Protein
View in Explore- UniProt accession
- E3SMR8 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTNSSWRVGSWTTPTTTVTQPPVPSEVSPESRSKISTHIAGQFPTFIRDEFPTFIDFVKEYYKSQELKGYCIDIIQNWSDYYNIDNYGDLVTTTTLISEVTTSSTTIDVESTRDFPSEGLLLINDEIIYYQSKGATLFQTCARGFNAVRAVGIEADYRFESTTAAHHTLGTEVVNLNNIFPLYMLGKFKEQFLATYPKNFADGVTESTIIKRIKDFYSSKGTGRSFQFVLRTLFGVESQVSYPRERIFKPSDAFYTSREIIRATPVSGNPIELVGQVLYQEADANDPNVDSARIYVKGVVEVFTSSGTIYEIDVDTNNSLGSFVTPYKTVLSQDLGQELIDTTVTVDSTLGWPELNGKFRIEDEIISYTDKTVTQFLGCTRAIAPTVNVAHDAGQEVFAAFKIFGYSNVDGSEIQLKVFGGTRGVKLNSGGKYYLPDSKVTTPAAPGFDSLDPIWDSFIYNVRRALRGDSATLGQVETDGSVRCTIVTKEKHRLVRDDTIRILNAPEDIYNNNHIVVGIVDEFTFEFIFSSTPAFGISGFEFYIAREFAFGRSDDTSINLAVRNTTGDVQNTYKSDTDAIIASTGIPTHKIGPFAATDLDPGNQRYLKRIPLVPTIKSQKTATPVGQIGIGANGVPLFSYKSESKKKYGGIKSIETVNGGSGYDITNPPTVQFEPTYQLDTTYAGLTRVQYNGNRYQAINAGKSSATQYPVHTIGQVLVGEVEWLYEGSTASADVSITGSVTSINVTSGGSGYTTEPIVSIVGGGAVSGQQAFATAQITDGSVTGINIVNGGSGYTSVPTVSISGGGGSGATASAVCRGPIESIDITNAGTQYTYEPTINLISGSGAVAYPSIINGKIESIIVTFGGSAYFGPPDVIITGDGVGATAFATVDLSTNIVTGITVSSKGIGYTAGSTRVSIVYPGSGAIFQTRLTELSINEAATGNELGSNTFVSPKTTDPYGGACFQGENFLIYSGEYGYLYNPKQIRFLLKDSIGLDVNQQLQELPPTVHSPIIGWAYDGHPIYGPYGYVDPENKAPFNEYKRIRSSYRVKTGRDALLSGLSDPLGTYIEDYEYVEGLGDLDRYNGRFCVTPEYPNGVYAYFTTITGTDGFPAFPYFIGPDFYGEANSVNWNGNGLQKNFTEDAIRYRAPFVGVDNIVAKRKVLDNKVDFFLALEDSTTLIIMETGETLTYIEDGIGYYSYYPFVRGGTADSLVVSATNKYSSAGVDQYLVEGGGKEYKVNDRLEFDNTGTGGEGVSATVAQVQGADTTSVAVASDSNTDVYTATVTTSVSHLLQPNDSVNVSVTDNTFTRTITSKSINGNYHFKYFALKSMKLLDAWASGVAYVQGDLVHVANRVYVAASSGTSGASTLTHTSGTTTDGDVSWTYLRIRTDGNLFQDGWASITGGSNYANGTYLNVPIKSVTGDGLGAKATILVQSNAVTEVTITDFGYGYDIGDEISADNINLGNAVGGTGFSITLTQVQREVQCHVAAGLDSHQLKAGDLVNISGVSPTDYNKANYIVVRTESLKKFTVKRNFAAVAAANVTSGNSGAAAEVYINEPNISLILGHSYIFDTSDTSNNGKLLSFTLDPDNTDVLTYKNVIDEVRDEITDEQDSITLKMVDLPGIFYYHDVKHENVSPRTYTVIVQAKTTSHPYYNYGSGNGYYITGDKYGSVTESPAIAMSRGLTYTFNQTAASNNTHAIYFSESEDAKGGVNRYEKGVVYRINGDPVGWDEYNSQFSLASTLSRSVEITPAVDSPNTLYYVCQNHLAMGNAINVQSDVSSSRFFNVINDPVLGSQIVTEVTSNTYKYTMAVAPEIGYSTGVSYSTNSIYPSGGISTITIGDQGRNYQSLPKLSGSSRSGSGAVATATISGGLSNVSITNQGSGYNQGIPPTCVVTLPDFIDITLENVLGNFLPNEIVISKEKIDNSTARGKVLSWNPITSVLRIQPLQNTRTGAGQKGYIMFDSGTSFSINPSQIDAVGYADHFEFASHNAKTGDPVLYVSAETAAVSNMTVGQTYYIIDVGDANRVKLAETPQLAEAGTAITITNSGTDTQVFLLRSRIYTGGSTVAVINSLSGTQSVVTPVISGLGKVLEVNINTAGTNYRAAPNVIFDDPYFGTISTVSIQSQTDTAYTASQTFTNIAQKSIAGTSATGARFTVVTDSSGTITSVTVTDGGTAYNIGDDITLGGADLGGTDGTHDVVLDMATMIYPDVVSTATLLDASLDSITVTNSGSGYLSAPTITAQGGNGINASLNALIVNQGVSNIQIEAAGQQFQSAPIINIEQKTGSGASILLKSSNLGEILKISGDNITFNYSHDRTLKPNLNTTYNLQLIRTQIIDYFDVINGGANFVSQPEILLEGGQGSLFELEPLILNEVIQSVIVNNPGRGFTSAPTVKARVAHSFVALNSNSTLNFPYNAKIPTGTKVNLVQVTGILPPPFVEGTTYYAVAATTANGLANNQIKLATSLANANTETTIAMTGPPLGDPLTGQTVFQLQTTDLGDNIVAYMKPATFSIGERIYQGASTSSYTAYGVIKNWDASGRVVSVELIEGDFVVGQPVFGEESAAFGQIHAYDRADANFEVSPISTSSANWEKTTGFLDLNEQRVYDSNRFQEFSYDISSSINISDWRNPLKFAAHPAGFKVVGTQVLLQSVKKDYRPRSITNQSPSTDYDWWIQQTNSVGTTFNGTTFITPKPSSKRTAKLATINNFALSKPDYTALVPTEVSIYGKQLLDVQKILSCISYKIDNVSDRTVTFDGSSSSIVDGATDRITITNHAFVANQLVTYTSGGDRFLDARDLIVNNIDYIIEESIGFLNATYPSLNLDPTLLGKCARDTRLVVAAWTNDLKYGGNYFSRDAAEQYTNGTNVQHVQGEESETVATFNKARDLCLLAVTNDLPVGTYTNIVPQTDLSITNDAGGCADVKSAINTLAGIVTNAISNPTDALPTQDIGNYPNNRYNTPIGGLSNNGQYYIRYVDANTIELSATFNGSAIDLTSQGGGIGHSLRCFVDGTNNQFRLQCDGVDLDTKIGKTAATSQLLLSVNGLIANPETYTLANSIVTFVTPPLSETRIIAMYFDRSSYTDSFVLDQIGDEVKTLGTGYSGTGTHTFVSGSTNGIVDNNGAFYTAQTGTTYDPLTGLMEVEIGSHSLTTSNKVAFGVGVVTFTCDADNHASEHSYPRTGDPVGNAAIVDIEAVTSTTITVNVGISNDEPNELAPGNGYSDYTYAAVPLKNRLGGGVGVTANITVTGGKVTNAKVVSGGNGYNNTDVLGIADPRVGEQFVKHFIPTNGTYTPADGQMVLTIGAGHNLSAPTTHTPTFATYDPNTGLMVVTIANHGRVNGDQVKFDDGAIRFSCTYSGGGNGDYPRSTDYASDRWLQVFDCTTNTFTVQVLDSIPSTDLSPHTYVSAVTNSVKFAVSTVRIANESLRFSCNYGSGGTAAYPRATDPIGTQGKMRDIPVEAVASTTITVNALNGTAPTNTDAHTWEGLSTYQFQPTGIDYTPTTGEMVLTLNGHPFIKGDRIQFATNSLSFTCAKDNNATTHTYPRVGDPAEGAWHTIDAVTTNTFTVFVGESSDTSAHTFTGATSTAITRAVVSYGVNKYSKFADAGNLLRQNQNFIATTAYGRMQADNPSFSTIYKTKCIRDTNLLIDAVADNVEFGGNDATYDAANFYVGTVHLSGEEGQSVQVFNHARDICRQVMRNLTVTTNSDTVGTQIKDNTISNDSGSTTYSEACCIDVASTITTLWGIVTQAVGTGAHTWAGGTASNAVQSGGNYVHTFVSAVPNGVTSNVGNLPNPVTGVAYTPNTGNMVITSNAHNLTTSNTLTIADNALSFTCTMDGNTATKTYPRSTDPVSGQTITITQTTTNTITVNVGASPIVNHDVTNATYDNNTGVLVLTIGSHSLTTGTSVKIANGSLSFTCENDNNTSVKTYPRPSDPYYDTAINIDAVGADSITLNVGTNTGNLNGITRTASQQPSFQIGVSDVAFDGTDKTFTMQSGGSTQVLPASDNFLIFLNSTLQLKGTTQAYTYTGSQVTFSEAPLAGMDFYGFYFGKLTQLDEIAPFFDNKKKTFTMKENTEPFSLESDNAAVEAQNNLIIFLNGVYQEPGVAYQLTGSIIEFSEAPRAGSDCTLFIYTGSASDILVSNTFNSIDPEDRVQISSEGSDRRVATISSSTTIDSYEYTGLRPTVAEFTATVTGGQVTQVTITNPGSNYEVPPILLFQGGGGEGAAAETVIEVGSGRVLSVINLNGGSGYTSAPTVLAVHPLALERKQRDRIISNSLSLGGSYLSQTLSAGGTTINLKNVYFNSSQKAGFPDEGEVLIPFYNTTVTPPVWTCERILYGSKDISNNTLTVATGGRGFEGTTAAAHPVITGTYSSTGTTCTVNTSTDHNLVTGQRFYLDFTTGTGFDGLYTVTVSTATQFTVEFPFSRTASGDVSLLPEVRLRSL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 4446 AA molecular weight: 474882,06040 Da isoelectric point: 4,75836 aromaticity: 0,09334 hydropathy: -0,16149
Domains
Domains [InterPro]
DC_1555
ATT
33–247
ATT
33–247
IPR025924
STR
983–1106
STR
983–1106
1
4446
Architecture
ATT 33-247 | ATT 250-505 | STR 508-808 | STR 835-1201 | RBD 1202-2010 | STR 2025-2193 | ATT 2194-2884 | RBD 2943-3244 | STR 3245-3596 | STR 3611-3881 | RBD 3882-4446
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Prochlorococcus phage P-HM1 [NCBI] |
445700 | Uroviricota > Caudoviricetes > Eurybiavirus > |
| Host |
Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986 [NCBI] |
59919 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > Prochlorococcus marinus |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98711.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071101
[NCBI]
CDS location
range 46129 -> 59469
strand +
strand +
CDS
ATGACCAATAGTTCTTGGAGAGTTGGATCGTGGACGACGCCCACAACAACGGTTACACAACCACCTGTACCGTCGGAAGTCAGTCCAGAGTCGAGATCCAAAATATCAACGCATATCGCAGGACAATTCCCTACTTTTATAAGGGATGAGTTTCCTACGTTCATTGATTTTGTCAAGGAATACTATAAGTCACAAGAATTAAAGGGATATTGCATTGATATAATTCAAAACTGGTCAGATTATTACAATATTGACAATTATGGAGATTTAGTTACTACTACAACACTAATTTCTGAGGTTACAACGTCTTCTACAACGATTGACGTTGAATCTACACGTGATTTTCCTTCAGAAGGACTATTATTGATAAATGATGAGATAATTTACTACCAAAGCAAGGGTGCAACGCTATTTCAGACTTGTGCAAGAGGATTTAACGCTGTAAGAGCAGTTGGAATAGAAGCAGACTACAGATTTGAGTCTACAACTGCTGCTCATCACACTTTAGGCACAGAAGTTGTCAATTTGAACAATATTTTCCCGCTTTACATGCTCGGAAAGTTCAAAGAACAGTTTTTAGCGACATATCCAAAGAATTTTGCAGATGGTGTTACAGAAAGTACCATAATTAAGAGAATTAAGGACTTTTACTCTTCAAAAGGAACAGGAAGGTCATTCCAGTTTGTTTTGAGGACACTTTTTGGTGTTGAGTCTCAAGTGTCTTATCCTAGAGAGCGAATATTCAAACCTAGTGACGCATTTTACACTTCTAGAGAAATTATTCGTGCAACTCCTGTAAGTGGTAACCCAATTGAACTTGTTGGGCAAGTATTATACCAAGAAGCAGATGCAAACGACCCAAATGTCGATTCTGCAAGAATTTACGTAAAAGGAGTTGTAGAAGTCTTTACATCAAGCGGAACAATCTATGAAATTGACGTAGATACCAATAATTCACTTGGATCTTTCGTAACTCCGTATAAAACAGTATTATCACAAGATTTAGGGCAAGAATTAATTGATACTACAGTTACAGTTGACTCTACACTCGGTTGGCCTGAATTAAACGGTAAATTTAGGATAGAAGACGAAATAATCAGTTATACAGACAAAACAGTTACACAATTCCTTGGATGCACCCGTGCAATTGCTCCAACAGTCAATGTAGCACATGATGCAGGGCAAGAAGTGTTTGCTGCGTTTAAAATCTTTGGATATTCAAATGTAGATGGTTCTGAGATACAATTAAAGGTATTTGGAGGGACTAGAGGAGTTAAACTGAATAGTGGTGGAAAATACTACTTACCAGACTCAAAAGTTACAACTCCTGCAGCACCTGGCTTTGATAGTCTTGATCCTATATGGGATTCGTTCATATACAATGTTAGACGTGCTCTCAGAGGCGACTCAGCGACCCTAGGACAGGTAGAAACCGATGGATCGGTAAGATGCACCATAGTTACAAAAGAAAAGCATAGATTAGTTAGAGATGACACTATTAGAATATTAAATGCTCCAGAAGACATTTACAACAATAATCATATCGTAGTTGGTATTGTTGATGAATTTACTTTCGAGTTTATCTTCTCATCAACTCCTGCATTCGGTATTTCTGGATTTGAGTTTTATATTGCTAGAGAATTTGCTTTTGGTCGTTCTGACGACACTTCTATCAACTTAGCAGTTAGAAATACTACAGGAGACGTTCAAAACACATATAAGTCAGATACTGATGCAATAATCGCTAGTACAGGTATACCAACACACAAGATAGGACCTTTTGCTGCTACAGACCTAGATCCTGGCAACCAAAGGTATTTAAAACGTATTCCTCTTGTACCAACTATTAAATCACAGAAAACTGCAACTCCTGTGGGTCAGATTGGTATTGGTGCAAATGGTGTCCCACTATTCTCATATAAGTCTGAAAGTAAGAAAAAGTATGGTGGTATAAAATCTATTGAAACCGTAAATGGAGGATCTGGTTATGATATTACAAACCCTCCTACTGTGCAGTTTGAACCAACATATCAACTAGACACAACATATGCAGGATTGACTAGAGTACAATATAACGGAAATAGATACCAAGCAATCAATGCGGGTAAATCTTCTGCAACTCAATACCCAGTTCACACAATAGGTCAGGTATTAGTCGGAGAAGTGGAGTGGTTATATGAAGGAAGCACTGCATCTGCTGATGTTAGCATTACAGGTTCCGTAACTTCTATCAACGTTACTAGCGGAGGAAGCGGATATACTACAGAACCTATTGTGTCAATCGTAGGTGGTGGTGCGGTAAGTGGACAGCAAGCGTTTGCTACCGCACAAATTACGGATGGTTCCGTAACTGGTATTAACATTGTTAACGGAGGAAGCGGATATACGAGTGTTCCTACTGTATCAATATCTGGTGGTGGTGGATCTGGTGCAACTGCATCCGCAGTTTGTAGAGGTCCTATTGAGAGTATCGACATTACTAACGCAGGAACGCAGTATACTTACGAACCAACTATCAATCTAATCAGTGGTAGTGGTGCTGTTGCGTATCCATCAATTATTAATGGAAAAATAGAGAGTATAATTGTTACATTTGGTGGTAGTGCATACTTCGGTCCTCCAGACGTTATCATTACAGGAGACGGAGTTGGTGCTACTGCTTTTGCTACTGTTGACCTAAGCACCAATATTGTTACTGGTATTACCGTATCAAGTAAAGGTATTGGATATACTGCGGGTTCTACAAGAGTTAGTATTGTATATCCTGGTTCTGGTGCGATATTCCAAACTAGACTTACAGAACTATCAATAAACGAAGCAGCAACAGGAAATGAACTAGGCAGTAATACATTTGTATCACCCAAGACTACAGATCCTTACGGAGGTGCATGTTTCCAAGGTGAGAACTTCCTTATCTACAGTGGAGAATACGGATATCTTTATAATCCAAAACAGATTAGATTCCTACTTAAAGATAGTATTGGTCTAGATGTAAATCAACAGTTACAAGAATTACCTCCTACTGTGCACTCTCCTATTATCGGTTGGGCATATGACGGACATCCCATTTACGGACCTTACGGATACGTAGATCCAGAAAACAAAGCACCATTCAATGAATACAAACGTATTAGAAGTAGTTACAGAGTAAAGACTGGTAGAGATGCTCTTCTAAGCGGTCTCAGTGACCCTCTAGGGACTTATATTGAAGATTATGAGTATGTGGAGGGATTAGGTGATTTAGACCGATATAATGGTAGATTCTGCGTCACTCCAGAATATCCAAATGGAGTATACGCTTACTTTACAACAATTACAGGTACAGATGGTTTCCCTGCATTCCCATACTTTATAGGACCTGATTTCTATGGAGAAGCAAATTCGGTAAACTGGAATGGTAATGGATTACAGAAAAACTTCACAGAAGATGCAATACGTTATAGAGCACCATTTGTGGGTGTTGATAACATTGTTGCAAAAAGAAAAGTATTAGACAATAAAGTTGACTTCTTCCTCGCATTAGAAGATAGCACAACTCTTATTATCATGGAGACTGGTGAGACACTTACATACATTGAAGATGGTATTGGTTATTATAGTTACTATCCATTTGTAAGAGGTGGAACTGCGGATTCTCTAGTTGTCTCCGCAACGAACAAATATTCCTCAGCGGGTGTTGATCAGTATCTTGTAGAAGGTGGTGGTAAAGAGTATAAGGTAAACGATAGATTAGAGTTTGATAATACTGGAACTGGAGGAGAAGGTGTAAGTGCTACTGTTGCACAAGTTCAAGGTGCGGATACAACTTCAGTAGCGGTTGCTTCTGATTCAAATACAGATGTTTATACAGCAACTGTTACAACTTCCGTTAGTCATTTACTACAACCAAATGATTCTGTTAATGTTTCCGTAACAGACAACACATTTACCAGAACAATAACGAGTAAATCTATTAATGGTAATTATCACTTCAAATACTTTGCTCTAAAGAGTATGAAGTTACTAGATGCATGGGCATCAGGTGTAGCATACGTGCAGGGAGATTTAGTTCATGTTGCAAATAGAGTATACGTTGCAGCAAGCAGTGGCACATCTGGAGCAAGTACACTCACACATACATCTGGAACAACAACGGACGGAGATGTATCGTGGACATATCTTAGAATTAGAACAGATGGTAATTTATTCCAAGATGGTTGGGCAAGTATTACAGGTGGAAGTAATTACGCAAATGGCACATACTTAAATGTTCCAATCAAATCTGTTACTGGTGATGGATTAGGTGCAAAGGCAACTATTCTGGTTCAGAGTAATGCGGTAACAGAAGTTACAATTACAGACTTTGGATATGGATATGATATTGGAGATGAAATATCTGCAGATAATATAAACCTTGGAAATGCAGTTGGTGGAACTGGATTCTCAATAACACTAACTCAAGTTCAAAGAGAGGTTCAATGTCATGTAGCAGCAGGACTTGACTCGCATCAACTTAAAGCAGGAGATTTAGTTAACATCTCAGGTGTATCACCTACTGATTACAATAAGGCAAATTATATTGTTGTAAGAACAGAAAGTCTTAAGAAATTTACCGTCAAGAGAAACTTTGCTGCTGTTGCTGCTGCAAACGTTACTTCTGGTAATAGTGGAGCTGCTGCAGAAGTTTATATCAATGAACCAAACATATCTCTGATATTAGGACATTCATATATCTTTGATACCTCTGACACAAGTAATAATGGAAAGTTGTTATCATTTACATTAGATCCTGATAATACAGATGTATTAACTTACAAAAACGTCATTGATGAAGTTAGAGATGAAATAACAGATGAGCAAGACTCAATAACACTCAAGATGGTAGATTTGCCTGGCATATTCTACTATCATGATGTAAAACATGAAAATGTATCACCACGAACATATACAGTTATTGTTCAAGCAAAAACAACTAGTCATCCATATTACAATTACGGATCTGGTAATGGGTATTACATAAC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Genome Context
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