Protein

Genbank accession
YAW78895.1 [GenBank]
Protein name
tail collar domain protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSSKFNSIDVYNDIKAKSAHTGEYNIELPQGEYNIDIKYASSAFVDGIYDFTISSGGSGYSEGDTLSVDGGTTLAYLEVTSVDAGEVTGLKFYLNTAQHGKTHGLNRGSGYVPSPTPVPTTTITGNGTGLEIIITELTGNPDSAPKSENLYLSSSNQYVSGDYLNDAGNLVGVIPDNVHGNKTSPELHAVATQTEAGFMSAQDKSDLDELMSTGSGAVRESRLVKLGHGIEPEEGNAPDPLKPNELDLTTDIKFKVTNGRGILVDETGVLINDAIVLTSDENSNIIDNKNITLNSNSGYLSGTGTLFGLPTPDQNSPEHQAPNKKYVDDLRAYLDGDGLKHGSKLELDLAVGSPYIINSEGKLAFDLINTSGEENAAFSDLFLFQRENTIYRATRDQLLANTYGNGIEPYSATNVKISVKAQSTKGLSVSEDGVRVDYSNMLDGSYMPTHRIMMYDQDSDSILSVPAGDMVQLSGLPGYGLVPRADGQDTYVDINTGVGGGLSVVAAAGSEISLDATNMTAASEAAGSDQIVIFTSGSPTRPKIVSKDAFLGSLTSVLKRRGTWSPDDSNPPSVGTVVGDNKNLFLYTGMPPIPDDGDFSPDGYLYICTDTGSVDLQGTGTEQVYVSGDQAIWTIDFNPDDPDWDGTTTLYSSGTRVKHNGYSYTCILDHDASAIIDDEPGTGNNWTTYWKFSGEWSKVSSGSSGFQIFTPATGVDRTGTTLVATIGDYKASMITNDSGFVSGNTLADAFENVVVTSGNQTIGGSKIFSNNVQMEATPISAKHLVTMGWVNASFLRTTGGNLTGALNITGNNLIIKTSDGSSTTLRYGNDNDGSANEFGLRFGGVGSRTQPDFVLRWPTDKENLRVSSSGNMTVSGEIYSNYIGLSNKKAGVEFLEDQSTMITSTKKLTLKESDISPRFFDGTTWYNMYHEGNTPTADQIGALRLSQFPTYTTQYDGVSNTATKELLDYHGNTLSRGEYRVRLVTAGTGTITGAIYIVNISESGTAGITDLWHNGYGSNHPELRIVDGKVHVATQHTSGYSVIAYVTSVQINTSSNFFGYEKQLYSVSNKPTATEIGALPLTGGTLTGPLNIGSNKLIVEGKNIIGVDSNLCRFGDATGASAVRIITNSVNNLSVQVGSNLYKVYNEGAKPTASDVGLGNLYRPSTGVLSWTSTSGETTIGMLNTTWNHYQTTASSGHYFYKSVNIQSGLTVGGNSSFVGKGVFSGNVDVSGYVYVAAADANPRLHIKRTNLAYNVNMAFEGSDSVKTYFGKTQDGHFAYGNNVDVNGAGYKIYSTGNKPTYNDVGISTKDIISLSGALGTTDLNSLTSSGFHFQNANANATTARHYPTAQAGSLLVQKAAGVTQTYTTYGPSTTAVYVRSYYNGSWGNWIEMYSTLNKPTPAEIGAIPITGGSVSGNLSVGGSFSAARISLGFDPGINNSIGCSGWFRSSGNTGWYNSTYNGGIYMIDSTYVRVYASKTLYVDNQIISTGNVQAYYSDARLKDITEELDTASALEAVCKWKKVRYTANETAHELGGYDTKKKEIGLLAQEIEEDYPELTSLAPFDHEVKEDGEIVSKSGENYKTLDYERVIAVQAAAIEELNKKIEALTKRLDDMQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1617 AA
molecular weight: 172823,44820 Da
isoelectric point:4,80087
aromaticity:0,08905
hydropathy:-0,33414

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
1319–1394
cd19958 IPR030392 Coil
IPR030392
1498–1613
IPR030392
YAW78895.1
1 1617
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage SA-M
[NCBI] 		3417976 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAW78895.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ510825 [NCBI]
CDS location
range 204426 -> 209279
strand +
CDS
ATGTCATCTAAATTTAATAGTATTGACGTTTATAACGATATAAAGGCAAAATCAGCCCATACAGGTGAATATAACATAGAATTACCGCAAGGCGAATATAACATAGACATAAAGTATGCTAGTTCGGCATTCGTAGATGGTATCTATGATTTTACTATATCATCTGGTGGTTCTGGATATTCAGAAGGTGACACACTATCTGTTGATGGTGGGACAACACTTGCCTACTTAGAAGTAACATCAGTAGATGCTGGTGAAGTAACTGGATTAAAGTTTTATCTAAATACAGCTCAACATGGAAAAACCCACGGGCTTAATCGTGGGTCTGGTTATGTTCCTTCCCCGACCCCCGTACCAACAACTACTATAACTGGTAATGGTACTGGATTGGAAATAATAATAACAGAATTGACTGGTAATCCAGACTCAGCACCAAAGTCAGAAAATTTGTATCTTAGTTCGTCTAATCAGTATGTAAGTGGTGACTATCTAAATGATGCAGGTAATCTAGTTGGTGTTATACCAGATAATGTCCATGGAAATAAAACGTCTCCTGAACTCCATGCAGTAGCAACACAGACCGAAGCTGGATTTATGTCAGCTCAGGATAAATCTGATTTAGATGAACTTATGTCTACTGGTTCTGGTGCTGTTAGGGAAAGCCGACTGGTTAAATTGGGACATGGAATAGAACCAGAAGAAGGTAACGCACCAGATCCATTAAAACCCAATGAACTTGATCTAACAACAGATATAAAGTTCAAAGTAACTAATGGTAGAGGTATACTTGTTGATGAAACAGGTGTTCTTATTAACGATGCTATTGTACTTACCTCCGACGAAAACTCTAATATCATAGACAATAAAAATATAACCCTTAATAGTAACTCTGGATATTTGTCTGGTACTGGTACTTTATTTGGTCTTCCAACTCCTGATCAAAATTCTCCAGAACATCAGGCACCAAATAAAAAATATGTTGACGATCTTAGGGCTTATCTTGATGGTGATGGTTTAAAACATGGTAGTAAACTAGAATTAGATCTAGCAGTCGGCTCACCTTATATCATTAACAGCGAGGGGAAACTTGCATTTGATTTGATTAATACTTCTGGTGAAGAAAATGCTGCGTTTTCCGATCTATTCTTATTCCAGAGAGAGAATACTATATATAGAGCAACCCGTGACCAATTACTTGCTAATACCTATGGTAATGGTATAGAACCATATAGCGCCACAAACGTAAAGATATCAGTAAAAGCGCAATCAACTAAAGGTTTGTCTGTTTCTGAAGATGGAGTAAGGGTAGATTATTCTAATATGTTGGATGGTAGTTATATGCCAACACACAGAATAATGATGTATGACCAAGATAGTGATAGCATTCTTTCAGTGCCTGCTGGTGACATGGTTCAATTATCGGGATTGCCAGGATATGGTCTAGTACCACGTGCTGATGGGCAAGATACCTATGTTGATATCAATACTGGTGTTGGTGGTGGTTTATCAGTAGTGGCTGCTGCTGGTTCGGAAATAAGCTTAGACGCTACTAACATGACGGCAGCAAGTGAAGCTGCTGGAAGTGATCAGATTGTTATCTTTACTTCTGGTTCACCAACAAGACCAAAGATAGTATCAAAAGACGCATTCTTGGGGTCACTTACTTCTGTTCTTAAGAGAAGAGGTACATGGTCGCCAGATGACAGCAACCCACCTTCTGTTGGTACAGTAGTTGGTGATAATAAAAACTTGTTCCTTTATACTGGTATGCCTCCAATTCCAGATGATGGTGATTTTTCACCAGACGGGTATTTGTATATATGTACTGATACTGGTTCTGTTGACTTACAAGGTACAGGTACAGAACAAGTATATGTATCTGGTGATCAGGCAATTTGGACAATAGACTTTAATCCAGATGACCCAGACTGGGATGGAACAACGACTCTTTACTCTTCTGGTACAAGAGTAAAACATAATGGTTACTCATATACATGTATACTGGATCATGATGCATCTGCTATCATAGATGATGAACCAGGCACTGGTAATAACTGGACAACTTATTGGAAGTTCTCTGGTGAATGGTCAAAAGTTAGTTCTGGTAGTTCTGGATTCCAGATCTTTACCCCTGCTACTGGGGTTGATAGAACAGGAACCACATTAGTTGCAACCATTGGTGACTATAAAGCTTCAATGATAACAAATGATAGCGGATTTGTTAGTGGTAATACATTAGCAGATGCTTTTGAAAATGTTGTAGTCACAAGTGGTAATCAAACCATTGGTGGTTCAAAGATCTTCTCTAATAACGTTCAGATGGAAGCTACCCCAATATCAGCAAAACATTTAGTTACCATGGGTTGGGTAAATGCTAGCTTCCTCCGAACTACTGGTGGAAATCTAACTGGTGCTCTTAATATAACTGGTAATAATCTGATAATAAAAACGTCTGATGGATCGTCAACAACATTACGATATGGCAATGACAACGATGGTTCTGCCAATGAATTTGGTCTACGTTTTGGTGGAGTTGGTTCAAGAACCCAACCAGATTTTGTATTAAGGTGGCCTACGGATAAAGAAAATCTACGTGTTAGTTCCTCTGGTAATATGACTGTATCTGGTGAAATATACAGTAATTATATCGGATTATCAAATAAAAAGGCTGGAGTTGAATTCTTAGAAGACCAATCTACCATGATAACTTCAACCAAGAAATTGACACTAAAAGAATCAGACATTTCCCCTAGATTTTTTGACGGTACAACTTGGTATAATATGTATCATGAGGGTAATACTCCCACTGCCGATCAAATTGGAGCACTGAGATTATCACAGTTTCCAACATATACAACCCAATATGATGGGGTGAGTAATACAGCTACTAAAGAGTTACTTGATTATCATGGTAATACTTTATCTCGTGGTGAGTATAGGGTTAGACTTGTAACAGCAGGAACTGGAACAATAACTGGCGCAATATATATAGTTAATATTTCAGAATCTGGGACTGCTGGTATAACAGATCTATGGCATAATGGTTATGGAAGTAACCACCCAGAACTTAGAATAGTAGATGGGAAAGTTCATGTAGCAACACAACATACAAGTGGCTATTCAGTGATAGCTTATGTTACTTCTGTTCAAATTAATACAAGTAGTAATTTCTTCGGATATGAAAAGCAGTTATATTCAGTGAGCAATAAGCCCACAGCTACAGAAATTGGTGCTCTACCTTTAACAGGTGGGACATTAACTGGACCATTGAATATTGGTTCTAATAAATTGATAGTAGAAGGGAAGAACATTATAGGCGTTGATAGTAATTTATGTAGGTTTGGTGATGCAACTGGTGCTTCAGCAGTTAGAATAATAACCAATAGTGTTAATAACTTATCTGTTCAGGTTGGTTCTAATCTTTATAAAGTTTATAATGAAGGTGCCAAACCAACAGCTTCTGATGTTGGTTTGGGTAATTTATACAGACCATCTACTGGTGTGTTATCATGGACCTCCACATCAGGTGAAACCACTATCGGGATGCTAAACACAACATGGAATCACTATCAAACAACAGCTTCAAGTGGTCACTACTTTTATAAGAGTGTTAACATACAAAGTGGTCTAACGGTTGGTGGAAACTCTTCTTTTGTTGGAAAGGGTGTGTTCAGTGGTAATGTTGATGTTAGTGGTTATGTTTATGTTGCCGCTGCCGATGCTAACCCTCGCCTCCATATTAAACGAACTAATCTTGCATATAATGTTAATATGGCATTCGAGGGCAGTGATTCTGTTAAAACATATTTTGGTAAAACACAAGATGGACACTTTGCATATGGTAATAATGTTGATGTTAATGGTGCTGGGTACAAGATTTATTCTACTGGTAATAAACCAACATATAATGATGTAGGTATATCTACCAAGGATATAATATCTCTTTCGGGGGCATTGGGAACTACGGATCTTAACTCTCTAACGAGTTCTGGGTTCCATTTCCAAAACGCTAATGCCAATGCAACAACAGCAAGACATTATCCAACGGCACAAGCTGGTAGTTTATTAGTACAAAAGGCTGCTGGTGTTACCCAAACATATACTACCTATGGTCCAAGTACCACAGCAGTATATGTAAGAAGTTACTATAATGGTAGTTGGGGTAATTGGATAGAAATGTACTCTACCTTAAATAAACCAACACCAGCAGAAATAGGAGCTATACCAATTACTGGGGGTTCTGTTAGTGGTAATTTATCAGTTGGTGGCTCATTTTCTGCTGCTAGAATAAGCCTAGGTTTTGATCCAGGTATTAATAATAGTATTGGTTGTTCTGGGTGGTTTAGATCCTCTGGTAATACTGGATGGTACAACTCAACATATAATGGCGGTATATACATGATTGATAGCACATATGTCAGGGTATATGCCTCAAAAACGCTTTATGTTGATAACCAGATAATCTCTACTGGTAACGTACAAGCATACTACTCAGATGCTAGACTAAAAGATATCACCGAAGAACTTGATACAGCTTCGGCTCTTGAGGCTGTTTGTAAGTGGAAAAAGGTAAGATACACTGCTAATGAAACAGCACATGAGTTAGGTGGGTACGATACAAAGAAGAAAGAGATAGGGTTGCTTGCTCAAGAAATAGAGGAAGATTATCCAGAACTTACTTCTTTGGCACCGTTTGATCATGAAGTTAAAGAAGATGGTGAGATAGTTTCAAAATCTGGTGAAAACTACAAGACTCTTGATTATGAAAGAGTAATTGCAGTTCAAGCAGCAGCTATTGAAGAACTAAACAAGAAAATAGAAGCATTAACTAAGAGATTAGACGACATGCAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.