Protein

Genbank accession
QGT52581.1 [GenBank]
Protein name
capsid and scaffold protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MLINVLNGSLKKVAILSNELPNAPSYYNDEFHDYLEQGATTFSFTVAKVINNQLQDYTQFLSDQSYFSFRKNGRDYLMTPSSEQSVHETSTEISFFCVSLDRELINEQANSLANTASHNIQWYFDRMGLISRTKITIGINEVSNLTRVINYDAQESKLSRLISVINNFNAEFDFVTTLNNDGSLGTVVLNIYKENDGQNIQGVGTKRDDVRLTFGKNIEDVEVDVSDDGFFNAAYMTGADGFSWKNYDFSYKNSDGVEEFYKRKGSEIAYAPLSAKMFPSQLKTDKGDIWTNSDRTTEYKNANDMWGYIVSQFKQYAYKQITYTVTPSSTLVNQLIGDGRPLQKGDTVIIQDDNYMDIDGNVGLILSARVSEIITSDTNPANNKIVFSNYKKLKSEASSDIKAIVSQLVNDATPYFADIATSNGVQFKNGTGSTTLSAHIYKGSATTEATADSYEWSKDGTVVAPTQTITVDASGVADKAVYSFKATVAGKVVASQSVTITNVNDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGNDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPTSGWTSTVPTVAAGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAMMGVKGDKGDQGIQGVDGRQGIPGPKGADGKTQYTHIAYANSADGSKDFSTSDSNRTYIGMYVDFNINDSTTPSDYSWTLVKGADGTQGTPGKPGTDGKTPYFHTAWSYSADGTDGFTTVYPNLNLGDNTKTFVGAEYELSNIRGSIIIDPATQKTQDGDINYLTFKPTRDGYDWFRFYLRPNSTMPNMTKVAIKPNTIQINLTSEWKIYTFTVTSSNVIPDRDVQFFIRSNNGTEINLKYPKVEEGSTATPYMQSASEVTTADYPSYIGQYTDFAQADSTNPSAYTWSLIRGNDGERGPQGLKGDPGATGIPGQPGADGKTSYLHIAYATNSTGTAGFDVSNATGKTYIGQYTDFMSADSTDPSKYTWSLIKGDKGDKGERGIQGPAGSNGDPGKIVSDTEPTTRFKGLTWKYLGMSDLTASDGTVILSGTEYYWSGTNWILNEINAHNINGDNLSVTNGTFTDGKIKSTWNSGTASGSTEIENSHINMSATNSSSKVTNSLGLDIKQGFGMRWTDPASNQSKSVLLDYGNLAFDRNGVAAGLNFDGTNLSSSMPIQAPNTIVKSTQFSVSGIGIRLDRMMSFVAVTFSGQASSTIKNSPTIINVLPDGFRPISPYSIDYIVPGNTANNGYIYFNPDGSIRIMATINSGYYIRGTRFYITNDVYPS
Physico‐chemical
properties
protein length:1393 AA
molecular weight: 151154,54340 Da
isoelectric point:4,99827
aromaticity:0,10625
hydropathy:-0,47351

Domains

Domains [InterPro]
IPR050149
576–825
IPR050149 G3DSA:1.20.5.320
G3DSA:1.20.5.320
729–783
G3DSA:1.20.5.320
QGT52581.1
1 1393
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage CHPC1175
[NCBI] 		2675241 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT52581.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN689509 [NCBI]
CDS location
range 15155 -> 19336
strand +
CDS
ATGCTCATTAATGTTTTAAATGGTTCATTAAAAAAAGTAGCGATCTTAAGTAATGAACTTCCCAATGCACCTAGTTATTATAACGATGAGTTTCATGACTATTTAGAACAAGGAGCAACTACATTTAGTTTTACAGTTGCTAAAGTGATTAATAATCAGCTACAGGATTATACACAATTCTTAAGTGATCAAAGTTATTTTAGCTTCAGGAAAAATGGTCGAGACTACTTGATGACTCCTTCATCCGAGCAATCAGTTCATGAAACAAGTACTGAAATTTCATTTTTCTGCGTTTCTTTAGACCGAGAACTTATTAATGAGCAAGCAAATTCATTAGCGAATACTGCAAGCCATAATATTCAATGGTATTTTGACCGAATGGGTTTAATCTCTAGAACTAAAATTACTATTGGAATTAACGAAGTTTCAAATCTAACACGAGTGATTAATTATGATGCGCAAGAATCTAAATTATCAAGACTTATTTCGGTAATCAATAATTTTAACGCTGAATTTGATTTTGTAACGACTTTAAATAATGATGGTTCTCTTGGAACTGTTGTTCTAAATATCTATAAAGAAAATGACGGTCAAAATATTCAAGGTGTGGGAACAAAACGTGATGATGTCAGACTAACATTTGGTAAAAACATCGAGGATGTCGAAGTAGATGTTAGTGATGACGGATTTTTTAACGCCGCTTATATGACTGGTGCTGACGGTTTTAGTTGGAAAAATTATGATTTCAGTTATAAAAATTCAGACGGTGTAGAAGAGTTCTATAAAAGAAAGGGTTCTGAAATAGCTTATGCTCCATTATCTGCCAAAATGTTCCCTTCTCAATTGAAAACAGACAAAGGAGACATTTGGACAAACTCAGACCGAACTACTGAATATAAAAATGCCAATGATATGTGGGGCTATATTGTCAGTCAATTTAAGCAATATGCCTACAAACAAATCACATATACCGTTACTCCTTCATCTACTTTAGTTAATCAACTTATTGGAGATGGAAGACCTCTCCAAAAGGGAGATACAGTTATTATCCAAGATGATAACTACATGGATATTGATGGCAATGTTGGTCTAATTTTATCTGCAAGAGTCTCTGAAATCATTACATCAGATACAAACCCTGCTAATAATAAAATTGTTTTTTCAAATTATAAAAAACTAAAGAGCGAGGCTTCTTCTGATATCAAAGCGATTGTCAGTCAGTTAGTCAATGATGCTACACCGTATTTCGCAGACATAGCAACTTCAAATGGAGTTCAGTTCAAAAACGGCACTGGTTCAACAACTTTATCAGCTCATATCTATAAAGGCTCTGCAACGACTGAAGCAACCGCAGACAGCTACGAATGGTCGAAGGATGGAACTGTTGTCGCTCCAACTCAGACTATTACAGTTGATGCCAGCGGAGTTGCGGATAAGGCAGTTTATAGTTTTAAAGCAACGGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCTAGTCAGTCGGTGACTATCACTAATGTGAATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGAAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACGTACGCTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACGAAAACAGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGGAACAACGGTAATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGTATCAAAACTACGACCATTACCTATGCAGGCTCAACAAGTGGAACAACAGCACCAACTAGCGGTTGGACTTCTACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACCGTTTGGGCTTATACGGACAATACCAGTGAAACAGGGTATTCAGTTGCGATGATGGGAGTTAAAGGCGATAAGGGAGATCAAGGTATTCAAGGTGTTGATGGACGTCAAGGTATTCCTGGACCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACACAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTGCCGATGGTAGCAAAGACTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTACCTATATCGGGATGTATGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCACTCCGAGTGATTACTCATGGACACTCGTAAAAGGAGCGGATGGAACGCAAGGGACACCGGGTAAACCTGGGACAGACGGTAAGACACCGTATTTTCACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGTACTGATGGTTTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATCTAGGAGATAATACCAAAACTTTTGTCGGCGCAGAGTATGAGTTAAGTAATATAAGAGGTTCTATTATAATAGACCCAGCAACTCAAAAAACACAGGATGGAGATATTAATTATTTAACCTTCAAGCCAACTAGAGATGGTTATGATTGGTTTAGATTCTATTTAAGACCAAATTCAACAATGCCTAATATGACGAAAGTCGCGATTAAACCAAATACAATACAAATTAATCTAACTAGTGAATGGAAGATATATACATTTACAGTAACATCATCAAATGTTATTCCAGATAGAGATGTTCAATTCTTTATAAGAAGTAACAATGGAACAGAAATTAATCTTAAATACCCTAAAGTAGAAGAAGGCTCAACTGCTACTCCATATATGCAATCAGCTAGCGAAGTCACAACTGCTGATTATCCAAGCTACATCGGTCAGTACACAGACTTTGCGCAAGCTGACAGCACTAATCCATCCGCCTATACTTGGAGTCTGATACGGGGGAATGACGGGGAAAGAGGTCCACAAGGATTAAAAGGTGACCCTGGAGCAACTGGTATCCCCGGACAACCCGGAGCTGACGGAAAAACAAGCTATCTTCACATCGCCTATGCCACAAACTCAACTGGTACGGCTGGATTTGATGTATCAAATGCGACTGGTAAAACTTATATTGGACAATATACAGACTTTATGAGTGCTGATTCTACAGACCCAAGTAAGTACACATGGAGCTTGATTAAAGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGAGCGAGGCATCCAAGGTCCTGCTGGAAGTAACGGTGACCCTGGTAAAATCGTTTCCGATACTGAGCCAACTACACGCTTCAAAGGCTTGACTTGGAAGTATTTAGGTATGTCTGACCTTACAGCTAGTGATGGAACAGTTATATTATCTGGCACCGAATATTATTGGTCGGGAACTAACTGGATATTAAACGAAATAAATGCACATAATATCAATGGTGATAATCTAAGTGTTACAAACGGAACTTTTACCGACGGGAAAATAAAAAGTACATGGAACTCAGGTACAGCATCGGGTAGCACGGAAATTGAAAATAGTCACATCAACATGAGTGCAACAAATTCATCAAGTAAAGTGACAAATAGTTTAGGACTGGATATCAAACAAGGTTTTGGGATGCGTTGGACTGATCCAGCTTCTAATCAATCAAAATCAGTTTTACTTGATTATGGAAACTTGGCTTTTGATAGAAATGGAGTTGCAGCAGGACTAAACTTTGATGGGACCAATTTATCAAGTTCTATGCCTATTCAAGCCCCGAACACAATTGTTAAGTCAACTCAGTTTAGCGTTAGTGGGATAGGAATCCGTTTAGACCGAATGATGTCATTTGTTGCAGTTACTTTTTCAGGGCAAGCTTCTTCAACGATTAAAAACTCTCCAACAATTATCAATGTTCTTCCAGATGGATTTAGACCAATTAGTCCATACTCAATAGACTATATAGTACCTGGTAATACAGCTAATAATGGTTATATCTATTTTAATCCAGATGGTTCAATTAGGATTATGGCAACTATTAATAGTGGTTATTACATTAGGGGAACAAGATTTTATATCACTAATGATGTTTATCCATCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
dd6793f9b52d3a98883617e5433965bf0cd903217efde118f7ff4f93db394500
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7863
Evidence 0,7863
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome Sequences of 31 Lactococcus lactis Bacteriophages Isolated from Foods Marcelli,B., de Jong,A. and Kuipers,O.P. — — GenBank