Protein

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Genbank accession
AOV60027.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGEIGIELDTTRLKIGDGVTAWNTLRYERPLESTTNTSNTLVQRDVDGNFSAGTITATLIGQSSTASRLASTRQVQITGDVTGTDNFDGSDNINLQSQLSIVDTLAHYDGTNTSLGTYTQVEVDAKGRIKRGFNPTTIADYGLDGSVEGSSAQPYDTDLQAIAQLNTTGLVARTSPGNAIARTINGTASQIVVNNGGGLTGNPVVDLAVTTVVAGDYNTESLTSVDALGSSNEPFGTETVNAAKFTVDDRGRLQSATNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSKVYQAITGIAAGGGAPTHTDATDAGGWRYLGAATVEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDVSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTVQISASEAAGKVHVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNITEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVIAGGAGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIELQSTTGNGSLAGILDVTGNLNVNTNKFNVIAASGNTSIAGTLGVTSIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITVLKNSGTGIWEIQSSDYGSLRVDGGAFVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATETESRLNWLQVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERSLHVGGTGTGEGLFVGKRYSGDTQKFSVLGASGNTTIEGTLTVNDNVNFNGTLDQDGDFAVRNGTTDKFFVAATSGDTNIEGTLTVDGHTELNSTLNVDNNVTLGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDAVQINDTLGVSDVVTFTRNTQQSITGNSISLDGAVRMSGGLGVSKNLAVGENLVVYGDFNIIGDTVVNGTTTYNAKIDITNTSEADSLADNDVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDDANSRNAFFVDVSTGDATLHNDLTVGGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSTAKVGFFGLDRSSLEYVFLTDATNSSEVLSGTDGQLRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDGLTTASTATVSTVVARDGSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITVTNADGVSGNITINVASTSTNASNNLVLRDASGDFAANEITADLIGGVTGNVVGNVTGNVTGQTSDISNHDTGDLTEGSNLYYTDARADARIAAADTGDLTEGSNLYYTNARADARIVAAGLDGGTLTGDVTGDVTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDADYIYICVATDTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1694 AA
molecular weight: 174532,05880 Da
isoelectric point:4,20940
aromaticity:0,05844
hydropathy:-0,18424

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
ATT
1–44
G3DSA:2.10.10.30 DC_1607 DC_0574
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AOV60027.1
1 1694
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 1-44 | STR 45-242 | STR 329-1115 | RBD 1210-1694
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM8
[NCBI] 		754038 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Neritesvirus > Neritesvirus scam8
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV60027.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686203 [NCBI]
CDS location
range 88178 -> 93262
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAAGGTGAGATCGGCATCGAACTCGATACAACTCGCCTCAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACTCTGAGGTATGAGCGTCCTCTTGAATCTACGACAAATACTTCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGTTGATGGTAATTTTTCTGCAGGTACAATCACAGCAACGTTGATTGGACAATCTTCTACTGCTAGTCGCCTTGCTTCTACAAGACAGGTTCAGATAACTGGTGATGTAACTGGTACAGATAACTTTGACGGTTCGGATAACATCAATCTGCAATCTCAACTCTCGATTGTTGATACTCTTGCTCATTATGATGGTACAAATACGTCTCTAGGAACATACACTCAAGTTGAGGTAGACGCAAAAGGTAGAATTAAGAGAGGTTTTAATCCAACAACAATTGCTGATTATGGTCTTGATGGTAGCGTCGAAGGATCTTCCGCACAACCTTATGATACCGATCTTCAGGCGATTGCTCAATTAAATACCACTGGTCTTGTTGCCAGAACTTCTCCTGGTAATGCCATTGCCAGAACAATCAATGGTACAGCATCTCAAATTGTTGTTAACAATGGTGGCGGTCTTACTGGTAATCCAGTTGTTGACTTGGCAGTTACAACTGTAGTTGCAGGTGACTATAACACTGAATCATTAACATCAGTTGATGCTCTTGGATCTAGCAACGAACCATTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGCAAAATTTACAGTTGACGATAGAGGTCGTTTACAAAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGCAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACGTATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAAAGTATATCAAGCAATCACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTACAGATGCTGGTGGATGGAGATATCTCGGTGCTGCAACAGTTGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAGCAATGGGCATGTCACAATCGCCGCAGTAGGTGTTGATAATACACAACTACAGAATAATAGAGTTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACGTTAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCAACTTAACGTTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGGTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTGTACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGCTGGTAAAGTCCATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTCGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTTACAGTTGATGATCCTATTATCACTCTTGGTGGTGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATATTATGATACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATATTACTGAAGTCTTTAGTGGCACCGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATCTAGTTATTGCTGGTGGTGCTGGTATCACACAAGATGTAAATATCGGTGGATTGCTAGATGTTGATGGTACTTTCCGTGCTAATAGTACTTCTCGCTTTGACGATAATATCGTTCTACAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGCACAACCAAGATTGAATTGCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATCCTAGATGTAACTGGAAACCTTAACGTTAATACTAATAAGTTTAATGTTATTGCTGCTTCAGGTAATACATCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAGTATCGCAACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCCGAGAGCACCAATGATATCACAGTTCTTAAGAACTCAGGAACAGGTATTTGGGAGATTCAGTCTAGTGATTACGGATCTCTGAGAGTTGATGGTGGTGCATTCGTTGCAGGATCTGCTCTGATTGATGGCACACTTCATGTTAACGGCGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGACTGAATCTAGACTTAACTGGTTGCAAGTAAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACCACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGATCTCTACATGTTGGTGGCACAGGAACTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGAGATACTCAGAAGTTTTCTGTTCTTGGTGCATCTGGCAATACAACAATTGAAGGCACACTAACTGTTAATGATAATGTAAACTTCAATGGCACTCTTGATCAAGACGGTGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGCTGCTACCTCAGGCGATACAAATATTGAAGGCACACTGACTGTTGATGGTCACACTGAGTTAAATTCAACTCTTAATGTTGATAACAATGTCACACTTGGTGCTCAGTTAACAGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACTGATAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAACATCATTGGCACACTGACTGTTGGTGATGCGGTTCAGATCAATGATACCTTAGGCGTCTCCGATGTTGTAACCTTTACTAGAAACACACAACAATCTATTACTGGCAACTCCATCAGTCTGGATGGTGCCGTAAGAATGTCTGGTGGTCTTGGTGTTTCTAAGAACCTGGCAGTCGGTGAAAACTTAGTTGTTTATGGTGACTTTAATATCATTGGTGATACGGTAGTCAATGGTACTACCACTTATAATGCAAAAATTGATATTACAAATACTTCTGAAGCAGATTCTCTTGCCGATAATGACGTTGCATTCCAAGTCGATGGTGGTGGCATTATCAGGAAGAAACTCTGGGCAGGTGGAGACTTCACTGTGTATGATGATGCAAATTCCAGAAATGCATTCTTTGTCGATGTAAGCACGGGTGATGCAACCCTGCATAATGACCTTACAGTTGGAGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAATGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCACTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGACTCGACAGATCATCGTTAGAATATGTCTTCCTTACTGATGCAACTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGATGGACAACTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTTACTGGCAGTGGCACATCTCTTGATGTTGATGCAAATGCAAACATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAGATTATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTAGTCATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTGAATGCTGACCTTCTGGACGGTTTGACAACTGCTTCTACAGCAACTGTTTCTACTGTTGTTGCTCGTGACGGTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGAACAATCACTGTTGATGGTGTTGTTGATGGTAGTGTATCCTTTAACGGATCTGCTGATGTTACTATTAGCACTACTTACAATGATGCAGACATCACTGCGCTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGGACTGCTGCTAATACTTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTGTTACTAATGCTGATGGTGTATCGGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTACGAGCACTAACGCATCCAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCAAACGAGATCACTGCTGATCTAATTGGTGGTGTAACGGGTAACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTTACAGGACAAACTTCTGACATCAGCAACCATGATACTGGTGATCTGACTGAAGGATCCAATCTTTATTATACAGACGCTAGGGCAGATGCAAGAATTGCTGCTGCTGATACTGGAGATCTTACAGAGGGATCTAACCTCTATTATACGAATGCTCGTGCTGATGCAAGAATTGTTGCTGCTGGACTTGACGGTGGCACTCTTACTGGTGATGTCACAGGTGATGTCACAGGTAATGTTGATGGTAATGTTTCTGGTGAAGTTACATTAGAGGGTGCTGCACCCGCCAGTGCTACTGCAACTGGAACTGCAGGTGATATTCGTTACGATGCTGATTATATCTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAGAGAGCAGCAATTTCTACCTGGAGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
28a8cc51efd3ae3fc23cf176176b3aaded5df9dfeb0da095e811437dd5e0b938
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5789
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50