Protein

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Genbank accession
XQU49958.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MPLSRLENFLKNAEGNILYVNPSDFDATDSFENRGNSLTRPFKTIQRAIIESARFSFRAGRNNDKIDTTTILVYPGTHYIDNRPGYSIRDNGGTAEIKKLVDKKWTTIGASLTEFSEDSNFDIFDEDNDLFRYNSTEGGVILPRGTSIVGLDLRKTKIRPLYVPDPHDDQVLPTSIFRVTGTCYFTAFSIFDADPNRSAYKNSSDLKVNPSFSHHKLAVFEYADGVNDAILDNVDMGITDLDMYYAKVTYAFGSTSGRPLANYPVGKDFEPLVDEYRIVGDLRADPIGITSIKAGDGAIPTTTITVTTSEAHGLFKDTPILLSGITTNPTVYNGSIVVSDVVSNTEFTYTAKTNPSNPLPASSQISNAQVVVESDSVSSASPYIFSCTLRSVYGMNGMIADGNKATGFKSMLTAQFTGISLQKDDNAFMVFDDTTQIYNDNDTAPEEQKPLHINSTALYKRGWESTHVTAKNDSIIQCVSIFAIGFARHFVAETGGDMSITNSNSNFGAVALESTGFRNEAFDRDDVGYITHIIPPREPDPRESNITWLSLDAEKIVSAAKTERLYVFGYNSKDVPPSSQIDSYRLGAKRGEEINLEVIIGTEKSNFRSPVLMPVPSGIGTSSQKVYRVGRNAGINSISQSIFTLTDDHQLFNGEKVRLVSDTGEVPNNVEQDKLYFAFTTGLNADQIKLSSTLNDTINGTTIGGISNNGGELRIVSFVADKDPGELGHPMQFDEDESQWYLQGSSSTFFNTIYDGIVGIGTSILGNQTGATFVTRRLDNRGLEDRLYKFRYVIPKEFSNARPPSDGFILQESNTVGFGSASYLTSALANTTQLRNPTIITDASYVGQEVTIRTEQPHHFVAGDTVKIQNVRSTNNLTSNVQIPFNGEYPIYTVPSTRTFTIAGITTDPGTFLNETNQRTTQQQVDALPTVQRLKYKDSIFVYRSQEIKSLIPGTDGQDGIYLVTPICGSIKPIDEIGYGVSERRFNQDVRNLYPQQDRDNYNSDPEGTTSLAKLSPLGKVTTNSKQKSVTKEALNYFFENNQIGYAITGGVVSGAGNTTLTIFLDTEHTLNSIKELSIITDGAGYNNNTGLSTTLYSTELSNSLIVGSNAAVRAEVSAANTVSSVSIVSAGGAYAIGNTMTVSASPAGAPSVSAVVEVTDINNNIGDAIELTGFPDDAFNDIFEIREIPSTKAIVLEKRGSVGLGVTFPERNDVRKPLAYVSSPRVGIATVDFTDAVGIATVTTLTAHGLQPGNTFTFSGFTAGGGITTNTFFERKFIANEVPGITTFIFNAGITTENPERDFGTAGVLKFNFSSNGRALGLGEENLNGRGSTFYAGITTTLSTIVTTTDTTITPTDTAGFYKGDYVQIGAEIMRISNNASSGTFAVLRGQFSTTAAVHQADELIKKVRVLPMEIRRHSILRASAHTFEYLGFGPGNYSTGLPLKQDRILTDEEVLVSQAREQDGGTVVYTAMNDRGEFFTGVTKISAATGEEEVIEAPIVTYFGDDIESELTRRNNGVFDDLVVKNRITVEGGENNNQTSQFYGPVNFSQKVTSSSEDGLETKDLYIKGLASQPKLITVGISTPIDAKRVGDISLLATPDKGGHLGHIYADGDWRRFGMISEEKNRDFLVIDQMGIGEKGGVFDFTDELEVNGNVKVKDLRVEGNVTFAGNQAIGNASFDKITVNQTATFGGINTNYSILHTDTTDIAQFGNLEVTGYAATFASSGADQEWLTIQRRLHSTYTGVSTFDGTLKVGNIVSNTGILSVSNAEIDDLYATVGTIDTLYAQSGIITSLRVSSISGDPKAGAGLTIYANAGIITSITGVAATITKGDFTELFATNASISNRFFADDARVNTGLATNFKSTNATLTNAFVNVGVVTTLVVPSTGYQGSTVDGWIGAPTAYINSGIVTTIQGTDSTYVNVVGSTKVTSPLFQGQDTNNPSGAGKLFIQNAQVASRLWLNGTADSEGIRSVVGVITYLGPNAKSDLGNLSAGNMHVNCGADGKIKARTIQSTVPTGTAPFVVASTTKVTNLNADLLDGLNTSSNDQSGASVVTRSGGSSEFNKVTCRNFLLESAGSGSMTVNKSATFTENVTIGSDSNNVTLRHHGPFLVDDDATTSDARLKENIETIPDALDMVLELRGVQFDWKSSGRSDIGLIAQEVEEVLPECVTEVDDVKGVKYGNIVGLLIESIKELKGEITDLQEEIRQLKGE
Physico‐chemical
properties
protein length:2214 AA
molecular weight: 238496,18060 Da
isoelectric point:4,83975
aromaticity:0,08266
hydropathy:-0,22764

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1810
DC_0066 DC_1985
IPR023366
STR
295–360
IPR023366 IPR036388
IPR030392
CHP
2121–2172
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
2121–2208
IPR030392
XQU49958.1
1 2214
Architecture
STR
RBD
STR 1-1810 | RBD 1957-2214
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SCSM2R
[NCBI] 		3400247 Viruses >
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XQU49958.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ898602.1 [NCBI]
CDS location
range 30806 -> 37450
strand +
CDS
ATGCCTCTAAGTAGATTAGAAAATTTCCTAAAGAATGCTGAAGGTAATATTCTGTATGTAAACCCTTCAGACTTCGACGCCACGGATAGTTTTGAGAACAGAGGTAACTCTCTGACTAGACCATTCAAGACGATTCAGAGAGCGATTATCGAGTCCGCAAGGTTCTCGTTCAGAGCGGGTAGAAATAACGATAAGATTGATACTACAACAATCCTCGTCTATCCTGGAACCCACTATATTGATAATAGACCAGGTTATTCGATTCGTGATAACGGCGGAACTGCTGAAATCAAGAAACTTGTTGACAAGAAGTGGACCACAATTGGTGCATCTCTAACAGAATTTTCCGAAGATTCTAACTTTGATATCTTCGATGAAGACAACGATCTATTCCGTTACAACTCTACTGAAGGTGGTGTAATCCTACCTAGAGGTACATCTATTGTCGGTCTTGACCTTCGTAAGACTAAGATTAGACCACTATATGTTCCTGATCCACATGATGATCAGGTTCTCCCAACTTCTATCTTTAGAGTTACTGGTACCTGTTACTTTACTGCGTTTAGTATCTTTGACGCAGATCCTAACAGATCCGCATATAAAAATAGTTCAGATCTGAAGGTCAATCCTTCTTTCTCTCACCATAAACTTGCTGTATTTGAATATGCAGATGGTGTAAATGATGCGATCTTAGATAATGTTGATATGGGGATCACTGATCTCGATATGTACTATGCTAAGGTAACTTACGCATTTGGTTCTACATCTGGACGCCCTCTTGCCAACTATCCAGTAGGTAAAGACTTTGAACCTCTTGTTGATGAATATAGAATTGTTGGTGATCTTCGTGCTGATCCTATCGGTATTACCTCCATTAAGGCGGGTGATGGTGCTATTCCTACCACAACTATCACAGTCACCACTAGCGAGGCGCACGGACTCTTTAAGGACACGCCTATCCTCCTTAGTGGTATTACCACCAACCCAACTGTATATAATGGTTCGATTGTTGTTAGTGATGTTGTTAGCAACACTGAGTTTACCTATACTGCTAAGACCAACCCATCGAATCCACTACCTGCATCCTCTCAGATCTCCAATGCTCAGGTAGTTGTTGAATCTGACTCGGTATCTTCCGCATCTCCATATATCTTCTCATGTACTTTGAGATCCGTTTATGGTATGAACGGAATGATCGCTGATGGTAACAAAGCGACTGGATTCAAGTCGATGCTTACCGCTCAGTTTACGGGTATTTCTCTCCAGAAGGATGATAATGCCTTCATGGTATTTGATGACACTACCCAGATCTATAACGATAACGATACTGCTCCAGAAGAACAGAAACCATTACACATTAACTCCACTGCACTCTATAAGAGAGGTTGGGAATCTACACACGTTACTGCAAAGAATGACTCTATCATTCAGTGTGTTTCGATCTTCGCTATCGGTTTTGCAAGACACTTTGTTGCAGAAACTGGTGGTGACATGTCTATCACCAACTCCAACTCTAACTTCGGTGCAGTTGCTCTCGAATCAACTGGATTCAGAAACGAAGCATTCGATAGAGATGATGTAGGTTATATCACTCACATTATTCCACCAAGAGAACCAGATCCTCGTGAATCTAACATCACCTGGTTGTCTCTTGATGCAGAGAAGATTGTTTCTGCTGCAAAAACCGAAAGACTATATGTATTTGGATATAACTCTAAAGACGTTCCACCTTCTTCCCAGATTGACTCTTACAGACTGGGTGCAAAGAGAGGTGAAGAGATTAACCTAGAAGTTATTATTGGAACCGAGAAGAGTAACTTTAGATCTCCAGTTCTAATGCCAGTTCCTTCTGGTATTGGTACATCTTCACAGAAAGTTTATAGAGTCGGTAGAAATGCTGGTATCAATAGTATTTCCCAGTCTATCTTCACTCTGACTGATGATCACCAACTATTCAATGGTGAGAAAGTTCGTCTTGTCTCTGATACTGGTGAAGTTCCAAACAACGTTGAACAGGATAAACTATACTTTGCTTTCACAACTGGACTCAATGCAGACCAGATTAAACTTTCGTCCACTCTGAATGACACTATCAATGGTACAACCATTGGTGGTATTTCTAACAATGGTGGTGAACTTAGAATCGTATCCTTCGTTGCTGATAAAGATCCTGGTGAACTGGGTCACCCAATGCAGTTTGATGAGGATGAATCTCAGTGGTATCTGCAAGGTTCAAGTTCAACATTCTTTAACACCATCTATGATGGTATCGTAGGCATCGGAACTTCTATTCTAGGCAATCAAACTGGTGCAACATTCGTAACCAGAAGACTTGATAACAGAGGTCTAGAAGATCGTCTCTATAAGTTCCGTTATGTAATTCCAAAAGAATTCTCTAATGCAAGACCACCTTCTGATGGTTTTATTCTACAAGAATCTAACACAGTTGGTTTTGGATCTGCATCTTATCTGACATCTGCTCTTGCAAATACAACTCAACTTAGAAACCCAACCATCATTACTGATGCGAGTTATGTTGGACAAGAAGTAACAATTAGAACGGAACAACCACACCACTTTGTTGCTGGTGATACGGTTAAGATTCAGAATGTTAGATCTACTAACAACTTAACTTCTAACGTTCAGATTCCTTTCAATGGTGAATATCCAATCTACACTGTTCCTTCTACAAGAACATTTACGATTGCTGGTATTACCACTGACCCAGGAACATTCCTGAACGAAACGAACCAGAGAACCACACAACAACAGGTTGACGCTCTACCAACTGTACAAAGACTTAAGTATAAGGATTCCATCTTCGTCTATAGATCTCAAGAGATTAAGAGTCTAATCCCTGGTACTGATGGTCAGGATGGTATCTATCTTGTCACTCCTATTTGTGGATCTATCAAACCAATCGATGAGATCGGTTATGGTGTATCTGAAAGAAGATTCAATCAGGATGTTAGAAACCTCTATCCACAACAAGATAGAGACAACTACAACTCTGACCCTGAAGGAACAACTTCTCTTGCTAAGTTAAGTCCACTCGGTAAAGTTACCACAAACAGCAAACAGAAATCTGTTACTAAAGAAGCACTGAATTACTTCTTTGAGAATAACCAAATTGGTTATGCTATCACTGGTGGTGTTGTTTCTGGTGCAGGTAACACAACTCTAACAATCTTCCTTGATACTGAACACACTCTAAACTCCATTAAGGAACTATCCATCATCACTGATGGTGCTGGATATAACAACAATACTGGACTTTCAACAACTCTATACTCTACAGAACTTTCTAATAGTCTGATTGTTGGTTCTAATGCTGCAGTTCGTGCTGAAGTTTCTGCTGCAAATACAGTCAGTTCCGTTTCTATCGTTTCTGCTGGTGGTGCATATGCTATCGGTAACACGATGACAGTTTCTGCATCACCTGCTGGAGCACCAAGTGTTTCTGCTGTTGTTGAAGTTACTGATATTAACAATAACATTGGTGATGCTATTGAACTCACTGGATTCCCAGATGATGCTTTCAACGACATCTTTGAAATTAGAGAGATTCCATCAACAAAAGCGATTGTTCTTGAAAAGAGAGGATCTGTTGGTCTTGGAGTAACTTTCCCAGAAAGAAACGATGTAAGAAAACCTCTTGCATATGTCTCTTCTCCAAGAGTAGGTATTGCAACAGTTGACTTCACTGATGCAGTAGGTATTGCAACAGTAACAACATTAACTGCACATGGATTGCAACCAGGTAATACATTTACCTTCAGTGGATTTACTGCTGGTGGTGGTATTACCACAAATACTTTCTTCGAGAGAAAGTTCATTGCAAATGAAGTTCCAGGCATCACAACATTCATCTTTAATGCTGGAATTACTACTGAAAATCCAGAGAGAGATTTTGGCACTGCTGGTGTTCTTAAGTTTAACTTCTCCTCCAATGGTAGAGCACTTGGTCTGGGTGAAGAAAACCTGAATGGTAGAGGTTCCACATTCTACGCAGGTATTACTACAACACTGAGCACAATCGTAACCACTACTGATACAACAATCACTCCAACAGATACTGCTGGTTTCTATAAGGGTGATTATGTTCAGATTGGTGCAGAGATCATGCGTATCTCTAACAACGCATCTAGTGGAACGTTTGCTGTTCTAAGAGGTCAATTCTCTACGACTGCTGCAGTACACCAAGCAGATGAACTAATCAAGAAAGTTCGTGTTCTCCCAATGGAGATTCGCAGACACTCCATTCTTCGTGCATCTGCACATACATTTGAATACCTAGGATTCGGACCTGGTAACTATTCAACTGGTCTGCCACTTAAACAGGATAGAATCCTCACTGATGAGGAAGTTCTAGTATCTCAGGCAAGAGAACAAGATGGTGGAACTGTTGTTTACACCGCTATGAATGATCGTGGTGAGTTCTTCACTGGTGTTACTAAGATTAGTGCTGCAACTGGTGAAGAAGAAGTCATCGAGGCACCTATTGTTACTTACTTCGGTGATGACATTGAGTCCGAACTGACTAGAAGAAACAATGGTGTATTTGATGACCTAGTTGTTAAGAACAGAATCACAGTTGAAGGTGGTGAGAATAACAACCAGACCTCCCAGTTCTATGGTCCAGTCAACTTCTCCCAGAAAGTTACATCATCTTCTGAAGATGGTCTAGAGACTAAAGATCTATACATTAAGGGTCTTGCATCTCAACCAAAACTGATCACAGTTGGTATTTCTACACCTATTGATGCTAAGAGAGTTGGTGACATCTCTCTGCTTGCAACTCCTGATAAAGGTGGACACCTAGGACACATTTATGCCGATGGTGATTGGAGACGTTTCGGAATGATTTCCGAAGAGAAGAATCGTGACTTCTTAGTTATCGATCAGATGGGTATCGGTGAAAAAGGTGGTGTCTTTGACTTCACTGATGAACTTGAAGTTAATGGTAATGTCAAGGTCAAAGATCTCCGAGTTGAAGGTAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
35bd48af5fb49f3f3b4866a6927be4e3d73a131510629dec79304ad1462b04b1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7191
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Unveiling a novel broad-host-range cyanophage cross-infecting Prochlorococcus and Synechococcus hosts Wei,S., Cai,L., Zhang,R., Xu,Y. and Li,J. 2025-12-09 — GenBank