Protein

Genbank accession
AAR09281.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,80
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPNFSLKDLYFDDVPVMNQDGSLNFQNVKAEFRPGTQTQDYIQGFTDTASEVTVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGVTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAVDGAEYKEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPAFNERVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWNIINVTSNYDPISRTYSGAWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGEFTYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTVGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRLMEVSGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPEKPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGSDGHPIVDEATLLTLIPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKTNDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRINQLTATFESEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNADSVGAMYGVKLGIRYNGQEYSAGMALSLVADGGGVKSQFLFDAGRFAIINNAQSGAFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIANFINSNNWQSGVAGWAINKDGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGTVYAEKIEGDVAKAVVLPFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGIHGYTYSGGTWGRGTVWVDSTYGGRLANVQATAMHGGSSGYVLLPAGNATTLSYGGDLNHANAVPILTVLLFKA
Physico‐chemical
properties
protein length:1258 AA
molecular weight: 138929,74320 Da
isoelectric point:4,98617
aromaticity:0,09380
hydropathy:-0,30223

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Tls
[NCBI]
2892339 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAR09281.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY308796.1 [NCBI]
CDS location
range 24930 -> 28706
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATCAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCCGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAAACTTTTCATTGAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCAGGATGGTTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAGGCAGAATTCAGACCAGGGACGCAAACGCAGGATTATATTCAGGGCTTTACTGATACAGCCAGCGAAGTTACTGTTGCTCGCGATCTGACAGCCGCAACGCCTTATATTATTTCTGTTACCAATAAAAACCTTTCTGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCTCGCGGGGTTACTCAGGAAGATAACGGAGATCTAACAGGTGTTCGCGTTGAATATGCTGTTGATATGGCTGTTGATGGTGCTGAATATAAAGAGGTTTTGCATGATGTAATTGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCAGAATTGATTTACCTGCTTTTAATGAGCGTGTTTTATTGCGCGTCCGTCGCCTGACAGATAGCACGTCAGCAAGGGTAACGGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCGGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTACCCACTGACTGGTTTAGTCTACGTTGAATTTGATAGCGAATTATTCCCTAATGCGTTACCGAATATCAGCATTAAAAAGAAATGGAACATCATAAATGTTACGTCGAATTACGATCCGATTAGCCGCACCTATTCAGGGGCATGGGATGGAACCTGGAAAAAAGCCTGGTCTAATAATCCGGCTTTTGTACTGTATGATTTAATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAGTTAGGCATCGCGCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGATATCTTTGCGACGTTGTGATCCAGAGCCAAGTAGAAGCGTATCAGCTTGTGCGTGATATTTGTTCAATCTTCCGTGGCATGAGCTTTTGGAATGGTGAGAGCCTTTCAATCGTGATCGATAAGCCTCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTGGTTAACGGTGAATTCACTTACACGTTTGCCAGCGAAAAAAGCATGTACACGCAATGCAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGATGTTGAGGGAGTTTTCGAAACGGAGGCGGCGTTACGCTTTGGCTATAACAGCACGTCAATTACTGCGATTGGATGCACACGACGCAGCGAAGCCAACCGCCGTGGACGCTGGATTTTAAAAACCAACGTCAAGAGCACAACGGTAAACTTTGCTACAGGTCTGGAAGGTATGATCCCAACCGTAGGAGATGTGATTGTTGTATCTGATAACTTTTGGTCAAGTGCTCTAACGCTGAATCTATCAGGTCGCTTGATGGAGGTTAGCGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTAGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCGGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTGAGTGATGACGGTAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGTTTTGACGTTCAGCCGGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACCGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCGAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCACCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTCCAAGGCGCGAGCGTGGAAACAATGCATGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGACAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCCAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGAATTTATGCTGGTAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCGAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCTGCAATCGTAAGTGCAGGATTAACCGGAAAAGTTGGAGAGCCGGAAAAGCCAATTAACCTTACAGCGTCTGACAATGAAGTTTTCGGAATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCAGAAGGAAGCGGAGACACGGCCTATATAGAGTTGCATCAAGCGCCAAACGGTTCTGATGGTCATCCTATTGTTGATGAAGCAACGCTCTTAACGCTGATACCGTTCCCGCAATATGAGTATTGGCATTCAATACTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCAGTTGACAAAATCGGTAACGTTTCTGATTGGACTGATTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGCTATAAGTGGTTGCAGGAAAACGCAATAAAGACCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTAGCTAATGATAAAGATGTTCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGAAAGCGTAAAGCGGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGACGAAACAGAAGCCAGGGTAACACAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAGTTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTAATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGAGTGAAATTGATGGGGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAGGCAATCACTAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGAGATACCCAATCAGCAGTGAATCAGAAACTTGATTCTTGGGTTAATGCCGATAGCGTTGGTGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGATCAGGTATAACGGGCAGGAATATAGCGCAGGTATGGCGCTTTCTCTTGTCGCTGATGGTGGCGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCAGGACGATTCGCGATCATCAACAATGCTCAAAGCGGAGCCTTTACATTGCCGTTTGTTGTTGAAAATAATCAGGTGTTTATCAATAGTTTGCTTGTTAAAAATGGTTCTATCGGTAATGCACAGATTGCTAACTTCATCAACTCTAACAACTGGCAGAGCGGGGTTGCAGGATGGGCTATTAACAAAGATGGTTACGCAGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACTGTTTACGCAAACGCCGGTTCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACTGATGGTTGGTTTAGGGGTACTGTTTACGCTGAAAAAATTGAGGGTGACGTTGCAAAGGCTGTTGTCCTTCCGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCGGTTAACTACAACAGACATCTTGTGATCCCTTATGTTGGTATTCACGGGTACACATATTCAGGTGGTACATGGGGCAGAGGTACTGTTTGGGTTGATTCAACATATGGCGGTCGCCTTGCTAACGTTCAGGCAACTGCAATGCATGGCGGATCAAGTGGTTATGTTCTGTTGCCAGCAGGTAACGCAACCACGCTTTCATATGGTGGAGATCTAAACCACGCAAACGCAGTACCGATCTTAACAGTTCTGCTATTCAAAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
ae20ab90d8eb68d12b934d0120c9f24d78ea9b90325ce6a5575b316bdc1c7182
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7433
Evidence 0,7433

Literature

Title Authors Date PMID Source
The TolC and LPS Specific (TLS) Bacteriophage Genome German,G.J., DeGiulio,J.V. and Misra,R. 2024-09-01 GenBank