Protein

Genbank accession
AIZ02609.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit adhesine
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKAIQFKRSKTAGAKPTVDQLVEGELAINLRDRTIYTKTDQNQIIDLGFAKGGQVDGDILQNGTFNLNGNMFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWSNQHLNKAPIFADLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQNNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWNGNTPTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITADENTNNYGSPTPLGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKGLFGRSEDQGTTWIMPGINAALLSVQTQADVNNAGDGQTHIGYNSGGKMSHYFRGKGQTNINTQEGMELNPGILKLVTGANNVQFYADGTISSIQPVKLDNELFLNSSNNTAGLKLGAPSKVDGSRTIQWNAGTRAGQNKSYLTMKAWGNAFDSTAGERETVFELYDGQGYHFYSQRLAPTGSETVGTLQFRISGALRVGGGIISAGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEAALHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDGKLVVVTSHSRISPNYNMQLGQNAYIDIEATEGARPAGWGSFASQNDANVRAPIYMNIDRAATSEYLPIIKQRYVQGDSTYSMGTLISRGDFRIHYHQGNSTTGTDLSWEFRRDGDFRASGKIIAGSVTLDHDGNITGGSGNFANLNSTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPAGYALMTGQPFDKSTYPKLAVAYPSGTIPDMRGQTIKGKPSGRAVLSAEADGIKSHNHSASASNTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGTTAAAGNHQHARSGPQVQGGIPTSVFYDGYNTVGPNGNAKFTATVSGATASSNMAKTSTEGNHTHTWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHSVAIGSHGHTITVNSTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1067 AA
molecular weight: 113619,27350 Da
isoelectric point:8,56129
aromaticity:0,08341
hydropathy:-0,42081

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
503–626
IPR048390 IPR051934
SSF88874
809–936
SSF88874 SSF88874
IPR037053
815–868
IPR037053
IPR011083
820–867
IPR011083
AIZ02609.1
1 1067
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_VR25
[NCBI] 		1567028 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIZ02609.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP007361 [NCBI]
CDS location
range 156885 -> 160088
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAAGCGATACAATTTAAAAGAAGTAAGACAGCTGGTGCCAAGCCTACTGTAGACCAGTTGGTTGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTACGCGACCGCACGATTTATACCAAAACCGACCAGAACCAGATTATCGACCTTGGATTTGCTAAAGGTGGTCAGGTTGATGGTGATATTCTCCAGAACGGCACATTTAACCTCAATGGTAATATGTTCGTTTACGCTGGTAAGTATATTGAATTCCTGCCTAAAACTGCCGGTAATGGCGCATGGTCCAACCAGCACTTGAATAAAGCTCCTATCTTTGCAGATTTAAGTTCAACTACCTCAGTATCAGAATACCATCCTCTGATTAAGCAACGTTATAAAGACGGTACTTTTTCTGCCGGTACATTAGTAAATGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGGTATTTAGTCGCTCAGAATAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACAAAAGCGTTCGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACCATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGAATGGAAATACACCTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCCATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACTGCTGACGAAAATACTAACAACTACGGCTCTCCTACTCCATTGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTCGCATCTATTACACCTGACAGTTTCCGCAGTACTCGCAAAGGTTTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCACTACATGGATTATGCCTGGAATCAACGCCGCTCTTTTATCAGTCCAAACTCAGGCTGATGTGAATAACGCAGGTGATGGTCAGACGCATATTGGCTATAACTCTGGTGGAAAAATGTCACATTATTTCCGCGGTAAAGGTCAAACGAATATTAACACTCAAGAAGGCATGGAACTTAATCCAGGTATTCTTAAACTGGTAACCGGTGCAAATAATGTACAATTTTATGCTGACGGCACTATTTCTTCTATCCAACCTGTTAAATTAGACAACGAATTATTTTTAAATAGTTCTAATAATACTGCAGGCCTTAAACTTGGTGCCCCTAGCAAAGTTGATGGCTCGAGAACTATCCAGTGGAACGCCGGGACCCGTGCAGGACAAAATAAAAGTTATCTGACTATGAAAGCTTGGGGTAATGCATTCGACTCCACTGCCGGCGAACGCGAAACTGTATTTGAATTGTATGACGGCCAGGGCTATCATTTTTATTCTCAACGTTTAGCTCCGACGGGTTCTGAAACTGTCGGTACTCTTCAATTCAGAATTTCTGGCGCTTTACGTGTAGGTGGCGGTATTATATCGGCAGGTTCTATTGTTACTGAATCAAGTTTAGTTGCAAATAATGGATTATCTGTAAACGGACAAGCTAAATTCGGTGGAACAGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGCAGCATTGCATATTATTCCAACTCCTAAAGACGCTGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTCCGTCCATTAAGTATCAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGACATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGAGCTGGCGGTAATATGATTACTGTGGACAATGACGGTAAACTTGTTGTTGTTACGAGTCATAGTCGCATTTCTCCTAATTATAATATGCAATTAGGACAAAATGCTTATATAGATATTGAGGCTACTGAAGGTGCACGCCCGGCGGGTTGGGGTTCATTTGCATCTCAGAACGATGCAAATGTCAGGGCTCCGATTTATATGAATATAGACCGTGCCGCTACTTCTGAATATCTCCCTATTATCAAACAACGTTACGTACAGGGCGATAGTACTTATTCTATGGGCACCTTAATTTCTCGAGGAGACTTCCGCATCCATTATCACCAAGGTAATAGTACTACCGGCACTGATTTAAGCTGGGAATTCCGCCGCGACGGTGATTTCCGCGCTTCGGGTAAAATTATTGCCGGTTCTGTTACTCTTGACCATGATGGTAACATCACAGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAACAGTACAATTGAATCACTTAAAACCGATATTGTATCAAGCTATCCAATTGGTGCTCCTATTCCATGGCCAACAGATACTCCTCCTGCGGGTTATGCTTTAATGACGGGTCAGCCCTTTGACAAGAGCACATATCCCAAGCTTGCCGTTGCTTATCCATCAGGTACTATTCCGGATATGCGTGGACAAACTATTAAGGGTAAACCGAGTGGTCGTGCCGTGCTGAGTGCGGAAGCTGATGGTATTAAGTCTCATAATCATAGTGCTTCTGCATCTAATACTGATTTGGGTACTAAAACCACATCAAGCTTTGATTATGGTACTAAAACCACATCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTAAGTGGAACTACTGCCGCTGCAGGTAACCACCAACACGCGCGTTCAGGTCCTCAGGTACAAGGCGGCATACCCACTAGCGTATTCTATGACGGATACAATACTGTAGGTCCAAACGGCAACGCTAAATTCACTGCAACCGTGAGCGGTGCTACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACATCAACAGAAGGTAACCATACTCATACTTGGTCAGGTACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTAGGTATCGGTGCTCACACTCACACTGTAGGTATCGGTGCCCACTCGCATTCAGTAGCGATTGGTTCGCACGGACATACTATCACTGTAAATAGTACAGGTAATACAGAAAACACGGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
90968bd6fafd79f8775c223c384215920b031aed5d837967859003e3d7803034
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5252
Evidence 0,5252
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
VR bacteriophages - a small but diverse group of low-temperature viruses Kaliniene,L., Meskys,R., Simoliunas,E., Zajanckauskaite,A. and Truncaite,L. 2015-03-10 — GenBank