Protein

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Genbank accession
QLF88075.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MANSFVRYTGNGTTTTYAIPFSYRDTADLSATVAGVNVTAYTLDAAGTNLTFTTAPANGSAIEIRRTTSQNTKLVDYVSGSVLTENDLDTDSDQAFYMSQEAIDKAGDVISLDNVDFNWDIQNKRLKNVADPVDNTDAVNKQFISTNIPNITTVAGISSDVTTVAGISSDVTAVAADATDIGTVSANIASVNTVATNIADVVTVANDLNEAISEIETAANDLNEATSEIDTVSNNITNVNTVGTNIADVNTVAGIDTNVTTVAGISADVTSVAGISTAVSNVNSNSTNINAVNANSANINTVAGINADVTSVAGISSEVSTVAGNNTNINTVAGNDANITTVAGNNTNITTVAGINSDVTTVSGISADVTSVASNSSNINAVASNEANINAVNTNSTNINIVATDIANVNNVGGSIASVNTVASNLASVNSFANTYLGASATAPTQDPDGSALDLGDLYFDSSSDTMKVYSSGGWINAGSAVNGTANRFKYTATASQTTFTGADDNSETLAFDPPYLDVFLNGVKLVNTADFTATTGTSIVLASGASANDILEVIAYGTFTLSNFSITDANDVPALGSAGQALVVNSGGTALEFSNASSAEVYGFHKDSNGDLIVTTTNQGDDDISSATYATFDDVLFSASGFTFSLNNGELIATI
Physico‐chemical
properties
protein length:656 AA
molecular weight: 66664,12230 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,05640
hydropathy:0,05747

Domains

Domains [InterPro]
DC_1263
ATT
1–319
DC_1263 DC_0265
IPR005604
ATT
3–114
IPR005604 Coil DC_0265
QLF88075.1
1 656
Architecture
ATT
STR
ATT 1-319 | STR 320-654 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage Eistla EXVC025P
[NCBI] 		2736226 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF88075.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT375521.1 [NCBI]
CDS location
range 1 -> 39638
strand +
CDS
ATGGCTAATTCATTCGTAAGATATACCGGAAACGGTACAACTACTACATACGCTATTCCTTTTAGTTACAGAGATACAGCCGATTTATCAGCTACAGTAGCAGGTGTAAATGTCACAGCTTACACTTTAGATGCCGCAGGTACTAATCTTACATTTACTACAGCACCGGCTAATGGCTCTGCGATTGAAATAAGAAGAACTACAAGCCAAAATACAAAATTAGTAGATTACGTATCAGGTTCAGTACTAACTGAAAATGACCTAGATACAGATAGTGACCAAGCTTTCTATATGTCTCAAGAGGCTATTGATAAAGCAGGTGATGTTATATCCTTAGATAACGTAGACTTTAACTGGGATATACAAAATAAAAGATTAAAAAATGTAGCAGACCCTGTAGATAATACAGATGCTGTTAATAAACAATTTATATCAACTAACATACCTAATATTACTACAGTAGCAGGTATAAGTTCTGACGTAACTACGGTTGCAGGTATAAGCTCTGATGTTACAGCCGTTGCAGCAGATGCTACAGATATTGGGACAGTATCAGCAAACATAGCTTCAGTAAACACAGTTGCTACAAACATTGCAGATGTTGTTACAGTAGCAAATGATTTAAATGAAGCAATTTCTGAAATAGAAACTGCGGCTAATGATTTAAATGAGGCTACGTCTGAAATAGACACAGTTTCAAATAATATAACTAACGTAAATACAGTTGGTACTAACATAGCTGATGTTAATACTGTAGCGGGAATAGATACAAACGTTACTACAGTTGCAGGGATTAGTGCTGATGTAACTTCAGTAGCAGGTATTTCAACTGCTGTATCTAATGTTAACTCAAATAGCACAAACATTAATGCTGTTAATGCTAATTCAGCTAACATAAATACTGTTGCAGGTATTAATGCAGATGTAACTTCTGTTGCAGGTATATCTTCTGAAGTATCTACAGTAGCAGGAAACAATACTAATATTAATACAGTAGCAGGAAATGATGCTAACATCACAACTGTTGCAGGTAACAATACAAACATTACGACTGTTGCAGGTATTAACTCTGACGTAACTACAGTTTCAGGAATTTCAGCAGACGTAACTTCTGTTGCAAGTAACAGTTCAAACATTAATGCAGTAGCTAGTAATGAAGCTAATATTAATGCTGTAAATACTAATTCAACAAATATTAATATAGTTGCTACAGATATTGCTAACGTAAATAATGTTGGTGGTTCTATAGCTTCAGTTAATACTGTTGCTTCAAACCTTGCTTCAGTAAACAGTTTCGCAAACACATATTTAGGTGCTAGTGCGACTGCACCAACACAAGACCCTGATGGTTCAGCTTTAGATTTAGGGGATTTATACTTCGATAGTTCTTCAGACACCATGAAAGTCTACTCAAGTGGTGGTTGGATAAACGCAGGTTCAGCAGTTAATGGAACAGCAAACAGATTTAAGTACACAGCAACAGCATCACAAACAACATTTACTGGTGCTGATGATAATTCAGAAACTCTTGCTTTCGACCCACCATATTTAGATGTCTTTTTGAATGGTGTGAAGTTAGTAAATACAGCAGATTTTACAGCTACTACTGGTACTTCAATAGTATTAGCTAGTGGTGCTTCAGCTAACGATATTTTAGAAGTGATTGCCTATGGTACATTCACTTTATCTAACTTCAGTATTACTGATGCAAATGATGTTCCTGCATTAGGTTCAGCAGGTCAAGCATTAGTAGTTAATTCTGGTGGAACAGCTTTAGAATTTTCTAATGCTTCTTCAGCAGAAGTTTATGGATTTCACAAAGATAGTAATGGAGACTTAATAGTCACTACTACTAATCAAGGTGATGACGACATATCAAGTGCAACATACGCCACATTTGATGATGTTTTATTTAGTGCGAGTGGTTTTACCTTCTCACTTAACAATGGCGAACTAATAGCAACAATATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
764af1101e369eb89ef2859735f48c9eeeca922835ba89f09ac8607ce16ff5ab
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7654
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50