Protein

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Genbank accession
AOO15579.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNTPNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLSTALSLINTLPHYLEGGLSTTTRTFTEVTVDQKGRVINARTPAQLNLADYGLDGSATSDTTLAQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLVSLSVQANVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNATKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGDLTFQLSQNTATNRNFNILTTNAGDGTSNIIITAEDTVQISASEATGKVHVEDYRFQENYLGTTDATMHLDPGDDRAITGLVRIHGNLQIDGTTTTVNSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNLKLTTGTASSSNTTGDLVVAGGVGITGAVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGDLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSNDYGALRLDGGAYVAGDALIDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGALRLTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGNLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTGDLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKDTDDVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLSAMLNNLATATTLVLNLSGDPTPGDVTTLNNGTLSGGTLYNTGTAVATTSSGSGTGLTVDITASGGAITAVAINAAGSGYVVGETITISTGGGDATINVSAVTEMAIGDTVTGSTSGTTGVITAVGATSVTVDTVDGFFKKTETVSAGDVSTLTITSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1907 AA
molecular weight: 196017,26100 Da
isoelectric point:4,20133
aromaticity:0,05873
hydropathy:-0,16287

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–202
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607
AOO15579.1
1 1907
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-202 | STR 345-1578 | RBD 1643-1907
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM12_Np_22_1112
[NCBI] 		2928614 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO15579.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349309 [NCBI]
CDS location
range 88416 -> 94139
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATACAGTTAAGACGCGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAGGGTGAACTTGGAATTGAACTTGATACTGGTCGGTTCAAAATCGGTGATGGTGCAACGGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTAGAGTCCAACACTAATACTCCAAACAGTCTTGTACAGAGAGACGCAGACGGAAGTTTTTCTGCGGGTACTATTACATCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAACTAGACTTGAACAGACTAGACAGATTCAGTTATCTAATGATGTAACAGCGACTGGTAACTTTGATGGTTCCCAAAACTTAAATCTAAGTACTGCTTTATCACTGATCAATACTCTTCCTCATTACTTGGAAGGTGGTCTAAGCACTACTACTAGAACTTTTACTGAGGTTACTGTTGATCAGAAAGGTAGAGTTATAAATGCTAGAACTCCTGCTCAACTAAATCTTGCTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCAACTAGTGATACAACTTTAGCACAACCTTGGAATGCTAACTTAGAAGCAATCTCAGACGAAACTGGTACTGGTTTATATTCAAAAACTGCAGCTGGTGTTGTTGAGACCAGACTTATTACTGGTGCTGCTGGTCAAATTGTTATCACTGACGGCGGTGGTATTAGTGGCAATCCTCTTGTCTCATTGTCGGTTCAAGCAAACGTTGTTCCTGGAGACTATAATACAGAATCTCTCACTTCAGTATCTCAAGCTGGTAGTGGTGGAGAACCTTTTGGTACAGAGACTGTTAATGCTACTAAGTTCTCTGTTGACGATAAAGGACGTTTAACAACCGTAACGAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACATATGTTAGATATGATATCATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAAGCAATTACAGGAATTGCTGCAGGTGGTGGCGCTCCAACTCATACTGATGGTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTTGCTGCTGCAGCAGTAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTTGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCTAACGGACATGTAACTATTGCTGCCGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAGAATAATAGAGTTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTGGATCAGGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTGTTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTATTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGTGACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAATATTCTGACAACTAATGCTGGAGATGGAACCAGCAATATTATTATTACTGCTGAAGATACCGTACAGATTAGTGCATCGGAAGCAACTGGTAAGGTCCATGTAGAGGATTATAGATTCCAGGAAAACTACCTTGGAACTACAGATGCAACTATGCATTTAGATCCAGGTGATGATCGTGCGATAACTGGTCTTGTTCGTATTCATGGCAATCTCCAGATTGATGGCACTACAACTACAGTAAATTCTACACAACTAACTGTAGATGATGTCACAATTTTGCTTGGTGGCGATACTGTCCCTACAACTGATGACAACTTAGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGATACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTACGGTTGGGATACCAATTATTCCGATTTAGGTGGTCATGCAGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCCACAAATACCAACGAAGTCTTTACGGGTACTGATTCTGGTATTATTGCAGGTAATTTAAAACTTACAACTGGCACAGCATCTTCATCGAATACAACTGGTGATCTGGTTGTTGCTGGTGGTGTAGGCATCACTGGTGCAGTCAATATCGGTGGTCTTCTAGATGTTGATAGTACATTGCGTGTTACTAGCACCTCTCGTTTCGACGATAATGTAGTTCTGCAGGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTAGTGGTACAACTAAGATTGAATTCCAATCCACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATGTTAATACTAATAAGTTTAATGTTGTTGCTGCTTCTGGCAATACCTCTATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACGTTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTGACCTCCACATGGAGAGCACTAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGTTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAATCTAACGACTATGGTGCTCTCCGTCTTGATGGGGGCGCATATGTTGCTGGTGATGCACTGATTGATGGCACCCTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTCAAGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGACTGAACTGGTTGAGAGTTAGGTATAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTACATGTTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACAGTTAAGTTTAGCGTTTTAGGTGCAACTGGTAATACTGACATTCAAGGCACATTCGATGTTGCTGGTAACTCCGAGTTCAATGGCACAGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTAAGAAATGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGATATCCAAGGCACTCTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGACCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGTACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGATAAGATGACCGTTGCTTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATCAACGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCTGATAACGGTAATACAAATATCATCGGCACACTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGCATCTGGTATTGTCACACTTACCAATAACACTGAGCAAACTCTGACAGGTAGTTATGGTGCTGATGGTGCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCTGCTGTCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAGTCTACGGCAACACTGAACTGACTGGTACTCTCGACCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTTTAGTAACACATGACAATGTTACGATTACTGCAGACAATAAGACATTTGCAATTCAGAATGCATCTGCTGCTAATAAATTTACGGTAGATACTGATAATGGAAACACTGATCTTCGTGGCACCTTAGACATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAATCTTACTATCAATGGAACGACAACTACTGTCAACTCTACGGTCACAACTATCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGACGCAACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGACGGCAATCTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTTACTGGTGCTGGAACCGCACTCGATGTTGATGCAAATGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTGGTCATTCCTAACACAACCAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCCGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCTCTTACTGCAGATACACTTAAAACGGCAAGAAACATCACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACAATCACCACAACATATGTTGACGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGGCAGGAACTGGTTTTGTTTCCAGAACTGCTGCCAATACATATGCTCAACGCACACTCGCTGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTGACAAATGCTGATGGGGTTTCTGGCAATCCAACCATTAACGTCGCTTCTACAGCAAGTAACTCAGCAAACAACCTCGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGGACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTTACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCACGATACTGGAGACCTTTCTGAGGGATCCAATCTATACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAGTTAATGCTCTGATTGTTGCGGGTACAGGTGTCACTAAGGCATATAACGATTCTGCAGGCACCTATACGCTTACTGTAACGCAGGCAGACATCGATACCGACAATGTAACCGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGTACACACTTCACATATGGTACAGGTATTGAACTTAGCGGTGCAGGTGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACTAATATCTTCTA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a3de33d085214b69da85a67c4a7e71362c2943cf4df554179e2a1c1810a89630
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5367
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50