Protein
- Genbank accession
- QJT71852.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MADLTAIQFLRTSTAGKLPTAAQLHEGALAINLADRTIYTKNAAGQIIDLGFGKGGSVNGSIDATGTVKAGKLETALADLATANITTLNVTNLNNTGLTNIANSLKIYGVYGNEDTRLTLSAASNQTAPIGIYTGRSGNNNTLSIDIGSSRLATLRLSNNPTTDGYTSRFDIPSMLWLDGESRVNRNMLFRQPFNEYALDLQAGYTYSGSGDANGLNYLLKTRGHNTATPFYMIVDSRSGANEITWSSGATGPSNGIWGFGVNYFNSRKPLSVGFTGASALGDTSIAIGVNNAGLALSNNAIHTFVGGASMANVSSAGILTVLRSITGLGTGLTTNNAIFKANTDSDGNAVGDGVTHIGYKDSSGNFNHYFRGKGSTNIDTHAGLIVNYDLFVRRNASISGVLNAGTLTGSGSSTSYKGLTIENISAGWSYIELKALNAVAHIALKTEVAEGAVANSLHLRPNGQQNGSLIIQPAGQMLHLNQYGSVSIGALNGQYAHFNTSNPQFYFYKDIVSGGNFYAEGGQKVFHQGFLPTLGQLGAMPSGSALLPGNDITAYYGRQGLQVSNFAGLGGAGTNGVQLSNPVDGWHHHITLNHANSAGYYVDIAASFEGAMYIKSVSNGSHSGWARFYTTSFKPTPNDIGAISTSGNGIINGNLSASNLGVNNTSASTGYGLSLYGGANTGMPSYGISFSGTPSFGTHGSVIGDWATYFTMTGATNRGWIFKTGNGSGGNIASISASGVITASSFVGSGASLSGITASQVGAIPISGLIATGQIGGTGNGDLYTGAGIETRSSGAATPSIGFHKPGSYAGTLRMLNSTTFGFLNQDNSSYADLTVRNLTAADNVTGVALNGTTYVTGGRIFSGWDSGVVGSISCSQWFRSSGATGWFSDTYGGGIWMKDDSYVRVYAGKKFAVESGDFDSINTIGGIYAAGSISSQSNITAVGDLSTQRNVGCTGDVYARSFYGNANIGGTGSAINCPGGIYSQGTNWLYGQIITNNSPINAGSGVITGNGSGLSNLQWNNIVGKPNEVNSWINVYNSTTKQKQISVPTALINHLNNGGAADVRVLMVTDGDGQKCVQQTIFGGGVWTSGKYKADMTWSGLGNLYLHNSSSAWGATYQNKIDCRYTWITRVDYRLL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1138 AA molecular weight: 118214,37010 Da isoelectric point: 8,42558 aromaticity: 0,09402 hydropathy: -0,11230
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Shewanella phage Thanatos-1 [NCBI] |
2734808 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJT71852.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT457552.1
[NCBI]
CDS location
range 127601 -> 131017
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATTTAACCGCTATCCAGTTCCTACGAACTAGTACGGCTGGAAAGTTACCCACCGCAGCTCAGTTGCATGAAGGTGCTTTGGCTATTAACTTAGCAGACAGGACAATTTATACAAAAAATGCTGCAGGCCAAATCATTGATTTAGGTTTCGGTAAAGGTGGATCAGTAAATGGAAGTATTGATGCCACAGGCACGGTAAAAGCCGGAAAATTAGAAACAGCTTTAGCTGATTTGGCTACAGCGAATATTACTACTTTAAATGTAACCAATTTAAACAATACAGGCCTTACAAACATTGCTAATAGTTTAAAGATTTATGGTGTTTACGGTAATGAAGACACAAGATTAACTTTAAGCGCCGCATCGAATCAGACAGCACCTATTGGGATTTATACAGGACGTTCAGGTAACAATAATACTCTTTCTATAGACATCGGTTCATCTAGGCTAGCCACACTAAGATTATCTAACAATCCTACTACAGATGGCTATACATCTAGATTCGATATACCTAGTATGCTATGGCTTGACGGTGAAAGTCGTGTAAATAGAAATATGCTGTTCCGTCAACCATTCAATGAATATGCGTTAGATTTACAGGCTGGGTATACATACTCCGGCTCAGGCGATGCAAACGGTTTAAATTATTTGCTTAAAACCAGAGGCCATAATACTGCAACTCCATTTTATATGATTGTAGATTCTAGGTCTGGTGCTAATGAAATAACTTGGTCTAGTGGAGCTACAGGTCCTTCTAATGGTATCTGGGGATTTGGTGTTAATTATTTTAATAGCCGTAAACCATTAAGTGTAGGATTTACCGGAGCAAGTGCATTAGGCGATACTTCTATTGCTATTGGTGTTAATAACGCCGGTTTAGCATTATCAAATAACGCAATACATACATTTGTAGGCGGGGCCAGTATGGCCAACGTTAGCTCTGCCGGTATATTAACTGTATTGAGAAGTATTACTGGGCTAGGTACAGGATTAACAACAAATAATGCTATATTTAAAGCAAATACTGATTCTGATGGTAATGCTGTTGGTGACGGTGTAACCCATATTGGGTATAAAGACAGTTCCGGGAATTTCAATCATTATTTTAGAGGCAAAGGCTCTACAAATATAGACACCCACGCAGGGTTAATAGTAAATTATGATTTATTTGTAAGACGTAATGCTAGTATTTCGGGTGTTTTAAATGCTGGTACTTTAACTGGTTCAGGAAGTTCTACTAGTTATAAAGGTTTAACAATAGAAAATATTAGTGCAGGTTGGTCATACATAGAGCTAAAAGCATTAAATGCCGTAGCTCATATCGCACTTAAAACAGAAGTAGCTGAAGGTGCTGTGGCTAATAGTTTACATCTAAGACCTAATGGGCAGCAGAATGGGTCTTTAATTATTCAGCCTGCTGGCCAAATGCTCCATTTAAACCAGTATGGCAGTGTAAGTATAGGTGCATTAAACGGCCAGTATGCACATTTTAATACAAGTAATCCACAATTTTATTTTTATAAAGATATTGTAAGTGGTGGGAATTTCTATGCTGAAGGTGGGCAAAAAGTATTTCACCAAGGATTTTTACCTACTTTAGGTCAACTTGGTGCTATGCCTTCTGGTTCTGCTTTATTACCCGGTAATGATATTACAGCATATTACGGTAGACAAGGATTACAAGTAAGTAATTTTGCTGGTTTAGGTGGAGCAGGTACAAACGGTGTACAATTAAGCAACCCTGTTGATGGATGGCACCATCATATCACATTAAACCATGCCAATTCCGCTGGATATTACGTTGATATTGCTGCATCATTTGAAGGAGCCATGTATATAAAATCTGTGTCTAATGGTTCTCATTCAGGCTGGGCTAGATTTTACACTACATCATTTAAGCCTACGCCGAATGATATTGGTGCTATTTCAACTAGTGGTAATGGTATAATTAATGGTAATCTATCGGCTAGTAATTTAGGCGTTAATAATACGTCTGCATCTACTGGATATGGTTTATCGTTATATGGCGGTGCTAATACTGGTATGCCTAGTTATGGTATATCATTTAGTGGAACACCATCATTTGGTACACATGGTAGTGTTATTGGTGATTGGGCTACATATTTTACAATGACTGGCGCTACTAATAGAGGATGGATATTTAAAACTGGTAATGGTTCTGGTGGAAATATTGCATCTATATCAGCATCTGGTGTCATAACTGCATCTAGTTTCGTCGGTTCTGGTGCTAGTTTGTCTGGTATTACGGCTAGTCAAGTTGGTGCTATTCCTATATCGGGGCTTATTGCTACAGGCCAAATTGGTGGTACAGGTAATGGTGATTTATATACTGGTGCTGGTATAGAAACTCGTAGTTCTGGTGCTGCTACACCATCTATTGGATTCCATAAACCTGGATCTTATGCCGGCACTTTAAGGATGCTTAACTCTACTACATTTGGATTCTTGAACCAAGATAACAGTTCATATGCTGATCTAACTGTTAGAAATTTGACTGCAGCAGATAACGTCACTGGTGTTGCATTAAATGGTACTACTTATGTTACAGGTGGTCGTATATTTTCCGGTTGGGATTCTGGTGTTGTAGGGTCTATATCATGCTCCCAATGGTTTAGAAGTTCAGGTGCTACAGGTTGGTTTAGTGATACCTATGGTGGTGGTATCTGGATGAAAGATGATAGCTATGTCCGTGTGTATGCTGGAAAGAAATTTGCAGTTGAAAGTGGAGATTTTGATTCCATTAATACTATTGGTGGAATATATGCAGCTGGGTCTATATCCTCACAATCTAATATAACCGCTGTTGGAGATCTTTCTACCCAACGCAACGTAGGTTGTACTGGTGATGTGTACGCCAGAAGTTTCTACGGTAATGCTAATATAGGTGGTACTGGTAGTGCTATCAATTGTCCCGGCGGTATTTATAGCCAAGGTACTAATTGGTTATATGGTCAGATTATCACTAATAATAGCCCTATTAATGCTGGTTCTGGTGTTATTACAGGCAATGGTTCTGGATTATCTAATCTTCAATGGAATAACATTGTAGGCAAACCCAATGAAGTTAATTCATGGATTAACGTTTATAATAGTACTACAAAACAAAAGCAAATTTCAGTTCCTACTGCATTAATAAACCATCTTAATAATGGAGGAGCCGCAGATGTTCGGGTATTAATGGTAACTGACGGCGATGGTCAAAAATGTGTACAACAAACTATATTTGGTGGTGGTGTGTGGACTTCAGGCAAATATAAAGCAGATATGACCTGGAGTGGATTAGGTAATTTATATTTACATAATTCGTCTTCTGCATGGGGTGCTACTTACCAGAATAAGATAGACTGTCGATACACATGGATAACCAGAGTAGATTATAGATTATTATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
8f0816dee79fa78a73815fdf92ec156aca4c583bdaea55cc73a41ddd2185efc4
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation and characterization of phage Thanatos infecting and lysing Shewanella oneidensis and promoting nascent biofilm formation | Kreienbaum,M., Doerrich,A.K., Brandt,D., Leonhard,T., Hager,F., Brenzinger,S., Hahn,J., Ruwe,M., Briegel,A., Kalinowski,J. and Thormann,K.M. | 2020-09-18 | — | GenBank |