Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009322953.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,51
Protein sequence
MPLNKLENFIKNVDGRTLYVNPADLNATDSITNEGTSLTEPFRTLQRALIESARFSYVQGDNNDLIEKTTIILYPGEHTIDNRPGYGIKVDGSGDAIAVAPNGQQVTPAPVFNLASDTNFDIESPNNILWHFNSIYGGVVIPRGTSIVGMDLRKTKIRPKYVPNPTDPSVPSSAIFRVTGTCYFWQFTIFDGAENGLVFTDPQDFSENNQCRPTFSHNKLTAFEYADGVNPAIANGFELTDLQMYYSKLSNAYNEASGRQIKQKFPAQPEGFAPMLPEFEIVGAFATDPIRIASLISGDGFTPDAVITVDTVVPNDLAVGTPIKIRGVAISDYNISAKVATVINPTRFTYLIPFVRPELPARPSVSSATVTVETDTVTGASPYIFNVSMRSVWGINGMHADGSKATGFRSMVVAQFTAISLQKDDRSFVKYNEQARRYDGIDVSTTVRGAELAAGSSSTNSARVYHLDPRAIYRPGWDTTHIKMSNDAVIQIVSVFAIGFNQHFAALSGADASVTNSNSNFGQFALLSGGFKNDAFEKDDRGFVTQIVTPNTAYNPSEDAISNIGWVNIDFSLTNSQSLPGQLYLLGYSNKEDIPPYINQGFRIGGNYNETLYQPLSDESLESASICMVDNLIDGNSNVATGTDIARKTYPVIAGPGQGPTSGSTLTLPFHGLLNGETIRIFSGTGDLPENIDAATLYYANVVDAENIRISTSQSNALNDLFLDIYGGTDLRIESRVNDKTPGDAGHPIQYDDTIGNWFVHTNVNSDIYQYVKSNPTSTEGLDSVTFYQREGDNRSLDDKIYRLRYVIPKETVNAKPPTPGYVIQESSSTGARDNDDFILNDLTFTDYEYDRNPRYIVSCNFISISSEVEVRSEIPHQLFVGDKINIINVTSTNNPDAVNGRGYNGEFLVTRIIDARTFYYSSTDVNGFTRNLIGELFTNDTNDRNILLPRFQRKDNQTNTFVYRVEEISPFSETIRDGIYHLFCVNGSNQVTETFTNRFYNQPIEDLYPQLDTDNTNNNVESSTTFANSSPLGKVVIDSLQSSITRETIDKLSKSSSTNIIKTVTIGASETTLEFEREHNFSGVYGYTTLAGGSGYVDGTYYNVRLLSGAAWKGASAEVVVISGQVNSLTIMDPGSGYSGGETLNIDPSGLGGGVGASITITSDDIESSAGFVLQLTGGGLTTPDLYAPIVTVDSTTSVSIANSSIVSGISTTGMYALPTDSGTSIAAYSFDSTTGVSTFTADPTTGFGMQRGNSFVAFDSNGYPLGKYYVSSVPSPNIIETKTNSNLIDVALVGKCGYEDNDANTGSSGENIGIRGTAAFDLGVFYLETNSGTGNVLTLSARDGGVTGKVAQKLPLGRYLQIGSEIIRVASTTFGGLNLNEVTVIRGALGTNIINHPQYSKVRAISPLAIELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTALPQLQVEQLPDEEVFLVQAQELSCGQVVYTGMSDNGDFYIGNTKYSATSGTQTTFDVPIPTVAGQNASSNNVVFDEVIVNQRLFVAGGETNQVLSQFDGPVKFTQSVNIENTLGVTGNSSFNTVDILSQENAISLTDGGALTIRGGASVGKDLYIGGTLYSTGDFSTNIVLAAEPDSPISLFENQNNGLLGIGSQPGKVVFNTTVPATGDGGDDIADADAGVVVEGGLVVRGTLLAGEVKANGLGKPGTVIMWGGTVDNVPEGYLLCNGAAYDRTTYDKLFASIGYVHGGSGNNFNVPDLRDKFITGAGSQYNTSDEGGSNTVVLTEAELPTHTHIIDNTDISHTHALDAGATASVVNDNTPLSVSGSTDDDTGKHIHSSGATSDPGNHTHSITDVQHAHSMAGFNQEDSAERSAGLIVDDDRRPNENTGWATRGAFTGITGTNGGGSHTHTISVTNLNSEHNHTLTASGNANHNHDLEGNTASSLGDHDHTAQTTGADVAHENRPPYYALVYLIQYK
Physico‐chemical
properties
protein length:1958 AA
molecular weight: 209976,82440 Da
isoelectric point:4,64098
aromaticity:0,08733
hydropathy:-0,26164

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1958
DC_0066
IPR037053
ATT
1686–1741
IPR037053
SSF88874
STR
1687–1831
SSF88874
IPR011083
ATT
1688–1745
IPR011083
YP_009322953.1
1 1958
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-1685 | ATT 1686-1745 | STR 1746-1958
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_009322953.1
1 1958
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 118 118 0,7934
Central domain 119 317 200 0,8777
C-terminal 318 1958 1640 0,1604
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-118
Central
119-317
C-terminal
318-1958

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM7
[NCBI] 		1883368 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Mazuvirus > Mazuvirus scam7
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009322953.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031927.1 [NCBI]
CDS location
range 20643 -> 26519
strand +
CDS
TTGCCACTTAATAAGTTAGAAAATTTCATTAAGAACGTTGACGGTCGCACTCTGTATGTGAATCCAGCGGATTTGAATGCGACCGACAGTATTACAAACGAAGGCACTTCTCTCACAGAGCCCTTCCGTACTCTTCAAAGGGCACTCATAGAGTCAGCTCGTTTTTCCTATGTTCAGGGAGATAATAACGATTTAATCGAAAAAACTACGATTATCTTATATCCAGGTGAGCACACTATTGATAATAGACCTGGCTATGGTATTAAGGTTGATGGTAGTGGTGATGCTATTGCGGTAGCTCCTAATGGTCAGCAAGTTACACCAGCACCAGTATTCAACCTAGCTTCTGATACAAACTTTGATATTGAGTCCCCAAACAATATTTTATGGCACTTCAACTCCATTTATGGTGGTGTTGTAATTCCTCGTGGTACTTCTATCGTAGGTATGGATCTACGTAAGACAAAGATCCGCCCCAAGTATGTACCAAACCCAACAGACCCATCAGTACCATCCTCTGCAATTTTCCGTGTTACTGGTACCTGTTACTTCTGGCAGTTCACAATTTTTGATGGTGCTGAAAATGGTCTAGTATTCACTGACCCACAAGATTTCTCTGAAAACAATCAGTGTCGCCCAACATTCTCCCACAATAAACTAACCGCATTTGAGTATGCTGATGGTGTAAATCCTGCTATTGCTAATGGATTTGAGCTAACTGACTTGCAGATGTATTATAGTAAGCTATCAAATGCTTATAATGAAGCATCTGGTCGTCAAATTAAGCAGAAGTTTCCAGCACAGCCTGAGGGATTTGCTCCAATGCTCCCTGAGTTTGAGATTGTGGGTGCATTTGCAACAGATCCTATTCGTATTGCTTCTCTAATTTCGGGTGATGGATTTACCCCAGACGCTGTTATTACAGTTGATACTGTTGTTCCCAATGATTTAGCCGTTGGAACTCCCATTAAGATCCGTGGAGTAGCTATATCAGATTATAATATTTCTGCGAAAGTTGCGACAGTCATTAACCCAACACGTTTTACATACCTAATCCCATTCGTAAGACCTGAACTTCCAGCGCGTCCATCAGTATCCTCTGCAACTGTAACCGTTGAGACTGATACTGTTACTGGTGCATCTCCGTACATTTTTAACGTATCCATGCGATCCGTCTGGGGTATCAATGGTATGCATGCTGACGGCAGTAAGGCAACTGGATTCCGTAGCATGGTCGTTGCACAGTTCACCGCGATCAGCCTTCAAAAAGATGACCGTTCATTCGTTAAGTATAACGAACAGGCACGTAGATATGATGGTATTGATGTTAGTACCACAGTACGTGGTGCTGAACTAGCAGCAGGCTCATCCTCCACAAATAGTGCTCGTGTTTATCATCTAGACCCACGAGCAATTTATCGTCCAGGTTGGGATACTACTCACATTAAGATGAGTAATGATGCTGTTATTCAGATCGTTTCAGTCTTTGCTATTGGATTCAACCAGCACTTCGCAGCACTATCTGGAGCTGACGCATCTGTCACCAACTCAAACTCAAACTTCGGTCAATTTGCCCTATTATCAGGTGGATTTAAGAATGATGCATTTGAGAAAGACGACCGAGGATTTGTAACACAAATTGTTACACCAAATACTGCATACAATCCATCAGAAGATGCTATCTCCAATATTGGTTGGGTTAATATTGACTTTTCGTTGACTAACAGCCAATCATTACCTGGTCAGTTATATCTACTTGGTTATTCTAATAAAGAGGATATACCACCATACATCAATCAGGGCTTCCGTATTGGTGGAAACTATAATGAGACTTTATATCAACCACTTAGTGATGAATCACTGGAAAGTGCTTCAATTTGTATGGTTGATAACCTTATTGATGGCAATTCCAATGTTGCTACTGGTACTGATATTGCTCGCAAAACATATCCAGTAATTGCTGGTCCTGGTCAAGGTCCAACATCAGGCTCCACTCTAACTCTTCCATTCCACGGTCTATTAAATGGAGAAACTATTCGTATCTTCTCTGGGACGGGTGATCTACCAGAAAATATCGATGCAGCTACATTATATTACGCAAACGTTGTTGATGCAGAGAACATTCGCATTTCAACCTCCCAGTCTAATGCTCTAAATGACCTATTTTTGGATATTTACGGCGGCACTGATCTGCGCATTGAATCTCGTGTAAATGATAAGACACCTGGTGATGCGGGTCATCCAATCCAGTATGATGATACTATAGGTAATTGGTTTGTTCATACTAATGTAAATAGTGATATCTATCAGTATGTTAAATCAAATCCCACATCTACTGAAGGTCTTGACTCTGTTACTTTCTACCAGAGAGAGGGTGATAATAGAAGCCTTGACGATAAAATCTATAGACTAAGATATGTTATCCCCAAAGAAACTGTAAATGCTAAGCCACCAACCCCAGGATATGTTATTCAGGAGTCTTCTTCTACTGGTGCTAGGGATAATGATGATTTCATCCTCAATGATTTAACATTCACTGATTATGAATATGATAGAAACCCAAGATATATTGTTAGCTGTAACTTCATCTCTATCTCATCAGAGGTAGAGGTTCGCAGTGAAATCCCTCACCAATTATTTGTTGGTGATAAGATCAACATCATTAATGTTACTTCAACAAATAATCCTGACGCAGTAAATGGTAGAGGATATAATGGTGAGTTCTTAGTAACACGTATTATAGATGCTAGAACTTTCTATTATAGTTCTACTGATGTTAATGGATTTACTAGAAACTTAATTGGTGAATTGTTTACCAATGATACAAACGATAGAAACATCCTACTACCACGTTTTCAGCGTAAGGATAATCAAACCAATACTTTCGTCTATCGTGTAGAGGAAATTTCTCCATTCAGTGAGACGATTAGAGATGGTATCTATCATTTGTTCTGTGTTAATGGTTCAAATCAAGTAACCGAGACCTTTACCAATAGATTCTACAATCAGCCCATTGAAGATCTTTATCCTCAATTAGATACTGATAATACTAATAACAATGTTGAGTCATCAACAACTTTCGCCAATAGTTCACCACTAGGTAAAGTCGTTATTGATAGCCTACAGTCCTCTATCACTAGAGAGACTATTGATAAGCTATCAAAGAGTTCAAGTACAAATATAATCAAAACAGTTACTATTGGTGCTTCAGAAACTACATTAGAATTTGAGCGTGAGCACAACTTCAGTGGAGTATATGGTTACACTACATTAGCCGGTGGTAGTGGTTATGTTGATGGTACTTACTATAATGTAAGGTTGCTATCTGGTGCTGCCTGGAAAGGTGCATCTGCCGAGGTTGTTGTTATCTCAGGTCAAGTTAATTCACTAACCATTATGGACCCAGGTTCTGGGTATAGTGGTGGAGAAACATTGAATATTGATCCATCTGGCTTGGGTGGTGGCGTAGGCGCAAGTATTACTATCACTTCAGATGATATTGAAAGTTCTGCTGGATTCGTATTACAGCTTACTGGTGGTGGTCTAACAACACCCGACTTATACGCACCTATTGTAACAGTAGATAGTACAACATCAGTATCAATTGCTAATTCTTCTATTGTTTCTGGTATCTCAACTACTGGAATGTATGCTCTACCTACCGATAGTGGAACATCTATCGCAGCATATAGTTTTGATAGCACTACTGGAGTATCAACATTCACTGCAGACCCAACAACTGGCTTTGGTATGCAGAGGGGCAATAGCTTCGTAGCATTTGATTCTAATGGATATCCATTAGGTAAGTATTACGTGTCTTCTGTTCCATCTCCAAACATCATTGAAACTAAAACTAATTCAAATCTAATAGATGTAGCATTAGTTGGTAAGTGTGGTTATGAAGATAACGATGCTAATACTGGTTCTAGTGGAGAAAATATTGGTATCCGTGGTACCGCAGCATTTGATTTGGGTGTATTCTACTTAGAAACCAATTCAGGCACTGGAAATGTATTGACTCTATCAGCCAGAGATGGCGGCGTAACTGGTAAAGTCGCACAGAAACTACCTCTTGGAAGATACCTACAGATTGGCTCTGAAATTATTCGTGTTGCTAGCACTACATTTGGTGGACTAAACCTTAATGAAGTAACTGTTATTCGTGGTGCTCTTGGTACTAATATCATCAACCACCCACAGTATTCTAAGGTTCGTGCTATCTCTCCATTAGCGATTGAGCTACGCAGACCTTCTATTCTCCGTGCATCTGGTCACACTTTTGAGTACCTAGGCTATGGTCCTGGTAACTACTCAACAGCACTACCACAGCTACAAGTAGAACAGCTCCCTGATGAAGAAGTATTCTTGGTACAGGCACAGGAACTATCTTGTGGTCAGGTTGTATACACTGGTATGTCCGATAATGGAGACTTCTACATCGGTAACACCAAGTATTCTGCTACTTCAGGCACACAAACTACATTTGATGTACCCATTCCAACAGTAGCAGGTCAAAATGCTTCCAGTAATAACGTAGTATTTGATGAAGTTATAGTCAATCAGAGATTATTCGTTGCTGGTGGTGAGACAAATCAAGTTCTATCACAGTTTGATGGACCTGTTAAGTTTACTCAATCAGTTAACATAGAAAATACTTTAGGTGTAACAGGTAATAGTTCATTCAATACTGTAGATATTCTCTCACAGGAGAATGCTATTTCTCTAACTGATGGTGGAGCACTTACTATTCGTGGTGGGGCATCCGTTGGTAAGGATTTGTATATTGGAGGCACACTATACTCAACTGGTGATTTCTCTACTAATATTGTTTTAGCAGCTGAGCCAGATTCTCCTATTAGCCTATTTGAGAATCAGAATAATGGTTTGCTTGGTATTGGTAGTCAACCAGGTAAAGTTGTTTTCAACACAACAGTACCTGCTACTGGTGATGGTGGAGATGACATTGCTGATGCTGATGCTGGTGTTGTTGTTGAGGGTGGTTTAGTTGTAAGGGGCACTCTACTAGCAGGTGAAGTTAAGGCTAATGGTCTTGGTAAGCCTGGTACCGTTATTATGTGGGGTGGTACTGTTGATAATGTCCCTGAGGGATACTTATTGTGTAATGGTGCAGCATATGATAGAACCACATACGATAAGTTATTCGCTTCCATTGGGTATGTTCATGGTGGTTCTGGTAATAACTTCAATGTTCCTGACCTAAGAGACAAGTTCATTACTGGTGCTGGTTCTCAATATAATACTTCTGATGAAGGTGGAAGCAATACTGTTGTTTTAACTGAAGCGGAACTTCCCACGCATACTCACATCATAGACAATACGGATATATCCCATACACACGCTCTTGATGCGGGGGCAACTGCAAGTGTTGTAAATGATAATACTCCATTATCTGTTAGTGGTTCTACTGATGATGATACAGGAAAGCATATACACTCTTCTGGTGCTACCAGTGATCCTGGAAATCATACCCATTCTATTACTGATGTACAACATGCACATAGTATGGCAGGCTTTAATCAAGAGGACAGTGCAGAAAGAAGTGCTGGACTCATTGTCGATGATGATCGAAGACCTAATGAGAATACTGGGTGGGCTACAAGGGGAGCATTCACTGGAATTACTGGCACGAATGGAGGTGGGAGTCATACCCATACTATTTCTGTAACTAATCTCAACTCCGAGCATAATCATACATTGACTGCTAGTGGTAATGCTAACCATAACCATGATCTTGAGGGAAATACTGCAAGTTCTCTTGGTGATCATGATCATACTGCACAAACCACTGGTGCTGATGTTGCTCACGAGAACCGTCCTCCATATTACGCTCTGGTCTATTTGATCCAGTACAAGTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5bc4836a5e816498dd0e122c3e113dd9bd68745064a169d9c93cd438d4a2dc27
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7999
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50