Protein
View in Explore- Genbank accession
- WPK38775.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MSIQSGPSVLNQFVPDFLIDSTPTNGQFLVYDETVQAFVNSTNPRIVLDSSNILDGSITIDKLAISGNKVPGYVLTITSAGGMAFLPVPGSGGQLPSLDELLDTNIVSPTVTQYLKWDGSAWVNSNITLNDVSDVSVISPTADDVLAWESGSWTNKKIDYTSLTNKPDLSDVVRSSELSPVAFSGDYNDLVNIPSATSNTIVGLTDVNDTALPNGFLRWNASGDEVEFITSISATVITGLAPVATSGNYNDLLGKPNLSVYPLRTEFSTVATTGNYSDLNNVPLTFAPSAHTHPAAQITGLASVATSNDYNDLVNKPTAMAPTAHTHAISDIIGLQNSLDSKLTVNLTTRLPKDVIYFNGTSWVNKQLSYTDISGTPNLDNYVTDSELSTVATTGRYSDLINKPELVENLNDLLDVDVSSKQTGNVLTWNGTAWVASAITQASIDWANISNKPSVFSPAAHTHDIVDVLGLQSLLDSKLDANIAFDGDYNSLTNKPGLIDLQDTFSPAVPNGFLRWNNLGTLVAYQDYIYPQDISGLSDVAISGQYSDLLGTPSLSTVAITGSYSDLIDAPPAFDGDYDSLTNKPFIPTNFDFKFIGLNDVSPTVQPGGYLKWNLNGSFVVSSANIPATDVAGLSVVSTTGQYSDLLGKPLLATVSSSGSYTDLINIPTEFNPAVHTHNIADISGLQAALDNKLNTSDAFSGDYNDLTNAPTNSSYSLVGLSDTNSVPVANGFLRWNASGSSVEYIQTIPVNAITGLAPVASSGQYADLQGTPDLSDYVLSVSLADIATTGEYSDLINAPDLSVYANKTDLSDVATTGQYSDLLGIPTQFTPTVHVHNVSQISGLATVATSGSYNDLSNKPSFANVATTGSYDDLNNKPSIPTNGSFSLLGLNDTNNTPVADGILRWNSSANQVIYANTIDAQSVSGLATVATIGKLSSLSDVDLIGLNQNEILQWNGSAWVPVPYNPNQIQAYIESGNTKVSTNDILDSIVLTAGPTTGNIIFELGNTNSSIILNPVANNVDALISSTSRIKLDSSTGISLGNISYPMTDGTVGQAVVTNGAGQLSFETVVKPSQLATVATSGNYNDLTNKPTLVTELNGLADVRMRDTNGNYLAQPEDVLTYSNGIWQARPNTSSSFIGLSDTQNITLPEDRANAYLRWDTTGNLIIYEDSISASVIAGLAEVATTGDLHDLINVNVNLPDMNNPATQAVWGLIWDRQNQRWINYNLRNIAGSGGSTVVALNDLTDVTLTFPVVDGNVLRATVQPDNSIVWQNKQLSYSDLTGTISMSLLQLTDTSSSAVPNGFLRWDSSGNTVQYITTISTNDISGLAPVATSGNYNDLSNTPAIPASINDLADVNTVSPVPTNGYVLTWDSSSNNWIAKEPATSPSGSTALADLTDVSLSDLTASDVLKYNGTTWVNEPVTYSELTDLPTFALVAFSGDYNDLTNKPSGSTTSILDLTDTADTALPNGFLRWNASGDEVLYQSSINVSDIIGLSSVAISGDFNDLSNKPENNSYYFRKLADAGNPQPNTFIKYPAFTIPPGSDIDDVNPILEYVSSINALTDIDNLAPVATNGILGSLVDVNLNSVEDGQVLTYDAVTNSWINKNSSGSPVVTSWTKINGNYTVTGSEYLLVDTTSASVTITLPVAPTENMVIRIADWKGTFRTNSCVVNTNGMPLMGASMDNTLTIQNQNASIELTFVDTTYGWKITDGIGEISKQNIPVTNWRTVDSSSTPAMLIAQPGEAIYVNTNNGAVTVKLPTGASVNAVVRIADLLGTYDKASCFVDGNGNPIMGKNEILEIANENASIEFTYVDSVVGWKVTDGIGELGRKTDIASDSDIIVYVATDGNDTTGSGTEESPFATLNAAFLSLDGKFVNSSAEIIVRVAEGVYEPTNPIAFSHIQGMNVKLIGELPQASSSFTVTNITNDSGLAKVTMQLSSVSDYEVGDIIKITSAATMLECVEIITAINTGSNTLEIVIPNSVLADVSDYTGYTGTISKFTTVFKNTNMYVAGGYSLGFIDNIALVDDTGLGTALTVGRTYTTGIYDGPAYVGLGANFAVYGYETAIQSIPGSSVVLAGNLCRQAGAAIRADGSILSFNAGQSVYIANQAQDGIVLKHGSKLIHNDDASQSFVFVIFNNIKSGTILSLDTSISTANFEVKNSEGIMIAATRHSTVDARSAIVSGTITGNLEVNATGMSVININEPAGSTNIPLAVVCNPAHGSNTELQKGYIGL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2236 AA molecular weight: 236352,96950 Da isoelectric point: 4,11454 aromaticity: 0,07379 hydropathy: -0,02531
Domains
Domains [InterPro]
DC_0165
STR
1–264
STR
1–264
PF12789
STR
324–347
STR
324–347
DC_0165
STR
693–784
STR
693–784
1
2236
Architecture
STR 1-264 | ATT 321-592 | STR 593-862 | STR 880-1118 | ATT 1119-1394 | STR 1395-1841 | RBD 1842-2236
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage Cassandra [NCBI] |
3092175 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa PAO1 [NCBI] |
208964 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK38775.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR805292
[NCBI]
CDS location
range 67616 -> 74326
strand +
strand +
CDS
ATGAGTATACAATCAGGTCCTTCTGTATTAAATCAATTTGTTCCAGATTTTCTAATAGATAGTACACCAACTAATGGTCAATTTTTAGTTTATGACGAAACTGTCCAGGCATTTGTAAATAGCACAAATCCCAGAATCGTATTAGATTCGTCTAATATATTAGACGGTTCTATAACAATTGATAAACTTGCAATATCTGGTAATAAAGTACCTGGATACGTACTAACTATAACTTCCGCAGGCGGAATGGCATTTTTACCAGTGCCTGGCAGCGGTGGCCAACTACCTAGTCTGGATGAATTACTAGACACAAATATAGTATCTCCTACTGTAACCCAATATCTTAAATGGGACGGTTCTGCATGGGTTAATAGTAATATAACGTTAAATGATGTATCAGATGTCTCTGTTATCTCCCCTACAGCCGATGATGTATTAGCATGGGAATCAGGTTCTTGGACAAATAAGAAAATAGATTATACATCACTAACAAACAAACCAGATTTGAGTGATGTAGTTAGATCTAGCGAATTGTCACCAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAGTAAATATTCCTAGTGCAACTTCTAATACTATAGTTGGATTAACAGATGTTAACGACACTGCACTACCTAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGCGGTGATGAGGTAGAATTTATTACTTCAATTTCTGCTACTGTAATAACCGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATTAGGAAAACCTAATTTGTCAGTGTATCCGCTTAGAACTGAATTTTCTACTGTTGCAACCACCGGTAATTATTCTGATTTGAACAATGTGCCTTTGACATTTGCACCAAGTGCGCATACTCACCCGGCTGCACAAATCACAGGATTAGCATCTGTAGCTACTAGCAACGATTATAACGATTTAGTTAATAAACCGACTGCAATGGCGCCAACAGCACATACGCATGCTATATCTGATATTATAGGATTGCAAAATTCGCTAGATAGTAAGCTGACTGTTAATTTAACTACTAGACTTCCAAAAGATGTTATTTATTTTAACGGCACTTCGTGGGTAAACAAGCAATTATCTTATACTGATATTTCCGGTACTCCTAACTTAGATAACTATGTTACTGATTCAGAATTATCTACTGTTGCTACAACTGGCAGATATTCTGATTTAATAAATAAACCCGAGTTAGTAGAAAATTTAAACGACTTATTAGATGTAGATGTTTCTTCTAAACAAACAGGGAACGTATTAACCTGGAACGGAACAGCATGGGTTGCTAGTGCAATAACACAAGCAAGCATAGATTGGGCTAATATAAGCAATAAACCAAGCGTTTTTAGCCCCGCTGCGCATACACACGACATAGTAGACGTACTAGGCCTGCAAAGTTTACTAGACAGCAAACTTGACGCAAATATTGCATTCGACGGCGATTATAATAGTTTAACAAATAAACCGGGGTTAATAGATCTTCAAGATACATTTAGTCCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGAATAATTTAGGTACCTTAGTTGCATATCAAGATTATATATATCCGCAAGATATTTCAGGATTGTCGGACGTTGCTATATCAGGTCAGTATTCGGATTTATTGGGTACCCCTTCCTTATCGACTGTTGCTATAACCGGGAGTTATAGCGACTTAATTGATGCGCCGCCCGCGTTTGACGGCGATTATGATAGTTTAACAAATAAACCGTTTATTCCTACTAATTTTGATTTTAAATTTATAGGTTTAAACGATGTAAGTCCTACTGTTCAGCCCGGCGGCTATTTAAAATGGAACTTAAACGGTTCATTTGTTGTATCGTCAGCAAACATTCCTGCAACAGATGTAGCAGGATTATCTGTTGTGTCTACAACCGGACAATATTCGGATTTATTAGGCAAACCGTTATTAGCTACAGTTTCTTCGTCGGGTAGTTATACTGATTTAATAAATATTCCTACTGAATTTAATCCAGCCGTACATACCCACAATATAGCAGACATATCCGGATTACAGGCAGCCCTGGACAATAAATTAAATACATCTGATGCATTTAGTGGTGATTATAATGATCTAACTAATGCACCTACTAATAGTTCATATTCATTAGTGGGATTATCAGATACTAATTCTGTACCTGTTGCAAACGGATTCTTACGCTGGAATGCATCTGGAAGTAGTGTTGAATATATTCAAACAATTCCTGTAAATGCAATAACTGGATTGGCTCCTGTCGCATCATCTGGCCAGTATGCAGATTTGCAAGGAACACCGGATTTATCTGACTATGTTTTATCTGTATCATTGGCTGACATAGCTACAACTGGAGAATATTCAGATTTAATAAATGCACCTGATTTAAGTGTGTATGCTAATAAAACTGATCTGTCAGATGTAGCTACAACAGGACAATATTCGGATTTATTGGGTATTCCTACACAATTTACACCGACAGTTCATGTCCATAACGTTTCTCAAATAAGTGGATTAGCTACTGTTGCTACTAGCGGAAGTTATAATGATTTATCTAATAAACCGTCGTTTGCTAATGTTGCAACTACAGGCAGCTATGATGATTTAAACAATAAACCATCCATACCTACTAATGGCAGTTTTAGTTTACTTGGGTTAAATGATACAAATAATACGCCAGTTGCAGATGGTATATTGCGTTGGAATTCCAGTGCAAATCAGGTAATATATGCAAATACAATCGATGCACAATCTGTTTCTGGATTAGCTACTGTTGCGACTATAGGTAAACTATCTTCACTAAGTGATGTAGATTTAATAGGTTTGAATCAGAATGAAATATTGCAATGGAACGGTTCTGCATGGGTACCTGTACCTTACAATCCTAATCAAATACAAGCCTACATAGAGAGCGGAAATACAAAAGTTTCTACTAACGATATTTTAGATAGCATTGTTCTAACAGCAGGACCTACTACCGGAAATATAATATTCGAGTTAGGAAATACAAATAGCTCAATTATTCTAAATCCAGTTGCTAATAACGTAGATGCTCTTATTTCTTCTACTTCTAGAATAAAATTAGATTCATCTACTGGCATATCATTAGGTAATATAAGTTATCCAATGACTGACGGTACAGTTGGGCAAGCAGTAGTTACAAATGGAGCTGGCCAACTATCGTTTGAAACGGTAGTTAAACCCTCTCAATTGGCTACAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTAACTAATAAACCTACATTAGTAACTGAACTAAACGGACTTGCTGACGTTCGTATGCGTGATACTAATGGAAATTATTTAGCACAACCAGAGGATGTGTTAACATATTCTAACGGAATATGGCAAGCACGACCGAACACTAGTTCTTCTTTTATAGGTTTAAGCGATACCCAAAATATAACATTGCCGGAAGATAGGGCTAATGCATACCTACGTTGGGATACTACCGGAAATCTAATTATATACGAAGATAGTATTTCTGCAAGCGTAATTGCCGGATTAGCAGAAGTAGCAACCACAGGAGATTTGCACGATTTAATAAATGTAAATGTAAATTTACCTGATATGAACAATCCAGCCACACAAGCTGTTTGGGGTTTAATATGGGATCGTCAGAATCAACGTTGGATAAATTACAATTTACGTAATATAGCAGGTTCAGGTGGATCTACAGTAGTAGCATTAAATGACTTAACTGATGTTACTCTTACTTTCCCTGTAGTTGACGGTAATGTTCTTAGAGCAACTGTGCAGCCAGACAATAGTATTGTTTGGCAGAACAAACAACTATCTTATAGTGACTTAACTGGAACTATAAGTATGAGTCTGTTGCAATTAACTGATACTAGTTCATCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGGATTCATCGGGTAACACAGTTCAGTATATTACTACAATAAGTACAAATGATATATCTGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATCTAATACGCCTGCTATACCGGCATCAATTAACGATTTAGCAGACGTTAATACAGTTAGTCCTGTTCCTACAAACGGATATGTATTAACATGGGATAGTAGTTCGAATAATTGGATTGCAAAAGAACCTGCAACTAGCCCATCTGGTAGCACAGCCCTCGCCGATCTAACAGATGTATCTCTATCTGATCTAACTGCTAGTGATGTTTTAAAATACAACGGCACTACATGGGTAAACGAACCAGTTACGTATTCTGAATTAACAGATTTACCTACATTTGCGTTAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAACTAATAAGCCATCGGGATCTACTACATCTATACTAGATCTAACTGACACTGCAGATACTGCACTACCTAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGCGGTGATGAGGTTTTATATCAATCATCTATTAATGTTTCTGATATAATAGGATTATCTAGTGTAGCTATAAGTGGTGATTTTAACGATTTATCCAATAAACCGGAAAATAATTCGTATTATTTTAGAAAGTTAGCTGACGCAGGAAATCCGCAGCCTAATACATTTATAAAATATCCTGCGTTTACTATTCCGCCTGGTAGTGATATAGACGATGTTAATCCTATACTCGAATATGTAAGTAGCATAAATGCACTAACCGACATAGATAACCTAGCTCCGGTTGCTACTAACGGAATACTAGGAAGTTTAGTAGACGTAAATCTAAATTCAGTAGAAGATGGACAAGTTCTTACTTATGATGCTGTAACAAATAGCTGGATAAACAAAAATAGCTCAGGATCACCGGTAGTAACTTCGTGGACAAAGATAAATGGCAACTATACTGTAACTGGCTCAGAATATTTATTGGTAGATACAACTTCTGCTAGTGTAACAATTACTCTGCCTGTTGCCCCTACTGAAAATATGGTAATTCGTATTGCTGATTGGAAAGGTACATTTAG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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
f3064b718991122642a7211f5e7af400301fdc0a919646684bde037fed44e430
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells | Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D. | — | — | GenBank |