Protein

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Genbank accession
YP_009848744.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,63
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAITKIILQQMVTMDQNSITASKYPKYTVVLSNSISSITAGELTTAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISAASSQQSATQSASSATASANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKAAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSETKAKASETAAKTSETNAKASELKAKEYADIVAPSNFLSKSQNLDDIPNKSAARLNLEVFHQSRVDLDDTNLDTLKGGQAGFYYQAANALATTEKGYPVRAAGSLEVIKNAANTVDGCHQIYRPYNTQDFYFSRWYDSAKSVWSTWSAFYAPESSDAYRTRIGLGALNNPQFANVNLVNVSDNAQAASGIISGYLNNNSGAQRARYRLYSEVRGDNKEWVTIHLQSDTNTNKYAGLSIDGNFQINGNFIGNAISLSDVATSKVNLKIDRLDQWGSETWVYNASKTMRLGLTDNSWGAYSDTEKRWIPLDVSHGGTGGNNTSDARRNLEVMYRRFSTLTGQNLNDLNGDYAGFYYQSLSANATTDRNYPIQEAGNLMVLQNSANGTPGCCQIYITFSTNRIYERSYNPGTSTWSAWGSILNSYDPSYCRQLIELGSQHAPLFAGLALTGYSDSTVAAGGIINSYLRATDGTQRVRMRLYPEKLADGVAAATLQVMGEDTGPSYKTFHFKHNGQLYVPNEINTETIAVRDLTVTQRNLGIPTTGFMGDYQTINAPAGAVDGKYYPVIIYTGGTNGYGITPVPIFVRTPGRSASHEMNNNVFSGYVTCGGWSDSPTMAHGMFTTYDPNELGILCIKGSNKDYAQHIAVYIHYKAFPINIMTDPKVEIIVPTEDYVLGTNGVKFKFGVTDAGDGNTEGNVKNILNFTGGGSGYYSTHPFRQGLSNNFALTNNLSTGDAFSATAPSFTFNGSVVGANSYSARGDAVTKNTYTSQLVNSDDNIVGQSEFRATEEAGQIIVRDMSSSASHKFFNFNKDGTFSAPSGILSSTGIDWNTQHNTINKFYGVAGQVNTPENNVVYGGIHVGFSGNYATQFVGRGSKFWARSIEGGTIGTWNRLITDKFADFGVPISISRNGECFTLRSSVSDTSESGYLAGRTANNTRMWYIGKSGGTKAVVVANDMTGASLNLGDDGNTSIRTPNYNGGIFADGSAVVVRRGNGRTFSYENNQTAAKSATILLWGNTTGRPSVVECKLSDGYLFYAQQSSDGSRVFNVNGKVEATNITQSSDRDLKDNIEEIQNATESLRKMKGYTYTLKENGLPYAGVIAQEVMEALPEAVSGFTKYTDLEGPTLTGEQLVGEERFYSVDYAAITGLLVQASRESDSRITALESEVSDLKKQIADLTLVVNSLLANR
Physico‐chemical
properties
protein length:1360 AA
molecular weight: 146123,32350 Da
isoelectric point:5,78902
aromaticity:0,09191
hydropathy:-0,40831

Domains

Domains [InterPro]
DC_0608
ATT
2–595
DC_0608 DC_1202
Coil
Unmapped
57–77
Coil cd19958 cd19958 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
CHP
1233–1284
IPR030392 Coil
YP_009848744.1
1 1360
Architecture
ATT
STR
ATT 2-595 | STR 893-1360
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage SE11
[NCBI] 		2592195 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Tequintavirus > Tequintavirus SE11
Host Salmonella sp.
[NCBI] 		599 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009848744.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048786.1 [NCBI]
CDS location
range 91795 -> 95877
strand +
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATTCTACAGCAAATGGTCACTATGGACCAGAATAGTATAACTGCAAGTAAATATCCTAAGTATACAGTTGTGCTTTCTAATTCTATTAGTTCTATCACTGCTGGTGAGCTAACTACTGCAATAGAATCCTCTAAAGCTTCTGCAGCAGCAGCTAAACAATCTGAGATTAATGCTAAACAGTCGGAGCTAAATGCTAAAGATTCTGAAAATGAAGCAGAAATTTCTGCGGCATCTTCTCAGCAGTCTGCAACTCAGTCTGCTTCTTCTGCTACTGCTTCTGCTAATAGTGCTAAAGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAGACAGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAAACAGCTGCTAAAACTTCTGAGACTAATGCTAATAGTAGTAAAGCTGCTGCGGCTGCATCTGCTTCAGCAGCAAAAACCTCAGAAACTAATGCTGCTGCGTCTGCATCTGCTGCTAAAACTTCAGAAACTAAGGCAAAGGCTAGTGAGACAGCTGCTAAAACTTCTGAGACTAATGCAAAGGCTAGCGAGTTAAAGGCTAAGGAATATGCGGATATAGTTGCTCCTAGTAATTTTCTTTCTAAATCTCAAAATTTAGATGATATACCTAATAAATCTGCCGCTCGCCTTAATCTAGAAGTATTCCATCAATCAAGAGTAGACCTAGATGATACTAACTTAGATACTCTTAAAGGGGGTCAGGCCGGTTTTTATTATCAGGCCGCTAATGCCCTTGCTACCACAGAAAAAGGTTATCCAGTTAGAGCAGCAGGATCACTGGAGGTAATAAAAAATGCTGCTAATACAGTAGATGGTTGTCACCAAATATATAGACCATATAATACACAAGACTTCTATTTTTCTAGGTGGTATGATTCTGCCAAGTCTGTATGGTCTACATGGTCTGCCTTTTATGCACCTGAATCCTCTGATGCATACAGAACTAGAATTGGTCTAGGGGCGCTCAATAACCCTCAATTTGCGAATGTTAATTTAGTAAATGTGTCTGATAATGCCCAGGCAGCCTCTGGTATTATAAGTGGATATTTAAACAATAATTCCGGTGCACAGAGGGCACGCTATAGGTTGTACTCCGAAGTACGTGGCGATAACAAAGAATGGGTTACTATACACCTACAATCAGATACTAATACTAATAAGTACGCAGGATTAAGTATTGATGGAAACTTTCAGATTAATGGAAATTTTATAGGTAATGCCATAAGCTTGTCAGATGTAGCTACTTCTAAAGTAAACTTGAAGATTGATAGGTTAGATCAGTGGGGAAGCGAAACCTGGGTCTACAATGCTTCTAAGACTATGCGTCTAGGACTTACTGACAACTCTTGGGGAGCATATAGTGACACAGAAAAAAGGTGGATTCCACTAGACGTATCCCATGGCGGTACTGGCGGTAATAATACTTCTGATGCGCGTAGAAATCTAGAAGTAATGTATCGTAGATTTTCTACCTTAACAGGGCAGAACTTGAATGACCTTAATGGTGATTACGCAGGTTTCTACTACCAGAGCCTATCAGCTAATGCAACTACAGACCGTAATTACCCTATTCAAGAAGCTGGAAACTTAATGGTACTACAAAATAGTGCTAATGGAACCCCAGGATGTTGTCAGATATACATTACCTTTAGTACTAATAGGATATACGAACGTAGTTATAACCCAGGTACCTCAACATGGTCTGCCTGGGGATCTATCCTTAATAGTTATGATCCTAGCTACTGTAGACAGCTTATTGAGCTAGGTTCCCAGCATGCACCATTATTTGCTGGTCTAGCATTAACCGGGTATAGTGATAGTACTGTAGCTGCCGGCGGTATTATTAATAGCTATCTAAGAGCTACAGATGGTACTCAAAGGGTACGTATGCGCCTATACCCAGAGAAACTTGCTGATGGGGTTGCGGCTGCAACTCTACAGGTTATGGGGGAAGATACTGGTCCATCTTATAAAACATTCCATTTTAAACACAATGGTCAATTATACGTACCAAATGAGATCAATACGGAGACTATAGCTGTTAGGGATCTTACTGTAACCCAACGAAATTTAGGTATACCTACTACTGGATTTATGGGGGATTACCAGACTATCAATGCACCAGCAGGTGCTGTAGATGGAAAATATTACCCAGTTATAATCTACACTGGAGGTACCAATGGTTATGGTATTACGCCTGTACCTATATTTGTGCGTACTCCTGGTAGATCTGCGTCCCATGAGATGAACAATAATGTTTTCTCTGGATATGTAACTTGTGGGGGTTGGAGTGATAGTCCCACTATGGCACACGGCATGTTTACAACATACGATCCTAATGAACTAGGGATCTTATGTATAAAGGGTAGTAACAAAGACTACGCCCAGCATATAGCAGTGTATATACACTATAAGGCATTCCCTATAAATATTATGACAGACCCTAAGGTTGAGATAATTGTTCCAACTGAGGATTATGTATTAGGTACTAACGGTGTTAAATTTAAGTTTGGGGTAACAGATGCGGGTGATGGGAACACAGAAGGTAATGTGAAGAATATTCTAAACTTTACTGGTGGTGGTTCTGGTTACTACTCTACTCATCCTTTCCGCCAGGGATTATCTAATAATTTTGCCCTAACTAATAACCTTAGTACTGGAGATGCTTTTTCTGCTACTGCACCTTCTTTTACTTTTAATGGTAGTGTTGTCGGTGCTAATAGTTATTCTGCTAGAGGTGATGCTGTAACAAAAAATACGTATACATCTCAACTGGTAAATAGTGACGATAACATAGTAGGGCAGAGTGAGTTTAGGGCAACCGAAGAAGCAGGACAAATTATTGTTAGAGATATGAGTAGTTCTGCTAGCCATAAATTCTTTAACTTCAATAAGGATGGAACCTTTTCAGCTCCTTCTGGTATTTTATCTTCTACTGGTATAGACTGGAATACCCAACATAATACTATCAATAAATTTTATGGTGTTGCGGGTCAAGTTAATACTCCGGAAAATAATGTTGTATATGGTGGTATCCATGTAGGGTTTAGCGGTAATTATGCTACCCAGTTTGTAGGTCGTGGATCTAAATTCTGGGCTAGAAGTATTGAGGGTGGTACTATTGGAACATGGAACAGATTAATCACAGATAAATTTGCTGATTTTGGTGTTCCTATATCTATATCCCGAAATGGGGAATGCTTTACTCTAAGATCTAGCGTTAGTGATACTTCTGAAAGTGGTTATTTAGCTGGTAGAACAGCAAATAATACTAGAATGTGGTATATCGGTAAAAGCGGAGGTACTAAAGCTGTTGTTGTAGCTAATGATATGACAGGAGCTTCATTAAACTTGGGAGATGATGGTAATACCTCAATAAGAACTCCTAATTATAATGGGGGTATATTTGCTGATGGATCTGCAGTGGTTGTACGGCGAGGTAATGGTAGGACGTTTAGTTACGAAAATAATCAGACAGCAGCAAAAAGTGCTACTATCTTGCTATGGGGTAATACTACTGGAAGGCCCTCTGTTGTTGAATGTAAGCTATCAGATGGTTATTTGTTTTATGCTCAGCAAAGCTCTGATGGATCCCGTGTTTTTAATGTTAATGGAAAAGTTGAAGCAACAAACATTACCCAGTCATCCGATAGAGATCTGAAGGATAATATTGAGGAAATCCAAAACGCCACTGAATCATTGCGTAAAATGAAAGGCTATACTTATACCCTTAAGGAAAATGGGCTACCTTACGCTGGTGTTATAGCTCAGGAAGTAATGGAAGCTCTACCTGAAGCTGTGAGTGGGTTTACAAAATATACAGATCTTGAAGGGCCTACACTTACTGGTGAGCAACTAGTTGGTGAGGAACGTTTCTATTCTGTTGACTATGCTGCTATAACAGGTCTACTAGTACAGGCAAGCAGAGAATCGGATAGCAGGATCACAGCTCTAGAATCAGAAGTATCTGATCTTAAAAAGCAAATTGCAGATCTAACCCTAGTAGTTAACTCTCTACTAGCAAATAGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a7fc85bb7481b078843197c4aad672a89a1a09d377c369d18625771c107582b8
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5537
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Salmonella bacteriophage diversity and host specificity revealed by physiological characterization and whole genome sequencing Fong,K., Tremblay,D., Delaquis,P., Moineau,S., Goodridge,L., Levesque,R. and Wang,S. 2019-09-14 — GenBank