Protein

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Genbank accession
AIX43618.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAYLLSNGGVIINDSREIVNAGVVTATAFFGDGSGLSGIATISDGGISIGDANITGNLNVSGISTVEFLNASDINVGGALTVTGDLSVGGDLSFDEVSGRNLNITGISTLGTVKISNGIVTATSGVVTYYGDGSNLTGIDITDSDVRLRNLSVTGVSTFTGDVSFGANASLVGDLTSGRNANLSGIATVNDIYIDNLLYDSNNNVGAAGSILVTAGGKLQWLPPDQAGIATVFQPGNTFFVSKNGDDSSDGLSMEKSFATISYALSQISSGTNNVLLITAGDYEEVFPLSVPDGLTVKGVGQRAVLVRPTSATETNDGFQLGNASTVEDLTIGQMFKPQGASNNNYAFTYRSGATISSRGPYVSRVTVLNKGSVTSTSDPFGYGSADAYPTTAPGGAGVLADGSVLNSASLEASFLLNEVTTFTAGNIGIDMVNGARVEWLNGFSYFASEGVKGRADQSTGLYGAGKTRLRVENASGGLVNGNTIELYDIDGTTSLASGTIDGTSGAYTTLTTGGTGTFAIAGSRKAKAASFVDTASLSTTQAKFGNASLDVTGQSTDCINVDPSSDFGFGTGDFTAEFWLYRTSATAGATILDMRDAADTDSALSIRENTSDVIEVLVGNSVVLTSSTSAIGNAAWYHIAVARLGSTMELFINGAQEASASNSSDLGLSQSLTFGADYANANGTIAFLDELRIEKGAAKYTNPFTPSTVPLEGDRGTAILLHFDGSNGATEAPDDIQIFQDIRISGGNTADRLSLADYSQFGAELRSSGCAVEYGNKGVVGDGAGVALRLIGINFSFVGALGDLTNDPNLAVQANEVTETNNAEVSFTSIDQGGDFRVGESFYVNQETGDVSFNNTTTDLTSLSSLTITDGTNNSLITPTSGRFGNVQISGQQVASVSGDLDLVTAGGGEVNIYGNTNVVGILTAQVVEINAIQKGDTSIALDDTGTDGTIRFNTDGSEAGRFTKDNDLAVTHNFRVGGIGTIPNLVSTTATITTLNVENLVSSGSTSGGGGTGIGSTAINSPNLNISGQANFNNVNVSGVATVPDLTVTNSFTNTGYSTITGDAEVGGNLWLKGDLNVIGSQNVSEFFATNMEISGIATFGTVKVNSNVHCDDTVFVGGAVTITGPITAVDIFATGIGTIPVADVGHADVDSINVTGISTISQVDIGKITVGDFTVTGFATVTDGLEVIGPVSFGGSITQLPLPTGQGGVWFDNSVVGVGTLLATNASISGLLGVGNSLGVAGDAYIDGNIIGSGGTISNYNEIITPLLTATDIDAATLDVSGNVTIDGNVDLGDTSADFVRINGRVSTSFIPSTDSATDLGSNGLRWKELFVDKLTLTDDAAIGGDLSVGGSVSADYVDTTELNVSGVATFAQISIGGGGGGISTNGVIINNVTVTDQSTLNNLIVSGVSTFVGVSTFKGDVYIDGNLIIDGDNSQDLISGTNLLVSGIATIGTLGVTTNLTVGGDVLVSGAMTAGSYNGDGSQLDNLPAASITTSITPTTRVNGDTLQTGDLWYDSSELRQYTYYDDGGSVQWVPSAPEPTIPDFTYAGNTGIGTLSLGDDTFSVVGDGTNVVTTASGVTTTVTISLSDSVAIAGSMTAGSFLGENLNVSGVSTFVGVTTFRGDVFIEGNLIIDGDESQDLVSGTNLIITGIATIGTLGVTTTTTNTLTVLDTFTLDNPVNSIGISSDLGGAGAAHTALASQLAIKQYIDANNSDQNLNFTGDTGSGSIGLGTEFLEVRGTAQQVTTIGVGNSVVIGLPNTVRVPQRLYVGGGAFTQVMDANSASGVVFANKIVTINKGLTLSSSDLTGVRNLVQTGIATLGTVNFSGVTTTVGNAFVGNDLSVLGTVNANDFNSTSSLV
Physico‐chemical
properties
protein length:1864 AA
molecular weight: 189195,54570 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06438
hydropathy:0,13444

Domains

Domains [InterPro]
DC_0763
STR
2–899
DC_0763 DC_0407 DC_1345
G3DSA:2.60.120.200
STR
504–703
G3DSA:2.60.120.200 DC_0407
IPR013320
STR
538–696
IPR013320
PF13385
LEC
568–697
PF13385
AIX43618.1
1 1864
Architecture
STR
STR
STR
STR 2-899 | STR 910-1159 | STR 1208-1815 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX43618.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019150 [NCBI]
CDS location
range 209308 -> 214902
strand +
CDS
ATGGCATATTTACTTTCTAATGGGGGCGTTATTATTAACGACTCCAGAGAAATCGTAAATGCTGGGGTTGTAACTGCTACTGCGTTCTTTGGGGACGGTTCTGGTTTATCTGGAATCGCAACCATTTCTGATGGGGGAATCTCCATCGGCGACGCAAACATCACTGGAAACTTAAATGTTTCTGGTATTTCTACCGTAGAATTCTTAAACGCTTCTGACATTAATGTCGGCGGTGCTTTAACAGTCACAGGTGATCTATCTGTCGGTGGTGATTTATCTTTTGATGAGGTTTCTGGTAGAAACCTAAACATCACTGGTATTTCCACACTCGGAACAGTTAAGATTTCAAATGGCATTGTAACCGCCACTAGTGGCGTTGTTACATATTACGGTGATGGTAGCAATCTAACCGGCATTGACATCACAGATAGTGATGTAAGACTCAGAAACCTTTCGGTTACTGGTGTCTCTACATTCACAGGTGATGTATCTTTTGGAGCAAACGCTTCTCTAGTAGGCGACCTAACTTCTGGTCGTAACGCAAACCTTTCAGGTATTGCGACAGTAAATGATATCTATATTGATAACTTACTTTATGATTCCAACAATAATGTTGGAGCAGCTGGTTCAATTCTTGTAACCGCAGGTGGAAAGTTACAGTGGCTACCGCCCGATCAAGCGGGTATTGCTACAGTATTCCAACCAGGAAATACATTCTTTGTTTCTAAGAATGGTGATGATAGTAGTGATGGTCTCTCCATGGAGAAATCATTTGCTACCATTTCCTACGCTCTGTCTCAGATTTCATCAGGGACAAACAACGTTCTCTTAATCACCGCTGGTGATTATGAAGAAGTATTCCCACTATCAGTTCCCGATGGACTGACTGTTAAGGGTGTTGGACAACGTGCGGTTCTAGTTAGACCCACTTCAGCTACAGAAACCAACGATGGTTTCCAACTTGGTAACGCATCCACAGTTGAAGATTTGACCATTGGTCAGATGTTTAAACCTCAAGGTGCTTCCAATAATAACTACGCTTTCACATATAGAAGTGGTGCTACCATTTCATCTCGTGGACCTTATGTTTCTAGAGTTACGGTTCTAAACAAAGGTAGCGTAACTTCTACCTCTGACCCATTTGGATATGGTTCAGCTGATGCTTATCCAACGACTGCCCCTGGTGGTGCTGGTGTATTGGCTGATGGTAGTGTTCTTAACTCCGCCTCACTAGAAGCCTCATTCCTACTTAACGAAGTCACCACCTTCACTGCCGGTAACATCGGTATTGATATGGTCAACGGTGCTCGTGTTGAGTGGTTGAATGGTTTCTCCTACTTCGCATCCGAGGGTGTTAAAGGTAGAGCTGACCAGTCAACTGGTTTGTATGGTGCAGGTAAGACGAGACTAAGAGTTGAGAACGCCTCTGGTGGTCTAGTCAATGGTAATACCATTGAACTCTATGATATTGATGGCACGACTAGCCTTGCTAGTGGTACTATTGACGGCACCAGTGGTGCATACACGACCCTGACTACTGGTGGTACTGGTACCTTCGCTATTGCAGGAAGTCGTAAGGCGAAAGCTGCCTCATTCGTTGATACAGCCTCTCTATCTACAACACAAGCCAAATTCGGGAATGCTTCACTAGATGTAACTGGTCAGTCTACTGATTGTATCAATGTTGATCCAAGCAGTGACTTCGGTTTCGGTACTGGTGACTTTACAGCTGAATTCTGGTTGTATAGAACATCAGCTACTGCTGGTGCTACTATTCTCGATATGAGAGATGCAGCTGATACTGATTCAGCTCTATCTATTAGAGAGAACACTAGTGATGTTATTGAAGTTCTTGTCGGCAACTCTGTTGTTCTAACTTCATCCACAAGTGCTATTGGTAATGCCGCTTGGTATCACATTGCTGTTGCCCGTTTGGGTAGCACAATGGAACTATTCATTAATGGTGCCCAGGAAGCTTCAGCATCCAATTCATCTGACTTAGGTCTAAGCCAGTCACTCACCTTTGGTGCTGACTATGCTAACGCCAATGGTACTATTGCGTTCTTAGATGAACTCCGTATCGAGAAGGGTGCTGCTAAGTACACGAATCCGTTTACTCCTTCCACTGTACCCCTTGAGGGTGACCGTGGTACAGCTATCCTACTCCACTTTGATGGATCAAATGGAGCAACTGAAGCTCCTGATGATATTCAGATATTCCAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGATAGACTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTGTTGAGTATGGTAACAAAGGTGTCGTCGGAGACGGTGCTGGTGTTGCTCTAAGACTCATCGGTATTAACTTCAGTTTCGTAGGTGCCCTAGGTGATCTAACTAACGATCCAAACCTAGCCGTTCAGGCTAATGAAGTTACAGAAACCAACAATGCTGAGGTATCTTTCACCAGTATTGATCAAGGTGGTGACTTCCGTGTTGGTGAATCCTTCTATGTTAACCAGGAAACTGGTGATGTATCATTCAACAACACAACAACTGATCTAACCTCACTATCTAGTCTAACCATCACTGATGGTACTAACAACTCACTTATCACTCCTACCTCTGGTAGATTTGGTAATGTTCAGATCTCTGGACAGCAAGTTGCTTCTGTATCTGGTGACCTAGACCTAGTAACCGCTGGTGGTGGTGAAGTTAACATCTACGGTAATACTAACGTTGTTGGTATTCTAACCGCACAGGTTGTTGAGATCAACGCTATCCAGAAGGGTGATACTTCTATCGCTCTAGATGATACCGGTACTGATGGTACTATCCGGTTTAACACCGATGGTTCTGAGGCAGGTAGATTCACTAAGGATAACGACCTTGCAGTAACACACAACTTCCGCGTTGGTGGAATTGGTACTATTCCAAACTTGGTAAGTACTACTGCGACCATCACAACTCTAAATGTTGAGAACCTTGTCAGTAGTGGTAGCACTAGTGGCGGTGGCGGAACTGGTATCGGTTCTACCGCTATCAATTCACCTAACCTTAATATTTCTGGTCAGGCAAACTTCAACAACGTCAACGTTTCTGGTGTTGCCACGGTTCCTGATCTAACTGTAACCAACTCCTTTACTAATACTGGTTATTCAACCATCACTGGTGACGCCGAAGTTGGTGGAAATCTATGGTTGAAGGGTGACCTCAATGTTATCGGTTCCCAGAATGTTAGCGAGTTCTTCGCTACCAATATGGAGATCTCTGGTATCGCTACCTTCGGTACCGTAAAGGTCAACAGTAATGTCCATTGTGACGATACTGTATTTGTTGGCGGTGCTGTAACAATCACTGGTCCAATCACAGCAGTGGATATCTTTGCCACTGGTATTGGAACCATTCCTGTAGCAGATGTTGGACATGCCGATGTTGATTCTATCAATGTCACTGGTATCTCTACTATCTCTCAGGTTGATATCGGTAAGATTACCGTAGGTGACTTCACTGTAACTGGATTTGCAACTGTCACTGACGGACTTGAAGTTATCGGTCCTGTCTCATTTGGTGGTTCTATCACACAACTACCTCTACCAACTGGTCAAGGTGGTGTTTGGTTTGACAACTCTGTTGTGGGTGTCGGCACACTACTCGCCACTAATGCATCAATTAGCGGACTCCTCGGAGTTGGTAATTCATTGGGTGTTGCTGGTGATGCCTACATCGATGGAAACATCATTGGTTCTGGTGGTACTATCTCTAATTACAACGAGATTATTACACCTCTCCTAACCGCAACTGATATCGATGCAGCTACACTCGATGTTAGTGGTAACGTAACCATTGATGGAAACGTAGACCTTGGTGACACATCTGCCGACTTCGTTAGAATCAACGGTAGAGTAAGTACTTCCTTTATTCCTTCTACTGATAGTGCAACTGACTTAGGTAGCAATGGTCTCAGGTGGAAAGAACTCTTCGTTGATAAACTCACCCTCACAGATGATGCTGCTATTGGTGGTGATCTATCTGTTGGTGGTAGTGTATCTGCCGATTATGTAGATACTACTGAACTCAATGTCAGTGGTGTTGCAACCTTCGCTCAGATTTCAATTGGTGGTGGCGGCGGTGGTATTAGTACCAACGGCGTTATTATTAACAATGTTACTGTTACTGACCAGAGTACTCTTAACAACCTCATTGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGTGTTTCTACCTTCAAGGGTGATGTCTATATCGATGGTAACCTAATCATTGATGGTGATAACAGTCAGGATCTAATCAGTGGTACTAACCTACTCGTCAGTGGTATTGCTACCATCGGCACACTAGGTGTAACTACAAACTTAACTGTTGGTGGTGATGTACTTGTCAGTGGTGCTATGACCGCTGGTTCATACAATGGTGATGGTTCTCAGTTAGATAATCTACCTGCAGCATCAATCACAACCTCCATAACACCTACAACTAGGGTGAATGGTGATACACTACAGACTGGTGATCTATGGTATGACTCTTCTGAGTTACGCCAGTATACTTACTATGATGATGGTGGATCCGTTCAGTGGGTACCTTCAGCCCCAGAACCTACTATTCCTGATTTTACCTACGCAGGTAACACAGGTATTGGTACTCTATCCTTAGGGGATGATACTTTCTCTGTTGTTGGTGATGGTACAAACGTAGTCACTACTGCAAGTGGTGTAACTACTACCGTAACCATTTCACTATCCGATAGTGTGGCAATCGCCGGTTCTATGACCGCTGGTAGCTTCCTTGGTGAGAACCTCAATGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGCGTTACAACCTTCAGAGGTGATGTCTTCATCGAAGGTAACCTAATCATTGATGGTGATGAGAGTCAGGATCTAGTCAGTGGTACTAACCTAATTATTACTGGTATTGCTACCATTGGTACATTAGGAGTAACTACTACTACTACCAATACTCTCACCGTACTCGATACCTTCACTCTAGATAACCCAGTCAATTCTATCGGAATTAGTTCTGATCTAGGTGGTGCCGGTGCTGCTCACACAGCTCTTGCTTCCCAGTTAGCAATCAAACAATACATTGATGCTAATAACTCAGATCAAAACCTAAACTTCACTGGTGATACTGGTTCTGGCTCGATTGGTCTTGGTACTGAATTCCTAGAGGTTCGTGGTACAGCACAACAGGTTACAACCATTGGTGTTGGTAACAGTGTTGTTATTGGACTACCTAACACAGTAAGAGTACCACAGAGACTATATGTTGGTGGTGGTGCCTTTACTCAGGTTATGGATGCCAACTCCGCTTCTGGTGTGGTATTTGCCAATAAGATTGTTACGATCAACAAAGGTCTAACCCTCAGTAGTAGTGACCTAACCGGAGTTCGTAACCTAGTTCAGACTGGTATTGCAACTCTTGGTACAGTTAACTTCTCTGGTGTAACAACCACTGTAGGTAACGCATTCGTTGGTAATGACTTAAGTGTCTTAGGCACAGTCAACGCTAATGACTTTAACTCTACTTCTTCTCTGGTGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7e14e3bfadeb5d60b13c754abb945c7470c2ea482eb1fddb469793a0910b63ff
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6567
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank