Protein

Genbank accession
QDH46718.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MSVGLYGDGVSESQENINVTQYGWTNEDVAGITLIQDYLNQIQTLFEQVVILEASAQEMMLELDQIKQMTLEVRVMYADFIEKYPKIQEALDEMDATLILMQGLVQQVEDDKTHVDLVKSQIDTIKASIDASVIIVNQAVADVNAKASEVTTMRDQTNAYYLATKDIADELAKGQVYRGTWNPNSGTWPDPHGTNSVWDVVLNEGQSEYIWSGIKWLWGDRLLYLKDTSQFQQVESGVGVLTVNGKAGFVTLTPDDVGAVPVTRTVNGKALSSNITLTNTDVGAAPTGFGLGGTMNSTLLSGASCNIATETGWYNVFSGTTDTPFATGPSGSALSVMKWGSSSIHQVFYTYTADRVFTRRMYSGVWQPWIEIYSTAKKPTATDILSSNGKTLQYLTDKVNQVYDVKDFGAVGDGTTDDTAAVQSALDSIPSGSVLSFTKGTYKLNIVNVTKPVKLIGHAKIIVRSFRIKTSNFISELTGEIVAPDYNSTCRAFQCMAHLDSADYENIQILGANFSGYFYSTDIRGRDYSATASDPTNRIVKNVLIQGCTSKAPVGQNAGHFQHTGLTNVKCIGNSTYGGQNATSYNFINGNGDILVVGNYDENNSYGSLEIENNVISSGVVSGNMFGHDLWIDDTSNIHVVGNNTKRVIRITSQHNDVQNVSVVANRCAAVSVTTFGVSPVGVSRNITVNGNHIYNDLNSHCVFADNTVYSISVEGNQLYIAPGGTGNVVGLVRHANADHKVINNFCNSGKLLFSSTGGSVIEYGNIGVGSGSTAGSGTMYANYGNLVYHQGFKPTPNEIGTLTATEINSALSAKLNLSGGTMTGPITSQTSKSSIVVNGQASISYQDASQTVFHTLAFGNSFAIARNINGDTNIWTITGNGLTQQNGPAYTRTGLISQSLDSTKWISMESPDGMDPYIGSRGIGEANTSVAMRFGNQITIEKSTVFNNFPISAYNVNRAWNSYGVANFSAREVSGSAGILRASISYPFKITGSYAVDCYLGTYSESTIASDLYHVLGFTDGGNYNPVWRFGTSGTLKYYSNAVSGTIGNINSGSPMTAPSFTPTSDSRIKSDFVKIENCLEVIKNFTPYNYQKKGLEGREDGLVAQDVQRTLPDSVKVVSTDESLYGFTDVLGVNYSSVTAVNSGAINELHDLVKQLQEEIKVLKDVINSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1172 AA
molecular weight: 126314,18120 Da
isoelectric point:5,09729
aromaticity:0,08959
hydropathy:-0,17850

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
296–373
cd19958 IPR011050 IPR030392
IPR012334
402–791
IPR012334 IPR030392 Coil
QDH46718.1
1 1172
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Aeromonas phage LAh_8
[NCBI] 		2591032 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QDH46718.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK838114 [NCBI]
CDS location
range 47910 -> 51428
strand +
CDS
ATGAGTGTTGGTTTATACGGGGATGGTGTTTCAGAGTCTCAAGAAAATATCAACGTAACTCAATATGGTTGGACTAATGAAGATGTAGCTGGTATTACTCTAATCCAAGACTACCTTAACCAGATCCAAACATTGTTCGAGCAAGTTGTTATTTTGGAAGCTTCTGCTCAAGAAATGATGCTTGAGTTAGATCAAATCAAGCAGATGACATTAGAAGTCCGTGTGATGTATGCGGACTTTATTGAGAAGTACCCAAAGATCCAAGAAGCGTTGGATGAAATGGATGCAACACTTATCCTCATGCAAGGGCTTGTACAACAAGTTGAAGATGATAAGACACATGTTGATTTAGTTAAGTCACAAATTGATACAATCAAAGCAAGTATTGATGCGTCTGTAATTATTGTTAACCAAGCTGTGGCTGATGTAAATGCAAAGGCTTCTGAAGTAACAACAATGAGAGATCAAACAAATGCATACTACTTAGCGACTAAGGATATTGCAGATGAACTCGCAAAAGGTCAGGTATATCGTGGAACTTGGAACCCCAATAGTGGAACATGGCCAGATCCCCACGGAACAAACTCCGTGTGGGATGTTGTTCTTAATGAAGGTCAGTCAGAGTACATCTGGAGTGGAATCAAGTGGCTGTGGGGAGATAGATTACTGTATCTCAAGGATACTTCTCAGTTCCAACAAGTAGAATCAGGTGTTGGTGTACTTACTGTTAATGGTAAAGCTGGTTTTGTAACATTGACCCCAGATGATGTTGGTGCAGTGCCTGTTACAAGGACTGTAAATGGTAAAGCACTCTCTAGTAACATCACCCTTACAAATACAGATGTTGGTGCAGCCCCTACTGGTTTTGGTCTTGGTGGAACAATGAACAGCACACTGCTTTCAGGGGCATCTTGTAACATTGCAACTGAAACGGGTTGGTACAACGTGTTCTCTGGGACAACAGATACACCTTTTGCCACTGGCCCCTCTGGTTCTGCGTTAAGTGTTATGAAATGGGGTTCTAGTTCAATACATCAAGTATTCTACACATATACAGCGGATAGGGTATTTACAAGAAGGATGTATAGTGGTGTTTGGCAACCTTGGATTGAAATTTACTCAACTGCTAAGAAGCCTACTGCAACCGATATCCTATCATCTAATGGTAAGACCCTCCAGTACCTAACTGATAAAGTAAACCAAGTTTATGATGTCAAGGATTTTGGGGCTGTTGGTGATGGAACAACTGATGATACAGCAGCTGTACAAAGTGCTCTTGACAGTATCCCATCAGGTTCTGTTTTATCCTTCACAAAAGGTACTTACAAACTAAACATTGTCAACGTGACTAAGCCTGTAAAACTAATTGGACATGCTAAGATTATTGTTAGAAGTTTCAGGATAAAAACAAGTAACTTCATTTCAGAACTAACTGGTGAGATTGTAGCTCCTGATTATAATTCAACCTGTCGAGCATTCCAGTGTATGGCTCACTTGGATAGTGCAGATTATGAAAATATTCAAATCCTAGGTGCTAATTTCAGTGGGTACTTCTACTCTACAGATATTCGAGGAAGGGATTACTCTGCTACAGCTTCTGATCCAACAAACCGGATTGTTAAGAATGTGCTTATCCAAGGGTGTACTTCAAAAGCCCCAGTTGGTCAGAATGCAGGACACTTCCAACACACAGGTTTGACGAATGTTAAATGTATTGGTAACTCTACATATGGTGGACAGAATGCTACATCCTACAACTTCATTAATGGGAACGGGGATATACTTGTTGTAGGTAACTATGATGAGAATAACTCCTACGGAAGTCTTGAAATAGAGAATAACGTGATCTCCTCAGGGGTTGTCAGTGGTAATATGTTTGGACATGATTTGTGGATTGATGACACAAGTAACATTCATGTAGTTGGCAACAATACTAAGCGTGTTATTAGAATCACCTCTCAGCACAATGATGTTCAGAACGTTAGCGTTGTTGCTAATAGATGTGCCGCAGTATCTGTTACCACTTTTGGTGTAAGCCCGGTTGGTGTGTCACGAAATATAACAGTTAATGGAAACCATATCTACAATGACTTAAACTCTCACTGTGTATTCGCAGATAATACAGTATATAGTATCTCTGTTGAGGGTAACCAACTTTATATTGCTCCTGGTGGAACTGGTAATGTTGTTGGTCTGGTTAGACATGCTAATGCTGATCACAAGGTCATTAACAACTTCTGTAACAGTGGTAAATTATTGTTCAGTTCTACTGGTGGGTCAGTAATTGAATACGGAAATATTGGTGTTGGGTCGGGCTCTACAGCTGGGTCTGGAACAATGTACGCTAACTACGGAAACTTAGTATATCACCAAGGTTTCAAACCAACTCCAAATGAAATAGGAACATTGACTGCAACTGAGATTAACTCTGCGTTAAGTGCAAAGCTTAATCTTAGCGGTGGTACAATGACTGGCCCCATTACATCCCAAACTTCAAAGAGTTCTATTGTTGTAAATGGACAGGCTTCTATTTCTTACCAAGATGCTAGTCAAACTGTGTTCCATACACTTGCTTTCGGTAATAGTTTTGCAATTGCAAGAAATATCAATGGTGATACAAATATTTGGACTATAACAGGTAATGGGTTAACACAACAAAATGGCCCAGCATATACCAGAACTGGTTTAATATCGCAAAGTTTAGACAGTACTAAATGGATTAGCATGGAAAGTCCAGATGGAATGGATCCTTACATCGGTAGTAGAGGTATAGGAGAAGCTAATACTTCAGTAGCTATGAGGTTTGGTAATCAAATCACTATAGAGAAGTCCACTGTTTTCAATAATTTTCCAATATCCGCTTACAATGTAAACAGGGCTTGGAATAGTTATGGTGTAGCTAACTTCTCAGCTAGAGAAGTCTCGGGATCCGCTGGAATTCTAAGGGCTTCAATTAGTTATCCGTTTAAGATAACTGGAAGCTATGCTGTAGATTGTTACTTAGGAACTTACTCTGAAAGTACTATAGCCTCTGATTTATACCATGTTCTTGGTTTTACTGACGGTGGTAATTATAACCCCGTTTGGAGATTTGGAACAAGCGGTACATTAAAATACTACTCTAACGCTGTATCTGGAACTATTGGGAATATTAATTCCGGTAGCCCAATGACTGCTCCTTCATTCACACCAACTTCAGACTCAAGGATTAAATCTGACTTTGTTAAGATTGAAAATTGTCTTGAAGTAATCAAAAACTTTACTCCATATAACTACCAGAAGAAAGGTTTGGAAGGAAGGGAAGATGGTTTAGTCGCACAAGATGTTCAGAGAACATTACCAGATTCTGTGAAGGTGGTCTCTACGGATGAAAGTTTGTATGGGTTTACTGATGTATTAGGCGTTAACTACTCAAGTGTCACTGCCGTAAACTCTGGGGCAATTAATGAGTTGCACGATCTTGTAAAACAATTACAAGAAGAGATTAAGGTTTTGAAGGATGTAATTAACTCTAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
91e60f57aebbb9b71ee600e113e2bb0ed433fe3976787262b67727de68f8bdec
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2454
Evidence 0,2454
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Novel bacteriophages capable of disrupting biofilms from clinical strains of Aeromonas hydrophila with intrinsic antibiotic resistance Kabwe,M., Brown,T.L., Speirs,L., Ku,H., Leach,M., Chan,H.T., Petrovski,S., Lock,P. and Tucci,J. 2020-02-14 — GenBank