Protein
- Genbank accession
- AAR09281.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPNFSLKDLYFDDVPVMNQDGSLNFQNVKAEFRPGTQTQDYIQGFTDTASEVTVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGVTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAVDGAEYKEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPAFNERVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWNIINVTSNYDPISRTYSGAWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGEFTYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTVGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRLMEVSGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPEKPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGSDGHPIVDEATLLTLIPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKTNDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRINQLTATFESEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNADSVGAMYGVKLGIRYNGQEYSAGMALSLVADGGGVKSQFLFDAGRFAIINNAQSGAFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIANFINSNNWQSGVAGWAINKDGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGTVYAEKIEGDVAKAVVLPFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGIHGYTYSGGTWGRGTVWVDSTYGGRLANVQATAMHGGSSGYVLLPAGNATTLSYGGDLNHANAVPILTVLLFKA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1258 AA molecular weight: 138929,74320 Da isoelectric point: 4,98617 aromaticity: 0,09380 hydropathy: -0,30223
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage Tls [NCBI] |
2892339 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAR09281.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY308796.1
[NCBI]
CDS location
range 24930 -> 28706
strand +
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATCAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCCGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAAACTTTTCATTGAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCAGGATGGTTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAGGCAGAATTCAGACCAGGGACGCAAACGCAGGATTATATTCAGGGCTTTACTGATACAGCCAGCGAAGTTACTGTTGCTCGCGATCTGACAGCCGCAACGCCTTATATTATTTCTGTTACCAATAAAAACCTTTCTGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCTCGCGGGGTTACTCAGGAAGATAACGGAGATCTAACAGGTGTTCGCGTTGAATATGCTGTTGATATGGCTGTTGATGGTGCTGAATATAAAGAGGTTTTGCATGATGTAATTGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCAGAATTGATTTACCTGCTTTTAATGAGCGTGTTTTATTGCGCGTCCGTCGCCTGACAGATAGCACGTCAGCAAGGGTAACGGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCGGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTACCCACTGACTGGTTTAGTCTACGTTGAATTTGATAGCGAATTATTCCCTAATGCGTTACCGAATATCAGCATTAAAAAGAAATGGAACATCATAAATGTTACGTCGAATTACGATCCGATTAGCCGCACCTATTCAGGGGCATGGGATGGAACCTGGAAAAAAGCCTGGTCTAATAATCCGGCTTTTGTACTGTATGATTTAATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAGTTAGGCATCGCGCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGATATCTTTGCGACGTTGTGATCCAGAGCCAAGTAGAAGCGTATCAGCTTGTGCGTGATATTTGTTCAATCTTCCGTGGCATGAGCTTTTGGAATGGTGAGAGCCTTTCAATCGTGATCGATAAGCCTCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTGGTTAACGGTGAATTCACTTACACGTTTGCCAGCGAAAAAAGCATGTACACGCAATGCAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGATGTTGAGGGAGTTTTCGAAACGGAGGCGGCGTTACGCTTTGGCTATAACAGCACGTCAATTACTGCGATTGGATGCACACGACGCAGCGAAGCCAACCGCCGTGGACGCTGGATTTTAAAAACCAACGTCAAGAGCACAACGGTAAACTTTGCTACAGGTCTGGAAGGTATGATCCCAACCGTAGGAGATGTGATTGTTGTATCTGATAACTTTTGGTCAAGTGCTCTAACGCTGAATCTATCAGGTCGCTTGATGGAGGTTAGCGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTAGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCGGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTGAGTGATGACGGTAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGTTTTGACGTTCAGCCGGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACCGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCGAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCACCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTCCAAGGCGCGAGCGTGGAAACAATGCATGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGACAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCCAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGAATTTATGCTGGTAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCGAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCTGCAATCGTAAGTGCAGGATTAACCGGAAAAGTTGGAGAGCCGGAAAAGCCAATTAACCTTACAGCGTCTGACAATGAAGTTTTCGGAATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCAGAAGGAAGCGGAGACACGGCCTATATAGAGTTGCATCAAGCGCCAAACGGTTCTGATGGTCATCCTATTGTTGATGAAGCAACGCTCTTAACGCTGATACCGTTCCCGCAATATGAGTATTGGCATTCAATACTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCAGTTGACAAAATCGGTAACGTTTCTGATTGGACTGATTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGCTATAAGTGGTTGCAGGAAAACGCAATAAAGACCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTAGCTAATGATAAAGATGTTCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGAAAGCGTAAAGCGGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGACGAAACAGAAGCCAGGGTAACACAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAGTTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTAATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGAGTGAAATTGATGGGGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAGGCAATCACTAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGAGATACCCAATCAGCAGTGAATCAGAAACTTGATTCTTGGGTTAATGCCGATAGCGTTGGTGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGATCAGGTATAACGGGCAGGAATATAGCGCAGGTATGGCGCTTTCTCTTGTCGCTGATGGTGGCGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCAGGACGATTCGCGATCATCAACAATGCTCAAAGCGGAGCCTTTACATTGCCGTTTGTTGTTGAAAATAATCAGGTGTTTATCAATAGTTTGCTTGTTAAAAATGGTTCTATCGGTAATGCACAGATTGCTAACTTCATCAACTCTAACAACTGGCAGAGCGGGGTTGCAGGATGGGCTATTAACAAAGATGGTTACGCAGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACTGTTTACGCAAACGCCGGTTCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACTGATGGTTGGTTTAGGGGTACTGTTTACGCTGAAAAAATTGAGGGTGACGTTGCAAAGGCTGTTGTCCTTCCGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCGGTTAACTACAACAGACATCTTGTGATCCCTTATGTTGGTATTCACGGGTACACATATTCAGGTGGTACATGGGGCAGAGGTACTGTTTGGGTTGATTCAACATATGGCGGTCGCCTTGCTAACGTTCAGGCAACTGCAATGCATGGCGGATCAAGTGGTTATGTTCTGTTGCCAGCAGGTAACGCAACCACGCTTTCATATGGTGGAGATCTAAACCACGCAAACGCAGTACCGATCTTAACAGTTCTGCTATTCAAAGCATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
ae20ab90d8eb68d12b934d0120c9f24d78ea9b90325ce6a5575b316bdc1c7182
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| The TolC and LPS Specific (TLS) Bacteriophage Genome | German,G.J., DeGiulio,J.V. and Misra,R. | 2024-09-01 | — | GenBank |