Protein

Genbank accession
QHR70557.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,82
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIAAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFSETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWEAGNEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMVKTVDIDGLGSKFHLVVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSVEKMWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTNVAQGDTIKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYLEDTDINVNYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTESLSGIVKYVSTTGTTPADSRATVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQAEVNAGATNPGFSNSVVTPETLGARRSTDTNHGLIEIATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKATETLTGIARIGTQVEFDAGVLDNVISTPLKIKTRFDNTARTSVSAASGLIESGTLWNHYTLDIREASNTQRGTARLATQTEVNTGTDDKTIITPLKLQAKKATENAEGIIQLATQAEVIDGTVSNKAFSPKHYKYIVQQEKSWEATSARRGYVKLTTGTATWEGDDTNGSVANLAKFEDDGFAISPLQMNTALTHYLPIKGKAFDSDKLDGFDSAQFIRRDIAQDINANMAFKQPVRIESTLTVTGAVNLSGSITSNNTTLTGSTTINSNSTVGTLNYIEFISETQGAGSWASQHASNVKAPIFVNITTGPGSSKYVPIAKQRYKTGTFSFGTLINESETSPDEGSFVLHYIDEAQTQRRWTFRRDGSLLLSEGDLTLYNGNATINGGLSVTKASGITTTGFVATAASRFDGSVAINNTLTVRDPLTANGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPNADNTGFWSVDVNDSATYNQFPGYFKMVEKINEVTGLPYLVRGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTADGSTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNASMSNLTIRDWLRIGNVRIIPDPVTRSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1292 AA
molecular weight: 141071,20750 Da
isoelectric point:5,54086
aromaticity:0,08282
hydropathy:-0,40217

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1140–1238
IPR048391
QHR70557.1
1 1292
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage dhaeg
[NCBI] 		2696391 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR70557.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850609 [NCBI]
CDS location
range 10085 -> 13963
strand -
CDS
ATGGCTGATATTTTAAAACCTGCATTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCGGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTACTAGATGATGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAGCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCTGCACCGGCTGGAACTTTTGTACCTGGATATTGGACCGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACAGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATCGCAGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACTCTGCCTCCTAACCCTACTGATGGCGATACCATTGTAATCAAGGACATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATCAAGGTTCAATCTAGTTCTGCTCCAGGCGGCGGTAATCAGAAAATTGTTCGATTTGGTAACCAGTTCTCTGAAACTCTGATAACCAAACCTTTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCTAACCGTCTTTGGCATTTCTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGCGGTATTCGTGTAGAGCCTAACACTGCACAGTTCCAATCACAAGCAGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAATTTACTCTTCCTAAGTATGCAAACCAAGGTGATATGGTTAAAACCGTTGATATCGATGGTCTTGGAAGTAAGTTCCATTTAGTAGTTGAAACGTTTGATGCGTCGTCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCACAGCATGGAATTCCGTACCTCCGGTGATGGGTTCTTTGTTTATAACTCTGTTGAAAAAATGTGGTATGTTTGGGACGGAGACCGTCAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAGCTCTTGGCTAATGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACAACTCCACAAACTATTAATATCACTTTACCTACTAACGTAGCGCAAGGCGATACTATTAAAATCGCATTGAACTATCTTCGTAAAGCCCAGACAGTAAATATTAAGGCTGCTGTAGGTGATAAAATTGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCGGAATATCCACCGGATACTGAATGGGTTCTGAATGACGTATTGACCTTTAATGGTAACTTAAGTTATACTCCGGTTATCGAATTAAGTTATCTTGAAGATACAGATATTAACGTTAACTACTGGGTGGTTGCTCAGAACGTTCCTACTGTAGAACGTGTGGATTCTAAGGATGATTTAACTCGTGCTCGTCTCGGTGTTATTGCCCTTGCATCTCAGACCCAGGCAAACGTCGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTTGCCACCGAATCACGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACAACTGCTCAGGTAAACCAGAATACAACTTTCGCTTTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCTACAGAAACTCGTCGTGGTGTAGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATGCAGGTGTTGATGATACAACCATTATCACTCCTAAGAAGCTACAGACGCGCCAGGGAACCGAAAGCCTGTCTGGTATAGTAAAATATGTATCTACCACAGGAACCACTCCTGCGGACTCCAGAGCAACTGTAGGTACCAACGTTTATAATAAGAACACTACTACTTTAGTTATTTCTCCTAAAGCTTTGGACCAGTATAAAGCTGACCAAAATAACCAAGGTGCCGTATATCTTGCTACGCAAGCCGAAGTTAATGCTGGTGCTACTAACCCTGGTTTTAGTAACTCGGTTGTCACACCTGAAACATTAGGTGCTCGTCGTTCTACTGATACTAATCATGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATGCTGGAACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAGGCTACAGAGACTTTAACTGGTATTGCTCGTATTGGTACTCAAGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTGATAATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGCGGTTTGATTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATCCGTGAAGCAAGTAATACCCAACGTGGTACGGCTCGTTTGGCTACCCAAACTGAAGTTAATACTGGAACCGATGATAAAACAATCATTACTCCTCTTAAGCTTCAAGCTAAAAAGGCTACCGAAAATGCCGAAGGTATTATCCAGCTTGCTACTCAGGCCGAAGTTATTGATGGTACGGTAAGTAATAAAGCGTTTAGTCCTAAGCATTACAAATATATCGTCCAACAGGAAAAATCCTGGGAAGCTACTTCTGCTCGTAGAGGATATGTTAAATTAACTACAGGTACAGCCACTTGGGAAGGTGACGATACTAACGGTTCTGTTGCTAACCTGGCTAAATTTGAAGACGATGGCTTTGCTATTTCCCCTCTTCAAATGAATACGGCATTAACTCACTATCTTCCGATTAAAGGTAAGGCTTTTGACTCTGATAAATTAGATGGATTTGATAGCGCGCAGTTTATTCGTCGTGATATAGCACAAGATATTAATGCTAATATGGCATTTAAACAGCCTGTAAGAATTGAAAGTACTTTAACCGTTACAGGTGCAGTTAATTTGAGTGGTTCTATTACTTCAAATAATACTACATTAACCGGTTCTACTACAATCAATAGCAATTCTACTGTAGGTACTCTGAATTATATTGAATTTATTTCAGAGACTCAAGGTGCAGGTAGTTGGGCTTCACAACATGCTTCTAATGTTAAAGCACCTATATTTGTAAATATAACTACAGGTCCAGGTTCTTCTAAATATGTTCCTATCGCAAAGCAAAGGTATAAAACCGGGACATTTAGTTTTGGTACTTTAATAAATGAATCTGAAACAAGTCCGGACGAAGGTTCATTTGTATTGCATTATATTGATGAAGCCCAGACACAAAGAAGATGGACCTTCCGTAGAGATGGTTCCCTACTTTTATCAGAAGGTGACTTAACTCTATACAACGGTAATGCTACTATTAATGGCGGGTTAAGTGTAACTAAAGCATCTGGTATTACTACCACAGGTTTTGTTGCTACAGCTGCATCAAGATTTGATGGTAGTGTTGCAATTAATAATACGTTAACTGTCCGAGACCCTTTGACAGCTAATGGCGGTTTAACGGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAACCTGCCGACCTTTATTCCAGAAAACCTAATGCAGACAATACAGGCTTTTGGTCTGTTGACGTTAATGATTCGGCTACTTATAATCAGTTCCCTGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAATTAACGAAGTAACAGGGTTGCCGTATTTGGTTCGTGGTGAAGAAGTTAAATCACCAGGTACATTAACTCAGTTCGGTAACACTCTGAATTCACTTTACCAGGATTGGATTACCTATCCAAATACTGCAGATGGAAGCACAACTCGTTGGACTCGTACTTGGCAGCAAAATAAAAATGCTTGGTCTGGATTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGTAACCCACCTCAACCGTCTGATATTGGTGCATTACCTTCTGATAATGCTTCAATGAGTAACTTGACCATTCGTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATAATTCCGGACCCAGTAACTCGTTCTGTTAAATTCGAATGGATTGATACACCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
1eaf138575e70c28becb598005eb35c0d73510e46f5b3b9e5b80592e7a4fe255
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5622
Evidence 0,5622
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank