFTSAGDTTNIRDAIATRVSKEGDTMTGKLIIRRDSDAINLAAPSTTDASYLLSTGAGENLWYIGKGGADNTVSFYNYKTNGAVQINSIGEIALIPQGAATFNFNRDRLYINGSQWTAHQAGDWVNQWRQEAPIFVDFGSVGNDCYYPIIKGKSVITNEGYVSGVDFGMRRITNQWAQAIIRVGNQENASDPQAIFEFHHNGNMYVPDMVKAGVRLSAGGGDPVWTGACVVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGVHIASWSSAYHLHEGLWDTTGALWTEHGRAIISFGHLVQESDAYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASEKLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1104 AA
molecular weight: 119156,80230 Da
isoelectric point:5,55922
aromaticity:0,09601
hydropathy:-0,30335

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterobacteria phage RB27
[NCBI]
69609 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI]
562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia
Host Escherichia coli B
[NCBI]
37762 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIT74611.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM607000 [NCBI]
CDS location
range 152111 -> 155425
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATCATTGATCTTGGTTTTGCTAAGGGCGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAACTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCGTCTTCACTCAGACTGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCTGCTGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCGCATGTTCGTTTTTTCGATGGCAATAGTCGCGAACGTGGAATCATTTATGCCCCGGCTAATGATGGTTTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCCGCTGGTAGCGAAAGCACTTATGCATTTTCAGGCAGTGGCCTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCGACAAAGTTATTACAAACGGGAAGAAGGCAGGAGATTATGATATCTATTCATTAGCAAATAACACCCCATTATCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTTCGTGTCATGCGTAATGCCGTTGGTTCTGGTATTTTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGGATAACCTGGTATGCCGGTGACGGGTTGGAGGCTTATCTTTGGTCGTTTACGTGGTCCGGTGGGTTGAAAGCGGGTCATTCTATTTCTATAGGTACCCCAGGCGGTCCAAAAGGATATTCTGAATTAGGAACGGCCTCAATTGTTCTTGGGGATAATGATACCGGATTTAAATGGCATCAGGACGGATATTATTTCAGCGTCAATAATGGAACAAAAACGTTTTTATTTAGTCCCAGAGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACTAACGGAACCGATTTAACTACTCCTCCAACTGAAAATTATGCTCTTGCTACTGTAGTAACATACCACGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTAGGATATTATCAAGGCGGTAACTATCATCATTATTTCCGCGGCAAGGGTACTACAAACATTAATACTCATGGCGGTTTGTTAGTTACTCCAGGTAATATTGATGTTATTGGCGGTTCTGTTAATATTGATGGTATAAATAATTCTTCTACCCTGCTATTTAGAGGCAACACAACTGGTAGTAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCCGTTTGGGGCAATACGTTTACTAATCCTAGTGTAGGTAATCGTAAAAACGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGTTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACAACAGGTGAAGTAGAAATGAACGTTAACGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAAATAGAGGAGTTCACACAACAGGCGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCGCTTCGCATTTGGAACGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGGTAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTACGGTGAAGGTAAACACGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGTTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATCGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACGGTAAATCCGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCAGGTACATTTGTTTTACATCATTTAAAAGAAGACGGAACTCAAGGACATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCAGATAACGTTCAGGTCGGCGGCGGTGAAGCTACTATTGCTCGCAATGGTAATATCTTCTCCGATATTTGGAAACCGTTTACTTCTGCAGGTGATACTACAAATATTCGCGATGCTATTGCGACTCGTGTTTCGAAAGAAGGCGACACGATGACCGGTAAGTTGATTATTAGAAGAGATTCTGACGCTATTAACTTAGCTGCGCCTTCGACAACTGATGCAAGTTACCTTCTTTCTACAGGCGCTGGTGAAAATCTATGGTATATTGGTAAAGGCGGCGCTGATAATACTGTATCATTTTACAACTATAAAACCAATGGGGCTGTGCAAATTAACTCTATTGGTGAAATCGCGCTGATTCCACAAGGTGCTGCAACATTTAACTTCAACCGTGATCGTCTCTATATAAATGGGTCTCAATGGACTGCACATCAAGCTGGTGACTGGGTTAACCAATGGCGTCAAGAAGCTCCTATATTTGTGGATTTTGGTAGTGTCGGCAATGACTGCTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCTGTTATTACGAATGAAGGATACGTATCTGGTGTTGATTTCGGTATGCGCCGTATCACTAACCAATGGGCTCAGGCTATTATCCGTGTTGGTAACCAGGAAAATGCTAGCGATCCGCAAGCTATCTTCGAATTCCACCATAATGGAAACATGTACGTTCCTGACATGGTTAAAGCTGGAGTAAGATTATCAGCTGGTGGAGGTGACCCTGTATGGACAGGCGCATGTGTTGTTATTGGTGATAATGACACTGGGTTAGTTCATGGCGGTGACGGTCGTATTAACATGGTTGCAAATGGAGTGCATATTGCTTCATGGTCGTCCGCTTACCATCTCCATGAAGGTCTTTGGGATACCACCGGTGCTTTGTGGACTGAACACGGAAGAGCTATTATTTCTTTTGGTCATTTAGTTCAAGAAAGTGATGCCTATTCCACATTTGTCCGCGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAGCGAGGCCTAGATGAAGAAGGCAATCAGAAATGGGAACCTAACGCCGGTTTGATAGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTGCCTGAATTAGTTGAAGGTGACCCTGATGGCGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCGGAACTTAAATCAGAAATTGAAGAACTTAAAGCATTAGTTAAATCATTGTTAAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
443b1ee17ac9a065ad9576031419942a10177c3412932a4b11a41be01e382926
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5341
Evidence 0,5341

Literature

No literature entries available.