Protein

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Genbank accession
YP_004934529.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MSLSRKSTKFSRQIISGNNLKADKKGNIYTGELDIDPKEFASVLLSGSNAEALKNSTTFKFEVQGVISDVNDILILAETSKDFTFSGKINFVNDDYADSATFDFAYNKSNDYIKEGSFFSVAFKITLVDVTKGDKSYIGLKFDALGSYILEAVVSDSSQVVTLKSTEYESYSVSTFLSNSMFRSIPDIPKIGMAMRNVSGTVNSKNNKFYLYPGCAGENGLATGLTYPNEIGFSSETGCNNVFEYNPETNSWREMAPFPEALYMSSTVEYKPGKNMIINYGVRSIGIPVVGGSYFYIHDIENDTYERIPVSHQFFSTAACIVNDTIYVFCGRETAYVNSVPTTMVPFFGLYKYNLLTGEETYVANKYTAVFNENVANPTAFDQDSFNSSVYLPELNGIIFTAGIFRNNHKGTVLYKFDVATEEITKFMSFDFFLSVPKIIRSPINDNKLIMFTGVSGEFTTIPTVTGTGNGAYYTSAFRDIIEIDFNTKDYYYREKLPYPGFVCNGIGIFKDKRVILAGGCVNYGEGESFFFSDPDNKISTGLMHSNHAMIVDFNKSVIATNPNVLSRLIPLNDNCTIPNTPVANWYNTQSASTSSNKVYTILEKNKTAYLFDTVKYTWTVSPVPAVVNYRLNMKGGAAIDFDDEANTIYSATDPSEFSLQKINNFNSITGYSLVLLGSTAGTKDAADSSDRTLNKSTLFYFYSPDSGITWTAGKPYFKDNFYTSNDNNRILREYGNYFYNSTQNVFYMIGGKDEMSLNKSSGYGVYSVTSNSVTRYHDLIESSGSSIPLEKYAKYGSALVSISDTECIVFGGTTFDENGDKVYSSETFKLSLVNKGDTYLTPIYTQLQSIPIEFESEGWMRATKINTNEIVLYAGRAKNYSGTLVFKYYIDTNKFEMVTQTRCFALADLVKTPKGEFYIPFGMVKGSNGSISVTPPFKFINAAYKPKIKFTSFGISPVFTLGNRTETNDIFITASTKVLDSNDNIHYFGGVISGGAKSGESVFVNSHWKAKVTENSDGLFTLGTWQEDTIPSSLCQNWSNGVAKTLPDGRIVLIGGLWDLSSASTDLQTNPIKYMRSTLTIFDPVTNTYTEKQPTYINNPLSVNVKFINGTMISLTNNPDEILIFGGYKYWSTVTDYHANTCFNKVFKYSISANTLTYLGKLSITDNPDMAISPFRNYAAVADNGTLFCFSSDNLSPDAMGNTGKILNNQVTVFDTLTNTTDEADANGLFKTIDLTKSESVIPAALLESGRVRPTYINLTGIKHSNGNFYIFPWVETKSTITAGIFNPYNKKYNTGIPWQLISVPIEANKMIAPVTTALSTSTGIFSSDDSAYPEMFELKSGKIIVLPGMFGSRLNKSVYINGLGMFVVIS
Physico‐chemical
properties
protein length:1372 AA
molecular weight: 151921,15450 Da
isoelectric point:5,36136
aromaticity:0,13120
hydropathy:-0,17901

Domains

Domains [InterPro]
IPR015915
STR
152–431
IPR015915 IPR015915 IPR015915
IPR011043
STR
196–523
IPR011043 IPR015915
YP_004934529.1
1 1372
Architecture
STR
STR
STR
STR 152-523 | STR 638-934 | STR 973-1294 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_004934529.1
1 1372
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 10 10 0,5310
Central domain 11 884 875 0,9455
C-terminal 885 1372 487 0,0447
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-10
Central
11-884
C-terminal
885-1372

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage phiR1-37
[NCBI] 		331278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Yersinia enterocolitica
[NCBI] 		630 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_004934529.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_016163 [NCBI]
CDS location
range 213715 -> 217833
strand -
CDS
ATGTCTTTATCCAGAAAATCTACTAAGTTTAGTAGACAAATAATCTCTGGCAATAACCTGAAAGCTGATAAGAAAGGTAATATTTATACAGGTGAGCTAGACATAGACCCCAAAGAATTCGCATCGGTGTTACTTAGTGGAAGTAATGCAGAAGCACTAAAAAATTCCACTACTTTTAAATTTGAAGTACAAGGTGTTATCTCAGATGTAAACGATATTCTTATACTTGCTGAAACAAGTAAAGACTTTACATTCTCAGGTAAGATTAACTTTGTAAATGATGATTATGCAGATTCAGCTACATTTGATTTTGCATATAACAAATCAAATGACTATATTAAAGAAGGTTCTTTCTTCTCTGTAGCATTTAAAATTACTTTAGTAGATGTTACTAAAGGTGATAAATCTTATATAGGCTTAAAATTTGATGCTTTAGGAAGCTATATACTGGAAGCTGTTGTATCTGATTCATCACAAGTAGTTACATTAAAATCTACTGAATATGAATCATATTCAGTAAGTACTTTTTTGAGTAATTCTATGTTCCGTAGCATACCAGACATTCCTAAAATTGGTATGGCTATGCGAAATGTATCCGGTACAGTTAACTCAAAAAATAATAAATTTTATCTTTATCCTGGTTGTGCTGGTGAGAATGGATTAGCTACTGGTTTAACATATCCTAATGAAATAGGATTCTCTAGTGAAACTGGTTGCAATAATGTTTTCGAATACAATCCAGAGACAAATAGTTGGAGAGAAATGGCTCCCTTCCCAGAAGCTTTGTATATGTCTAGTACTGTAGAGTACAAGCCTGGTAAAAATATGATCATAAACTATGGGGTGCGCTCAATAGGGATTCCCGTAGTCGGTGGTAGTTATTTCTATATACATGATATAGAAAATGATACATATGAAAGAATACCTGTATCTCATCAATTCTTTTCCACTGCAGCCTGTATAGTAAATGATACAATTTATGTCTTTTGTGGCAGAGAAACTGCTTATGTAAACTCTGTTCCGACTACAATGGTTCCTTTCTTTGGGTTATATAAATATAATTTATTGACTGGTGAAGAAACTTATGTAGCTAATAAATATACAGCCGTATTTAATGAAAACGTTGCAAATCCTACTGCCTTCGATCAGGATTCATTTAATTCATCTGTATATCTACCGGAGCTAAATGGTATAATATTTACTGCTGGTATTTTTAGAAACAACCATAAAGGTACAGTTTTATATAAATTTGATGTAGCTACTGAAGAAATTACAAAGTTTATGAGCTTTGATTTCTTCCTGTCGGTGCCAAAGATTATTCGTTCTCCTATAAATGATAATAAACTTATAATGTTTACTGGCGTAAGTGGGGAATTTACTACAATACCCACTGTTACCGGAACTGGTAATGGAGCTTACTATACTTCTGCATTTAGAGATATTATTGAAATAGATTTTAATACTAAAGATTATTACTATAGAGAAAAATTACCATACCCAGGCTTTGTATGTAACGGTATAGGTATTTTTAAAGATAAACGAGTTATTCTTGCTGGTGGTTGTGTAAATTATGGTGAAGGGGAATCTTTCTTCTTTTCTGATCCTGATAATAAGATATCTACAGGTTTAATGCATTCTAATCATGCTATGATTGTAGATTTTAATAAGAGTGTAATAGCAACTAACCCAAATGTTTTATCTAGATTAATTCCATTAAATGACAATTGCACTATACCAAATACCCCTGTAGCGAACTGGTATAATACTCAATCAGCTAGTACATCTAGCAATAAAGTTTATACTATTCTTGAAAAGAATAAAACTGCCTATTTATTTGATACAGTTAAATATACTTGGACAGTTTCACCAGTTCCAGCAGTGGTTAATTATAGACTTAATATGAAAGGTGGAGCGGCTATAGATTTCGATGATGAAGCGAATACTATTTATAGTGCAACTGATCCATCTGAATTTTCTCTACAGAAAATTAATAATTTTAACAGTATAACTGGTTATTCGTTAGTTCTCTTAGGTAGTACGGCTGGCACTAAAGATGCTGCAGATTCCAGTGATAGAACTCTGAACAAGAGTACATTATTCTATTTTTATTCTCCAGATTCTGGTATAACTTGGACTGCTGGCAAACCTTATTTCAAAGACAATTTCTATACTTCTAATGATAATAACAGAATATTGAGAGAATATGGCAATTATTTCTATAATTCTACTCAAAATGTATTCTATATGATTGGTGGTAAAGATGAAATGTCATTGAATAAATCTTCAGGATATGGAGTTTATTCAGTTACAAGTAACAGTGTCACTCGTTACCATGATTTAATTGAGAGTAGCGGCAGTTCAATACCTTTAGAGAAGTATGCTAAATATGGTTCAGCTTTAGTATCTATATCTGATACTGAATGCATTGTATTCGGCGGTACTACTTTTGATGAAAATGGCGATAAAGTTTATTCATCTGAGACCTTCAAGCTATCTTTAGTAAATAAAGGTGACACTTATCTAACCCCTATCTATACTCAATTACAATCCATTCCTATTGAATTTGAATCAGAAGGGTGGATGCGAGCTACCAAAATCAACACAAATGAGATTGTTTTGTATGCTGGTAGAGCTAAAAATTATAGTGGTACCTTAGTATTTAAATACTATATTGATACTAATAAATTTGAAATGGTTACGCAAACTAGATGTTTTGCATTAGCCGATCTAGTTAAAACGCCTAAAGGTGAATTTTATATACCATTTGGTATGGTTAAAGGATCTAATGGTTCAATTTCAGTTACTCCTCCTTTTAAATTCATTAATGCTGCATATAAACCTAAAATTAAATTTACTTCATTTGGGATTTCCCCTGTATTTACTTTAGGTAATCGTACTGAAACAAATGATATTTTTATAACAGCCAGTACTAAAGTTTTAGATTCTAATGATAATATACATTATTTTGGCGGGGTAATTAGTGGAGGGGCTAAGTCTGGTGAATCTGTTTTCGTTAATAGTCATTGGAAAGCTAAAGTTACTGAAAATTCAGATGGTTTATTTACTTTAGGTACTTGGCAAGAAGATACTATACCTTCTTCTTTATGTCAAAACTGGTCAAATGGTGTAGCTAAGACCCTACCAGATGGAAGAATTGTTTTAATTGGAGGTTTATGGGATCTCAGTAGCGCTTCTACTGATTTACAAACTAACCCTATCAAATACATGAGAAGTACTTTAACTATCTTCGATCCAGTTACTAATACTTATACTGAGAAGCAGCCAACTTATATTAATAATCCATTAAGTGTTAATGTTAAATTTATCAATGGCACTATGATATCTTTGACTAATAACCCTGATGAGATTTTGATATTTGGTGGGTATAAATATTGGAGTACTGTTACAGATTATCATGCAAACACTTGTTTTAACAAAGTATTTAAATATAGTATTTCAGCCAATACCTTAACATACTTAGGTAAATTATCAATTACTGATAACCCTGATATGGCAATTTCACCTTTCCGAAATTATGCGGCTGTTGCTGATAACGGTACGCTTTTCTGCTTTAGTTCAGATAATTTATCACCTGATGCTATGGGGAATACTGGTAAGATACTCAATAATCAGGTAACTGTTTTTGATACATTAACTAATACTACTGACGAAGCCGATGCCAATGGGTTATTTAAAACTATTGATCTTACTAAGAGTGAATCAGTTATACCAGCAGCTTTACTTGAATCTGGTAGAGTAAGACCTACTTATATTAACTTAACCGGTATTAAACATAGTAATGGTAACTTCTATATTTTCCCTTGGGTAGAAACTAAATCAACTATAACGGCTGGTATTTTCAATCCTTATAATAAGAAGTATAATACCGGTATTCCTTGGCAGCTTATTAGTGTACCTATTGAAGCAAATAAAATGATAGCTCCTGTAACTACAGCCCTTTCTACATCTACAGGTATTTTTTCTTCAGATGACTCAGCTTATCCAGAAATGTTTGAGCTTAAGTCAGGTAAAATAATTGTTCTTCCAGGAATGTTTGGTAGTCGTCTAAATAAATCCGTTTACATAAACGGATTAGGTATGTTTGTTGTAATATCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
2e115b19c775211ed68b6d5c5735cdbe5f7cf20e46ccf1b72641be74dd97ac89
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5611
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50