Protein

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Genbank accession
WBM23485.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,69
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGGYLQNGTFNLNGNMFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGTGRMAVGMSQGLLVEPGILDISTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNVSGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLHIIPTLKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDNKLVVVTSNSRISPNFRMQIGQSVYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSSTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQVTAAWADDLFRDGVTTISANAYAKLNSGITGSTLATKVGKTSNDGAHTHSWSGTTSTTGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVSIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1096 AA
molecular weight: 116450,27590 Da
isoelectric point:8,08351
aromaticity:0,08394
hydropathy:-0,37208

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1094
DC_0538
IPR051934
Unmapped
733–1096
IPR051934
SSF88874
STR
837–966
SSF88874 SSF88874
IPR037053
ATT
844–897
IPR037053
IPR011083
ATT
849–896
IPR011083
WBM23485.1
1 1096
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-843 | ATT 844-897 | STR 898-1095 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WBM23485.1
1 1096
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 179 179 0,3238
Central domain 180 378 200 0,6186
C-terminal 379 1096 717 0,7691
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-179
Central
180-378
C-terminal
379-1096

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PNJ-6
[NCBI] 		3017168 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBM23485.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ076693.1 [NCBI]
CDS location
range 49184 -> 52474
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGTGGTTATTTACAAAACGGCACATTTAACCTCAATGGTAATATGTTCGTTTACGCTGGTAAGTATATTGAATTTTTACCTAAAACCGCTGGAAATGGTGCATGGGCCAACCAACATTTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGGCGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAATGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGTATGTCCCAAGGTCTCCTTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAGCACTGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGTATCCGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGATATTATTTTTATTCTCAGCGCGTAGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGTGGTGGTTCTATTACCGGTCAAGTTAAAATCGGTAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCGTCTTTGCATATTATACCTACACTTAAAGATGCAGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGCTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGTGCTGGTGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATAACAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGCATTTCTCCTAATTTCAGAATGCAGATAGGTCAGTCGGTGTACATCGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCAGCCGGAGCGGGTTCATTTGCTTCCCAGAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCTTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGCGATGGCGTTTCTACTGGCGCAATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCAGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTAGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGCAGTACTACTGGTAACCATAACCATACAGTAAGTGGGAACACCAGTTCAGCCGGTGCTCACCAGCACGCTCGTTCAGGTCCACAGGTCACTGCTGCATGGGCAGACGATTTGTTTAGAGACGGGGTTACTACGATAAGTGCAAACGCATATGCTAAACTTAACTCAGGTATCACTGGTTCGACTTTAGCAACTAAGGTCGGTAAAACATCAAATGATGGCGCCCATACCCACTCTTGGTCTGGTACTACTAGCACCACAGGTAACCATGCCCATACCGTTGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTCGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTTCAATTGGTTCCCATGGCCATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
70def3113e5086e30a59e81b304dd9f5badc2aac4b1438193f6b1eee603e8c42
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4909
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Glycosylation modification of MUC2 determines the protective role of bacteriophages Wu,J. and Tang,F. 2025-07-11 — GenBank