Protein

Genbank accession
AFD02935.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,51
Protein sequence
MNINKVSQSIESQSPDFIGSEYPLFNKFLEYYYKSQEKTGIGQNILNNFLQYLDIDKLDIGILDGATTLVEAITDSSDKIVVESINPFLETNGSILIGDEVIYYEGVDKSPEISLSPGISYEQVKLKWTTLASLINSFDGTTTSFAITSQDSPIAPPSAQHLVVSLYGNILVPNIDYTVSGSNIVFTTAPRTKIPADDAGSTYIFYLSGFVENTIYGLDNLSGAFGDGKKQFSLTRNGVKYEPEVEEYLNVIYDNRLLVPKVDYFIDEDQFVFKVAPLNGRFLSIYSIEAPIPSFGNGAVGFSRINDNGLLTSVSSSAIGTGYRFEYPPQVSIDSEQGSGAAATALVNGLKSITLLEGGRGYSSTNPPVVQVQSPTKTGSSQATINATVVDGAVTALNISNSGSGYTFTPRITFVQPGGAKLGTPVITNGQVTSIPVTDGGFGYTTAPTVYIDESTGSNPIKAALRANLTDGKVTSITILNAGQGYTTTPRVAIIDPVGAQVLETIVDGDGRVIRVDLLNGGSGYDDVPSVYIVDNRTNGGTGATAVASIFNGQITDLNINAFGSGYSAANPPEIVIQAPPQAKASVEIGLNEVTGFVVTESGKGYNKAAFTGCARAASGITKYTETGNAVFSNNTVAASATVGSSVKCLDALFVKRLLDKYTEQFLPDVPELDYSKIDVRTSIKTIKDFYSSKGTSFSIAYLFKLLYGETVTVTYPKDQIIKPSAATWSIDTILRATLVSGNADNIRDGLLTQEADIADPNVTAASALVENYISIKTSDVEIFELVLSEETIVGTFTVPYKTKLAEPLNTTDSIITVDSTIGWPERNGEFVIGGGTTTELVQYKEKSLNQFIECTRSANGIVEDWDSATQVASNFTVYVNRGTPQEVVLNVVGIVDAQQTVLTDTGSYYLPGDKLTVSKLGGTSIDPHLTTWLYNVKKLINVSTVTFGGVNNRFATITCSNNHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSATVFQYQLPQPATVVPQGNILVSVDLNKGKSTSSAVLNAIGPYTTNVQNSFFNTNYAYLASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPITSTTISTKNTVSPGPIGTWVNGVSIWSYKSTLKKTFGAVTSVAITNAGKEYDAASPPVLTISGGGGTGATAAVVVNGSVNEITVSTGGSGFTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGVVSRILINSGGTGYTSQPSITVVGGGGTGAAATASVRGPIQSVSVGSGGISYTSTPTVSLSSGSGAVAQAIVQNGRIISIAIISAGSGYTTAPEITIQGEGFGAVARASIDTDGENAGRVTSITIVNRGIGYLQGTTNINLNSVGSEATFTANVFEWTYNLQSTTTFDAAKGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQTLRYILGDNLFENTSGVIKEKEDGLIHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTDQSSAIQKLNTSYRLKTNLVYNVDSNPNPVRTAGPLLSAEAAGKFVEDYEYVFGLGALDQYNGRFCKTPEYPEGRYSYFVTIDATDDGNPLFPYVMGPSFNSVVDSWNLNADAVQQNIPEGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNALTLENGDVLLFDLEDEDRSGVIEADEIADPDQVFEESPLQLFDYFPKVKFDSKVDIEVETTTKFEDASVTGFTVENPGISYQVNDRLIFDNTDTDGSGVSARISRIKGEAVEAYTFENVSGNNFGVLTTVNPHNLQPGDSVFVDYTPVMDSTNKTFVVRQFKGIEEIVVNQTGSGYNTDIPPTIIIDGNGTGGRLEAVVTSVGSIENVNIINSGYGYTSNPRVILSHPQVFKKADYYVAKFTNRNYVRISDVYINDSKETYICGKTYDAASNDVAFIAKLSATGVKEWEASLELPGGQQDSEFL
Physico‐chemical
properties
protein length:1892 AA
molecular weight: 201295,45000 Da
isoelectric point:4,54765
aromaticity:0,09302
hydropathy:-0,08758

Domains

Domains [InterPro]
IPR023366
939–1015
IPR023366 IPR025924 IPR018247
AFD02935.1
1 1892
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage metaG-MbCM1
[NCBI] 		1079999 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFD02935.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN371769 [NCBI]
CDS location
range 54178 -> 59856
strand +
CDS
ATGAACATTAATAAGGTTTCCCAGTCGATTGAGTCTCAATCACCAGACTTTATTGGATCAGAATATCCTCTGTTTAATAAGTTTCTTGAGTATTATTACAAATCTCAAGAGAAGACTGGTATAGGGCAAAATATACTTAATAACTTCCTCCAGTATCTTGATATCGACAAACTTGATATCGGTATCCTAGATGGTGCGACAACGCTTGTAGAAGCGATTACAGACAGTTCAGATAAGATTGTTGTTGAGAGTATCAACCCGTTCCTAGAAACGAATGGGTCTATTCTAATTGGCGATGAAGTCATATATTATGAAGGTGTAGATAAATCTCCAGAAATCTCACTTTCCCCAGGTATTTCATATGAACAGGTAAAACTTAAGTGGACTACTCTTGCTAGTCTTATCAACAGTTTTGATGGTACCACTACATCATTTGCAATAACATCTCAAGACAGTCCAATTGCTCCCCCTTCAGCACAGCATTTGGTTGTTTCTTTGTATGGTAATATTTTAGTTCCAAATATTGATTATACAGTTAGCGGATCAAATATTGTATTCACTACTGCACCTAGAACAAAAATTCCTGCTGATGATGCAGGTTCAACTTATATCTTCTATCTCAGCGGTTTTGTTGAGAACACCATTTATGGATTGGACAATCTGTCTGGTGCTTTTGGTGATGGTAAGAAGCAGTTCAGTCTAACTCGTAATGGAGTTAAGTATGAACCAGAAGTTGAAGAGTATTTGAATGTAATTTATGATAATCGTCTCTTAGTTCCTAAAGTTGATTACTTTATTGATGAAGACCAGTTTGTATTTAAAGTAGCACCCCTTAACGGTCGTTTCTTATCAATTTATTCAATTGAGGCACCCATCCCGTCTTTCGGTAATGGTGCAGTTGGTTTTTCTCGTATTAATGATAATGGACTTTTAACAAGTGTTTCATCTAGTGCTATTGGTACTGGATATCGCTTTGAATATCCTCCTCAAGTTAGCATTGACTCTGAGCAAGGTTCAGGTGCTGCTGCAACTGCCCTTGTCAATGGTTTGAAGTCAATCACCCTACTAGAGGGTGGAAGGGGTTACAGTTCGACTAACCCTCCTGTTGTGCAGGTTCAATCTCCTACCAAAACTGGTTCTAGTCAAGCAACTATTAATGCAACGGTTGTTGACGGTGCAGTTACTGCGCTGAATATTAGCAACTCTGGTTCTGGTTATACTTTTACTCCTAGAATTACTTTTGTTCAACCTGGTGGTGCAAAACTAGGTACTCCTGTAATTACTAATGGTCAAGTTACTTCCATTCCTGTTACTGATGGAGGTTTTGGTTATACTACTGCTCCAACTGTTTATATTGACGAATCAACTGGTTCAAACCCAATTAAGGCAGCATTGAGAGCAAATCTTACTGATGGTAAGGTTACCAGCATTACAATTTTGAATGCAGGGCAAGGATATACTACTACACCTAGGGTTGCTATTATTGACCCTGTAGGTGCACAGGTATTAGAAACTATTGTTGATGGTGATGGGCGTGTTATTAGAGTTGATCTACTGAATGGTGGCAGCGGATATGATGATGTGCCTTCAGTCTACATTGTAGATAATAGAACTAACGGTGGTACTGGTGCGACTGCAGTTGCTTCTATTTTCAACGGTCAAATCACTGATCTTAATATTAATGCCTTTGGTAGCGGTTACTCTGCTGCAAATCCTCCAGAGATTGTAATTCAAGCACCTCCTCAAGCAAAAGCATCTGTTGAAATTGGTCTTAATGAAGTTACAGGTTTCGTAGTTACTGAGTCAGGTAAAGGATACAATAAGGCAGCATTTACTGGATGTGCGAGAGCAGCATCTGGTATTACTAAGTACACTGAAACAGGTAATGCAGTATTCAGTAATAACACTGTAGCAGCATCTGCAACGGTTGGTTCAAGCGTTAAGTGTTTAGATGCGCTATTTGTTAAGAGACTACTAGACAAGTATACAGAACAGTTCTTACCTGATGTTCCAGAACTTGACTACTCTAAGATTGATGTTCGTACATCGATCAAAACTATTAAAGATTTTTATTCATCTAAAGGTACTTCGTTCAGTATTGCTTATCTGTTCAAGTTACTTTATGGTGAAACTGTTACGGTCACATATCCAAAAGACCAAATCATCAAACCCTCTGCAGCAACTTGGTCTATCGACACAATTTTGCGTGCAACCCTAGTAAGTGGTAATGCTGATAATATTAGAGATGGTTTGTTAACTCAAGAAGCAGATATTGCAGATCCTAACGTAACTGCTGCAAGTGCCTTAGTTGAAAACTATATTTCAATCAAAACCTCTGATGTAGAGATTTTTGAACTTGTTCTCTCAGAAGAAACTATTGTTGGGACGTTTACCGTACCATATAAGACAAAACTTGCTGAACCTCTTAATACAACCGATTCAATCATTACGGTTGACTCTACAATTGGTTGGCCAGAACGAAATGGTGAATTTGTTATTGGTGGTGGTACAACAACTGAACTTGTACAGTATAAAGAGAAATCACTCAACCAGTTCATCGAATGTACTCGTTCTGCAAACGGTATTGTAGAAGACTGGGATTCTGCAACTCAAGTTGCTTCTAACTTCACGGTATATGTGAATAGAGGAACTCCTCAAGAAGTAGTACTGAATGTTGTTGGTATTGTTGATGCACAGCAAACTGTTCTTACTGACACTGGTTCATACTACCTACCTGGTGATAAACTCACTGTGTCTAAGTTAGGTGGAACTAGTATTGATCCTCATTTAACTACATGGTTATATAACGTCAAAAAACTTATCAATGTTTCCACAGTTACCTTTGGAGGCGTTAATAATAGATTTGCAACTATTACTTGTTCAAACAATCACGGTTTATTGGTTGGTGATCAGGTTACAGTTTATGGTGCAAACCCAATCATCTATAATGGCACATTCCTTGTAACATCTAGGGATAGTGCAACAGTATTCCAATATCAGTTACCCCAACCCGCAACTGTGGTACCACAGGGTAATATCCTAGTATCTGTTGACTTGAACAAAGGTAAGTCTACAAGTAGTGCTGTATTGAATGCTATTGGTCCTTATACGACTAACGTTCAAAACTCATTCTTCAATACAAACTATGCATACCTAGCATCTACAGGTATTCCAAACTATAATATTGGTCCTTTCCCAGGATCTGCTCTACTTCCAGGAAACCAACGTAAGTTGAATCGTTTCCCGATTACTTCTACAACAATTTCTACAAAGAACACCGTTTCTCCAGGTCCTATCGGAACTTGGGTTAATGGCGTTTCTATCTGGTCTTATAAGTCAACTCTCAAGAAAACCTTTGGTGCTGTAACTAGCGTTGCTATTACAAATGCAGGTAAAGAATATGATGCTGCATCTCCACCAGTATTAACTATCAGTGGTGGCGGAGGAACTGGTGCAACTGCTGCGGTTGTTGTTAACGGTTCTGTTAATGAAATTACTGTATCTACAGGGGGTTCTGGGTTTACTTCTTCTCCTCTAGTCTCTATCGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCTGCAACTGCTATTATTACAAAAGGGGTTGTTTCTAGAATTCTAATCAACTCAGGTGGTACTGGATACACCTCACAACCTTCTATTACTGTTGTTGGTGGCGGTGGTACTGGTGCTGCAGCAACTGCATCTGTTCGTGGTCCTATTCAGTCTGTTTCTGTTGGATCAGGTGGTATTTCTTATACTTCTACTCCTACTGTATCGTTAAGTTCTGGTAGTGGTGCTGTTGCACAAGCAATTGTACAGAATGGTCGTATTATTTCGATCGCTATCATTTCTGCAGGTTCTGGATACACAACTGCTCCCGAAATTACTATTCAGGGTGAAGGTTTTGGTGCTGTTGCTAGAGCATCTATTGATACTGATGGTGAAAACGCAGGTAGAGTTACAAGCATTACTATTGTTAACCGAGGTATTGGATATCTTCAAGGAACAACTAATATTAACCTGAACTCTGTTGGTTCTGAAGCAACTTTCACTGCAAACGTATTTGAATGGACTTATAACTTACAATCAACTACTACATTTGATGCTGCTAAGGGTTCTGTCTTTGAAGGATTTAATAATCAGTATGGTGGTGAGTATGCTCACTTATCAAACCCTCAAACACTAAGATATATTCTTGGTGACAACTTATTTGAAAATACATCAGGCGTAATCAAAGAAAAGGAAGACGGTTTAATACACTCTCCTATTATTGGTTGGGCATTTGATGGTAACCCAATTTACGGTCCTTATGGTTACTCCGATCCTACTGATCAGTCATCTGCGATTCAAAAACTTAATACTTCATATAGATTAAAGACAAATCTTGTTTATAATGTAGATTCTAACCCAAATCCTGTTAGAACAGCAGGTCCTTTACTATCTGCTGAGGCAGCAGGTAAATTTGTTGAAGACTATGAGTATGTGTTCGGTCTTGGTGCATTAGATCAGTATAACGGTAGATTCTGTAAGACTCCTGAGTATCCCGAAGGTAGATATTCTTACTTCGTTACTATTGATGCAACTGACGATGGTAATCCATTATTCCCTTATGTTATGGGTCCTAGTTTCAACTCTGTTGTTGATTCTTGGAACTTGAATGCTGATGCTGTACAACAAAATATTCCAGAAGGTGTTGTTAGATATCGTGACCCTTATGAGAATGTTGATATTGACGTTGAGAGGGCACCTAATGCTTCTACAAACGCTCTAACACTAGAGAATGGAGATGTATTACTATTTGATTTAGAAGACGAAGATAGAAGTGGTGTTATTGAAGCGGATGAGATTGCTGATCCTGATCAGGTCTTTGAAGAGTCACCATTACAGTTATTTGATTACTTCCCCAAAGTCAAGTTTGACTCTAAGGTTGATATTGAAGTTGAAACAACTACTAAGTTTGAAGATGCTTCTGTAACTGGATTTACAGTTGAAAACCCAGGTAT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
1e552380ccc550aae1df9fde759f70e5cc96c9ed3c3310564e2725a8c093a58e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7832
Evidence 0,7832
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Viral Tagging: a high-throughput approach to explore virus-host interactions Deng,L., Sullivan,M.B., Poulos,B. and Ignacio Espinoza,J.C. 2019-08-05 — GenBank