Protein
- Genbank accession
- AJA73233.1 [GenBank]
- Protein name
- host specificity protein J
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MRIYGAKGGGGSSHTPIEAPETGRSKQIVNIVELLCEGEIEGLVDGFKSIYLDGTQIQNDDGTYNFNNVSGQLNVGTQDQDVLDGYDSSQNEVNVGVEIKKKNGAIVRTVTDERINRLRLTLGVRSLFHQNNQGDTNTTNVDLKITIGTRQYSHSFNGKYSSQYLESVVFDNLPPVPFNISVERLTEDSNSQRLQNGTIWSSYTEIIDTEFTYPNSAVAGISFDSEYFNNIPTRNYLIKAKKVKVPSNYDPVKRTYTGFWDGTFKVAWTNNPAWEIYDLAPILSKMLGVEISFDKWALYDVSRYCDQLVPDGMGGQEPRFTCDVWLTEVKTAYDLLNDFCSVFRAIPIWTGTEVSVIIDRPRDPVWTYTNANVVSGFERSYSARKSRHNAVQVTYSDKTNGYESAIEYVSDDEEIKKHGLNLSQITAFGCTSRGQAHRTGKWILETEKREKETITFTVGREGLMHLPGDIIRVADSHYAGTEIGGRVLAINGRKVTLDREISIDNASYFTYINGEATHSTIKIQSVNGKEITLDSTPTGLETYGVWSLSTKQISSGLYRSISIVENADGTNTITALQHEPQKEAIVDNSAHFVETARTLYKAPQINAVEVSTGYDGKLYITGDISSGDGKLTYDIKITKDGNLYQYKKGLSDPNIELSDLPNGDYTVIIYGKNAKGQIVTEKTQTFTIDRPPAPTGVVVTGGLGQITLEWDWVNEVTQTEIFAAETDNFALAKKIAKVTARTYAHTLKGNKVVRYYWLRHTRGINVGPFYQQQGVRGQTAVDLDARLTELNTQLSRNIVNEVFDVAAPARGLELVKTVANLTDKGTKLASSQVYNQADGKLYTWNGTAYSATVAAEDVTGKLSKSKIDTSLISQLTGADNTANLARRLAETAQSNINQEITNRQDAVTAEANNRTKAIQAESANLTKKIQAEATARGAAVTQLQNVDAQQAQLISAVTAKADNALSGLEEEKTARANADKAESQAREALTARMGAAESNIVTIQRTVANNAQSISEVSQNLNAKIDNINIGGRNLLRDSEFNAYNKWGSPQIEFAENANRRTIKVTSTGTNGPVGIVSSNRHSTSYFQQGETYTLSLFARGSKALDYLYLMRQDGNNVRLPVINVASETEFNHYKLTFKAPFTTQQGYVLIGFRQTSTEQFVEFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVESAVSAVSADLTSYKQTQAATDSAQAQQLNQLSVNLTKAETNFNAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASIAQQNLQSIWRTDAQSAVDALKIGGANLLVDSEYLTTARWGGSSRVASSQYGDRRLTQVFVTQAGTGHFGVTQGTQKATTRIRQGETYTLSLNAQGTAGFTRTGLNYVYLIREDGGNFRLPTLPLTASLSQRPKVTFTAPWTSNQVRLLIGANGIFEATDWFAFHSVKLEMGNVATGWTPTAKDIDDKVSAVQSNLTAYQAAQAKADQAKATQISGLTTRMGAAESNLTRTERAVTELNQTTVTTLRDLTARTKTTEGSLSRLETAKANKTEVASIAQSSLQSIWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKITFTAEWTSERAYLLVGVNGTYETTDWLAFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVDSAVSAVSAKIDTIQETLANADSALSSRIDTVNASVGSNSSKITQVSNAVASVDGKLSATHTIKTETIAGGRKAIAGIAFGATADNRNAESSVIVMADKFEVVKNAQDGTPVRLFGVVENKVAINGNLIATGSISGDHINANSVRTAVLTAGAIKTEHLAAGQISADKLAIGLGGNLLVNPIFATPDLSIAPFGWNYWRGEVGDRLNIDTRTIFNRNEQDNYGLKNGGLPNELVFSMRYSTTKETSDTGRIGWLSQDINVVPNKKYIASVWLACHRGQAKLVIENIEKPGGAYLGRIGNSEVITGYSAHQGEFKNMKRVKVVFTAPTSGCIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIVTNTVTAQQIAANTITANEIAAGTIAARNMAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGAITAGSININNRFKVSNAGVVEMRANSGNVGMVMNNNSIIVYDEQGRVRVKMGKL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2241 AA molecular weight: 243418,21160 Da isoelectric point: 7,35885 aromaticity: 0,07184 hydropathy: -0,33280
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Mannheimia phage vB_MhS_535AP2 [NCBI] |
1572743 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Mannheimia haemolytica [NCBI] |
75985 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pasteurellales > Pasteurellaceae > Mannheimia |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJA73233.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP137433
[NCBI]
CDS location
range 17533 -> 24258
strand +
strand +
CDS
ATGCGTATTTACGGAGCAAAAGGTGGTGGCGGCAGTAGCCATACCCCGATTGAAGCACCGGAAACCGGTCGCTCAAAACAGATTGTGAATATTGTGGAATTGCTGTGCGAGGGCGAAATTGAAGGCTTGGTTGATGGCTTTAAATCGATTTACCTAGACGGCACGCAGATCCAAAACGATGACGGCACCTATAATTTTAATAATGTGAGCGGTCAGCTAAATGTCGGTACGCAAGATCAAGATGTGTTGGACGGTTACGATAGCTCACAGAATGAAGTGAATGTGGGTGTTGAGATTAAGAAAAAGAATGGGGCTATTGTCCGCACCGTAACTGATGAACGAATTAACCGCTTGCGTTTAACGTTGGGAGTAAGGTCATTATTCCACCAAAATAATCAAGGCGATACCAATACCACCAATGTTGATTTAAAAATCACGATTGGCACACGGCAATATTCGCATAGCTTTAACGGCAAATACAGCTCGCAATACCTTGAATCTGTGGTGTTTGATAACCTGCCGCCTGTGCCATTTAATATCTCAGTTGAGCGTCTAACCGAGGATAGCAATTCGCAACGCTTACAAAACGGTACAATTTGGAGTAGTTACACCGAAATTATCGATACCGAGTTTACCTACCCTAATTCAGCGGTTGCCGGTATCAGTTTTGATTCGGAGTATTTTAATAATATCCCGACCCGAAACTACCTAATTAAAGCGAAAAAAGTCAAAGTGCCAAGCAATTATGATCCAGTTAAACGCACTTACACCGGCTTTTGGGACGGCACATTTAAAGTTGCGTGGACGAACAACCCTGCTTGGGAAATTTACGATTTAGCTCCGATTTTAAGCAAAATGCTTGGGGTTGAAATCAGCTTTGATAAATGGGCGTTGTATGACGTCTCTCGCTATTGCGATCAGCTTGTGCCGGACGGTATGGGCGGACAAGAGCCACGTTTTACCTGTGATGTATGGCTCACGGAAGTTAAAACTGCCTATGATTTATTAAATGATTTCTGCTCGGTATTCCGTGCGATTCCGATTTGGACCGGCACGGAAGTCTCCGTGATTATCGACCGTCCTCGTGATCCGGTTTGGACTTATACCAACGCTAATGTAGTCAGCGGTTTTGAACGCTCATATTCTGCCCGCAAATCTCGCCATAATGCGGTACAAGTGACCTATTCGGATAAAACGAATGGCTATGAAAGTGCGATTGAATATGTCTCTGACGATGAAGAAATAAAAAAGCACGGCTTAAATTTAAGTCAAATTACCGCCTTTGGTTGCACCTCTCGGGGACAAGCACACCGTACCGGTAAATGGATTTTAGAAACCGAAAAACGAGAAAAGGAAACCATTACCTTTACCGTTGGACGTGAGGGCTTAATGCACTTACCGGGCGATATTATCCGTGTAGCCGATAGCCATTATGCCGGCACGGAAATTGGCGGACGAGTGTTGGCGATTAATGGGCGAAAAGTTACCCTTGACCGTGAAATTAGCATTGATAACGCCAGTTATTTTACTTACATCAACGGTGAGGCGACACACTCAACCATCAAAATCCAATCTGTAAACGGCAAAGAAATTACGCTGGATAGTACACCAACCGGCTTAGAAACCTACGGTGTTTGGTCGTTATCGACTAAACAAATCAGCTCTGGATTATATCGCTCAATCTCGATTGTCGAAAATGCGGACGGCACAAACACTATCACAGCGTTACAACACGAACCGCAGAAAGAGGCAATTGTTGATAACTCCGCTCACTTTGTGGAAACGGCTAGAACACTCTACAAAGCTCCACAAATTAACGCAGTGGAAGTCTCGACCGGTTATGACGGTAAGCTCTACATTACCGGTGATATTAGCTCCGGTGATGGCAAGCTAACCTATGATATTAAAATTACCAAAGATGGCAATTTATATCAATACAAAAAAGGCTTAAGCGATCCGAACATTGAACTAAGTGATTTACCTAACGGCGATTATACCGTCATTATTTACGGCAAAAACGCCAAAGGGCAAATCGTCACCGAAAAAACACAAACCTTTACTATTGATCGACCTCCAGCTCCGACCGGTGTAGTAGTAACAGGTGGATTAGGGCAAATTACCCTCGAATGGGATTGGGTAAATGAGGTTACGCAAACCGAGATTTTCGCGGCCGAAACCGATAATTTCGCCCTTGCAAAAAAAATCGCAAAAGTGACCGCTAGAACCTACGCTCACACACTAAAAGGTAACAAGGTTGTACGCTATTATTGGCTACGTCATACCAGAGGCATTAATGTCGGACCGTTTTATCAACAACAGGGGGTAAGAGGACAAACAGCGGTTGATTTGGATGCTCGATTAACCGAATTAAACACTCAGTTATCACGCAATATTGTTAATGAGGTTTTTGATGTTGCTGCACCGGCAAGAGGTTTAGAATTAGTGAAAACAGTCGCTAATTTGACCGACAAAGGTACTAAACTGGCGTCATCTCAAGTTTACAATCAGGCTGACGGCAAGCTCTATACTTGGAACGGTACAGCATACTCAGCTACAGTGGCTGCGGAAGATGTTACCGGCAAATTATCAAAATCTAAAATTGATACGTCCCTTATTTCGCAATTAACAGGTGCAGATAACACCGCAAATTTGGCAAGAAGATTAGCGGAAACAGCTCAAAGCAACATTAACCAAGAGATTACTAACCGACAAGATGCCGTTACTGCCGAAGCAAATAACCGTACTAAAGCCATTCAAGCCGAAAGTGCGAATTTAACGAAAAAAATTCAAGCTGAAGCAACCGCTCGTGGGGCTGCTGTTACACAGTTACAAAATGTTGATGCTCAACAAGCACAGTTGATTTCTGCTGTCACAGCAAAAGCTGATAATGCTCTTTCAGGCTTGGAAGAAGAAAAAACAGCACGAGCAAACGCCGATAAAGCGGAGTCTCAAGCACGTGAAGCATTAACAGCAAGAATGGGAGCAGCTGAAAGCAATATCGTAACTATTCAACGTACGGTAGCAAATAATGCCCAAAGCATTAGTGAAGTCAGTCAGAATTTAAATGCTAAGATTGATAATATTAATATCGGCGGTCGGAATTTATTAAGAGACAGCGAGTTCAATGCGTACAATAAATGGGGTAGCCCACAAATTGAATTTGCTGAAAATGCAAATCGCCGAACTATCAAAGTAACCTCAACAGGTACTAACGGTCCTGTTGGTATTGTTTCATCTAATCGCCATTCCACATCTTATTTCCAACAAGGAGAAACTTATACACTCTCATTATTTGCTCGAGGAAGTAAGGCACTAGACTATCTCTATCTAATGCGTCAAGATGGGAATAACGTTAGATTACCAGTGATTAACGTTGCCTCTGAAACTGAGTTTAATCATTACAAACTCACGTTCAAGGCTCCTTTTACCACGCAACAAGGTTATGTCTTAATCGGTTTTCGGCAAACCAGCACAGAGCAGTTTGTTGAGTTTCACAGCGTCAAACTTGAAAAAGGCAACGTAGCCACAGACTGGACACCAGCACCGGAGGATGTGGAGAGTGCGGTTAGTGCTGTTTCGGCTGATTTAACGAGTTATAAACAAACTCAAGCGGCTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGACTAATTTCAACGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAAAGCTCGTGTTGATGCAGATAAAGTGAATGCAGATAAACTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTGGCAAGTATTGCCCAGCAGAACTTACAGAGCATTTGGCGCACCGATGCGCAAAGTGCGGTGGATGCCTTGAAAATCGGTGGTGCAAATCTACTGGTTGATAGTGAGTATTTGACGACAGCCCGTTGGGGCGGTAGCTCACGAGTGGCAAGCTCGCAATATGGTGATCGTCGCTTGACTCAAGTGTTTGTGACCCAAGCAGGCACAGGGCATTTTGGTGTGACTCAAGGCACACAAAAAGCCACTACGCGTATTCGTCAGGGTGAAACCTATACCTTGTCACTAAATGCGCAGGGGACGGCAGGTTTTACCCGCACAGGGTTAAACTATGTGTACCTTATCCGCGAAGATGGTGGCAATTTTAGATTGCCAACTTTGCCGCTTACTGCATCATTGTCCCAACGCCCTAAAGTGACATTTACTGCGCCGTGGACGAGCAATCAAGTTCGGTTACTGATTGGCGCAAATGGCATATTTGAGGCGACAGACTGGTTCGCATTTCACAGCGTTAAGCTCGAAATGGGTAATGTTGCCACAGGCTGGACACCAACCGCCAAGGATATTGACGACAAAGTATCAGCGGTTCAGTCCAACCTCACCGCTTATCAGGCGGCACAAGCTAAAGCAGATCAAGCCAAAGCTACGCAGATTTCGGGGCTCACAACCCGAATGGGGGCAGCGGAAAGTAACCTCACTCGCACCGAACGGGCAGTGACGGAACTTAATCAGACAACGGTGACGACACTGCGTGATCTAACCGCGCGCACCAAAACAACGGAAGGTTCGCTCTCTCGTTTGGAAACCGCCAAAGCAAATAAAACTGAGGTGGCAAGTATTGCTCAAAGCTCCTTACAGTCAATTTGGAAAGCTGATGCAAAATCTGCCGTTGATTCACTTTCTATCGGTGCAAGGAACTTACTGATAGACAGTACTTACAACCAACACATCAACTACAATACAAAAATGTCATCAATCACACGCACAGTCTATCGCGGCAATATGTTGATACGACTCGGAATGCTTGGTGGCGCAGGTGTGGCCGGTATTGTACAAGCACCAGCCGCTCAAGTAAGTAATATCAGACAGGGTCAAGAGTACACACTTAGCCTGAATGTACAGGGTACAGCCGGCATACAAAAAACGGGGCTCAACTATGTATTCTTGATGCGTGCTGATGGGGCTAATCAACGGTTAGCAACAATACCTGTTATAGCCAGCCTATTAAACAGACCTAAAATAACCTTTACTGCCGAATGGACAAGTGAGCGAGCCTATCTGCTTGTTGGTGTAAATGGTACTTATGAGACCACAGATTGGTTAGCGTTTCACAGCGTCAAACTTGAAAAAGGCAACGTAGCCACAGACTGGACGCCAGCACCTGAAGATGTGGACAGTGCGGTTAGTGCAGTTTCGGCTAAAATTGATACTATTCAGGAGACTTTAGCGAATGCCGACTCTGCATTAAGCTCTCGCATTGATACGGTCAATGCCTCAGTCGGATCAAACTCATCTAAAATTACCCAAGTCAGCAATGCGGTAGCAAGTGTGGACGGCAAATTATCTGCTACCCATACCATCAAAACCGAAACCATTGCCGGTGGACGCAAAGCGATTGCCGGTATTGCATTTGGTGCAACGGCAGATAACCGTAATGCGGAATCTTCTGTGATTGTGATGGCAGATAAATTTGAGGTCGTGAAAAACGCCCAAGACGGCACGCCAGTAAGACTATTTGGCGTGGTAGAAAATAAAGTAGCGATTAATGGGAATTTAATCGCAACAGGCTCGATTTCAGGAGACCACATCAATGCAAATTCCGTCAGAACTGCTGTATTGACTGCAGGAGCGATTAAAACGGAGCATTTGGCAGCAGGGCAAATATCGGCGGATAAGTTAGCGATTGGGCTAGGTGGGAATTTGCTGGTTAATCCTATTTTTGCAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTGGAACTACTGGCGAGGAGAAGTTGGTGATCGGCTAAATATTGACACCCGTACTATTTTCAATAGGAATGAACAAGATAATTACGGACTAAAAAATGGAGGACTACCAAATGAGTTAGTATTTTCGATGCGGTATAGCACTACAAAGGAAACCTCTGATACTGGGCGAATTGGGTGGTTATCTCAGGATATTAATGTTGTGCCTAATAAAAAATATATTGCCTCCGTATGGTTAGCTTGTCATCGTGGGCAAGCTAAATTAGTCATTGAGAATATCGAAAAACCTGGTGGTGCTTATTTAGGTCGGATAGGCAACAGCGAGGTAATTACTGGCTATAGTGCTCATCAAGGCGAATTTAAAAATATGAAACGGGTTAAGGTTGTATTTACTGCACCTACTTCAGGCTGTATTCGTTTCGCATTACGATTAGATAATATTCAAGGTAAAGCTAATCCATTTTTATTTGCTCGTAGACCAATGCTTGAGGAGGCTAGTGATAATGTTACAGATATCACTCAGCCTAGCCCTTGGCAAAATGCCGGTGTAACCGCTATCCACGGTGGCTCAATAGTTACTAATACCGTTACTGCTCAACAAATTGCAGCAAATACCATTACCGCCAACGAAATCGCAGCCGGCACGATTGCAGCTCGAAATATGGCAGCAAACTCGATTAATGCAAGTCATATTGTAGGGAGTTCGATCACTGCGGATAAGCTAAATGTAAACAATTTAGCGGCAATATCAGCGAATCTCGGAGCTATTACAGCTGGTTCTATTAATATCAATAATAGATTCAAGGTAAGTAATGCTGGAGTAGTCGAAATGCGAGCCAATAGTGGAAATGTTGGTATGGTAATGAATAACAATAGTATTATTGTTTATGATGAACAAGGTAGGGTTAGAGTAAAAATGGGGAAATTATGA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
de55543a7e9becdb18413752372f8bc3850e527d7d58291777a9a4f7af323cc1
Literature
No literature entries available.