Protein

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Genbank accession
QBX16133.1 [GenBank]
Protein name
capsid and scaffold protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,74
Protein sequence
MNNVRIAIRDSTDSHSVGFFDNVAGIKYKKAEIQRFLAGSASILTLQYNSKDIDTIRTGCKLAFRYKARDYWLNIMKFEKQGFEVEITACSLHLELNNEERGAHKPDKAMSFAEYLAYYDPEHSVTLGINQVSDKRIKLEWTGTDTILARLFSIANSFDAELEFVTELNDDYSLKRHVLNVYKKGNLGSNKTSSPVRVGKELKVINYSDSIEDLRTAVRATGKDGLTIDGLNKKIYDDNKQLLYYSSGNTVYAPQSRDRFPSVGQASNDNWLVKDLGETEYETKEGLWGYMYGEIQKICLPKIEYKVTGAIDSDVGDTQTLIDDVHYEPPLYLKARVSELTDDILQGKVIDSTFINFERQYSQIADSLLKQVEALAEDAAPYIVRLSTDNGYNFKNGQGTSTITAKLEKYSKIVNADWKWLINNSVVSDKNSVTINASQVTGTLNVVAVASVDGNEVAREYITFTNSDDGVGIKSIKRYYTTNDQAEGVTAGGQNWSTKPTTVTADKNYMWSYDVITYTNDTNLVTEPAVIGARGDDGLDADTTGITEALDKAKQELTALSANIEKVRDDSLAAVAEAKQQLTTVANDLNTAKQDLQKQASQLTAQASAQSELTKRVSTVEETANGTKTTVSELNKAVDSNTKNITSVTARTKTVEDDLTSTKTTLSQVKTTADSTSQKTATLETGLNGLNAKFETLKIGSRNYFKNSKSRKYYINSTKTQDVRTYIDDEFWQNDTRFTKNYVRMSFDIAFNPALPSNFTTNVHFSASPWYNCGGITFKGGTTALQHFDLKFDLSGASKSYKTDNVFIRLNNTLPLNTAVSLENFNLYLSAVVEDYNQNEADIESKVAEYKQTADQNYASLQSTVQTLDGTVKQNKSEFDQTASQIKSSISAVEGKIPTEIGSSNLLRNTAVNADNLKLFGTANSTVSIATKDGHQTYKIVVSATNNSGALFNGNAQYYNLIKDRYYTFSFWVLTNKDKTYSSGSLGHIQAINNNSDQVGNDTVHQHTTPVYSTNTIKANTWTRVWCTFKATSNSYFKPYFWYLTAGDEIYIYDMMLNEGKIPLSYTPAVEDTQSDITKLNTTLTQTANGLEQLSTQVTSQGNTITSHTNSINSLSTGLSAKVSQTDFNTLSGRVTTAENNITAKANELSSKISSLNVGNKNYLPTSRVINRGCTNFSYSETSKSWTMTVPASSTTFGNGITFNTSGLNILLNGSETLFFGLMIKASKACSFNYDINNALSGSASNDNDDRGKQAWSPSNKSIPANVWTRVWFSYTAKANVPITEANSNFGIVNNTEAITVEIKEVMVAKSNVPVDYQTPDADFEAKNTELKQTAESIKASVSALDSSTVKTATLNLDNNGFVTKVGKTVNGNTFATMIAQNESDVQIIAKKMKVSGDMIVNGAITAEKLNINSLSALSAKLGDVTSGSITNGFSSGTRSGSIKIKDNVEITSTDTSNLLPEKAKENLVLSTGSLAMNASTSSDEATHSMLIMPETIKYTKNNYDTTRGGTSGWSLTHNGYYSMLQVDMVWQNVRLNNTSNLPYGIKANYVRIGNLVTISVNRQITNVAVVTENNLANETIPTGFRPISQAHLTLTGNTGSTIDATCICHLNPDGTIRFTNNKTGNRVWTGTVTYTCVEPMPYVKDLNNGSTI
Physico‐chemical
properties
protein length:1653 AA
molecular weight: 181556,73340 Da
isoelectric point:5,80704
aromaticity:0,08409
hydropathy:-0,43950

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
1–681
DC_0690 DC_1398
PTHR43049
Unmapped
537–1157
PTHR43049
Coil
Unmapped
550–570
Coil Coil Coil G3DSA:2.60.120.260 G3DSA:1.20.5.340
G3DSA:1.20.5.340
STR
608–698
G3DSA:1.20.5.340 DC_1418
QBX16133.1
1 1653
Architecture
STR
STR
STR 1-698 | STR 795-1552 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan233
[NCBI] 		2548059 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus gallolyticus
[NCBI] 		315405 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX16133.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448710 [NCBI]
CDS location
range 31560 -> 36521
strand +
CDS
ATGAATAATGTACGTATTGCCATTCGGGATTCAACAGATAGCCACAGCGTTGGCTTCTTCGATAACGTGGCAGGTATTAAATACAAGAAAGCGGAAATACAGCGATTTCTGGCAGGTTCTGCTAGTATTTTAACACTACAATATAACTCAAAAGACATTGACACAATTCGTACTGGTTGCAAGCTCGCTTTTCGCTATAAAGCTCGTGACTACTGGCTTAACATCATGAAGTTTGAAAAACAAGGCTTTGAAGTCGAAATCACAGCTTGCTCATTGCATTTAGAGTTAAACAATGAAGAACGAGGAGCGCACAAACCAGATAAGGCAATGTCATTCGCTGAATATTTAGCTTATTATGACCCTGAACATTCCGTAACACTCGGCATCAATCAAGTGTCAGATAAGAGAATTAAATTAGAGTGGACGGGTACAGACACGATTCTGGCGCGTCTATTTTCGATTGCCAACAGCTTTGACGCAGAGCTTGAATTTGTTACAGAATTAAACGACGACTATTCTTTGAAACGTCATGTATTGAACGTCTATAAGAAAGGTAACCTTGGTTCAAACAAAACAAGCAGCCCAGTCCGTGTTGGTAAAGAGCTTAAGGTTATCAATTACAGTGATAGCATTGAGGATTTGCGCACGGCTGTACGCGCAACTGGTAAAGACGGTTTAACTATCGATGGATTAAATAAGAAAATCTATGATGATAATAAACAGCTTCTTTATTATTCAAGTGGCAATACAGTTTATGCGCCACAATCTCGTGACCGTTTCCCGTCCGTCGGTCAAGCTTCAAACGATAACTGGCTTGTTAAAGATTTAGGCGAGACGGAATATGAGACTAAAGAGGGCTTGTGGGGCTACATGTATGGAGAAATCCAAAAAATCTGTTTGCCCAAAATTGAGTATAAAGTGACTGGTGCGATTGATAGTGATGTCGGTGACACACAAACACTCATTGATGACGTGCATTATGAACCGCCACTTTATTTAAAAGCTCGTGTGTCAGAGTTAACAGACGACATATTGCAAGGCAAGGTCATTGATTCAACGTTTATCAATTTTGAGCGACAATACAGTCAAATCGCAGACAGCTTATTAAAACAGGTCGAAGCACTCGCAGAGGACGCAGCGCCTTACATTGTTCGTTTATCAACTGATAATGGCTACAATTTTAAAAACGGTCAAGGTACAAGCACAATCACAGCTAAACTCGAAAAATATAGCAAGATTGTTAATGCAGATTGGAAATGGCTTATCAATAACAGCGTTGTTAGCGATAAGAACAGCGTCACAATCAATGCTAGTCAAGTTACTGGTACGTTGAATGTGGTAGCAGTTGCAAGTGTAGACGGTAACGAGGTAGCTCGTGAATACATCACATTCACCAATTCTGATGACGGTGTTGGTATTAAATCAATCAAACGTTATTACACGACTAACGACCAAGCCGAGGGCGTAACAGCAGGCGGTCAAAACTGGTCTACCAAGCCAACAACTGTTACGGCGGACAAAAATTACATGTGGTCTTATGACGTCATCACGTATACGAATGACACAAATCTAGTCACAGAGCCAGCCGTTATTGGCGCTCGTGGGGATGACGGTTTGGACGCTGACACGACAGGTATTACAGAAGCACTTGACAAAGCTAAGCAAGAATTGACTGCTTTATCAGCAAATATCGAAAAGGTGCGAGATGATTCGCTTGCAGCAGTCGCAGAAGCCAAACAACAACTCACTACAGTAGCTAACGATTTGAACACTGCTAAGCAAGACTTGCAAAAACAAGCTAGTCAGTTGACTGCACAAGCTAGCGCACAGTCTGAACTAACCAAACGTGTCTCAACAGTCGAAGAAACCGCAAATGGTACAAAGACGACTGTTAGCGAGTTAAACAAGGCAGTTGACAGCAACACTAAAAATATTACTAGCGTTACTGCTCGGACTAAAACGGTTGAAGATGATTTGACAAGCACGAAGACAACGCTATCGCAAGTTAAGACGACTGCGGACAGTACCAGTCAAAAAACGGCTACTTTAGAAACTGGATTGAATGGACTTAATGCGAAGTTTGAAACTTTGAAAATCGGTAGTCGAAACTATTTCAAGAATTCAAAATCACGTAAATACTATATTAATAGTACAAAAACACAAGACGTCAGAACTTATATTGATGATGAATTTTGGCAAAATGATACTCGTTTTACTAAAAACTACGTGAGAATGTCTTTTGATATTGCTTTCAATCCAGCTTTGCCATCAAATTTCACAACGAATGTACATTTTAGTGCTAGCCCTTGGTATAACTGCGGTGGCATTACATTCAAAGGTGGCACAACTGCTTTACAACACTTTGATTTGAAGTTTGATTTGAGTGGTGCTAGCAAGAGCTATAAAACGGATAATGTATTTATTCGTTTAAATAATACACTTCCACTTAATACAGCTGTAAGTCTTGAAAACTTTAATCTCTACTTATCTGCGGTAGTTGAAGACTATAACCAAAATGAAGCCGATATTGAATCGAAAGTCGCTGAGTACAAGCAAACAGCAGACCAGAACTACGCTAGCTTGCAATCAACAGTTCAAACATTAGACGGTACGGTTAAGCAGAATAAGTCAGAGTTCGACCAAACAGCAAGTCAGATTAAAAGTAGTATTTCAGCAGTCGAGGGTAAGATACCAACCGAAATAGGGTCATCTAACTTATTGCGAAACACTGCGGTAAATGCTGATAACTTAAAACTTTTTGGAACAGCTAACTCAACAGTTAGCATTGCCACAAAAGATGGACATCAGACGTATAAAATCGTAGTGTCAGCTACTAACAATTCTGGTGCGCTTTTCAACGGTAACGCTCAATACTACAATTTAATCAAAGACAGGTATTACACGTTTAGTTTCTGGGTTTTAACTAACAAAGATAAGACCTACAGCAGTGGCAGTCTAGGTCATATCCAAGCTATTAACAATAATAGCGATCAAGTTGGCAACGATACTGTACACCAACACACAACACCTGTTTATAGTACAAATACTATAAAAGCGAATACGTGGACAAGAGTTTGGTGTACGTTTAAGGCTACATCAAATAGTTACTTTAAACCGTATTTCTGGTATCTAACGGCTGGGGATGAAATTTACATCTATGACATGATGTTAAATGAAGGGAAGATTCCTTTAAGCTATACGCCAGCAGTTGAAGACACACAATCTGACATCACTAAACTAAACACTACTCTCACTCAAACCGCAAACGGTCTTGAACAGCTTAGCACGCAAGTAACGTCGCAAGGAAACACAATTACATCACACACTAACTCGATTAATTCATTATCAACTGGTTTAAGTGCCAAAGTCTCACAGACTGATTTCAATACGCTGTCTGGTCGTGTGACAACTGCAGAAAATAACATTACAGCTAAAGCTAACGAGTTAAGCAGTAAGATTAGTAGTTTAAACGTTGGTAATAAGAACTATTTACCAACGTCACGAGTAATCAATCGTGGATGTACTAATTTCAGTTACAGTGAAACGTCTAAGAGCTGGACAATGACAGTACCAGCAAGTTCAACGACTTTTGGTAATGGTATCACGTTCAACACAAGTGGTCTTAATATTCTTTTAAACGGTAGCGAAACGCTATTCTTTGGCTTGATGATAAAGGCGAGTAAAGCATGTTCTTTTAACTACGACATTAACAACGCTTTATCTGGTTCAGCGTCAAATGATAACGACGATAGAGGCAAACAAGCGTGGTCGCCATCCAACAAAAGCATTCCAGCAAATGTTTGGACGAGGGTTTGGTTTAGCTATACTGCTAAAGCTAACGTGCCAATCACAGAAGCTAACTCTAATTTTGGTATTGTCAACAACACCGAAGCAATCACTGTTGAAATCAAAGAGGTTATGGTTGCTAAGTCAAACGTACCTGTTGATTATCAAACGCCTGATGCTGATTTTGAAGCTAAGAATACAGAATTAAAACAGACTGCTGAATCAATCAAAGCAAGTGTGTCTGCGTTGGATAGTTCGACGGTTAAGACGGCAACTCTTAATCTTGACAACAACGGCTTTGTGACGAAAGTCGGTAAAACCGTTAACGGTAACACGTTCGCGACAATGATTGCACAAAATGAATCAGACGTTCAAATTATCGCTAAGAAAATGAAAGTTAGCGGTGACATGATTGTCAATGGTGCGATTACAGCGGAGAAACTAAATATCAATAGCTTGTCTGCGTTGAGTGCAAAACTCGGCGATGTAACATCAGGTTCAATCACGAACGGCTTCTCATCTGGTACACGAAGCGGAAGTATCAAAATTAAGGATAATGTTGAAATCACATCAACAGACACCTCTAATTTATTACCTGAAAAGGCAAAAGAAAACTTAGTGCTGTCCACTGGAAGCTTAGCAATGAATGCTAGCACATCAAGCGATGAAGCAACACACTCGATGTTAATCATGCCAGAGACAATTAAGTATACTAAAAATAATTACGACACCACTCGAGGCGGCACGAGTGGTTGGAGCTTGACACATAACGGCTACTATTCAATGCTTCAAGTTGATATGGTTTGGCAAAATGTACGACTTAATAATACGTCAAATTTGCCTTACGGAATTAAAGCTAACTATGTTCGAATCGGTAATTTGGTGACTATTTCAGTTAACCGCCAAATTACAAACGTAGCAGTTGTAACAGAAAATAATCTAGCAAATGAAACAATTCCAACTGGCTTTAGACCGATTTCACAAGCGCATTTAACATTGACTGGTAATACTGGTTCAACGATTGACGCAACGTGTATTTGTCATTTAAACCCAGACGGTACAATTCGTTTTACTAATAATAAGACAGGCAATCGTGTGTGGACTGGCACAGTCACTTATACATGCGTTGAACCTATGCCTTACGTCAAAGATTTAAATAATGGTTCTACAATTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4f2da0df36402489a7a8cde8e68275ff75889d03eb7cdf499fb3c03bc7c80343
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7731
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50