Protein

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Genbank accession
XOF09568.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,79
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDENDAVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLVLEMGVGSNDAYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRIGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTVGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATTPSGSILVSMKQIFDSISKPDFSDTTGTLPVNRGGTGATNVGAARNNLGLRTAAVRDVGESNGNVMEVGAFGIGGNGKSLTNITSDVDLMTRLKALGGTVFRANTASGYTGAPYYSHGTGFYGRASDTMAALNIDYATGNVRVFAINDSGLASGRVNSNVLYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTAPNFHASGPGTASFYVNAGTGNAHVWFRTDANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPSGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGDGAAVAMLKVTPEGYVQFGYQEAVATPSPIKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISDKTVDLNSLIIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGNNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNGNVEGVYVRYGQNGSWAAWREVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQSVKFGGLVVNGVGTSDPTITFKNGAVIREAQGGSIGALIMSASATAATAAKYIAFRPYGDSSNSEIRVKAFGNNETSLEWSQGAGVRSNTQGAFVVYAKAGQALHLRPNGDSANQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGRNTDIGLVKKSNMPGKMAISKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSQVNRQLTVSSSATVNGVINANGGIIVPTAKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLTITGDQLKTTSLWTTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNDGNSHVFFRKANGAEKGLIWADDPGNVSIRAGGASGPVWNFWASGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPIGTYNNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNFHQAIINVNGFGRDDSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1515 AA
molecular weight: 160145,62610 Da
isoelectric point:6,19058
aromaticity:0,07525
hydropathy:-0,31947

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–619
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_1159
STR
450–1086
DC_1159 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1415–1509
IPR030392
XOF09568.1
1 1515
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-619 | STR 620-1086 | RBD 1124-1515
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XOF09568.1
1 1515
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1093 1093 0,1144
Central domain 1094 1292 200 0,3574
C-terminal 1293 1515 222 0,8781
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1093
Central
1094-1292
C-terminal
1293-1515

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Raoultella phage Ra_O-2
[NCBI] 		3390846 No lineage information
Host Raoultella ornithinolytica
[NCBI] 		54291 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOF09568.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ642265.1 [NCBI]
CDS location
range 9627 -> 14174
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCTTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTATACTAAAGATGAAAATGATGCTGTAGTACAGCTCGCCGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACCTCCGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTAACTATTTCTCCGAATAAAGCAATTAGTTTTGAAACTACTGATTTGAGCGGTGAAATAACTCGTCATATCGTTGGCAAATGTGCTACTAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGTGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACACTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGCTTACATTAAAAACCAACGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGTAATCTGACATTCAGAAATTCACAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACCGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCATCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGCATTGATTCTGGACACGGAAGGCATTATGTTGATTTTATCACGTTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGCAATGGGCTTTATGTTACAGTACTAAACACTGTTGGATACAACGGCCAAGATAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACTGGCCAAGATACTGGTGCTACTACACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTATCTCAAAACCAGATTTCAGCGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGCCGCTCGAAATAACTTAGGTCTTAGAACTGCGGCTGTTCGCGACGTTGGTGAATCCAACGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCCTTCGGTATTGGTGGTAACGGGAAATCACTTACGAATATCACATCCGATGTTGATTTAATGACTCGTCTTAAGGCTCTTGGTGGTACAGTGTTCAGAGCTAACACAGCGAGTGGTTATACCGGGGCTCCTTATTACTCCCATGGCACCGGGTTTTACGGAAGAGCTTCTGACACAATGGCTGCGCTTAATATAGATTATGCAACTGGTAACGTCAGAGTATTTGCTATAAACGATAGTGGTTTAGCAAGTGGAAGAGTAAATTCTAATGTTCTCTACGGCACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACTCAAGTTAAGAAAGCCGGCGACACCATGACTGGTGATTTAACTGCTCCTAACTTCCACGCTTCTGGGCCTGGAACTGCATCTTTTTACGTTAATGCTGGGACCGGAAACGCTCATGTATGGTTCAGAACAGATGCTAACGAACGCGGTGTAATCTGGGCGACGCCTAATACTGCTGACTTAGGACAAATTAATATCCGTGCAAAAACTACTGGAGGCACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGCCGACTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGATATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAATCCTAGTGGAACATTTGTTGATTTGGGTTCAGAGAACTCTGATAAGTATAGCAGATTAACCCTTGCCCGTAAAGTTGGCGATGGCGCTGCTGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGAGGCAGTTGCTACTCCATCTCCTATCAAGTACATCCGAGTTAAACCTGATGGTCTTGATGTAGAAGGTGATTTGGTTTTTAACCAGACCTATCGCGGCACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTGATAAGACTGTTGACCTTAATAGCCTTATCATTAAAAGAACCGACCCAGGTACTCGTCAGTTATATAAATGTGTATCTTCTGGCGGCGGAAATAATATATCGAACAAACCTACCTCTGATGGCAATTTTGTTCTCGAAGTTCTGTCTTTACGTAAAGTTTCTGATACTGATTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATGGTAATGTTGAAGGCGTATATGTTCGATACGGGCAAAACGGTTCATGGGCTGCATGGAGAGAGGTTGTTGCAGGGGTTCAGCCAATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCCCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGACAGAGCGTGAAGTTCGGCGGATTAGTTGTTAATGGCGTCGGAACAAGCGATCCAACTATCACATTTAAAAATGGCGCGGTAATTCGTGAAGCCCAAGGCGGTAGTATTGGCGCATTAATCATGTCAGCTTCTGCTACAGCCGCTACAGCCGCTAAGTATATTGCTTTCAGGCCATATGGGGATTCGTCCAACTCCGAGATTAGAGTCAAAGCATTTGGTAATAACGAGACATCACTTGAGTGGTCGCAGGGCGCTGGTGTTCGTTCAAATACGCAGGGGGCTTTCGTAGTTTATGCAAAAGCCGGACAAGCGCTTCATTTAAGACCAAACGGTGACAGTGCGAACCAAGCTACTGTTATCGATCAGAACGGTAAAATGACAGTCGGTGGTGAGTTCGAGGCTCAGAACTCAAAAATCACAGGTAACCTGAACGTATCTGAAGATAACAGAATGATTGTTCTTGGCAGAAATACCGATATCGGTTTAGTCAAGAAAAGTAATATGCCAGGAAAAATGGCTATCAGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTGTCAACCAATACTAACAATCAGATTAATCCTGCTGATACTTTTAACGATATATTCAAAGTTGACGCTGATGGAAACCAAACTGTTTATGGAAACTCTCAAGTCAATAGACAATTAACGGTATCAAGCTCAGCAACTGTTAACGGTGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTGCCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACTAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCCATCAGTAATGCTGGTGATACTTATCTTCCGTTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGGCGGTTAACAATTACAGGTGATCAGTTAAAAACTACCTCTCTGTGGACTACCGGAGACGCTGCTGTTAACGGTGTTTTAACGGTTGATGGAAAAGCTAGATTTAATCAAGAATTTAGTGTATCCACTTCAGTTAACGTCCAGAATGACGGTAACAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAAACGGCGCAGAAAAAGGACTTATTTGGGCTGATGATCCTGGTAACGTTAGTATAAGAGCCGGCGGTGCTTCTGGACCAGTATGGAATTTCTGGGCAAGTGGTTCATGCCAATTCCCGGGTGCTATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCTATTGGCACATATAACAATACCGCTGGGTTAGTAAGCAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCCTCTCTGTATTTCCAAGAATATGTTGGTAACTTCCACCAAGCTATCATTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAGTTTCTATTTCAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACTCGCAATGGTTCATTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATATTGAAGCGGACGGCGGATTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTTGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCGGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
813416da7492a8583b037f65fc20f6e4e5856810480d7ee9f8942806186c5d00
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6587
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50