Protein

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Genbank accession
YP_009843949.1 [GenBank]
Protein name
tail protein with lysin activity
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
Protein sequence
MASNSITSITTNQTSVPLIELKLYTEHNIINLKYDNSIKTNNKSLTSGVVSFQTKNAMEDDSSAFSIILSGDFKWDYVIFPNDIISLGVKTNQTGVKNDKNTKLITGMITEVHRVDNYDSDNVVYQLNGRSMANAFMQYKIGLIEEVQESISSMGWLWDTNMDYEAETASGTSSDDTGMQTSVSGGTNARKVWNYWKKQGVSDAGVAGILGNIAYEDGTFDPHTIQHGGGGAVGLYQFDPNGELPGYRNWVSGRKGGIYNLLNQCNYVYHVVHGTAWYNTSIKRAKNAGSAAQSWEKNFERPRVLQDRSDKANAYLKKFKGKSGDSSDDSSDSNSSSSSSKVSGNTNATQEEINNEKSNSKGVAFLGNSCATIESEIMDRFLPYMKYSYGTKGYSLDHFINYSSMTSWDSYEKLQDSSSFVNFKGSLYELQDAILHKPFVEMFYDTDYNGLAHLVVRRTPFNPSDWNGVDSKGNYEIPRVVINSNQVINDDLSKTNSEAYSVFNVNPATANYTGIKNAGELGSLPQFNQQLVNIYGYSILEVTSLYLKGSSTGPLANNTKASGKNSKVLASAGTPYTASDINKLLNKVKLKTLRQKQSTYAQKIANNANNISGQQAAELVSAYLINEKHLTQTKMNGILDTENGGGQSCIGGEGISYKKWLDIVKTYSDAKTYMQECKTTFNNTDDEVLFELRGKYASGGNKLSQKDFKSLLKKYQVSSQNTKIKDEAIDLKFFTQMLFNWYSDDINFLAGNITVPGDSKYRIGEIAEVINENDPKDSMEFYIESVEHTFSFTSGWQTVLGVTRGLKNLGKDRFKHMWGKNQDFLGGYMGEAALNMLAYGTEPTKSSGGSDSTGGAAGGKWGLPFKGHGTIDTNPAQNFGSPRGQGTHDGTDFGFSNFSNGGSIRAIHGGTVKYVGSGAGSWTNSVIIITESDDGYSVCYQEFGTTANAKVKKGDKVKTGDIIGTRNYSGHDHVHVGVTKHGWRKLYNGSYSTSGFEDPLKLIAGKNHGSV
Physico‐chemical
properties
protein length:1011 AA
molecular weight: 110906,59120 Da
isoelectric point:6,59943
aromaticity:0,10386
hydropathy:-0,56588

Domains

Domains [InterPro]
DC_0587
STR
7–185
DC_0587 G3DSA:1.10.530.10 DC_0587 DC_0587 IPR011055
G3DSA:1.10.530.10
RBD
176–319
G3DSA:1.10.530.10 IPR050570
IPR041219
ENZ
187–319
IPR041219 IPR011055
IPR016047
ENZ
887–982
IPR016047
cd12797
ENZ
888–978
cd12797
YP_009843949.1
1 1011
Architecture
STR
RBD
STR
STR
RBD
STR 7-185 | RBD 186-319 | STR 320-640 | STR 669-834 | RBD 838-1003 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage 521B
[NCBI] 		2510942 Uroviricota > Caudoviricetes > Herelleviridae > Tybeckvirus tv521B >
Host Lactobacillus brevis
[NCBI] 		1580 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009843949.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048752 [NCBI]
CDS location
range 85177 -> 88212
strand +
CDS
ATGGCATCTAATAGCATAACTAGTATAACTACTAATCAAACATCTGTTCCACTAATTGAATTGAAGCTGTACACAGAACATAATATTATTAATTTAAAATATGATAATTCTATAAAAACTAATAATAAAAGTTTAACTTCTGGTGTCGTTAGTTTTCAAACAAAGAATGCTATGGAAGATGACTCGTCTGCTTTTAGCATAATCCTATCTGGAGACTTTAAGTGGGACTACGTTATCTTCCCTAATGATATTATTTCTCTAGGAGTCAAGACTAATCAAACTGGTGTTAAAAATGATAAAAATACTAAGCTAATTACTGGAATGATTACAGAAGTCCATAGAGTTGACAACTATGATTCAGATAATGTTGTCTATCAGCTTAATGGCCGTTCTATGGCAAACGCTTTTATGCAATATAAAATTGGACTTATTGAAGAAGTTCAAGAAAGTATTAGTTCTATGGGTTGGCTATGGGATACTAATATGGATTATGAAGCTGAAACTGCAAGTGGTACTTCTTCCGATGATACTGGTATGCAAACCAGTGTTTCTGGAGGTACAAATGCAAGAAAAGTATGGAATTATTGGAAAAAGCAGGGAGTTAGTGATGCAGGAGTTGCCGGAATACTTGGTAATATCGCTTATGAAGATGGTACTTTTGATCCTCATACTATCCAACATGGGGGAGGAGGGGCAGTAGGCCTATACCAATTTGACCCGAATGGTGAGCTTCCCGGATATAGAAACTGGGTTTCAGGTAGAAAAGGTGGTATATACAACCTACTTAATCAATGTAATTATGTATATCATGTAGTTCATGGTACTGCTTGGTATAATACATCTATAAAAAGGGCGAAAAATGCAGGAAGTGCCGCACAATCTTGGGAAAAGAACTTTGAACGGCCAAGGGTATTACAAGATAGAAGTGACAAGGCAAATGCGTATTTAAAAAAGTTTAAGGGTAAATCTGGGGATTCTTCTGATGATAGCTCTGATAGTAATTCTTCCTCATCAAGTTCAAAAGTATCCGGCAATACAAATGCTACGCAAGAAGAGATAAATAATGAAAAGTCTAACTCAAAAGGGGTTGCTTTTTTAGGAAACTCCTGTGCTACTATTGAATCTGAAATAATGGATAGGTTTTTACCTTACATGAAATATTCTTATGGTACAAAAGGGTATAGCCTAGACCACTTTATTAATTATTCATCAATGACTAGCTGGGATTCTTACGAAAAACTACAAGATTCTTCTTCATTTGTAAACTTTAAAGGAAGCTTATATGAATTACAAGATGCAATCCTTCATAAACCATTTGTAGAAATGTTCTATGATACTGATTATAATGGTTTAGCACATTTAGTAGTAAGAAGAACTCCTTTTAATCCATCAGACTGGAATGGAGTGGATTCTAAAGGTAATTATGAAATACCTAGGGTTGTTATTAATAGTAATCAAGTTATTAATGACGATTTGAGTAAAACTAATAGTGAGGCCTATTCGGTATTCAATGTCAATCCAGCTACTGCTAACTATACAGGTATTAAAAATGCCGGAGAATTAGGATCACTTCCACAGTTTAACCAACAGTTAGTTAATATATATGGATATAGCATTCTAGAAGTTACTAGTCTTTATTTAAAAGGAAGTAGTACGGGGCCTTTAGCTAATAATACTAAAGCATCTGGTAAAAACTCTAAAGTATTAGCTAGTGCAGGAACTCCTTATACCGCATCTGATATTAATAAGCTTTTGAATAAAGTTAAACTAAAAACACTTAGACAGAAGCAATCCACTTATGCTCAAAAAATAGCTAATAATGCTAATAATATTTCTGGCCAGCAAGCCGCAGAATTAGTTAGTGCTTATTTAATTAATGAAAAGCATTTAACGCAAACTAAAATGAACGGAATATTAGATACAGAAAATGGCGGTGGTCAAAGCTGTATTGGTGGAGAAGGAATAAGCTATAAGAAATGGCTAGATATTGTTAAAACATATTCTGATGCTAAAACCTATATGCAAGAATGTAAAACAACTTTTAATAATACAGATGATGAGGTATTATTTGAACTTCGAGGAAAGTATGCTAGTGGTGGTAACAAGCTTTCTCAAAAAGATTTTAAGTCATTACTTAAAAAGTATCAAGTTTCTAGTCAAAATACAAAAATTAAGGATGAAGCTATTGATTTAAAATTCTTTACTCAAATGTTATTTAATTGGTATTCAGATGATATTAATTTCTTAGCAGGAAACATAACAGTTCCCGGTGACTCTAAATATAGAATTGGGGAAATAGCAGAAGTAATTAATGAAAATGATCCTAAAGATTCAATGGAATTCTATATAGAGTCTGTTGAACACACTTTTAGCTTTACTTCTGGATGGCAGACTGTTTTAGGAGTTACTAGAGGGCTTAAAAACTTAGGAAAAGATAGGTTTAAGCATATGTGGGGTAAAAACCAAGACTTCTTAGGAGGATATATGGGAGAAGCCGCACTTAATATGCTTGCTTATGGTACGGAACCTACTAAATCTTCTGGAGGAAGTGACTCAACAGGAGGTGCCGCTGGAGGAAAATGGGGGCTTCCTTTTAAAGGACATGGAACTATTGATACCAACCCTGCACAAAACTTCGGATCTCCTAGAGGACAAGGAACCCATGATGGAACAGACTTTGGATTTTCTAATTTCTCTAATGGGGGATCAATTAGGGCTATCCATGGGGGAACCGTAAAATACGTGGGATCTGGGGCAGGTTCTTGGACAAATTCTGTTATTATTATTACGGAATCTGATGATGGATATTCAGTATGCTATCAAGAATTTGGAACAACGGCCAATGCTAAAGTTAAAAAAGGAGATAAAGTAAAAACAGGAGATATAATTGGAACAAGAAACTACAGTGGGCATGATCATGTACATGTAGGAGTAACCAAGCATGGATGGAGAAAATTATATAATGGTAGCTATTCTACTAGTGGGTTTGAAGACCCTTTAAAATTAATTGCTGGTAAAAACCATGGAAGTGTTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
53f1acb763d7b2458587e648d58fb7ff494120f8b446d33ec7114825d44de88f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3093
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of virulent Lactobacillus brevis phages Feyereisen,M., Mahony,J., O'Sullivan,T. and van Sinderen,D. 2019-04-26 — GenBank