Protein
View in Explore- UniProt accession
- Q58MX0 [UniProt]
- Protein name
- Phage tail fiber-like protein
- RBP type
-
TFTFTSPTFTF
- Protein sequence
-
MANIKKTFNFRNGVQVDDDNLIVNQTGLVGIGTTVPTEALDVRGKVKVIADPNVTGSGEINATTGIITSLTVTNLTVSGNNYSGGVIGVGISVGTAGIITATEPTGIVTYYGDGKELLNLPTSQWLDKDVGLGYTSIYAQGGVGVGTVDPRFTFQVSGNNDLTNFEEGVGINDKGGIVATGVITATTFKGHVDGSVSSGLSTITQLQSTNANVTGVVTATEFKGDVTGDVVSGVSTITTLQSTTINAGLINATGAGFTGALSGDVTGNVTGNVNGNINAVTGISTLNILKILGTIDGDTVSGILTTGRLTAATSTIGVATAASLNVQGKLGVGINNPIGDIQVYKSGISTVNVVGEEFAVLQLGQRDSIGIGASTAQFKFGETSQELDIINGDPGSINSIIHGGGSAGINTGSFNWIYGVNNSTLMSLDYTGKLGVNKPDPEYPLDVSGIGTFSSDVYVRNSLDVGVLLTVGGNATVAGTLGVTSSVTVGGDLNVTGVFNYPSDVPADKLPDQIDVRINSAGVSTFLGGVNLGAVQVGGLNGVISGVSTIGILTSAENIPLAMGVYSPTAKAVFNRLGVGNTDPINALDVTGTIQATQYLGVGNQPIGAAVDFSNAGRGLTVPSLQNRNFMLPPKVTTTERSNLAGLAAGAIIYNTTTNKLQVYNGSSWQNLH
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 673 AA molecular weight: 68141,29740 Da isoelectric point: 4,52151 aromaticity: 0,05349 hydropathy: 0,17415
Domains
Domains [InterPro]
DC_0326
STR
495–673
STR
495–673
IPR059888
RBD
629–672
RBD
629–672
1
673
Architecture
STR 495-673
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
673
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 448 | 448 | 0,7219 |
| Central domain | 449 | 647 | 200 | 0,5264 |
| C-terminal | 648 | 673 | 25 | 0,9909 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 49 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 49 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-448
1-448
Central
449-647
449-647
C-terminal
648-673
648-673
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Prochlorococcus phage P-SSM2 [NCBI] |
268746 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Salacisavirus > Salacisavirus pssm2 |
| Host |
Prochlorococcus [NCBI] |
1218 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > |
| Host |
Prochlorococcus marinus str. NATL1A [NCBI] |
167555 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX44412.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY939844
[NCBI]
CDS location
range 34286 -> 36307
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAATATTAAGAAGACATTTAATTTCCGTAATGGTGTTCAGGTTGATGATGATAATCTGATCGTAAACCAAACGGGTCTGGTTGGTATCGGAACTACTGTTCCAACTGAGGCTTTGGATGTCCGAGGAAAAGTTAAAGTTATTGCAGATCCTAATGTTACTGGATCTGGAGAGATTAATGCAACTACAGGTATAATTACATCTTTAACTGTAACCAATTTAACCGTTAGTGGAAATAATTATTCTGGTGGTGTAATTGGTGTTGGTATTAGTGTTGGAACAGCAGGTATTATAACTGCAACAGAACCAACTGGTATTGTTACTTATTATGGTGATGGTAAAGAATTATTGAATCTTCCCACATCACAGTGGTTAGATAAAGACGTAGGATTAGGATATACAAGTATATACGCTCAAGGTGGCGTAGGTGTGGGGACAGTAGATCCTCGATTTACCTTCCAAGTTAGTGGAAATAATGACTTAACTAACTTTGAAGAAGGTGTAGGTATTAATGATAAGGGTGGTATTGTAGCGACAGGTGTTATTACTGCTACTACCTTTAAAGGACATGTTGATGGATCTGTATCTAGTGGATTATCAACCATTACACAGTTACAGTCTACAAATGCAAATGTTACTGGTGTAGTTACTGCTACTGAATTTAAAGGAGATGTTACTGGTGATGTAGTTAGTGGTGTATCAACAATCACTACCTTACAATCAACCACGATAAATGCAGGTCTTATAAACGCTACTGGTGCAGGATTTACTGGTGCTTTATCGGGTGATGTTACTGGTAATGTTACTGGTAATGTTAATGGTAATATTAATGCGGTAACAGGTATTTCAACACTTAATATACTTAAGATACTTGGAACTATTGATGGTGATACTGTTTCTGGTATTCTTACTACTGGAAGATTAACTGCTGCTACTTCAACTATAGGTGTGGCAACAGCAGCATCATTAAATGTTCAAGGTAAATTGGGAGTTGGTATCAATAACCCAATAGGTGATATTCAGGTATATAAGTCAGGAATTTCTACTGTTAATGTTGTTGGTGAAGAGTTTGCTGTTCTACAATTAGGTCAGAGAGATTCGATTGGTATTGGAGCAAGCACAGCACAGTTTAAGTTTGGTGAAACTAGTCAAGAACTTGATATTATTAATGGAGATCCTGGTAGCATCAATAGTATTATTCATGGTGGTGGATCTGCTGGTATTAATACTGGATCATTTAACTGGATATATGGTGTAAATAACAGCACACTAATGTCACTAGACTATACTGGAAAGTTGGGTGTTAATAAACCTGATCCAGAATATCCTTTAGATGTAAGTGGTATTGGAACATTCTCAAGTGATGTTTATGTAAGAAATTCTTTAGATGTTGGTGTTTTACTGACTGTTGGTGGTAATGCAACTGTTGCTGGAACATTAGGAGTTACTAGTAGTGTGACTGTTGGTGGAGATTTAAATGTTACTGGAGTATTTAATTATCCTTCAGACGTTCCTGCTGATAAATTGCCAGATCAAATTGATGTTAGAATAAATTCTGCTGGAGTATCTACATTCTTAGGTGGTGTTAACCTTGGAGCAGTTCAAGTTGGTGGATTAAATGGAGTTATCTCTGGTGTATCCACGATTGGAATCTTAACTTCTGCGGAAAATATTCCATTAGCTATGGGTGTTTATTCACCAACAGCAAAGGCAGTTTTCAATAGACTGGGTGTTGGTAATACTGATCCTATAAATGCGTTGGATGTTACTGGTACTATTCAAGCAACTCAATATCTTGGAGTTGGTAATCAACCAATAGGTGCTGCGGTTGACTTCTCTAATGCTGGTAGGGGACTTACTGTACCATCTTTACAGAATAGAAACTTTATGCTCCCACCAAAAGTTACTACAACTGAGAGAAGTAACTTAGCAGGATTAGCTGCTGGTGCAATAATATACAATACTACTACAAACAAACTTCAAGTTTATAATGGATCTTCGTGGCAGAACCTTCACTAA
Genbank protein accession
ACY75910.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071092
[NCBI]
CDS location
range 36294 -> 38315
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAATATTAAGAAGACATTTAATTTCCGTAATGGTGTTCAGGTTGATGATGATAATCTGATCGTAAACCAAACGGGTCTGGTTGGTATCGGAACTACTGTTCCAACTGAGGCTTTGGATGTCCGAGGAAAAGTTAAAGTTATTGCAGATCCTAATGTTACTGGATCTGGAGAGATTAATGCAACTACAGGTATAATTACATCTTTAACTGTAACCAATTTAACCGTTAGTGGAAATAATTATTCTGGTGGTGTAATTGGTGTTGGTATTAGTGTTGGAACAGCAGGTATTATAACTGCAACAGAACCAACTGGTATTGTTACTTATTATGGTGATGGTAAAGAATTATTGAATCTTCCCACATCACAGTGGTTAGATAAAGACGTAGGATTAGGATATACAAGTATATACGCTCAAGGTGGCGTAGGTGTGGGGACAGTAGATCCTCGATTTACCTTCCAAGTTAGTGGAAATAATGACTTAACTAACTTTGAAGAAGGTGTAGGTATTAATGATAAGGGTGGTATTGTAGCGACAGGTGTTATTACTGCTACTACCTTTAAAGGACATGTTGATGGATCTGTATCTAGTGGATTATCAACCATTACACAGTTACAGTCTACAAATGCAAATGTTACTGGTGTAGTTACTGCTACTGAATTTAAAGGAGATGTTACTGGTGATGTAGTTAGTGGTGTATCAACAATCACTACCTTACAATCAACCACGATAAATGCAGGTCTTATAAACGCTACTGGTGCAGGATTTACTGGTGCTTTATCGGGTGATGTTACTGGTAATGTTACTGGTAATGTTAATGGTAATATTAATGCGGTAACAGGTATTTCAACACTTAATATACTTAAGATACTTGGAACTATTGATGGTGATACTGTTTCTGGTATTCTTACTACTGGAAGATTAACTGCTGCTACTTCAACTATAGGTGTGGCAACAGCAGCATCATTAAATGTTCAAGGTAAATTGGGAGTTGGTATCAATAACCCAATAGGTGATATTCAGGTATATAAGTCAGGAATTTCTACTGTTAATGTTGTTGGTGAAGAGTTTGCTGTTCTACAATTAGGTCAGAGAGATTCGATTGGTATTGGAGCAAGCACAGCACAGTTTAAGTTTGGTGAAACTAGTCAAGAACTTGATATTATTAATGGAGATCCTGGTAGCATCAATAGTATTATTCATGGTGGTGGATCTGCTGGTATTAATACTGGATCATTTAACTGGATATATGGTGTAAATAACAGCACACTAATGTCACTAGACTATACTGGAAAGTTGGGTGTTAATAAACCTGATCCAGAATATCCTTTAGATGTAAGTGGTATTGGAACATTCTCAAGTGATGTTTATGTAAGAAATTCTTTAGATGTTGGTGTTTTACTGACTGTTGGTGGTAATGCAACTGTTGCTGGAACATTAGGAGTTACTAGTAGTGTGACTGTTGGTGGAGATTTAAATGTTACTGGAGTATTTAATTATCCTTCAGACGTTCCTGCTGATAAATTGCCAGATCAAATTGATGTTAGAATAAATTCTGCTGGAGTATCTACATTCTTAGGTGGTGTTAACCTTGGAGCAGTTCAAGTTGGTGGATTAAATGGAGTTATCTCTGGTGTATCCACGATTGGAATCTTAACTTCTGCGGAAAATATTCCATTAGCTATGGGTGTTTATTCACCAACAGCAAAGGCAGTTTTCAATAGACTGGGTGTTGGTAATACTGATCCTATAAATGCGTTGGATGTTACTGGTACTATTCAAGCAACTCAATATCTTGGAGTTGGTAATCAACCAATAGGTGCTGCGGTTGACTTCTCTAATGCTGGTAGGGGACTTACTGTACCATCTTTACAGAATAGAAACTTTATGCTCCCACCAAAAGTTACTACAACTGAGAGAAGTAACTTAGCAGGATTAGCTGCTGGTGCAATAATATACAATACTACTACAAACAAACTTCAAGTTTATAATGGATCTTCGTGGCAGAACCTTCACTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
df0ef53a749528cc20cf13267afd33c59bd4d56c548b779daab8ca958722d1ba
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50