Protein

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Genbank accession
QLF88463.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,67
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MTITVTSTPLNLSVTNERGPIGPTGATGPAGAQGSTGPQGPTGPAGPTGPTGPQGSSITGSTGPTGPQGPAGPTGPSFNLTNYTTNSNISSNDWIFWADNSTFQEYKLQYSDFQTPITTAANAYTDTQINNLINGSPAALDTLDELAAALNDDSNFASTVTNSITTKLNSSDFNPFFDSRIATKSIDNFIDIDISTNNPTNGQTLIFDSTNGVFVPGLSFSQSDFDTAFTAKSTTDLSEGTNLYYTNARADARVTNAIIDEDNMSSNLDTKVPTQQSVKAYVDAQVATVPTGDITGVSAGTGLSGGGTSGDVTLNVDLLSKVEGTNFSNSLLIGHSTTGTLNNANSNTGVGIAALDNLSAGDFNTALGNEAVSSVSTTRYNTGIGYRALRSTTGESNTAVGAVAMYGTYGGNFNTAIGRNALTSNNTGDNNVSLGYDSGSSITSDTANYNLTLGTEAGDNITTGAGNVIIGTVDADNATGDRQLKIAGYDGTTTTTWISGDSNGVVTFADDILIKDNGTIGNATTSNAITIEPNGQISFSGAIQTPSAHYHGGDGLVTYWGTNSEIRLTHVHDTGLLLTNDNGSFKLQLADPGEYIEGNGINLNVNSSNNTNISATNIVKLAGSGIEVSLGGGAAHMLFSDGTTQFGHIKKVSNNLDIRSSISDGDITFRGNDGGTGITALTLDMSEAGAATFNSNVTIGGDLIVNGTTTTVNSTQVNIQNAFVFEGSTADAYETTLTVTDPTADRTITLPDESGDVIIGKNGGTNFTDSLLVGHSTTGTLNAAIRNVGVGSNALDALTSGDSNVAIGYVAGTNINSGSGNIAIGSSALTTSTGAINNVAIGVSTLQSADGSTTENTAIGNQSGLAVSSGNVNIFLGFQAGSNITSGSGNVIIGAVPANSATDDRQLKIAGHDGTNTTTWLTGDSSGKLTMTDGDIIPGKIEGTNFTESLLIGHSTTGTLNSAERNLGILNSSLEKITSGDDNIAIGKNTLRGLTAGAQNVALGNFASAHSSTGLASYTTFVGYGAGGSNQGSYNTAMGRGALQNVTGNYNIGLGVQVGDNITSGAGNVMIGHYVDADSTTGNRQLVISGYDGTTTTTWISGDSSGNLTFPANISIGSNLTDQYTTDLTVKTSNFTITSSSLGKIYLLDSSSNTVTATLPASPNNGERVKFIDVAGSASTNNITIGRNGNSIQGSASDLTVVTDRAAFELMFVTSYGWILTNV
Physico‐chemical
properties
protein length:1223 AA
molecular weight: 124447,43930 Da
isoelectric point:4,22293
aromaticity:0,05887
hydropathy:-0,17817

Domains

Domains [InterPro]
DC_1284
STR
4–289
DC_1284 DC_2098 DC_0768 DC_2098
DC_1988
STR
244–448
DC_1988 IPR027411
IPR036240
STR
1136–1219
IPR036240
QLF88463.1
1 1223
Architecture
STR
STR
STR
STR 4-589 | STR 602-865 | STR 895-1219 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QLF88463.1
1 1223
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 323 323 0,9926
Central domain 324 522 200 0,8855
C-terminal 523 1223 700 0,5081
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-323
Central
324-522
C-terminal
523-1223

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage Kolga EXVC016S
[NCBI] 		2736233 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp
[NCBI] 		2024849 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF88463.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT375529.1 [NCBI]
CDS location
range 13604 -> 17275
strand +
CDS
ATGACAATTACAGTAACTTCAACACCGTTAAATTTAAGCGTTACAAATGAAAGAGGCCCAATAGGCCCAACAGGTGCAACAGGCCCAGCAGGTGCGCAAGGTTCTACAGGCCCGCAAGGCCCAACAGGCCCAGCAGGCCCAACTGGCCCAACTGGCCCACAAGGTTCATCAATAACAGGTTCAACAGGCCCAACTGGCCCACAAGGCCCAGCAGGCCCAACAGGCCCATCGTTTAATTTAACTAACTATACAACAAATTCAAATATCAGTTCAAATGATTGGATATTCTGGGCTGACAATTCAACTTTTCAAGAATATAAATTACAATATTCTGACTTTCAAACACCTATTACAACAGCAGCAAATGCATATACAGATACACAAATTAATAATTTAATAAATGGATCACCTGCAGCATTAGATACTTTAGATGAATTAGCAGCAGCTTTAAATGATGATTCAAATTTTGCTTCAACTGTTACAAATAGTATTACAACTAAATTAAATTCAAGTGATTTTAATCCATTTTTTGATTCAAGAATAGCAACTAAATCTATTGATAATTTTATTGACATAGATATTAGCACAAACAATCCTACAAATGGACAAACTTTAATATTTGATAGTACAAATGGTGTATTTGTTCCTGGTCTTAGTTTTAGTCAAAGTGATTTTGATACTGCATTTACAGCTAAAAGCACAACTGATTTAAGTGAGGGCACAAATTTATATTACACAAATGCTAGAGCAGATGCGAGAGTAACTAACGCTATTATTGATGAAGATAATATGTCTTCAAATTTAGATACAAAAGTTCCTACTCAACAATCTGTTAAAGCTTATGTAGATGCACAAGTTGCAACAGTACCAACTGGAGATATTACAGGCGTATCAGCTGGAACTGGTTTATCTGGTGGTGGTACTTCAGGTGATGTAACTTTAAATGTAGATTTATTAAGTAAAGTTGAAGGAACAAATTTCAGTAATTCTTTATTAATTGGTCACTCTACTACAGGTACTTTAAATAATGCAAATTCAAATACTGGGGTAGGTATTGCAGCTTTAGATAATTTATCAGCAGGAGATTTTAACACTGCATTAGGTAATGAAGCAGTTTCCAGTGTATCTACTACTAGATATAACACTGGTATCGGTTATAGAGCTTTAAGATCAACAACTGGAGAAAGTAATACAGCTGTTGGTGCGGTAGCAATGTACGGAACTTATGGTGGTAATTTTAATACAGCAATCGGAAGAAATGCCTTAACATCAAACAATACTGGAGATAATAATGTTTCACTAGGTTATGACAGTGGTTCAAGTATAACTAGCGATACTGCTAATTATAACCTTACATTGGGAACTGAGGCTGGAGACAATATCACTACTGGTGCTGGTAACGTAATTATTGGAACTGTTGATGCTGATAATGCTACTGGTGATAGACAATTAAAGATAGCAGGCTATGACGGTACAACAACTACAACATGGATATCTGGGGATAGTAATGGTGTTGTAACTTTTGCAGATGATATATTAATTAAAGATAATGGTACTATTGGTAATGCAACAACTTCAAATGCAATAACTATTGAACCAAACGGTCAAATATCTTTTTCTGGAGCAATTCAAACACCTTCAGCACATTATCATGGTGGTGATGGACTTGTTACATATTGGGGGACAAATTCTGAAATAAGATTAACACACGTACATGATACGGGTTTATTATTAACAAATGATAACGGATCATTTAAATTACAACTTGCAGATCCAGGTGAATATATTGAGGGTAATGGAATTAATTTAAATGTAAACTCATCAAATAACACAAATATAAGCGCAACAAACATAGTAAAATTAGCTGGTAGCGGAATAGAAGTATCGCTTGGAGGCGGAGCAGCTCATATGTTGTTTTCTGATGGTACAACTCAGTTTGGTCATATAAAAAAAGTAAGTAATAATTTAGATATTAGAAGTTCAATATCTGATGGAGATATTACTTTTAGAGGTAACGATGGTGGTACAGGAATTACAGCATTAACTTTAGATATGTCAGAAGCTGGTGCGGCTACGTTTAATAGTAACGTAACAATTGGTGGAGATTTAATAGTAAATGGAACAACTACAACTGTTAATTCAACACAAGTTAATATTCAAAATGCTTTTGTATTTGAAGGATCAACTGCTGATGCATATGAAACAACTTTAACAGTTACAGACCCTACAGCAGATAGAACAATAACTTTACCTGATGAAAGTGGTGATGTTATTATTGGTAAAAATGGTGGAACTAATTTTACAGATAGTTTATTAGTTGGTCATTCAACAACAGGAACTTTAAATGCCGCTATTAGAAATGTAGGTGTTGGCTCTAATGCTTTGGATGCACTTACATCTGGAGATAGCAACGTAGCCATAGGATATGTTGCTGGAACTAATATAAACAGTGGATCTGGTAATATTGCGATTGGAAGTAGTGCTTTAACAACTTCTACTGGTGCAATAAATAACGTAGCTATTGGTGTTAGTACTTTACAGAGTGCAGATGGTTCAACTACTGAAAATACTGCTATTGGTAATCAATCTGGACTTGCAGTAAGTAGTGGAAATGTAAATATATTTTTAGGTTTTCAAGCTGGTAGTAATATTACAAGTGGTTCTGGAAACGTAATTATTGGCGCTGTTCCTGCTAATAGTGCTACTGACGATAGGCAATTAAAAATTGCTGGACATGATGGTACAAATACAACTACTTGGCTAACAGGTGATAGTTCAGGTAAACTTACAATGACAGATGGTGATATAATACCAGGAAAAATTGAAGGTACTAATTTTACAGAATCATTATTAATTGGACATTCAACAACAGGAACTTTAAATTCTGCTGAAAGAAACCTTGGAATATTAAATTCTTCTTTAGAAAAAATAACTTCTGGTGATGACAACATTGCCATTGGAAAAAATACTTTAAGAGGATTAACGGCAGGTGCCCAAAACGTTGCATTAGGAAATTTTGCAAGCGCTCACTCTAGCACAGGATTAGCTTCTTATACTACGTTTGTAGGATATGGTGCTGGTGGAAGTAACCAAGGTAGTTATAATACAGCTATGGGTCGTGGTGCATTACAAAATGTTACAGGAAATTATAATATTGGATTAGGGGTACAAGTAGGTGACAATATAACTTCTGGTGCTGGTAATGTAATGATTGGTCACTATGTTGACGCTGATAGTACAACAGGAAACAGACAATTAGTAATTTCTGGATATGATGGTACAACTACAACTACTTGGATTAGTGGAGATAGTTCTGGTAACTTAACTTTCCCTGCAAATATTAGTATTGGTTCAAATTTAACAGATCAATACACAACAGATCTTACAGTTAAAACTTCTAACTTTACTATTACATCTTCAAGCTTAGGTAAAATATATTTATTAGATAGTTCATCAAATACTGTTACTGCTACTTTACCAGCAAGTCCTAACAATGGCGAGAGGGTTAAATTTATTGATGTTGCAGGATCTGCAAGTACAAATAATATAACTATTGGTAGAAATGGTAATAGCATACAAGGTAGTGCATCTGATTTAACAGTCGTAACTGATAGAGCAGCATTTGAATTAATGTTTGTTACTTCATATGGTTGGATTTTAACAAACGTTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
267b54787a94a112f534575e64103a4dc68c60a5706536d4076b622f428fbc07
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6097
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50