UniProt accession
E3SMR8 [UniProt]
Protein name
Baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,61
Protein sequence
MTNSSWRVGSWTTPTTTVTQPPVPSEVSPESRSKISTHIAGQFPTFIRDEFPTFIDFVKEYYKSQELKGYCIDIIQNWSDYYNIDNYGDLVTTTTLISEVTTSSTTIDVESTRDFPSEGLLLINDEIIYYQSKGATLFQTCARGFNAVRAVGIEADYRFESTTAAHHTLGTEVVNLNNIFPLYMLGKFKEQFLATYPKNFADGVTESTIIKRIKDFYSSKGTGRSFQFVLRTLFGVESQVSYPRERIFKPSDAFYTSREIIRATPVSGNPIELVGQVLYQEADANDPNVDSARIYVKGVVEVFTSSGTIYEIDVDTNNSLGSFVTPYKTVLSQDLGQELIDTTVTVDSTLGWPELNGKFRIEDEIISYTDKTVTQFLGCTRAIAPTVNVAHDAGQEVFAAFKIFGYSNVDGSEIQLKVFGGTRGVKLNSGGKYYLPDSKVTTPAAPGFDSLDPIWDSFIYNVRRALRGDSATLGQVETDGSVRCTIVTKEKHRLVRDDTIRILNAPEDIYNNNHIVVGIVDEFTFEFIFSSTPAFGISGFEFYIAREFAFGRSDDTSINLAVRNTTGDVQNTYKSDTDAIIASTGIPTHKIGPFAATDLDPGNQRYLKRIPLVPTIKSQKTATPVGQIGIGANGVPLFSYKSESKKKYGGIKSIETVNGGSGYDITNPPTVQFEPTYQLDTTYAGLTRVQYNGNRYQAINAGKSSATQYPVHTIGQVLVGEVEWLYEGSTASADVSITGSVTSINVTSGGSGYTTEPIVSIVGGGAVSGQQAFATAQITDGSVTGINIVNGGSGYTSVPTVSISGGGGSGATASAVCRGPIESIDITNAGTQYTYEPTINLISGSGAVAYPSIINGKIESIIVTFGGSAYFGPPDVIITGDGVGATAFATVDLSTNIVTGITVSSKGIGYTAGSTRVSIVYPGSGAIFQTRLTELSINEAATGNELGSNTFVSPKTTDPYGGACFQGENFLIYSGEYGYLYNPKQIRFLLKDSIGLDVNQQLQELPPTVHSPIIGWAYDGHPIYGPYGYVDPENKAPFNEYKRIRSSYRVKTGRDALLSGLSDPLGTYIEDYEYVEGLGDLDRYNGRFCVTPEYPNGVYAYFTTITGTDGFPAFPYFIGPDFYGEANSVNWNGNGLQKNFTEDAIRYRAPFVGVDNIVAKRKVLDNKVDFFLALEDSTTLIIMETGETLTYIEDGIGYYSYYPFVRGGTADSLVVSATNKYSSAGVDQYLVEGGGKEYKVNDRLEFDNTGTGGEGVSATVAQVQGADTTSVAVASDSNTDVYTATVTTSVSHLLQPNDSVNVSVTDNTFTRTITSKSINGNYHFKYFALKSMKLLDAWASGVAYVQGDLVHVANRVYVAASSGTSGASTLTHTSGTTTDGDVSWTYLRIRTDGNLFQDGWASITGGSNYANGTYLNVPIKSVTGDGLGAKATILVQSNAVTEVTITDFGYGYDIGDEISADNINLGNAVGGTGFSITLTQVQREVQCHVAAGLDSHQLKAGDLVNISGVSPTDYNKANYIVVRTESLKKFTVKRNFAAVAAANVTSGNSGAAAEVYINEPNISLILGHSYIFDTSDTSNNGKLLSFTLDPDNTDVLTYKNVIDEVRDEITDEQDSITLKMVDLPGIFYYHDVKHENVSPRTYTVIVQAKTTSHPYYNYGSGNGYYITGDKYGSVTESPAIAMSRGLTYTFNQTAASNNTHAIYFSESEDAKGGVNRYEKGVVYRINGDPVGWDEYNSQFSLASTLSRSVEITPAVDSPNTLYYVCQNHLAMGNAINVQSDVSSSRFFNVINDPVLGSQIVTEVTSNTYKYTMAVAPEIGYSTGVSYSTNSIYPSGGISTITIGDQGRNYQSLPKLSGSSRSGSGAVATATISGGLSNVSITNQGSGYNQGIPPTCVVTLPDFIDITLENVLGNFLPNEIVISKEKIDNSTARGKVLSWNPITSVLRIQPLQNTRTGAGQKGYIMFDSGTSFSINPSQIDAVGYADHFEFASHNAKTGDPVLYVSAETAAVSNMTVGQTYYIIDVGDANRVKLAETPQLAEAGTAITITNSGTDTQVFLLRSRIYTGGSTVAVINSLSGTQSVVTPVISGLGKVLEVNINTAGTNYRAAPNVIFDDPYFGTISTVSIQSQTDTAYTASQTFTNIAQKSIAGTSATGARFTVVTDSSGTITSVTVTDGGTAYNIGDDITLGGADLGGTDGTHDVVLDMATMIYPDVVSTATLLDASLDSITVTNSGSGYLSAPTITAQGGNGINASLNALIVNQGVSNIQIEAAGQQFQSAPIINIEQKTGSGASILLKSSNLGEILKISGDNITFNYSHDRTLKPNLNTTYNLQLIRTQIIDYFDVINGGANFVSQPEILLEGGQGSLFELEPLILNEVIQSVIVNNPGRGFTSAPTVKARVAHSFVALNSNSTLNFPYNAKIPTGTKVNLVQVTGILPPPFVEGTTYYAVAATTANGLANNQIKLATSLANANTETTIAMTGPPLGDPLTGQTVFQLQTTDLGDNIVAYMKPATFSIGERIYQGASTSSYTAYGVIKNWDASGRVVSVELIEGDFVVGQPVFGEESAAFGQIHAYDRADANFEVSPISTSSANWEKTTGFLDLNEQRVYDSNRFQEFSYDISSSINISDWRNPLKFAAHPAGFKVVGTQVLLQSVKKDYRPRSITNQSPSTDYDWWIQQTNSVGTTFNGTTFITPKPSSKRTAKLATINNFALSKPDYTALVPTEVSIYGKQLLDVQKILSCISYKIDNVSDRTVTFDGSSSSIVDGATDRITITNHAFVANQLVTYTSGGDRFLDARDLIVNNIDYIIEESIGFLNATYPSLNLDPTLLGKCARDTRLVVAAWTNDLKYGGNYFSRDAAEQYTNGTNVQHVQGEESETVATFNKARDLCLLAVTNDLPVGTYTNIVPQTDLSITNDAGGCADVKSAINTLAGIVTNAISNPTDALPTQDIGNYPNNRYNTPIGGLSNNGQYYIRYVDANTIELSATFNGSAIDLTSQGGGIGHSLRCFVDGTNNQFRLQCDGVDLDTKIGKTAATSQLLLSVNGLIANPETYTLANSIVTFVTPPLSETRIIAMYFDRSSYTDSFVLDQIGDEVKTLGTGYSGTGTHTFVSGSTNGIVDNNGAFYTAQTGTTYDPLTGLMEVEIGSHSLTTSNKVAFGVGVVTFTCDADNHASEHSYPRTGDPVGNAAIVDIEAVTSTTITVNVGISNDEPNELAPGNGYSDYTYAAVPLKNRLGGGVGVTANITVTGGKVTNAKVVSGGNGYNNTDVLGIADPRVGEQFVKHFIPTNGTYTPADGQMVLTIGAGHNLSAPTTHTPTFATYDPNTGLMVVTIANHGRVNGDQVKFDDGAIRFSCTYSGGGNGDYPRSTDYASDRWLQVFDCTTNTFTVQVLDSIPSTDLSPHTYVSAVTNSVKFAVSTVRIANESLRFSCNYGSGGTAAYPRATDPIGTQGKMRDIPVEAVASTTITVNALNGTAPTNTDAHTWEGLSTYQFQPTGIDYTPTTGEMVLTLNGHPFIKGDRIQFATNSLSFTCAKDNNATTHTYPRVGDPAEGAWHTIDAVTTNTFTVFVGESSDTSAHTFTGATSTAITRAVVSYGVNKYSKFADAGNLLRQNQNFIATTAYGRMQADNPSFSTIYKTKCIRDTNLLIDAVADNVEFGGNDATYDAANFYVGTVHLSGEEGQSVQVFNHARDICRQVMRNLTVTTNSDTVGTQIKDNTISNDSGSTTYSEACCIDVASTITTLWGIVTQAVGTGAHTWAGGTASNAVQSGGNYVHTFVSAVPNGVTSNVGNLPNPVTGVAYTPNTGNMVITSNAHNLTTSNTLTIADNALSFTCTMDGNTATKTYPRSTDPVSGQTITITQTTTNTITVNVGASPIVNHDVTNATYDNNTGVLVLTIGSHSLTTGTSVKIANGSLSFTCENDNNTSVKTYPRPSDPYYDTAINIDAVGADSITLNVGTNTGNLNGITRTASQQPSFQIGVSDVAFDGTDKTFTMQSGGSTQVLPASDNFLIFLNSTLQLKGTTQAYTYTGSQVTFSEAPLAGMDFYGFYFGKLTQLDEIAPFFDNKKKTFTMKENTEPFSLESDNAAVEAQNNLIIFLNGVYQEPGVAYQLTGSIIEFSEAPRAGSDCTLFIYTGSASDILVSNTFNSIDPEDRVQISSEGSDRRVATISSSTTIDSYEYTGLRPTVAEFTATVTGGQVTQVTITNPGSNYEVPPILLFQGGGGEGAAAETVIEVGSGRVLSVINLNGGSGYTSAPTVLAVHPLALERKQRDRIISNSLSLGGSYLSQTLSAGGTTINLKNVYFNSSQKAGFPDEGEVLIPFYNTTVTPPVWTCERILYGSKDISNNTLTVATGGRGFEGTTAAAHPVITGTYSSTGTTCTVNTSTDHNLVTGQRFYLDFTTGTGFDGLYTVTVSTATQFTVEFPFSRTASGDVSLLPEVRLRSL
Physico‐chemical
properties
protein length:4446 AA
molecular weight: 474882,06040 Da
isoelectric point:4,75836
aromaticity:0,09334
hydropathy:-0,16149

Domains

Domains [InterPro]
E3SMR8
1 4446
Architecture
ATT
ATT
STR
STR
RBD
STR
ATT
RBD
STR
STR
RBD
ATT 33-247 | ATT 250-505 | STR 508-808 | STR 835-1201 | RBD 1202-2010 | STR 2025-2193 | ATT 2194-2884 | RBD 2943-3244 | STR 3245-3596 | STR 3611-3881 | RBD 3882-4446
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-HM1
[NCBI]
445700 Uroviricota > Caudoviricetes > Eurybiavirus >
Host Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986
[NCBI]
59919 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > Prochlorococcus marinus

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98711.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071101 [NCBI]
CDS location
range 46129 -> 59469
strand +
CDS
ATGACCAATAGTTCTTGGAGAGTTGGATCGTGGACGACGCCCACAACAACGGTTACACAACCACCTGTACCGTCGGAAGTCAGTCCAGAGTCGAGATCCAAAATATCAACGCATATCGCAGGACAATTCCCTACTTTTATAAGGGATGAGTTTCCTACGTTCATTGATTTTGTCAAGGAATACTATAAGTCACAAGAATTAAAGGGATATTGCATTGATATAATTCAAAACTGGTCAGATTATTACAATATTGACAATTATGGAGATTTAGTTACTACTACAACACTAATTTCTGAGGTTACAACGTCTTCTACAACGATTGACGTTGAATCTACACGTGATTTTCCTTCAGAAGGACTATTATTGATAAATGATGAGATAATTTACTACCAAAGCAAGGGTGCAACGCTATTTCAGACTTGTGCAAGAGGATTTAACGCTGTAAGAGCAGTTGGAATAGAAGCAGACTACAGATTTGAGTCTACAACTGCTGCTCATCACACTTTAGGCACAGAAGTTGTCAATTTGAACAATATTTTCCCGCTTTACATGCTCGGAAAGTTCAAAGAACAGTTTTTAGCGACATATCCAAAGAATTTTGCAGATGGTGTTACAGAAAGTACCATAATTAAGAGAATTAAGGACTTTTACTCTTCAAAAGGAACAGGAAGGTCATTCCAGTTTGTTTTGAGGACACTTTTTGGTGTTGAGTCTCAAGTGTCTTATCCTAGAGAGCGAATATTCAAACCTAGTGACGCATTTTACACTTCTAGAGAAATTATTCGTGCAACTCCTGTAAGTGGTAACCCAATTGAACTTGTTGGGCAAGTATTATACCAAGAAGCAGATGCAAACGACCCAAATGTCGATTCTGCAAGAATTTACGTAAAAGGAGTTGTAGAAGTCTTTACATCAAGCGGAACAATCTATGAAATTGACGTAGATACCAATAATTCACTTGGATCTTTCGTAACTCCGTATAAAACAGTATTATCACAAGATTTAGGGCAAGAATTAATTGATACTACAGTTACAGTTGACTCTACACTCGGTTGGCCTGAATTAAACGGTAAATTTAGGATAGAAGACGAAATAATCAGTTATACAGACAAAACAGTTACACAATTCCTTGGATGCACCCGTGCAATTGCTCCAACAGTCAATGTAGCACATGATGCAGGGCAAGAAGTGTTTGCTGCGTTTAAAATCTTTGGATATTCAAATGTAGATGGTTCTGAGATACAATTAAAGGTATTTGGAGGGACTAGAGGAGTTAAACTGAATAGTGGTGGAAAATACTACTTACCAGACTCAAAAGTTACAACTCCTGCAGCACCTGGCTTTGATAGTCTTGATCCTATATGGGATTCGTTCATATACAATGTTAGACGTGCTCTCAGAGGCGACTCAGCGACCCTAGGACAGGTAGAAACCGATGGATCGGTAAGATGCACCATAGTTACAAAAGAAAAGCATAGATTAGTTAGAGATGACACTATTAGAATATTAAATGCTCCAGAAGACATTTACAACAATAATCATATCGTAGTTGGTATTGTTGATGAATTTACTTTCGAGTTTATCTTCTCATCAACTCCTGCATTCGGTATTTCTGGATTTGAGTTTTATATTGCTAGAGAATTTGCTTTTGGTCGTTCTGACGACACTTCTATCAACTTAGCAGTTAGAAATACTACAGGAGACGTTCAAAACACATATAAGTCAGATACTGATGCAATAATCGCTAGTACAGGTATACCAACACACAAGATAGGACCTTTTGCTGCTACAGACCTAGATCCTGGCAACCAAAGGTATTTAAAACGTATTCCTCTTGTACCAACTATTAAATCACAGAAAACTGCAACTCCTGTGGGTCAGATTGGTATTGGTGCAAATGGTGTCCCACTATTCTCATATAAGTCTGAAAGTAAGAAAAAGTATGGTGGTATAAAATCTATTGAAACCGTAAATGGAGGATCTGGTTATGATATTACAAACCCTCCTACTGTGCAGTTTGAACCAACATATCAACTAGACACAACATATGCAGGATTGACTAGAGTACAATATAACGGAAATAGATACCAAGCAATCAATGCGGGTAAATCTTCTGCAACTCAATACCCAGTTCACACAATAGGTCAGGTATTAGTCGGAGAAGTGGAGTGGTTATATGAAGGAAGCACTGCATCTGCTGATGTTAGCATTACAGGTTCCGTAACTTCTATCAACGTTACTAGCGGAGGAAGCGGATATACTACAGAACCTATTGTGTCAATCGTAGGTGGTGGTGCGGTAAGTGGACAGCAAGCGTTTGCTACCGCACAAATTACGGATGGTTCCGTAACTGGTATTAACATTGTTAACGGAGGAAGCGGATATACGAGTGTTCCTACTGTATCAATATCTGGTGGTGGTGGATCTGGTGCAACTGCATCCGCAGTTTGTAGAGGTCCTATTGAGAGTATCGACATTACTAACGCAGGAACGCAGTATACTTACGAACCAACTATCAATCTAATCAGTGGTAGTGGTGCTGTTGCGTATCCATCAATTATTAATGGAAAAATAGAGAGTATAATTGTTACATTTGGTGGTAGTGCATACTTCGGTCCTCCAGACGTTATCATTACAGGAGACGGAGTTGGTGCTACTGCTTTTGCTACTGTTGACCTAAGCACCAATATTGTTACTGGTATTACCGTATCAAGTAAAGGTATTGGATATACTGCGGGTTCTACAAGAGTTAGTATTGTATATCCTGGTTCTGGTGCGATATTCCAAACTAGACTTACAGAACTATCAATAAACGAAGCAGCAACAGGAAATGAACTAGGCAGTAATACATTTGTATCACCCAAGACTACAGATCCTTACGGAGGTGCATGTTTCCAAGGTGAGAACTTCCTTATCTACAGTGGAGAATACGGATATCTTTATAATCCAAAACAGATTAGATTCCTACTTAAAGATAGTATTGGTCTAGATGTAAATCAACAGTTACAAGAATTACCTCCTACTGTGCACTCTCCTATTATCGGTTGGGCATATGACGGACATCCCATTTACGGACCTTACGGATACGTAGATCCAGAAAACAAAGCACCATTCAATGAATACAAACGTATTAGAAGTAGTTACAGAGTAAAGACTGGTAGAGATGCTCTTCTAAGCGGTCTCAGTGACCCTCTAGGGACTTATATTGAAGATTATGAGTATGTGGAGGGATTAGGTGATTTAGACCGATATAATGGTAGATTCTGCGTCACTCCAGAATATCCAAATGGAGTATACGCTTACTTTACAACAATTACAGGTACAGATGGTTTCCCTGCATTCCCATACTTTATAGGACCTGATTTCTATGGAGAAGCAAATTCGGTAAACTGGAATGGTAATGGATTACAGAAAAACTTCACAGAAGATGCAATACGTTATAGAGCACCATTTGTGGGTGTTGATAACATTGTTGCAAAAAGAAAAGTATTAGACAATAAAGTTGACTTCTTCCTCGCATTAGAAGATAGCACAACTCTTATTATCATGGAGACTGGTGAGACACTTACATACATTGAAGATGGTATTGGTTATTATAGTTACTATCCATTTGTAAGAGGTGGAACTGCGGATTCTCTAGTTGTCTCCGCAACGAACAAATATTCCTCAGCGGGTGTTGATCAGTATCTTGTAGAAGGTGGTGGTAAAGAGTATAAGGTAAACGATAGATTAGAGTTTGATAATACTGGAACTGGAGGAGAAGGTGTAAGTGCTACTGTTGCACAAGTTCAAGGTGCGGATACAACTTCAGTAGCGGTTGCTTCTGATTCAAATACAGATGTTTATACAGCAACTGTTACAACTTCCGTTAGTCATTTACTACAACCAAATGATTCTGTTAATGTTTCCGTAACAGACAACACATTTACCAGAACAATAACGAGTAAATCTATTAATGGTAATTATCACTTCAAATACTTTGCTCTAAAGAGTATGAAGTTACTAGATGCATGGGCATCAGGTGTAGCATACGTGCAGGGAGATTTAGTTCATGTTGCAAATAGAGTATACGTTGCAGCAAGCAGTGGCACATCTGGAGCAAGTACACTCACACATACATCTGGAACAACAACGGACGGAGATGTATCGTGGACATATCTTAGAATTAGAACAGATGGTAATTTATTCCAAGATGGTTGGGCAAGTATTACAGGTGGAAGTAATTACGCAAATGGCACATACTTAAATGTTCCAATCAAATCTGTTACTGGTGATGGATTAGGTGCAAAGGCAACTATTCTGGTTCAGAGTAATGCGGTAACAGAAGTTACAATTACAGACTTTGGATATGGATATGATATTGGAGATGAAATATCTGCAGATAATATAAACCTTGGAAATGCAGTTGGTGGAACTGGATTCTCAATAACACTAACTCAAGTTCAAAGAGAGGTTCAATGTCATGTAGCAGCAGGACTTGACTCGCATCAACTTAAAGCAGGAGATTTAGTTAACATCTCAGGTGTATCACCTACTGATTACAATAAGGCAAATTATATTGTTGTAAGAACAGAAAGTCTTAAGAAATTTACCGTCAAGAGAAACTTTGCTGCTGTTGCTGCTGCAAACGTTACTTCTGGTAATAGTGGAGCTGCTGCAGAAGTTTATATCAATGAACCAAACATATCTCTGATATTAGGACATTCATATATCTTTGATACCTCTGACACAAGTAATAATGGAAAGTTGTTATCATTTACATTAGATCCTGATAATACAGATGTATTAACTTACAAAAACGTCATTGATGAAGTTAGAGATGAAATAACAGATGAGCAAGACTCAATAACACTCAAGATGGTAGATTTGCCTGGCATATTCTACTATCATGATGTAAAACATGAAAATGTATCACCACGAACATATACAGTTATTGTTCAAGCAAAAACAACTAGTCATCCATATTACAATTACGGATCTGGTAATGGGTATTACATAAC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Genome Context

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Tertiary structure

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