Protein

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Genbank accession
QGT52581.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MLINVLNGSLKKVAILSNELPNAPSYYNDEFHDYLEQGATTFSFTVAKVINNQLQDYTQFLSDQSYFSFRKNGRDYLMTPSSEQSVHETSTEISFFCVSLDRELINEQANSLANTASHNIQWYFDRMGLISRTKITIGINEVSNLTRVINYDAQESKLSRLISVINNFNAEFDFVTTLNNDGSLGTVVLNIYKENDGQNIQGVGTKRDDVRLTFGKNIEDVEVDVSDDGFFNAAYMTGADGFSWKNYDFSYKNSDGVEEFYKRKGSEIAYAPLSAKMFPSQLKTDKGDIWTNSDRTTEYKNANDMWGYIVSQFKQYAYKQITYTVTPSSTLVNQLIGDGRPLQKGDTVIIQDDNYMDIDGNVGLILSARVSEIITSDTNPANNKIVFSNYKKLKSEASSDIKAIVSQLVNDATPYFADIATSNGVQFKNGTGSTTLSAHIYKGSATTEATADSYEWSKDGTVVAPTQTITVDASGVADKAVYSFKATVAGKVVASQSVTITNVNDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGNDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPTSGWTSTVPTVAAGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAMMGVKGDKGDQGIQGVDGRQGIPGPKGADGKTQYTHIAYANSADGSKDFSTSDSNRTYIGMYVDFNINDSTTPSDYSWTLVKGADGTQGTPGKPGTDGKTPYFHTAWSYSADGTDGFTTVYPNLNLGDNTKTFVGAEYELSNIRGSIIIDPATQKTQDGDINYLTFKPTRDGYDWFRFYLRPNSTMPNMTKVAIKPNTIQINLTSEWKIYTFTVTSSNVIPDRDVQFFIRSNNGTEINLKYPKVEEGSTATPYMQSASEVTTADYPSYIGQYTDFAQADSTNPSAYTWSLIRGNDGERGPQGLKGDPGATGIPGQPGADGKTSYLHIAYATNSTGTAGFDVSNATGKTYIGQYTDFMSADSTDPSKYTWSLIKGDKGDKGERGIQGPAGSNGDPGKIVSDTEPTTRFKGLTWKYLGMSDLTASDGTVILSGTEYYWSGTNWILNEINAHNINGDNLSVTNGTFTDGKIKSTWNSGTASGSTEIENSHINMSATNSSSKVTNSLGLDIKQGFGMRWTDPASNQSKSVLLDYGNLAFDRNGVAAGLNFDGTNLSSSMPIQAPNTIVKSTQFSVSGIGIRLDRMMSFVAVTFSGQASSTIKNSPTIINVLPDGFRPISPYSIDYIVPGNTANNGYIYFNPDGSIRIMATINSGYYIRGTRFYITNDVYPS
Physico‐chemical
properties
protein length:1393 AA
molecular weight: 151154,54340 Da
isoelectric point:4,99827
aromaticity:0,10625
hydropathy:-0,47351

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–761
DC_0690 G3DSA:1.20.5.320
IPR050149
Unmapped
576–825
IPR050149 DC_1971
DC_1441
STR
694–1013
DC_1441
G3DSA:1.20.5.320
STR
729–783
G3DSA:1.20.5.320
QGT52581.1
1 1393
Architecture
STR
STR
STR 2-1013 | STR 1019-1255 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage CHPC1175
[NCBI] 		2675241 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus lactis
[NCBI] 		1358 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT52581.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN689509.1 [NCBI]
CDS location
range 15155 -> 19336
strand +
CDS
ATGCTCATTAATGTTTTAAATGGTTCATTAAAAAAAGTAGCGATCTTAAGTAATGAACTTCCCAATGCACCTAGTTATTATAACGATGAGTTTCATGACTATTTAGAACAAGGAGCAACTACATTTAGTTTTACAGTTGCTAAAGTGATTAATAATCAGCTACAGGATTATACACAATTCTTAAGTGATCAAAGTTATTTTAGCTTCAGGAAAAATGGTCGAGACTACTTGATGACTCCTTCATCCGAGCAATCAGTTCATGAAACAAGTACTGAAATTTCATTTTTCTGCGTTTCTTTAGACCGAGAACTTATTAATGAGCAAGCAAATTCATTAGCGAATACTGCAAGCCATAATATTCAATGGTATTTTGACCGAATGGGTTTAATCTCTAGAACTAAAATTACTATTGGAATTAACGAAGTTTCAAATCTAACACGAGTGATTAATTATGATGCGCAAGAATCTAAATTATCAAGACTTATTTCGGTAATCAATAATTTTAACGCTGAATTTGATTTTGTAACGACTTTAAATAATGATGGTTCTCTTGGAACTGTTGTTCTAAATATCTATAAAGAAAATGACGGTCAAAATATTCAAGGTGTGGGAACAAAACGTGATGATGTCAGACTAACATTTGGTAAAAACATCGAGGATGTCGAAGTAGATGTTAGTGATGACGGATTTTTTAACGCCGCTTATATGACTGGTGCTGACGGTTTTAGTTGGAAAAATTATGATTTCAGTTATAAAAATTCAGACGGTGTAGAAGAGTTCTATAAAAGAAAGGGTTCTGAAATAGCTTATGCTCCATTATCTGCCAAAATGTTCCCTTCTCAATTGAAAACAGACAAAGGAGACATTTGGACAAACTCAGACCGAACTACTGAATATAAAAATGCCAATGATATGTGGGGCTATATTGTCAGTCAATTTAAGCAATATGCCTACAAACAAATCACATATACCGTTACTCCTTCATCTACTTTAGTTAATCAACTTATTGGAGATGGAAGACCTCTCCAAAAGGGAGATACAGTTATTATCCAAGATGATAACTACATGGATATTGATGGCAATGTTGGTCTAATTTTATCTGCAAGAGTCTCTGAAATCATTACATCAGATACAAACCCTGCTAATAATAAAATTGTTTTTTCAAATTATAAAAAACTAAAGAGCGAGGCTTCTTCTGATATCAAAGCGATTGTCAGTCAGTTAGTCAATGATGCTACACCGTATTTCGCAGACATAGCAACTTCAAATGGAGTTCAGTTCAAAAACGGCACTGGTTCAACAACTTTATCAGCTCATATCTATAAAGGCTCTGCAACGACTGAAGCAACCGCAGACAGCTACGAATGGTCGAAGGATGGAACTGTTGTCGCTCCAACTCAGACTATTACAGTTGATGCCAGCGGAGTTGCGGATAAGGCAGTTTATAGTTTTAAAGCAACGGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCTAGTCAGTCGGTGACTATCACTAATGTGAATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGAAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACGTACGCTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACGAAAACAGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGGAACAACGGTAATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGTATCAAAACTACGACCATTACCTATGCAGGCTCAACAAGTGGAACAACAGCACCAACTAGCGGTTGGACTTCTACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACCGTTTGGGCTTATACGGACAATACCAGTGAAACAGGGTATTCAGTTGCGATGATGGGAGTTAAAGGCGATAAGGGAGATCAAGGTATTCAAGGTGTTGATGGACGTCAAGGTATTCCTGGACCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACACAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTGCCGATGGTAGCAAAGACTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTACCTATATCGGGATGTATGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCACTCCGAGTGATTACTCATGGACACTCGTAAAAGGAGCGGATGGAACGCAAGGGACACCGGGTAAACCTGGGACAGACGGTAAGACACCGTATTTTCACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGTACTGATGGTTTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATCTAGGAGATAATACCAAAACTTTTGTCGGCGCAGAGTATGAGTTAAGTAATATAAGAGGTTCTATTATAATAGACCCAGCAACTCAAAAAACACAGGATGGAGATATTAATTATTTAACCTTCAAGCCAACTAGAGATGGTTATGATTGGTTTAGATTCTATTTAAGACCAAATTCAACAATGCCTAATATGACGAAAGTCGCGATTAAACCAAATACAATACAAATTAATCTAACTAGTGAATGGAAGATATATACATTTACAGTAACATCATCAAATGTTATTCCAGATAGAGATGTTCAATTCTTTATAAGAAGTAACAATGGAACAGAAATTAATCTTAAATACCCTAAAGTAGAAGAAGGCTCAACTGCTACTCCATATATGCAATCAGCTAGCGAAGTCACAACTGCTGATTATCCAAGCTACATCGGTCAGTACACAGACTTTGCGCAAGCTGACAGCACTAATCCATCCGCCTATACTTGGAGTCTGATACGGGGGAATGACGGGGAAAGAGGTCCACAAGGATTAAAAGGTGACCCTGGAGCAACTGGTATCCCCGGACAACCCGGAGCTGACGGAAAAACAAGCTATCTTCACATCGCCTATGCCACAAACTCAACTGGTACGGCTGGATTTGATGTATCAAATGCGACTGGTAAAACTTATATTGGACAATATACAGACTTTATGAGTGCTGATTCTACAGACCCAAGTAAGTACACATGGAGCTTGATTAAAGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGAGCGAGGCATCCAAGGTCCTGCTGGAAGTAACGGTGACCCTGGTAAAATCGTTTCCGATACTGAGCCAACTACACGCTTCAAAGGCTTGACTTGGAAGTATTTAGGTATGTCTGACCTTACAGCTAGTGATGGAACAGTTATATTATCTGGCACCGAATATTATTGGTCGGGAACTAACTGGATATTAAACGAAATAAATGCACATAATATCAATGGTGATAATCTAAGTGTTACAAACGGAACTTTTACCGACGGGAAAATAAAAAGTACATGGAACTCAGGTACAGCATCGGGTAGCACGGAAATTGAAAATAGTCACATCAACATGAGTGCAACAAATTCATCAAGTAAAGTGACAAATAGTTTAGGACTGGATATCAAACAAGGTTTTGGGATGCGTTGGACTGATCCAGCTTCTAATCAATCAAAATCAGTTTTACTTGATTATGGAAACTTGGCTTTTGATAGAAATGGAGTTGCAGCAGGACTAAACTTTGATGGGACCAATTTATCAAGTTCTATGCCTATTCAAGCCCCGAACACAATTGTTAAGTCAACTCAGTTTAGCGTTAGTGGGATAGGAATCCGTTTAGACCGAATGATGTCATTTGTTGCAGTTACTTTTTCAGGGCAAGCTTCTTCAACGATTAAAAACTCTCCAACAATTATCAATGTTCTTCCAGATGGATTTAGACCAATTAGTCCATACTCAATAGACTATATAGTACCTGGTAATACAGCTAATAATGGTTATATCTATTTTAATCCAGATGGTTCAATTAGGATTATGGCAACTATTAATAGTGGTTATTACATTAGGGGAACAAGATTTTATATCACTAATGATGTTTATCCATCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
dd6793f9b52d3a98883617e5433965bf0cd903217efde118f7ff4f93db394500
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7933
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome Sequences of 31 Lactococcus lactis Bacteriophages Isolated from Foods Marcelli,B., de Jong,A. and Kuipers,O.P. — — GenBank