Protein

Genbank accession
XAO54576.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,73
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVRPAPTVLAEGELAINLKDRLLFTKDDTGAIIDLGFAKGGNIDGNVIHNGNYNQTGDYALKGAFTQTGSYATSGSVTADGDITAKSRLMTDNGEVLVRGTGTAHVRFQDLADARERGIIYSQSRPGNTKQILNVRVQDYTNSTSNIFAFNGDGLFYAPSISGGTSVKSPVIYTNTVDTGNKSALDYDISSLANNNPASSSATSINYLRISRHAVDGIRYRELNNVNGISWHSISTAGTAKYLWSFNADGDVKTSNSLSVGLPGDSSGYSTLGPSAIALGDNNTGLKWRQDGQFHTVNNGAYTLLTTPTEVTSLKQLVAGYSTNGSDLILPTAQNYPLVIVNTTNDKNGFGDGQTLLGYHQSGKYHHYFRGKGVTNVNTTGGLLVTPGNIDVRGGLIAIDGQASSSSLVFKGNTSGQSSVDDMRLSVWGNTFNTVDGTRKNIMEISDVTGTMHYIQRDTDGKVTSRLNGFMDIADGIVVAQDATLKRNLYVSNEIKVRGASGLRIWNDKYGVIFRNSEDNLHIIPTNINAGESGGLGPLRPLSIVLGTGQVKIPNLAADQVSFIANSVLEFPAGNGASYANQNTTKAPLYQTLGAATQAFYPITKQKNTVSNVTITQGMDRTTSEYRIVAQGDLLGDGDATGLKYWRFTKEGNFMAQNRLYAGTAFMNTDGNIAGSIWNKYSGSTNLDAAVNTRVGKGGDTMTGRLTLKTNSDAIVIDYPADEAGYVKGKKGGVDNWYVGNGGADNGLAFWSFQSQGGININPNGEVILSPQGTSIFNINRDRIHMNGAQWIARHSGAWADQWREEAPYFLDFSSVGEDSYYPIIKGKSVITGQGYTTSVELGIRRTPQAWGQAIIRVGNAERGDGPVGIFEFHSSGLFYSPTLIQTPAIGVGTVNGLGAPSIAIGDNDTGLSHGGDGRVNMVANGVHIASWSSSYHIHQGLWDTTGALWTEQGRAIMSYGHLVQANDSYSTYVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASDKLSKINGYTYMQKRGTDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1106 AA
molecular weight: 118743,59980 Da
isoelectric point:6,20781
aromaticity:0,08318
hydropathy:-0,33264

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage vB_YenM_P8
[NCBI]
3141560 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAO54576.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP693301.1 [NCBI]
CDS location
range 125977 -> 129297
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGTAAGGTTGCCGGCGTTCGCCCGGCGCCAACAGTTCTTGCTGAAGGTGAACTGGCTATCAACCTGAAAGACCGCTTACTTTTTACTAAAGATGACACCGGCGCCATTATCGACCTTGGCTTTGCCAAAGGCGGTAATATCGACGGAAACGTTATTCATAACGGTAACTACAATCAAACCGGTGATTATGCTCTGAAGGGTGCTTTTACCCAAACAGGTAGTTATGCGACATCCGGAAGTGTAACAGCAGATGGTGATATCACAGCAAAATCTCGCCTAATGACAGATAACGGTGAAGTTCTTGTACGGGGTACAGGAACCGCCCACGTTCGATTCCAGGATTTGGCTGATGCGCGTGAAAGAGGCATAATTTATTCACAATCACGCCCAGGAAATACCAAGCAAATCTTGAACGTTCGTGTTCAGGATTATACTAATTCAACATCTAATATTTTTGCATTCAACGGTGACGGTTTATTTTATGCTCCATCTATTTCCGGTGGAACATCGGTAAAATCTCCGGTAATTTATACTAATACCGTTGATACCGGTAATAAATCAGCTCTTGATTATGATATATCTTCATTGGCAAATAATAATCCTGCAAGTTCAAGCGCAACATCTATTAACTATCTTAGAATAAGTAGACATGCTGTCGATGGAATTAGGTATCGTGAACTTAATAATGTAAATGGTATTTCATGGCATTCTATTTCTACAGCCGGAACAGCTAAGTATCTTTGGTCATTTAATGCAGATGGCGATGTCAAAACATCAAATTCTCTTTCCGTTGGCCTACCTGGGGATAGCTCAGGATACTCAACATTAGGTCCGTCTGCTATCGCACTTGGCGACAATAACACAGGTTTGAAATGGAGACAAGACGGCCAGTTCCATACAGTTAATAATGGAGCTTATACTTTACTTACAACTCCGACTGAAGTTACAAGCCTTAAACAGTTAGTTGCGGGTTATTCAACCAACGGTTCTGATTTAATTCTCCCTACAGCCCAAAACTATCCATTAGTTATTGTTAATACTACTAATGATAAAAACGGCTTCGGTGACGGTCAAACTCTTTTAGGTTATCATCAGAGTGGTAAATACCACCATTATTTCCGTGGTAAAGGCGTAACAAACGTTAACACTACAGGTGGATTGTTGGTTACTCCTGGAAATATTGATGTTCGTGGCGGACTAATTGCTATTGATGGGCAAGCTAGTTCATCTTCTTTGGTGTTTAAAGGAAATACATCAGGGCAAAGTTCTGTTGATGATATGAGGCTTTCTGTGTGGGGTAACACCTTTAATACAGTAGATGGTACTCGTAAAAACATAATGGAAATATCTGATGTCACTGGCACAATGCATTATATCCAACGTGACACCGATGGAAAAGTTACCTCTAGATTGAACGGCTTCATGGATATAGCAGATGGTATTGTGGTTGCTCAAGATGCAACCTTAAAACGCAATCTGTATGTTTCTAATGAAATTAAAGTTCGCGGTGCTAGTGGACTTCGTATTTGGAACGATAAGTATGGTGTTATTTTCCGAAATTCAGAAGACAACCTGCATATTATTCCAACCAATATTAATGCCGGTGAAAGTGGTGGATTAGGTCCATTACGCCCATTAAGTATTGTATTGGGTACTGGTCAAGTTAAAATCCCTAATTTAGCGGCTGACCAAGTTTCTTTTATTGCTAACAGCGTATTAGAATTCCCTGCTGGTAATGGTGCATCTTATGCCAACCAGAATACGACTAAAGCTCCGTTGTATCAAACACTTGGTGCAGCAACCCAAGCATTCTATCCAATTACCAAGCAGAAAAATACAGTTTCTAATGTAACTATTACTCAAGGTATGGACCGAACTACAAGCGAATACCGAATTGTTGCTCAAGGCGATTTGCTTGGTGATGGTGATGCTACAGGATTAAAATATTGGCGCTTTACCAAAGAAGGTAACTTCATGGCTCAGAACCGCTTATATGCTGGTACAGCTTTCATGAATACCGATGGTAATATTGCTGGTTCTATTTGGAATAAGTATAGTGGTTCTACTAACCTTGATGCAGCGGTGAATACTCGTGTCGGTAAAGGCGGGGACACAATGACAGGCCGCTTAACTCTTAAAACCAATTCAGACGCTATTGTTATTGATTATCCGGCAGATGAAGCGGGTTATGTTAAGGGTAAAAAAGGTGGTGTTGATAACTGGTATGTAGGTAATGGTGGTGCTGATAACGGTTTAGCCTTCTGGAGCTTCCAATCTCAAGGTGGTATTAATATCAACCCTAATGGCGAAGTTATTCTATCTCCACAAGGTACTAGTATATTCAATATAAACCGTGACCGAATTCATATGAACGGTGCCCAGTGGATTGCACGACATTCTGGTGCTTGGGCCGACCAATGGCGTGAAGAAGCACCTTATTTCCTTGATTTCAGTTCGGTAGGTGAAGACAGTTATTACCCTATTATTAAAGGTAAATCAGTAATTACTGGTCAAGGGTATACTACTTCTGTTGAACTTGGTATTAGACGTACACCTCAAGCCTGGGGACAAGCGATAATTCGAGTAGGTAATGCCGAGCGTGGCGACGGCCCTGTAGGTATTTTTGAATTCCATTCTAGTGGACTATTCTACAGCCCTACTTTGATTCAAACTCCTGCAATCGGTGTTGGTACTGTTAATGGACTTGGTGCCCCGAGTATCGCAATTGGTGATAACGATACAGGCTTATCACACGGTGGTGATGGCCGAGTTAATATGGTTGCCAATGGTGTTCATATTGCTTCATGGTCCAGCTCATACCATATCCATCAAGGTCTTTGGGATACCACTGGCGCTTTATGGACTGAGCAAGGAAGAGCTATTATGTCTTATGGTCATCTTGTTCAGGCAAACGACAGCTATTCTACATATGTCCGTGACGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAGGACCTCGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGATAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGAACTGACGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCGGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCGGAATTAGTTGAAGGCGACCCTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCACACTGCCGAAATAGCAGAATTGAAATCAGAGATTGAAGAACTTAAAGCTTTAGTTAAATCATTGTTAAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
d7fbd3ccea15d75b83b67b4a48b642c82f2e21a68a03202a17c85fba8775e5c1
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5401
Evidence 0,5401

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequence of Yersinia phage vB_YenM_P8 Hammerl,J.A. 2003-08 GenBank