Protein

UniProt accession
A0A6S4PDR1 [UniProt]
Protein name
Tail tubular protein B
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,72
Protein sequence
MGGVVSQSIPNFLNGMSQQTPTQRGINQGEDQVNLQNGLVDGLSKRPPLDYVATVDSSNIYSNKTKFWQIQRDANNQYIVALYNGGIKVFDLAGNEKTVTIASGSSYLTSTNPRENFKLVNIADYTFLANTGTTVTADSNTSAAKVEEFLVVCKLTNYGREYKVALKHPSMAQELEVVFQLPSGSDAATDSKFRDTNKITDILLYGTASTHWDGNANGIGFNVRRTDTNASVSTTQGLANYSGFTSHFTFEAFDSVIYGKPTDGNANYTITTSDGSGNTAMYSIRDEIQDFSKLPFYGKEGVILKITGEEGETLSDYYVKFTGKSGVWNETIAPATSVGLTNSTMPHALINNNDGTFTFQELDWTDRVCGDSESNPDPTFVGKKINNLTYYKNRLGILSGENLILTENASFFNYFATTSTQVLDTDPIDIAASGTQVNTLKNSVGFNESLLLFSDTAQYKLDSSGESISPTTAILNEVSSFEHDDKVTPVSAGKFAYFAQARTNNTAIREYFADDDTLTNDGLDISVSVQNLIPTNCYQIVSNTTEDTLIFLTSDTGDSQTAPYSGTVSTTYANTMYIYKYFFDGGEKVQNAWSKWTFTGVKILGAMSLESFIYLLVSEGTTTKLVKIDLRNLKDTTIGHGVYIDLKTSVTGSYSSTTDLTTFTSPYGAKTGLIAVDRTNGNNYTATNTSGATYTIVGNHTALYIGVPYESKYRMSTQFVRENTGKGLIAVTSGRYQIRNITFNFENSGYFQVEVTPTNRDTSTAIMNGYVIGTSTSIIGQPAISTGTLRVPVQSQNTQFTLDIKSSSHLPMYIAGAEVEGYYHNRASRI
Physico‐chemical
properties
protein length:830 AA
molecular weight: 90603,14530 Da
isoelectric point:4,94246
aromaticity:0,10602
hydropathy:-0,31542

Domains

Domains [InterPro]
A0A6S4PDR1
1 830
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured phage_MedDCM-OCT-S35-C6
[NCBI]
2741075 Uroviricota > Caudoviricetes > Autographiviridae > Pelagivirus S35C6 >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BAQ94158.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP013542 [NCBI]
CDS location
range 9850 -> 12342
strand +
CDS
ATGGGCGGAGTAGTATCACAATCTATTCCTAATTTCTTAAATGGAATGTCACAACAGACACCCACACAAAGAGGTATTAATCAGGGAGAAGACCAAGTTAATTTACAAAATGGTTTAGTAGATGGTTTATCAAAAAGACCACCTTTAGATTATGTAGCTACAGTAGATAGTTCTAATATTTATTCTAACAAAACAAAATTTTGGCAAATACAAAGAGATGCAAATAATCAATATATTGTAGCTTTATATAATGGTGGTATCAAAGTATTTGATTTAGCAGGTAATGAAAAGACTGTAACAATAGCAAGTGGTTCAAGTTATTTAACATCAACAAATCCTAGAGAAAATTTTAAATTAGTTAACATTGCAGATTACACATTTTTAGCTAACACAGGAACAACAGTTACAGCAGATAGTAATACGTCTGCGGCTAAAGTAGAAGAATTTTTAGTTGTTTGTAAACTTACAAACTATGGTAGAGAATATAAAGTTGCATTGAAACACCCATCAATGGCACAAGAATTAGAAGTAGTATTTCAATTACCTTCAGGTAGTGATGCGGCTACTGATAGTAAATTTAGAGATACAAATAAAATTACAGACATACTTTTGTATGGAACAGCAAGCACACACTGGGACGGCAATGCAAATGGTATAGGATTTAATGTTAGAAGAACTGACACTAATGCTTCTGTGTCTACTACACAAGGATTAGCAAATTATTCTGGCTTTACATCTCATTTTACATTTGAAGCATTTGATAGTGTAATTTATGGAAAACCTACTGATGGTAATGCAAACTACACTATAACTACATCTGATGGTTCTGGTAACACAGCCATGTATTCTATTAGAGATGAAATACAAGATTTTAGCAAATTACCTTTTTATGGAAAAGAAGGTGTTATTCTAAAAATTACTGGAGAAGAAGGAGAAACTTTATCTGATTATTATGTAAAGTTTACAGGAAAATCTGGTGTATGGAATGAAACTATTGCACCTGCAACTTCTGTAGGACTAACTAACTCTACAATGCCACACGCATTAATTAATAATAATGATGGTACATTTACTTTCCAAGAATTAGATTGGACAGATAGAGTATGTGGAGATAGTGAAAGTAATCCTGACCCAACATTTGTTGGTAAAAAGATTAATAATTTAACTTATTATAAAAATAGACTAGGTATTTTATCTGGTGAAAATTTAATATTAACAGAGAATGCTTCATTCTTTAATTACTTTGCAACAACATCTACACAAGTTTTAGATACTGACCCAATAGATATTGCGGCGTCAGGCACACAAGTTAATACACTTAAAAACTCTGTAGGATTTAATGAAAGTTTATTATTATTTTCTGATACAGCACAATATAAATTAGATAGTTCAGGTGAAAGTATATCACCTACAACAGCTATACTTAATGAAGTATCGTCATTTGAACATGATGATAAAGTTACGCCAGTATCAGCAGGTAAGTTTGCTTACTTTGCACAAGCTAGAACAAACAACACAGCAATAAGAGAATACTTTGCTGATGATGATACATTAACAAATGATGGATTAGATATAAGTGTATCAGTACAAAATTTAATACCAACTAATTGCTATCAAATTGTAAGTAATACAACAGAAGACACTTTAATATTTTTAACATCAGACACAGGAGATAGTCAAACAGCTCCTTACAGTGGCACAGTGTCTACAACATACGCTAACACAATGTACATCTATAAGTATTTCTTTGATGGTGGAGAGAAAGTACAAAATGCTTGGTCTAAATGGACATTTACAGGTGTTAAGATTTTAGGTGCTATGTCATTAGAAAGTTTTATTTATTTATTAGTTTCTGAAGGCACTACTACAAAATTAGTTAAAATAGATTTAAGAAATTTAAAAGATACAACAATAGGTCATGGAGTTTACATTGACCTTAAAACATCAGTTACAGGTTCGTACAGTAGTACAACAGACTTAACTACGTTTACATCTCCTTATGGAGCTAAAACTGGATTAATAGCTGTAGACAGAACAAATGGTAATAATTACACCGCAACAAACACGTCAGGGGCAACTTATACAATCGTTGGAAACCACACAGCGTTATACATTGGTGTGCCTTATGAAAGTAAATATAGAATGTCTACGCAGTTTGTAAGAGAAAACACTGGTAAAGGTTTAATTGCAGTAACTTCAGGTAGATACCAGATTAGAAACATAACATTTAATTTTGAAAATAGTGGTTACTTCCAAGTAGAAGTCACACCTACAAATAGAGATACATCAACAGCTATTATGAATGGTTATGTAATTGGTACGTCTACAAGTATTATAGGACAGCCTGCTATTTCAACAGGAACTTTAAGAGTACCAGTACAATCGCAAAATACACAATTTACTTTAGATATTAAATCTTCATCTCACTTGCCTATGTATATCGCAGGTGCAGAAGTTGAAGGTTATTATCATAATAGAGCAAGCAGGATTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
130d9cb76978aa124c08e2ab1a5bd3f0407c64c72fa6af660c2237316e06461c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2505
Evidence 0,2505

Literature

No literature entries available.