Protein

Genbank accession
AIX22799.1 [GenBank]
Protein name
putative short tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGEVLYTNVAPIDENSNLDITSPNNVLYKYNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYTAKGINTEADVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTELISPKFSHHRLTCFQFADGLNSLQTLIDSGTVPVGNYGVVDDIYERTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPTTDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGNTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGPQSEVDATEYNGSFTVTSASGNVFTYQMSATPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMRADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATEGDGAHLDGFAEYRKGWAHEHITATNDSFIQAVSVFAVGYGTHFTTESGADMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKSFSKDKAGEITHIIPPRSLNVISTSATGTSGTNTVTLADDGSVEGIIEGMLINNEDIPLGTQVSAVNTSTRVITMTSSSTDTVTGNIIFGEEVTVNWVNLDIQRTISINSELAQAGQTPGSRLYLFGYTAEPSPPATKVQGYGIGARQDGTGANAVADKINVLLYANSSATQPSVVSANVAPYGPSVSGLSAGVDGSPFQYDSSTYTIGGTSKIGGWYLSTEGGSSNTIYTALSSQSASSQRYENAAFTPTTFIKRIPDSRDLQDRTYRVRYVIDKNKTNPLPRDPLSGYVMQPLNSDATSYNLNRTFYIYDIEIVQEYERGVADGIYYLTLLCASISPSTSNFDNRKFSQNVNEVYPTFDRDNPLGDPDPSVSVADNETIGLVYSTDGATPPNKDPKLSITKEGIEFLLGDTGWVQPGTSPNWDSVNKRLSGVQLTSRYGDEEVRKIPVRENVDGTVAPVPVELRRHSIMRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSTDQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQIINPVTGQITSEDIAQLNVIGEEGTTIETFSEVVLTDKLTVIGGASNQLESIFSGPVTFQNTTTFTGNLQTSKFTLFNTDGTVVRQQLLAPSTTGAGGSNAQPDFATIVGYDTPSTGDLVYNSNWTPGTSLGWIYDGDTASWKQFGLTNTGDIEIQTFNTRQNIGIGEAPDSTYRVRMNGSARIDGDLVVTGRGGVGSDKYVTRTYTGDGVTQTFALTTYANVSHTANSLLVFVNGVAQIGGTNFSVDGTGANIVFSAGDEPTSIDTVHIIELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1330 AA
molecular weight: 143318,36720 Da
isoelectric point:4,66923
aromaticity:0,09474
hydropathy:-0,28955

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-MbCM6
[NCBI] 		3126011 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX22799.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019064 [NCBI]
CDS location
range 24983 -> 28975
strand +
CDS
ATGGCATTAACACGTCTTAAGAATATTATTACGTCCCGTACGGGGCGTATTATTTACGTTAACCCTGATGATTTCGACGCTTCGGATGCCATTGATAACCGAGGAAACTCTGCACTTAGACCTTTTAAAAGTCTACAGAGAGCATTTCTTGAGGTAGCGAGATTCTCATATCGAGTTGGTTTATCAAATGACGAATTTGATGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATGTTGTTGATAATAGACCAGGTGAAGTATTATATACTAATGTTGCTCCCATTGACGAGAATTCAAACTTAGATATTACTTCTCCAAACAACGTATTATATAAGTATAATTCTGTTGAAGGTGGTATTATTGTACCTAGAGGTTGCTCTTTAGTTGGCACAGATCTTAGACGCACTAAGATTATTCCTAAGTATGTGCCGTATCCAACCACATATACTGCAAAAGGAATCAATACTGAAGCAGATGTACCACCTCGCACTGCTATCTTTAAGGTAACTGGTGGCACATATTTCTGGCAATTCTCTTTCTTTGATGGTGCTGAAGAAGGTGTATACTTCAAACCTGACAGCACAGAATTAATCTCACCTAAATTCTCTCACCATAGACTCACTTGTTTCCAATTTGCTGATGGTTTGAATAGTCTACAGACATTAATTGACTCAGGCACTGTGCCTGTAGGAAACTATGGTGTGGTTGATGACATTTATGAGCGCACAGATTTAGAAATTTACTATCAAAAAGTATCTAAGGCATTTGCTACTATTCCTGATACATCTGGTGATCCTACAACTGACCAAATTCAGGCAAGAGTAGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCTGATGAATATCGAGTCTTACAAATCACTCGTAATGGTAATACTGCAACAGCAGTCACTGTTGATGAATTTGATAACCCAAGAGATCATGGATTCTCTGTAGGTGTTAACATTAATATCAGTGGTGTTACAGGATCTACAGGTCCACAGTCTGAAGTTGACGCAACAGAATATAATGGATCATTTACTGTAACCTCGGCATCAGGTAATGTCTTTACCTATCAGATGTCAGCAACACCAACAGGTAATGCAGTTGGATCAAACATTACTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTTAACCTGTCACTGAGATCAGTGTGGGGTATGAATGGTATGAGAGCGGATGGTAGTAAAGCAACTGGATTTAAGTCCATGGTTGTTGCTCAATTTACTGGTTTGAGTCTTCAAAAGGATGATAGAGCATTCGTAAGATATAATGCTTCTACTGGCAATTATGATGTTGCAACTGAAGGAGATGGTGCTCACCTAGATGGTTTTGCTGAATACCGTAAGGGTTGGGCACATGAGCATATTACTGCAACAAATGATTCATTTATTCAGGCAGTTTCGGTGTTTGCTGTTGGATATGGCACACACTTTACTACTGAGAGTGGTGCTGACATGTCTATCACCAACTCAAACTCTAACTTCGGTAACACTGCTTTAAGATCTGCTGGTTTCAAAGCAAAATCATTCTCGAAGGATAAAGCGGGTGAAATTACACATATCATTCCACCTAGATCTTTGAATGTTATTTCAACATCAGCAACTGGCACATCTGGCACTAATACAGTTACATTAGCAGATGATGGATCTGTTGAGGGTATTATCGAAGGTATGCTTATCAATAATGAGGATATTCCTCTTGGCACTCAAGTATCTGCTGTTAATACTAGCACCAGAGTAATTACAATGACTTCAAGTAGCACTGATACTGTTACTGGAAATATTATTTTTGGTGAGGAAGTCACTGTAAACTGGGTAAACCTTGATATTCAACGCACAATCAGTATCAATAGTGAATTAGCACAGGCAGGTCAAACACCTGGATCCAGACTTTATCTGTTTGGATATACTGCAGAACCTTCTCCCCCTGCAACAAAGGTTCAGGGTTACGGAATTGGTGCCAGACAAGATGGCACGGGTGCTAATGCTGTAGCAGATAAAATCAATGTGCTACTATATGCTAATTCTAGTGCAACTCAACCTTCAGTTGTTTCTGCTAACGTAGCACCGTATGGTCCTAGTGTATCTGGTTTATCTGCTGGTGTTGACGGATCACCCTTCCAATATGATTCATCAACATATACTATTGGCGGCACTTCTAAAATTGGTGGTTGGTATCTCTCTACAGAAGGTGGATCTAGTAATACAATTTACACTGCATTATCTTCTCAAAGTGCAAGTAGTCAAAGATATGAGAATGCTGCTTTCACACCGACAACATTTATTAAACGTATTCCTGACAGTAGAGACCTACAAGATAGGACATATCGTGTTCGTTATGTAATTGATAAGAATAAAACTAATCCACTTCCTCGTGATCCACTGTCTGGTTATGTAATGCAACCACTTAATAGTGATGCAACCAGTTATAACCTTAACAGGACATTCTACATTTACGATATTGAAATTGTCCAAGAATATGAGCGAGGCGTTGCTGATGGAATTTACTACCTTACACTCCTTTGTGCATCTATTTCACCTTCAACTTCTAATTTCGACAACAGAAAATTCAGTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACATTTGACAGAGACAACCCTCTTGGTGACCCTGATCCTTCGGTATCCGTCGCTGACAATGAAACTATTGGTCTAGTATATTCTACCGATGGTGCAACACCACCTAACAAAGATCCCAAACTTTCTATTACTAAAGAAGGGATTGAATTCTTATTGGGTGATACTGGTTGGGTGCAACCTGGCACATCTCCAAACTGGGATTCTGTTAATAAAAGGTTGAGTGGTGTGCAACTAACTTCTAGATATGGTGATGAAGAAGTCAGAAAGATTCCTGTCAGAGAAAATGTTGATGGCACTGTTGCACCTGTCCCTGTTGAGTTACGCAGACACTCAATTATGAGATCTGGTAACCATACCTTTGAGTATCTTGGATTCGGTCCTGGTAACTACTCAACTGCATTCCCTCAGACTCAAGTAGAGACGCTATCTACAGACCAGATTAAGTTCTCTCAGTCTATTAAAGAAGAAGCAGGAGTTGCATTCTATTCGGGTCTTAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAGATTATTAACCCTGTTACAGGTCAAATTACATCTGAAGATATTGCACAACTGAATGTTATTGGTGAAGAAGGCACAACGATTGAAACATTCTCTGAAGTTGTATTGACTGATAAACTCACTGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTAGAATCTATTTTCTCTGGTCCTGTTACCTTCCAAAATACAACTACATTTACAGGTAACTTGCAAACTAGTAAGTTTACTTTATTCAATACAGATGGCACTGTTGTTAGACAACAACTCTTAGCACCTTCTACAACAGGAGCAGGTGGATCTAATGCACAACCAGATTTTGCAACTATCGTTGGATATGACACACCATCTACAGGTGACTTAGTTTATAATAGTAATTGGACACCTGGCACATCTCTTGGTTGGATTTATGATGGTGATACTGCATCTTGGAAGCAGTTTGGTCTAACTAACACGGGTGATATTGAAATTCAAACATTCAATACTCGTCAAAATATTGGTATTGGTGAAGCACCAGATTCAACATATCGTGTTAGAATGAATGGTAGCGCCAGAATTGACGGTGACTTGGTTGTTACTGGTCGTGGTGGTGTTGGATCTGATAAATATGTCACTCGCACATATACTGGCGATGGTGTAACACAAACTTTTGCACTTACCACTTATGCAAATGTTTCGCATACTGCAAACTCTTTGTTAGTATTTGTAAACGGTGTTGCACAGATTGGTGGCACTAACTTTAGTGTAGATGGCACAGGTGCAAATATTGTATTTTCAGCAGGTGACGAACCTACTTCGATTGATACAGTTCATATTATCGAGTTGCCCATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f1e99f8a86ebe78f1b227c423d4b4a0d80481018294381c7b6757c01388013b6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3601
Evidence 0,3601
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank