Protein

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Genbank accession
QHR70557.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,82
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIAAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFSETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWEAGNEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMVKTVDIDGLGSKFHLVVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSVEKMWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTNVAQGDTIKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYLEDTDINVNYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTESLSGIVKYVSTTGTTPADSRATVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQAEVNAGATNPGFSNSVVTPETLGARRSTDTNHGLIEIATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKATETLTGIARIGTQVEFDAGVLDNVISTPLKIKTRFDNTARTSVSAASGLIESGTLWNHYTLDIREASNTQRGTARLATQTEVNTGTDDKTIITPLKLQAKKATENAEGIIQLATQAEVIDGTVSNKAFSPKHYKYIVQQEKSWEATSARRGYVKLTTGTATWEGDDTNGSVANLAKFEDDGFAISPLQMNTALTHYLPIKGKAFDSDKLDGFDSAQFIRRDIAQDINANMAFKQPVRIESTLTVTGAVNLSGSITSNNTTLTGSTTINSNSTVGTLNYIEFISETQGAGSWASQHASNVKAPIFVNITTGPGSSKYVPIAKQRYKTGTFSFGTLINESETSPDEGSFVLHYIDEAQTQRRWTFRRDGSLLLSEGDLTLYNGNATINGGLSVTKASGITTTGFVATAASRFDGSVAINNTLTVRDPLTANGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPNADNTGFWSVDVNDSATYNQFPGYFKMVEKINEVTGLPYLVRGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTADGSTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNASMSNLTIRDWLRIGNVRIIPDPVTRSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1292 AA
molecular weight: 141071,20750 Da
isoelectric point:5,54086
aromaticity:0,08282
hydropathy:-0,40217

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1140–1238
IPR048391
QHR70557.1
1 1292
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1139 | ATT 1140-1238 | STR 1239-1272 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage dhaeg
[NCBI] 		2696391 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR70557.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850609 [NCBI]
CDS location
range 10085 -> 13963
strand -
CDS
ATGGCTGATATTTTAAAACCTGCATTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCGGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTACTAGATGATGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAGCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCTGCACCGGCTGGAACTTTTGTACCTGGATATTGGACCGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACAGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATCGCAGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACTCTGCCTCCTAACCCTACTGATGGCGATACCATTGTAATCAAGGACATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATCAAGGTTCAATCTAGTTCTGCTCCAGGCGGCGGTAATCAGAAAATTGTTCGATTTGGTAACCAGTTCTCTGAAACTCTGATAACCAAACCTTTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCTAACCGTCTTTGGCATTTCTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGCGGTATTCGTGTAGAGCCTAACACTGCACAGTTCCAATCACAAGCAGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAATTTACTCTTCCTAAGTATGCAAACCAAGGTGATATGGTTAAAACCGTTGATATCGATGGTCTTGGAAGTAAGTTCCATTTAGTAGTTGAAACGTTTGATGCGTCGTCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCACAGCATGGAATTCCGTACCTCCGGTGATGGGTTCTTTGTTTATAACTCTGTTGAAAAAATGTGGTATGTTTGGGACGGAGACCGTCAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAGCTCTTGGCTAATGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACAACTCCACAAACTATTAATATCACTTTACCTACTAACGTAGCGCAAGGCGATACTATTAAAATCGCATTGAACTATCTTCGTAAAGCCCAGACAGTAAATATTAAGGCTGCTGTAGGTGATAAAATTGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCGGAATATCCACCGGATACTGAATGGGTTCTGAATGACGTATTGACCTTTAATGGTAACTTAAGTTATACTCCGGTTATCGAATTAAGTTATCTTGAAGATACAGATATTAACGTTAACTACTGGGTGGTTGCTCAGAACGTTCCTACTGTAGAACGTGTGGATTCTAAGGATGATTTAACTCGTGCTCGTCTCGGTGTTATTGCCCTTGCATCTCAGACCCAGGCAAACGTCGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTTGCCACCGAATCACGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACAACTGCTCAGGTAAACCAGAATACAACTTTCGCTTTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCTACAGAAACTCGTCGTGGTGTAGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATGCAGGTGTTGATGATACAACCATTATCACTCCTAAGAAGCTACAGACGCGCCAGGGAACCGAAAGCCTGTCTGGTATAGTAAAATATGTATCTACCACAGGAACCACTCCTGCGGACTCCAGAGCAACTGTAGGTACCAACGTTTATAATAAGAACACTACTACTTTAGTTATTTCTCCTAAAGCTTTGGACCAGTATAAAGCTGACCAAAATAACCAAGGTGCCGTATATCTTGCTACGCAAGCCGAAGTTAATGCTGGTGCTACTAACCCTGGTTTTAGTAACTCGGTTGTCACACCTGAAACATTAGGTGCTCGTCGTTCTACTGATACTAATCATGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATGCTGGAACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAGGCTACAGAGACTTTAACTGGTATTGCTCGTATTGGTACTCAAGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTGATAATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGCGGTTTGATTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATCCGTGAAGCAAGTAATACCCAACGTGGTACGGCTCGTTTGGCTACCCAAACTGAAGTTAATACTGGAACCGATGATAAAACAATCATTACTCCTCTTAAGCTTCAAGCTAAAAAGGCTACCGAAAATGCCGAAGGTATTATCCAGCTTGCTACTCAGGCCGAAGTTATTGATGGTACGGTAAGTAATAAAGCGTTTAGTCCTAAGCATTACAAATATATCGTCCAACAGGAAAAATCCTGGGAAGCTACTTCTGCTCGTAGAGGATATGTTAAATTAACTACAGGTACAGCCACTTGGGAAGGTGACGATACTAACGGTTCTGTTGCTAACCTGGCTAAATTTGAAGACGATGGCTTTGCTATTTCCCCTCTTCAAATGAATACGGCATTAACTCACTATCTTCCGATTAAAGGTAAGGCTTTTGACTCTGATAAATTAGATGGATTTGATAGCGCGCAGTTTATTCGTCGTGATATAGCACAAGATATTAATGCTAATATGGCATTTAAACAGCCTGTAAGAATTGAAAGTACTTTAACCGTTACAGGTGCAGTTAATTTGAGTGGTTCTATTACTTCAAATAATACTACATTAACCGGTTCTACTACAATCAATAGCAATTCTACTGTAGGTACTCTGAATTATATTGAATTTATTTCAGAGACTCAAGGTGCAGGTAGTTGGGCTTCACAACATGCTTCTAATGTTAAAGCACCTATATTTGTAAATATAACTACAGGTCCAGGTTCTTCTAAATATGTTCCTATCGCAAAGCAAAGGTATAAAACCGGGACATTTAGTTTTGGTACTTTAATAAATGAATCTGAAACAAGTCCGGACGAAGGTTCATTTGTATTGCATTATATTGATGAAGCCCAGACACAAAGAAGATGGACCTTCCGTAGAGATGGTTCCCTACTTTTATCAGAAGGTGACTTAACTCTATACAACGGTAATGCTACTATTAATGGCGGGTTAAGTGTAACTAAAGCATCTGGTATTACTACCACAGGTTTTGTTGCTACAGCTGCATCAAGATTTGATGGTAGTGTTGCAATTAATAATACGTTAACTGTCCGAGACCCTTTGACAGCTAATGGCGGTTTAACGGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAACCTGCCGACCTTTATTCCAGAAAACCTAATGCAGACAATACAGGCTTTTGGTCTGTTGACGTTAATGATTCGGCTACTTATAATCAGTTCCCTGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAATTAACGAAGTAACAGGGTTGCCGTATTTGGTTCGTGGTGAAGAAGTTAAATCACCAGGTACATTAACTCAGTTCGGTAACACTCTGAATTCACTTTACCAGGATTGGATTACCTATCCAAATACTGCAGATGGAAGCACAACTCGTTGGACTCGTACTTGGCAGCAAAATAAAAATGCTTGGTCTGGATTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGTAACCCACCTCAACCGTCTGATATTGGTGCATTACCTTCTGATAATGCTTCAATGAGTAACTTGACCATTCGTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATAATTCCGGACCCAGTAACTCGTTCTGTTAAATTCGAATGGATTGATACACCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1eaf138575e70c28becb598005eb35c0d73510e46f5b3b9e5b80592e7a4fe255
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5622
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank