Protein

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Genbank accession
WBF48001.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPHLKAYDKYGNILAIGYNVELHEEVGSVIIPNLAPHTHYPQGEFYVSWEAEKYETDKVVVPGFTTLESSFKEITLYFKDHILVNAKSAYDVAVDNGFVGSEEEWVKSIKGEKGEEGEQGKQGLSAYEVAVNNGFTGSATDWLKTGKSPYVYSNEYIKQKDDTSDVQRLRRAIKDTSEGNTLHIPSSESPIKIDDTLIIDKNINIVSDAKIVYNGSKDKPAIKLDSLSYSNVTIKGIYDDSSYPTYGGGYHGFKSQNYIGLELVNCRNVNTNINEIIGFTVGNKHKATGGKGHWFNNTIINFFINNETHIELNTDGIGSNGEQSWMNSNYFYKSAFSYSGTEFNKHPNTYYNIKQTLTNANTYGGNSNVFDSLKFETASTTSENYVMVYLKKAVGFIFKNYRFEFNNKATFAIIDLETQDMTKSYVTHSKDIKFIPEFVLGNGHKLTFTNINTAKIPRSSIAKIVDEYKTTLLYKNNDFSKDYRRLGGNYHTVKNVFRKPLQSTSLTDEVSYDYSTTPSLVDDKGLLTFTGSYPMALYVNNVSVGDELIINKLSFIGNSSGIFIKCFDKDGNILDKVSNNYDTILLDGYYNDKYKAFTFNNAQKDTFTVNSEDVKSIVILISGTMQGLLVDSTNPSNIIKSSNDSSKNKTDVFYSHVKPSSVEDFKYDEKVYNNGTTQVYGWVLKGNDWKELGKDTNSKSKVIVNIEDYPRINDEDNDYPRFQRALDYLTSTKGGTLIVPKGTEDYLFKTKTPTVQNPSRVKVTGSNIHIKGEGNPTFIMSGITKNYLDSIDDISSSGRDMFTGFSFINCDNILVEGLTFKGEWDSKGEFRYASPRSIGVAFKGSRNCKAYNVHGYNIMGNVVNAVNTMQAVDGVYGYSDNITIDSCSATQCLENGFNFMGGTKNGYYVNNISTGNGSSGFESGTENVIISNNIHTNNKYSGLSISGTNYTITNNVIYGNSNKGELSNKPSNGIAITGGSKGIISNNNVSGNEGYELYLYPGVNNIYIQNNVLKQDTTSLKTSIIYASGTTSKPVSEINFKNNTLRSTNTALDKAMFLNFVMDSTITNNDIKTDKGNDSLSVQGSCSNLFVLNNNMNKNLSISSNAFNVISKDNIAYNLPKVLNGTAIPTTGSWRLGDIVVNTSRTLTSGSPEKWRCTSDGVATNMKWTSNTDYTQGQIVYNGNYVYKAVASGTSGGTQPTHNNGVISDGSILWEFISTKANFEVISQIGVTESISNIPLYKGQIAIIGSSVYVAKGTSSNTDWIILN
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 140199,21440 Da
isoelectric point:6,09521
aromaticity:0,10962
hydropathy:-0,45237

Domains

Domains [InterPro]
DC_0876
STR
6–1039
DC_0876 IPR006626 G3DSA:2.10.10.20
IPR006626
Unmapped
545–566
IPR006626 IPR011050
IPR012334
STR
704–1056
IPR012334 DC_0276
IPR006626
Unmapped
810–844
IPR006626 IPR006626 IPR039448
IPR006626
Unmapped
925–946
IPR006626 IPR006626 IPR006626
WBF48001.1
1 1268
Architecture
STR
RBD
ATT
RBD
STR 6-1097 | RBD 1098-1165 | ATT 1166-1224 | RBD 1225-1268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WBF48001.1
1 1268
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 166 166 0,9852
Central domain 167 491 326 0,9736
C-terminal 492 1268 776 0,2485
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-166
Central
167-491
C-terminal
492-1268

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage SSP49
[NCBI] 		3017777 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBF48001.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ094961 [NCBI]
CDS location
range 126341 -> 130147
strand +
CDS
ATGCCTCATTTAAAAGCATATGATAAATACGGTAATATATTGGCAATAGGTTACAATGTAGAGTTACATGAAGAAGTAGGGTCTGTAATCATACCTAACTTAGCTCCTCATACCCATTACCCTCAAGGTGAGTTCTATGTATCATGGGAAGCTGAAAAATATGAAACCGATAAAGTAGTAGTTCCTGGTTTTACAACCCTAGAATCATCATTCAAAGAAATAACATTATATTTTAAAGACCATATACTTGTAAATGCTAAATCTGCTTATGATGTAGCGGTAGATAATGGTTTTGTCGGTTCTGAAGAAGAATGGGTTAAGTCTATTAAAGGAGAAAAAGGGGAGGAAGGGGAACAAGGTAAGCAAGGTTTAAGTGCTTATGAAGTAGCTGTAAATAACGGTTTTACAGGTTCAGCTACAGATTGGCTTAAAACAGGTAAAAGTCCTTATGTATACTCTAACGAGTATATAAAGCAAAAAGATGATACTTCGGATGTTCAAAGGTTAAGACGTGCTATTAAAGATACAAGTGAAGGTAATACCCTACACATTCCTTCTAGTGAATCACCTATTAAAATAGATGATACTTTGATAATAGATAAGAATATTAATATTGTATCTGATGCTAAGATTGTTTATAATGGTAGTAAGGATAAACCAGCTATTAAACTAGATAGTTTATCATATTCTAATGTTACAATTAAAGGTATTTATGATGATAGTTCTTATCCAACTTATGGTGGAGGCTATCATGGTTTTAAGAGTCAAAACTATATAGGACTAGAATTAGTTAACTGTAGAAATGTTAATACTAATATTAATGAAATTATTGGTTTTACAGTCGGTAATAAACATAAAGCTACTGGTGGTAAAGGTCATTGGTTTAATAATACTATTATTAATTTCTTTATTAATAATGAAACACATATAGAATTAAATACAGATGGTATAGGTTCTAATGGTGAGCAATCTTGGATGAATAGTAATTACTTCTATAAATCAGCTTTTTCATATAGTGGCACTGAGTTTAATAAACACCCTAACACATACTATAACATCAAACAAACTCTAACAAATGCTAATACCTATGGAGGAAATAGCAATGTATTCGATTCACTTAAATTTGAAACTGCTTCCACAACATCTGAAAATTATGTTATGGTGTATCTTAAAAAAGCAGTAGGATTTATATTTAAGAATTACAGATTTGAATTTAATAACAAAGCTACCTTTGCTATTATAGATTTAGAAACACAAGACATGACAAAATCTTATGTAACACATAGTAAAGATATTAAGTTTATTCCTGAATTTGTTTTAGGTAATGGACATAAACTAACGTTTACAAATATTAATACTGCTAAAATACCTAGAAGTAGTATTGCTAAAATAGTAGACGAATACAAAACAACATTATTGTATAAAAATAATGATTTTAGCAAAGACTATAGAAGATTAGGGGGTAACTATCACACAGTCAAAAATGTATTTAGAAAACCATTACAGTCAACTTCTCTGACAGATGAAGTATCTTATGACTATAGTACTACACCTAGTTTAGTAGATGATAAAGGACTACTTACCTTTACAGGCTCGTACCCTATGGCTTTATATGTTAATAATGTTAGTGTTGGTGACGAGCTAATTATTAACAAGTTATCATTTATAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGTTTTGATAAAGACGGTAATATATTAGACAAAGTATCTAATAATTATGATACAATATTACTAGATGGTTATTATAATGATAAATATAAAGCGTTCACTTTCAATAACGCCCAAAAAGATACTTTTACTGTTAATAGTGAAGATGTTAAGTCTATCGTTATTTTAATATCTGGAACTATGCAAGGTTTACTTGTAGATTCAACTAATCCATCCAATATTATTAAGTCTTCAAACGATAGTAGCAAGAATAAAACTGATGTTTTTTATTCTCATGTTAAACCTTCTAGTGTTGAAGATTTTAAATATGATGAAAAAGTATACAACAATGGTACAACACAAGTATATGGTTGGGTACTAAAAGGTAATGATTGGAAAGAACTAGGTAAAGACACTAATTCTAAGAGTAAAGTAATAGTTAATATAGAAGATTACCCAAGAATTAATGATGAAGATAATGACTATCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATTATTTAACAAGTACTAAAGGTGGTACTCTTATAGTACCTAAAGGAACAGAGGACTATTTATTCAAAACTAAGACACCTACTGTACAAAACCCATCACGTGTAAAAGTAACAGGAAGTAATATACACATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACATTTATTATGTCAGGAATCACTAAAAACTATTTAGACTCTATAGATGATATTTCTTCTAGTGGTAGAGATATGTTTACAGGATTCTCATTTATCAACTGTGATAACATTCTTGTAGAAGGATTAACATTTAAAGGGGAATGGGATAGTAAAGGTGAATTTAGATATGCGTCACCTCGTTCTATTGGAGTAGCGTTTAAAGGAAGTAGAAACTGTAAAGCATATAATGTACATGGCTATAATATCATGGGTAATGTTGTAAATGCAGTAAACACTATGCAAGCAGTAGATGGTGTTTATGGTTACTCAGACAACATTACTATAGATAGTTGCTCAGCTACACAATGTTTAGAGAATGGTTTTAACTTTATGGGTGGTACTAAAAATGGATATTATGTTAATAATATATCTACAGGAAATGGTTCAAGTGGATTTGAATCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAATATACACACAAATAATAAGTACTCAGGTTTAAGTATATCTGGCACTAATTACACAATTACTAATAACGTAATTTATGGTAATAGTAATAAAGGAGAGTTAAGTAATAAACCATCTAATGGTATTGCTATTACAGGAGGTAGTAAAGGAATTATTAGTAACAATAATGTATCAGGTAATGAGGGTTACGAGTTGTACCTTTATCCAGGAGTTAATAACATATATATACAAAATAATGTATTAAAACAAGATACAACAAGTTTAAAAACAAGTATTATTTATGCCTCAGGAACAACTAGTAAACCTGTGTCAGAAATTAACTTTAAAAATAATACATTAAGAAGTACAAATACTGCTTTGGATAAAGCTATGTTCTTAAATTTTGTTATGGATAGTACAATTACTAATAATGATATAAAAACAGATAAAGGTAATGATTCATTAAGTGTTCAAGGTTCTTGTAGTAATCTATTCGTATTAAATAACAATATGAATAAAAACTTAAGTATTTCTAGTAATGCATTTAATGTTATAAGTAAGGATAACATAGCTTATAATTTACCTAAAGTACTGAACGGTACTGCAATACCAACTACAGGGAGTTGGAGATTGGGAGATATTGTTGTTAATACTAGTAGAACCCTAACATCAGGTAGTCCTGAGAAATGGAGATGTACTAGCGATGGAGTTGCTACTAATATGAAGTGGACATCTAATACGGATTATACACAAGGTCAAATTGTTTATAATGGGAATTATGTATATAAAGCAGTAGCTTCAGGTACAAGTGGTGGAACACAACCTACTCATAATAACGGTGTTATATCAGATGGCTCTATACTGTGGGAATTTATATCCACAAAAGCTAATTTTGAAGTCATAAGCCAAATAGGTGTAACTGAAAGCATTAGTAATATACCTTTATACAAAGGTCAAATTGCTATAATAGGTTCATCTGTATATGTAGCTAAAGGTACATCAAGCAATACTGATTGGATAATTTTAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a7192932ad7eab46e99556099aa11b6e5888ea5a9f2d054764a36c52688b9fb1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2580
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50