Protein

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Genbank accession
NP_049860.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/Swiss
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAEIKREFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAIVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELKLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAADEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNDETNYVPVLELAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTDNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQQGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIAQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTGEFGGSLAANRTFTIRNTGAPTSIVFEKGPASGANPAQSMSIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDDTSHHFYSQRNKDGNIAFNINGTVMPININASGLMNVNGTATFGRSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDASNTYFLLTAAGDQTGGFNGLRPLLINNQSGQITIGEGLIIAKGVTINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140401,92410 Da
isoelectric point:5,29293
aromaticity:0,07525
hydropathy:-0,33258

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
14–133
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
979–1092
IPR048390
DC_1209
STR
991–1277
DC_1209
NP_049860.1
1 1289
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 14-133 | STR 343-978 | ATT 979-1092 | STR 1093-1138 | ATT 1139-1237 | STR 1238-1277 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
NP_049860.1
1 1289
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1079 1079 0,8104
Central domain 1080 1278 200 0,1304
C-terminal 1279 1289 10 0,8398
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1079
Central
1080-1278
C-terminal
1279-1289

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage T4
[NCBI] 		2681598 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Tequatrovirus
Host Escherichia coli B
[NCBI] 		37762 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
NP_049860.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_000866 [NCBI]
CDS location
range 150809 -> 154678
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAGAATTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAGTATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCTGGTGAAGCAATTTCGGTTAACACCGCAGCTGGAAATGACATCACGTTTACTTTACCATCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTACAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTATAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCCAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTCAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTATGGAGACTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCGCGTTTACGTATCATAACGACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAAACAATTGAGCTTAAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGATGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTTACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGATGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTGGAGCTTGCTTACATAGAAGATTCTGATGGAAAATATTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTCGCAGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTGATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAGCAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAGCAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACACTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACGCAGGTCGAAGCTGCTGCGGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCGCAAGAGGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGCGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCAATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCACTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGGTGAATTTGGTGGTTCATTGGCCGCTAATAGAACATTTACCATCCGTAATACAGGAGCCCCGACTAGTATCGTTTTCGAAAAAGGTCCTGCATCCGGGGCAAATCCTGCACAGTCAATGAGTATTCGTGTATGGGGTAACCAATTTGGCGGCGGTAGTGATACGACCCGTTCGACAGTGTTTGAAGTTGGCGATGACACATCTCATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGACGGTAATATAGCGTTTAACATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTGAATGGCACTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTTAGAGCAATAAACGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCCTCTAATACCTATTTTTTGCTCACTGCAGCCGGTGATCAGACTGGTGGTTTTAATGGATTACGCCCATTATTAATTAATAATCAATCCGGTCAGATTACAATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGTTACTATAAATTCAGGCGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACGCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTGCGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

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PDB ID
Source
Method
Resolution
Oligomeric State