Protein

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Genbank accession
AAM83084.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MLINVLNGSLKKVAILSNELPNAPSYYNDEFHDYLEQGATTFSFTVAKVINNQLQDYTQFLSDQSYFSFRKNGRDYLMTPSSEQSVHETSTEISFFCVSLDRELINEQANSLANTASHNIQWYFDRMGLISRTKITIGINEVSNLTRVINYDAQESKLSRLISVINNFNAEFDFVTTLNNDGSLGTVVLNIYKENDGQNIQGVGTKRDDVRLTFGKNIEDVEVDVSDDGFFNAAYMTGADGFSWKNYDFSYKNSDGVEEFYKRKGSEIAYAPLSAKMFPSQLKTDKGDIWTNSDRTTEYKNANDMWGYIVSQFKQYAYKQITYTVTPSSTLVNQLIGDGRPLQKGDTVIIQDDNYMDIDGNVGLILSARVSEIITSDTNPANNKIVFSNYKKLKSEASSDIKAIVSQLVNDATPYFADIATSNGVQFKNGTGSTTLSAHIYKGSATTEATADSYEWSKDGTIVAPTQTITVDASGVADKAVYSFKATVAGKVVASQSVTITNVNDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGNDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPTSGWTSTVPTVAAGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAMMGVKGDKGDQGIQGIQGVDGRQGIPGPKGADGKTQYTHIAYANSADGSKDFSTSDSNRTYIGMYVDFNINDSTTPSDYSWTLVKGADGTQGTPGKPGTDGKTPYFHTAWSYSADGTDGFTTVYPNLNLGDNTKTFVGAEYELSNIRGSIRIDPATQKTQDGDFYHLTVKAPRDNYDWFRFYLRPNSTMPNMTKVAIKPNTKYTFSVLLKGTGQHTIYAYQNWTAPNTPWTLQINLTSEWKIYTFTVTSSNVIPDRDVQFFIRSNNGTEINLKYPKVEEGSTATPYMQSASEVTTADYPSYIGQYTDFAQADSTNPSAYTWSLIRGNDGERGPQGLKGDPGATGIPGQPGADGKTSYLHIAYATNSTGTAGFDVSNATGKTYIGQYTDFTSADSTDPSKYTWSLIKGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGNDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPTSGWTSTVPTVAAGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAMMGVKGDKGERGIQGPAGNNGDPGKIVSDTEPTTRFKGLTWKYLGMSDLTASDGTVILSGTEYYWSGTNWILNEINAHNINGDNLSVTNGTFTDGKIKSTWNSGTASGSTEIENSHINMSATNSSSKVTNSLGLDIQQGFGMRWTDPASNQSRSVSLDYGNLAFDRNGVAAGLNFDGTNLSSSMPIQAPNTIVKSTQFSVSGIGIRLDRMMSFVAVTFSGQASSTINNSPTIINVLPDGFRPISPYSIDYMVPGNTANNGYIYFNPDGSIRIMATINSGYYIRGTRFYITNDVYPS
Physico‐chemical
properties
protein length:1579 AA
molecular weight: 170726,47370 Da
isoelectric point:5,07893
aromaticity:0,10703
hydropathy:-0,48442

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–759
DC_0690 DC_1545 DC_1022 DC_1328
IPR050149
Unmapped
576–1308
IPR050149
G3DSA:1.20.5.320
STR
729–783
G3DSA:1.20.5.320 G3DSA:1.20.5.320 DC_1328
DC_1022
STR
743–816
DC_1022
AAM83084.1
1 1579
Architecture
STR
STR
STR 2-904 | STR 914-1559 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage 4268
[NCBI] 		201847 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAM83084.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AF489521.1 [NCBI]
CDS location
range 29768 -> 34507
strand +
CDS
ATGCTCATTAATGTTTTAAATGGTTCATTAAAAAAAGTAGCGATCTTAAGTAATGAACTTCCCAATGCACCTAGTTATTATAACGATGAGTTTCATGACTATTTAGAACAAGGAGCAACTACATTTAGTTTTACAGTTGCTAAAGTGATTAATAATCAGCTACAGGATTATACACAATTCTTAAGTGATCAAAGTTATTTTAGCTTCAGGAAAAATGGTCGAGACTACTTGATGACTCCTTCATCCGAGCAATCAGTTCATGAAACAAGTACTGAAATTTCATTTTTCTGCGTTTCTTTAGACCGAGAACTTATTAATGAGCAAGCAAATTCATTAGCGAATACTGCAAGCCATAATATTCAATGGTATTTTGACCGAATGGGTTTAATCTCTAGAACTAAAATTACTATTGGAATTAACGAAGTTTCAAATCTAACACGAGTGATTAATTATGATGCGCAAGAATCTAAATTATCAAGACTTATTTCGGTAATCAATAATTTTAACGCTGAATTTGATTTTGTAACGACTTTAAATAATGATGGTTCTCTTGGAACTGTTGTTCTAAATATCTATAAAGAAAATGACGGTCAAAATATTCAAGGTGTGGGAACAAAACGTGATGATGTCAGACTAACATTTGGTAAAAACATCGAGGATGTCGAAGTAGATGTTAGTGATGACGGATTTTTTAACGCCGCTTATATGACTGGTGCTGACGGTTTTAGTTGGAAAAATTATGATTTCAGTTATAAAAATTCAGACGGTGTAGAAGAGTTCTATAAAAGAAAGGGTTCTGAAATAGCTTATGCTCCATTATCTGCCAAAATGTTCCCTTCTCAATTGAAAACAGACAAAGGAGACATTTGGACAAACTCAGACCGAACTACTGAATATAAAAATGCCAATGATATGTGGGGCTATATTGTCAGTCAATTTAAGCAATATGCCTACAAACAAATCACATATACCGTTACTCCTTCATCTACTTTAGTTAATCAACTTATTGGAGATGGAAGACCTCTCCAAAAGGGAGATACAGTTATTATCCAAGATGATAACTACATGGATATTGATGGCAATGTTGGTCTAATTTTATCTGCAAGAGTCTCTGAAATCATTACATCAGATACAAACCCTGCTAATAATAAAATTGTTTTTTCAAATTATAAAAAACTAAAGAGCGAGGCTTCTTCTGATATCAAAGCGATTGTCAGTCAGTTAGTCAATGATGCTACACCGTATTTCGCAGACATAGCAACTTCAAATGGAGTTCAGTTCAAAAACGGCACTGGTTCAACAACTTTATCAGCTCATATCTATAAAGGCTCTGCAACGACTGAAGCAACCGCAGACAGCTACGAATGGTCGAAGGATGGAACTATTGTCGCTCCAACTCAGACTATTACAGTTGATGCCAGCGGAGTTGCGGATAAGGCAGTTTATAGTTTTAAAGCAACGGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCTAGTCAGTCGGTGACTATCACTAATGTGAATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGAAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACGTACGCTATATCTTCAAGCGGTACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACGAAAACAGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGGAACAACGGTAATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGTATCAAAACTACGACCATTACCTATGCAGGCTCAACAAGTGGAACAACAGCACCAACTAGCGGTTGGACTTCTACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACCGTTTGGGCTTATACGGACAATACCAGTGAAACAGGGTATTCAGTTGCGATGATGGGAGTTAAAGGCGATAAGGGAGATCAAGGTATTCAAGGTATTCAAGGTGTTGATGGACGTCAAGGTATTCCTGGACCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACACAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTGCCGATGGTAGCAAAGACTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTACCTATATCGGGATGTATGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCACTCCGAGTGATTACTCATGGACACTCGTAAAAGGAGCGGATGGAACGCAAGGGACACCGGGTAAACCTGGGACAGACGGTAAGACACCGTATTTTCACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGTACTGATGGTTTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATCTAGGAGATAATACCAAAACTTTTGTCGGCGCAGAGTATGAGTTAAGTAATATAAGAGGTTCTATTAGAATAGACCCAGCAACTCAAAAAACACAGGATGGAGATTTTTATCATTTAACCGTTAAAGCACCAAGAGATAATTATGATTGGTTTAGATTCTATTTAAGACCAAATTCAACAATGCCTAATATGACGAAAGTCGCGATTAAACCAAATACAAAATATACATTTAGTGTTTTGCTAAAAGGTACTGGACAACATACGATTTATGCATACCAAAATTGGACTGCTCCCAACACGCCTTGGACTTTACAAATTAATCTAACTAGTGAATGGAAGATATATACATTTACAGTAACATCATCAAATGTTATTCCAGATAGAGATGTTCAATTCTTTATAAGAAGTAACAATGGAACAGAAATTAATCTTAAATACCCTAAAGTAGAAGAAGGCTCAACTGCTACTCCATATATGCAATCAGCTAGCGAAGTCACAACTGCTGATTATCCAAGCTACATCGGTCAGTACACAGACTTTGCGCAAGCTGACAGCACTAATCCATCCGCCTATACTTGGAGTCTGATACGGGGGAATGACGGGGAAAGAGGTCCACAAGGATTAAAAGGTGACCCTGGAGCAACTGGTATCCCCGGACAACCCGGAGCTGACGGAAAAACAAGCTATCTTCACATCGCCTATGCCACAAACTCAACTGGTACGGCTGGATTTGATGTATCAAATGCGACTGGTAAAACTTATATTGGACAATATACAGACTTTACGAGTGCTGATTCTACAGACCCAAGTAAGTACACATGGAGCTTGATTAAAGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGGAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACGTACGCTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACGAAAACAGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGGAACAACGGTAATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGTATCAAAACTACGACCATTACCTATGCAGGCTCAACAAGTGGAACAACAGCACCAACTAGCGGTTGGACTTCTACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACCGTTTGGGCTTATACGGACAATACCAGTGAAACAGGGTATTCAGTTGCGATGATGGGAGTTAAAGGCGATAAGGGAGAGCGAGGCATCCAAGGTCCTGCTGGAAATAACGGTGACCCTGGTAAAATCGTTTCCGATACTGAGCCAACTACACGCTTCAAAGGCTTGACTTGGAAGTATTTAGGTATGTCTGACCTTACAGCTAGTGATGGAACAGTTATATTATCTGGCACCGAATATTATTGGTCGGGAACTAACTGGATATTAAACGAAATAAATGCACATAATATCAATGGTGATAATCTAAGTGTTACAAACGGAACTTTTACCGACGGGAAAATAAAAAGTACATGGAACTCAGGTACAGCATCGGGTAGCACGGAAATTGAAAATAGTCACATCAACATGAGTGCAACAAATTCATCAAGTAAAGTGACAAATAGTTTAGGACTGGATATCCAACAAGGTTTTGGGATGCGTTGGACTGATCCAGCTTCTAATCAATCAAGATCAGTTTCACTTGATTATGGAAACTTGGCTTTTGATAGAAATGGAGTTGCAGCAGGACTAAACTTTGATGGGACCAATTTATCAAGTTCTATGCCTATTCAAGCCCCGAACACAATTGTTAAGTCAACTCAGTTTAGCGTTAGTGGGATAGGAATCCGTTTAGACCGAATGATGTCATTTGTTGCAGTTACTTTTTCAGGGCAAGCTTCTTCAACGATTAACAACTCTCCAACAATTATCAATGTTCTTCCAGATGGATTTAGACCAATTAGTCCATACTCAATAGACTATATGGTACCTGGTAATACAGCTAATAATGGTTATATCTATTTTAATCCAGATGGTTCAATTAGGATTATGGCAACTATTAATAGTGGTTATTACATTAGGGGAACAAGATTTTATATCACTAATGATGTTTATCCATCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
34eb0b49070178f756fbe8985a5545dfe82b51863cc38074f62b7d3440894941
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8036
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Sequence analysis of an obligately lytic P335 bacteriophage 4268 Trotter,M., Ross,R.P., Fitzgerald,G. and Coffey,A. 2006-01 — GenBank