Protein

Genbank accession
YP_010075519.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,69
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFFDGNNRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGDESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSISSPQILTDKVITDWKKTGDYDISSLANNNSDTDKNYLRIVRTDPAAAMLHEICENNGISWYSGSTPTDYMLSFSYSGGLQAGHSIAVGMESSPMTYSALGKGSIAIGDNDTGFKWHQDGHFHAVNNGTRTFIYGPAETQSLRKMVMGYSPDGILMTTPPTENYALATVVTYHDNNAYGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNNSTLMFKGYTMGQSSVDNMYIAVWGNTFSNPSEGTRKNVMEISDDIGWMHYIQRTTAGKIESVINGTQIVNENFTVVKNATFDGTISAAGEIATNAVNGLRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYVQAAPIFQEIDDDAVNKYYPIVKQKYLQGKAVWSLGTEINSGTFVIHHIKEDGTQGHTSRFNADGTVNFPDNVLVGGDINMKGLMTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSKGVHFSTERTLATGAIKTKFFGEVESDGRLIIKRPGDSIVLSAPASNSLHIRGDVDGTNNWYIGKGGDDNGLAFYSYATNAGVYITNAGDITLSPKGVEMAHVNNIRLYVHGERWTASQPGDWGNQWRVEAPIFVDHGYVSQDCYYPILKARSVITNQGYSTAVDFGMRRIPSQWGQAIIRVGSTEASPDAGHPQAVFEFHHDGFFYTPGNGSFSDVYIRSDSRLKINKEELEYGAVEKVCRLKVYIYDKVKSIKDRSVIKREVGIIAQDLEKELPEAVSKVEVDGSDVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPLFTKIARKISKYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:1046 AA
molecular weight: 114283,21570 Da
isoelectric point:5,95340
aromaticity:0,10038
hydropathy:-0,34446

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
749–803
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
934–1032
IPR030392
YP_010075519.1
1 1046
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage pSe_SNUABM_01
[NCBI] 		2656520 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010075519.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054937 [NCBI]
CDS location
range 159134 -> 162274
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGCGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATTATTGATCTTGGTTTTGCTAAGGGCGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAATTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCACCTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACTGAGGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCGCATGTTCGTTTTTTCGATGGCAATAACCGCGAACGCGGAATAATTTATGCCCCGGCTAATGATGGATTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCCGCTGGTGATGAAAGCACCTATGCATTTTCAGGCAGTGGCCTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCGATAAAGTTATTACAGATTGGAAGAAGACGGGCGATTATGATATATCTTCATTAGCAAATAATAATTCTGACACAGATAAAAACTATTTGCGCATTGTACGTACCGACCCAGCGGCCGCAATGCTCCATGAAATTTGTGAAAATAACGGCATCAGTTGGTATTCTGGTTCAACCCCTACTGATTACATGTTGTCATTTTCTTATTCCGGTGGGCTTCAAGCAGGCCATTCAATTGCAGTAGGTATGGAATCAAGTCCTATGACATATTCAGCCTTAGGTAAAGGTTCTATTGCTATTGGCGATAATGATACCGGATTTAAATGGCATCAGGACGGACATTTTCATGCAGTAAACAACGGAACAAGAACTTTCATTTACGGTCCTGCGGAAACACAAAGCCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTCCGGATGGGATTCTTATGACAACGCCACCGACAGAAAACTATGCATTAGCCACTGTTGTTACTTACCATGATAATAACGCGTATGGTGACGGTCAAACTCTTTTAGGATATTATCAAGGCGGTAACTATCATCACTATTTCCGCGGTAAGGGTACCACAAACATTAATACTCATGGCGGTTTGTTAGTTACTCCAGGCAATATTGACGTTATTGGTGGTTCGGTTAATATTGATGGTAGAAATAATAATTCAACTTTAATGTTTAAAGGCTATACCATGGGTCAAAGCTCCGTTGATAACATGTATATAGCTGTTTGGGGAAATACTTTTAGTAATCCAAGTGAAGGCACCCGTAAAAATGTCATGGAAATTTCTGATGATATTGGATGGATGCATTATATTCAACGAACAACTGCGGGTAAAATCGAATCGGTTATAAATGGCACCCAGATTGTTAATGAAAACTTTACAGTAGTAAAAAATGCTACATTTGACGGTACAATCAGCGCAGCCGGTGAAATCGCGACAAATGCTGTAAATGGTCTTCGCATTTGGAACGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGGCAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGTGAAGGTAAACATGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACCGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCTGCGAACGGCTATATTAAATTTGTTGGTCATGGCGCTGGCGCTGGTGGTTATGATATTCAATATGTTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATCGATGATGATGCTGTAAACAAATATTATCCGATTGTTAAGCAAAAATACCTTCAAGGTAAAGCAGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCAGGTACATTCGTGATACACCATATCAAAGAAGATGGAACACAGGGCCATACATCAAGATTTAATGCTGATGGTACAGTTAACTTCCCGGATAACGTTCTGGTCGGCGGTGATATTAACATGAAAGGCTTGATGACTTTTGACGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCGCGTGATAACATTATTCAGTTAGAAGACAGCAAAGGAGTTCATTTTTCTACTGAACGTACTTTAGCGACTGGTGCAATTAAAACTAAATTCTTTGGTGAAGTTGAATCCGATGGTAGATTGATTATTAAACGTCCGGGTGATTCTATTGTATTATCAGCACCTGCTAGTAATTCTTTGCATATTCGTGGTGACGTAGACGGGACTAATAACTGGTATATTGGTAAGGGTGGTGATGATAATGGATTAGCGTTCTATAGTTATGCTACTAATGCTGGTGTATACATTACAAACGCAGGAGATATCACGCTAAGTCCAAAAGGCGTCGAAATGGCTCATGTTAATAACATTCGATTATATGTTCATGGTGAACGTTGGACCGCTAGTCAACCAGGTGATTGGGGCAACCAATGGCGAGTAGAAGCGCCAATATTCGTTGATCATGGTTATGTTTCACAGGATTGTTATTATCCTATTCTTAAAGCAAGAAGCGTTATAACCAATCAAGGATATAGCACCGCTGTTGACTTTGGTATGCGTCGTATTCCATCACAGTGGGGGCAAGCAATCATTCGTGTCGGATCCACGGAGGCTTCTCCTGATGCTGGACACCCACAAGCTGTGTTTGAATTCCATCATGATGGATTCTTTTATACACCAGGAAATGGTAGCTTTAGCGATGTGTATATTCGTTCTGACTCCCGTCTCAAGATTAATAAAGAAGAATTAGAATATGGAGCGGTCGAAAAAGTTTGCCGACTGAAAGTTTATATTTACGATAAAGTTAAGTCTATTAAAGACCGTAGTGTTATTAAACGTGAAGTTGGTATTATTGCTCAGGACCTTGAAAAGGAATTACCGGAAGCTGTATCTAAAGTTGAAGTTGATGGATCTGATGTTCTGACAATTTCTAACTCTGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCCATTCAGGAAATGAGTGAAGAAATTAAAGAATTGAAAACGCCTCTCTTTACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAAATATTTTAAATTCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
fd50ccb018560f4ef5702d00644620042fa866ca3a24f2570bc3bcce71ea7851
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5368
Evidence 0,5368
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of bacteriophage pSe_SNUABM_01 infecting Salmonella enterica Kim,S.G., Lee,C.H. and Park,S.C. 2012-01-15 — GenBank