Protein

Genbank accession
QKE55318.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,73
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSVDGEAGAVVLTSKYLQISKYNLDKQELNTRLTGIDSSIQSNVEAIGNINIAIGSINSTLNTKAATGANNDITELNALTKAITVAQGGTGASTAENARVNLDLNRFKQLPGETLVYSPYATNYLTVGEGTTWGVYSTASGTFIPLPIQSGGTGASTPAEALTKLLDGKPLALAADGQAPYDAVTVRQLANISGGGNASMSGVMNNFIGAVEWFNGNRTKLPAGYIPADGQLVSRTDAKTADLWSAVSSGLFYAVSDALWINSGDPVRPCAWRASYSTGDGSTTFRVPDLNGTQLNSIKHLFLSGSSGATNEPSANQVWNQVAPNITGTFYTHGSNADAIDAMGAFYLNAQDTGSSLTIGGTDKGDHLGFSASRSSKTYGRGVAYQSDPGGTGPIGDLYPNHAAGIWIIRANGSFNAAGSQYHVINGDSTRPADGTTTYGGFTYSDYRVGEAVNHSALIVSAKRFGNPYSVAVLQAHNRENGDLANFEVQSNGVVNLPTSINNKSWIKASGANGLHLEAATTTTDLHTMPGGGCGVSAAERNAIELNNAPGAVGSGGYVNWLQGWWYDDRFQFGTVRSGSVVLDAVALTIYSNTFGLKQWFFRANDGRIASTAGTIAIEGSDIKLKENIVRASEGALDRITKITPREFDWKAGGRHDRGYIAQELRDVDPTYVYSSTVGEGEEVLNVSTSALISDLIAAVTTLKQELDSAKLEIKKLKAK
Physico‐chemical
properties
protein length:747 AA
molecular weight: 78554,22060 Da
isoelectric point:5,67824
aromaticity:0,08166
hydropathy:-0,19772

Domains

Domains [InterPro]
IPR030392
648–741
IPR030392
IPR030392
648–700
IPR030392 Coil
QKE55318.1
1 747
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage ECOP18
[NCBI] 		2713223 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QKE55318.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT080103.1 [NCBI]
CDS location
range 105124 -> 107367
strand -
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCAAAATCTGGCGCAATGGCGCCTTACGTTGTAGTTAACAGAGACGCAGCAGTAGCTGGTGTTTTCTCTGTTGATGGAGAAGCTGGTGCTGTTGTACTAACTTCCAAATACTTACAAATATCTAAATATAATTTAGATAAACAAGAATTAAATACTCGTCTTACTGGCATAGATAGTTCCATTCAGAGCAATGTAGAGGCTATTGGCAATATTAATATTGCAATTGGTAGTATTAATAGTACTCTCAACACTAAAGCTGCTACAGGTGCTAATAACGATATTACTGAACTAAACGCACTTACTAAGGCTATTACGGTTGCTCAGGGTGGTACAGGGGCTAGCACTGCGGAAAACGCTAGAGTTAACTTAGATCTTAATAGGTTTAAGCAGTTGCCCGGCGAAACTCTGGTATATAGTCCCTATGCGACAAACTATCTTACTGTTGGTGAAGGTACTACCTGGGGAGTTTATAGTACAGCTTCTGGTACATTTATACCTTTACCTATTCAATCTGGTGGTACCGGTGCTAGTACTCCTGCGGAGGCCTTAACTAAGCTGCTAGATGGTAAACCTCTAGCATTAGCCGCCGATGGTCAAGCACCTTATGATGCTGTTACTGTTCGTCAGCTAGCTAATATTTCTGGTGGCGGCAACGCTAGCATGAGTGGGGTTATGAATAACTTCATTGGTGCTGTAGAATGGTTTAACGGTAACCGTACTAAACTGCCAGCCGGCTATATACCAGCAGATGGTCAGTTAGTTAGCCGTACTGATGCTAAAACAGCAGATCTATGGTCTGCGGTATCTAGTGGTCTATTTTACGCTGTTTCCGACGCTTTATGGATTAATAGTGGGGATCCTGTTAGACCCTGCGCTTGGAGAGCTTCCTACTCTACTGGTGATGGTTCTACTACTTTCCGAGTTCCAGATCTTAACGGTACTCAGTTAAATAGTATTAAGCATTTATTTTTATCTGGTAGTTCAGGTGCTACTAATGAACCTTCGGCTAATCAGGTGTGGAATCAGGTTGCCCCCAATATTACTGGTACTTTCTATACTCATGGTAGTAACGCAGATGCTATAGATGCCATGGGGGCTTTTTATTTAAATGCTCAAGATACAGGTAGTTCCCTTACTATAGGAGGTACAGATAAGGGAGACCACTTAGGATTTTCGGCCTCTAGAAGTAGCAAGACATATGGTCGTGGTGTGGCTTACCAATCAGACCCTGGCGGTACCGGCCCTATTGGTGATCTATACCCTAACCATGCAGCAGGTATTTGGATTATCCGTGCTAACGGTTCTTTTAACGCTGCTGGTTCACAGTATCATGTTATTAATGGAGATTCTACACGCCCTGCTGATGGAACTACTACTTATGGTGGCTTTACATATAGCGACTACAGAGTAGGGGAAGCAGTTAATCACTCAGCTTTAATAGTAAGTGCCAAAAGATTTGGTAATCCTTATAGTGTTGCTGTTCTACAAGCGCATAATAGGGAGAATGGGGATCTTGCTAACTTTGAAGTACAATCTAATGGTGTTGTTAACTTACCTACTTCGATTAATAATAAATCCTGGATAAAAGCTTCGGGTGCCAACGGCCTACATTTAGAGGCTGCTACTACTACTACGGATCTACATACTATGCCCGGTGGGGGTTGTGGTGTATCTGCGGCAGAGAGAAATGCTATCGAGTTGAATAATGCCCCAGGTGCTGTAGGTTCTGGTGGTTATGTTAACTGGCTGCAAGGATGGTGGTATGACGATAGGTTCCAGTTCGGGACTGTTCGTAGTGGTTCTGTTGTATTGGATGCTGTAGCCTTAACTATATACTCTAATACATTTGGGTTAAAACAGTGGTTCTTTAGAGCTAATGATGGTAGGATTGCTTCCACTGCAGGTACTATTGCTATTGAAGGTTCGGATATCAAACTTAAGGAGAATATAGTTAGAGCATCCGAAGGGGCCTTAGATAGAATAACTAAAATCACTCCTAGAGAGTTTGACTGGAAAGCTGGAGGTAGGCATGATAGAGGATATATTGCTCAGGAATTACGTGATGTAGATCCTACCTATGTATACTCATCAACTGTTGGGGAAGGAGAAGAGGTATTAAATGTTAGTACATCTGCTCTGATTTCTGACTTAATAGCTGCTGTTACAACTCTTAAACAAGAGTTAGATTCTGCCAAATTAGAAATTAAAAAGCTGAAAGCTAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
c0f5440b46d6a5bbb37e0f751c2d5b85736210e2e400c43109ab0f05912769aa
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6610
Evidence 0,6610
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and genomic study of ECOP18 phage Lee,J.-H. and Yoo,B.-E. 2023-05-12 — GenBank