Protein
- Genbank accession
- WGH49683.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MSSLHFKTPNVSSFTLDGNMFNMNNNGTGIGWVELRVFIRPSGSFNANQNLWRTNSSQNRCLHSSSQRISFSTPEISELLTPAGSAPFNTWLVVRVEVDYVNTKTKLSVLREDTNEFHSVDTAGIATTFFNLASASIFDFYLDYFAASSGVIYRASNSNGTGNLLIADTGQSVVLGGNWPTNNQQWILTEPEPTIVKVGLGWPALERDFDSIPDFISARASSRFFMVVSCLGDLGSSPNLIQTSEFFGGLLFTSPVKYIGNNHNDLPFFDGSLYFTSIAPVTFEHLALYNSIANTYAIRLIRASSFLQNCYIKKLTTSGGSGVLVDLGLASAKNLVIDANNLIATTIRSTTSPVQNVVGFNATNRGMQIAGEGNTGTHKNLFSLNSGISDYFWSGTASLIPSNLTNSASEKSGDYAGQYTGYTTAEFVDFANGDYRIKASSPLHALGIGSFFEEVGTPTGSYYYSDVSNIQLNSVTSIDYVIDPANDPTSPNYVLFLNGVDEYVQLNSPINITAPEFEIEFIGNGRGYDESVAYIFGNLGDANNRLWIGGVDYNELSLSNATGQTINFTNMNFFVADENRLVISRDINNIVSVTINDEPHNQTFVLSGNITPTILGNSGGALPAGIARADEIEIDKLKVTVGGVVINHYEPTVTEGVGIILKDTESDNDGTIINFKSNLHHWKYYDGIVIDEQTEARIGNGWASKVYVSSPTLGGFLSTFKSLTFTDEITCYAVGDCSYSVFFDQTGATLNFTNADFEQGLYVKGMIPFNGKNYDRVARLNNQITSNSQLFIDDFYIYSEQAGASAVVSDDNTRLMRCYVEHTGGASALGIVQMKDYSTLRNCIVRSLTPSPLGINTSEPSFIGNTVAIGCDVNMKISSPSPKSYEYLFATQSTTSDFDITNSFVFRYASGDNTGQYTGYTTAEFVDFANKDYRIKYSSDLHPLNIGAFFQEFVEGGISYFYGDSSVLTLNSEQSFYSKIANSYVSTFSIVGNGNGNHITVPNNQVPTISIDFNNELYASTHQGGTSEVGVDFIPNTSAVSQIIESSNVQVDDVQSLMVEISNSNLSNIDILFYANVSAYNNINNISELVIDDISNTNAVMTNNSLSNMHISNIDNTYIATNIFDYGDININNIDRHSVFSNISKISEFNFETVSKFNFRMNFFQDITMDIQTIDAHSGYANFNDVSQINIVSIDNVEINVGFSGVSVFDVSVLPNTYVSATVDNKSTFDISDVESFIVKFEIQDKSVFDIADISNAYISMTVDKSSSFDVSNIEAVLAKFEVQDKSTFDVSDIASVLSEFQIQDRSTFDITGLSSNLIEHNIVDASTLFVDGVSAITLHASNHDKSTFNIWIDGDVFNSVSISDVYSISNFNLIMGEEYHIENNTNVVSSFNVHGIVNFHTEVNHADMSGISIITGDSYNINVTNNNVVDINVENITNTHMEMNQHEESLIEVDDLTASNVEFNENTTSLINIDDVQSQYVVIRTSPVSELTVDLVPTYSVEFNAYTNSGFNLSYTGNPFIAAIIMDRSIIDLTIIDEIEYIIASPEFKYFDKSTLRIDGVDASTIFFNTSTVANNLVDFVPEFNTVTTIANGSMIDLVMSGNPILAIEYVSTSELTIDMVQSSEFVSLISNGSALDITTIQGQNFIVAVKDVSYNDLTIVESTNVAVAENTINTLNVSFSNQIQYASLYSDVSKFDVAFISEFFIVIDFDVYEYSERSISYIDVVPNYFVSHAEHSDSVFDIGTERGYNIEITDDTVGDIVVSIKTELDVRLFNNITIYIKPTDIGTPVIDTGKSWLDDSVFRTDMKTRTIVTGKSMLDDLVISTAINRTTTIPLELSTRA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1843 AA molecular weight: 202423,75020 Da isoelectric point: 4,28091 aromaticity: 0,10852 hydropathy: -0,03842
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Alishewanella phage vB_AspM_Slicko01 [NCBI] |
3038238 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WGH49683.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ508956
[NCBI]
CDS location
range 103569 -> 109100
strand -
strand -
CDS
ATGTCTTCATTACATTTCAAGACTCCTAATGTAAGTTCGTTTACATTAGACGGTAATATGTTTAATATGAACAATAACGGTACTGGTATTGGGTGGGTAGAACTTAGAGTATTTATTCGCCCTTCTGGTTCTTTTAATGCCAATCAGAATTTGTGGAGAACAAATTCTTCACAGAACAGGTGCTTGCATAGTTCATCTCAGCGTATTTCATTCTCTACTCCTGAAATATCTGAATTACTAACTCCAGCAGGTTCTGCACCCTTCAATACATGGCTTGTAGTGCGTGTAGAGGTAGACTATGTTAATACTAAAACAAAATTATCGGTACTTAGAGAAGATACTAACGAGTTCCATTCAGTAGATACAGCAGGCATTGCGACAACGTTTTTTAATTTAGCTAGTGCTAGTATTTTTGATTTTTATCTAGACTATTTTGCTGCAAGTTCTGGTGTAATTTATAGAGCTAGTAACAGTAACGGTACTGGAAACCTACTTATAGCGGATACAGGTCAGTCAGTTGTGTTGGGTGGGAACTGGCCAACTAACAACCAACAATGGATATTGACAGAACCAGAACCTACTATTGTAAAGGTAGGTTTAGGTTGGCCTGCGTTAGAACGTGATTTTGATAGTATTCCTGATTTTATTTCTGCACGAGCATCTTCTAGATTTTTCATGGTCGTATCGTGTCTTGGAGATTTAGGTTCTTCACCAAATTTAATACAAACCTCAGAATTTTTTGGCGGGCTATTATTTACAAGTCCAGTAAAATATATAGGCAACAATCATAACGATTTACCGTTTTTTGATGGGTCTCTTTATTTTACATCAATCGCACCTGTAACCTTTGAGCATCTAGCATTATACAATAGTATAGCAAATACTTACGCCATCAGACTAATACGCGCTAGCTCGTTTTTACAAAACTGCTATATTAAGAAATTAACAACATCTGGAGGCTCAGGAGTATTGGTAGATCTTGGTTTAGCTTCGGCTAAAAATTTAGTCATTGATGCGAATAACTTAATAGCGACTACGATAAGAAGCACAACCTCACCTGTTCAAAATGTAGTTGGTTTTAATGCGACTAACCGAGGGATGCAGATAGCAGGCGAAGGCAACACTGGAACTCATAAAAATCTATTTTCTCTTAATAGCGGAATTAGTGATTATTTTTGGAGTGGAACCGCTTCTTTAATCCCATCCAATTTAACTAATAGTGCCAGTGAAAAGTCTGGAGACTACGCTGGTCAATATACTGGCTACACTACTGCTGAGTTTGTAGATTTTGCTAATGGTGATTACCGCATTAAGGCAAGTTCACCATTACATGCTTTAGGTATTGGTTCATTCTTTGAAGAAGTAGGGACACCAACAGGTTCATACTATTATTCTGATGTTTCTAATATACAACTTAACTCAGTTACATCAATTGATTATGTTATAGATCCCGCCAACGATCCAACATCACCTAATTATGTATTATTTTTAAATGGTGTTGATGAGTATGTACAACTAAATTCACCAATCAATATAACAGCGCCAGAATTTGAAATTGAGTTTATAGGTAATGGTCGCGGTTATGACGAGTCTGTTGCTTATATTTTTGGTAATCTTGGTGATGCTAATAATAGATTATGGATCGGTGGTGTAGACTATAACGAACTATCATTATCAAACGCAACTGGCCAGACGATAAATTTCACCAATATGAATTTCTTTGTAGCTGATGAAAATCGGTTAGTAATAAGCAGAGATATTAATAACATTGTTAGCGTCACTATTAACGATGAACCACACAATCAAACATTTGTTCTAAGTGGTAACATCACTCCAACTATTTTAGGTAATTCTGGTGGCGCTTTGCCAGCTGGTATAGCAAGGGCAGATGAGATAGAGATTGATAAGTTAAAGGTTACCGTCGGTGGTGTGGTTATTAATCATTATGAGCCTACTGTTACTGAGGGTGTAGGTATCATTCTAAAAGACACCGAAAGTGACAATGATGGCACCATAATCAATTTCAAATCTAATTTACATCATTGGAAGTATTATGATGGTATTGTTATAGATGAGCAAACTGAGGCTAGGATTGGTAATGGTTGGGCATCTAAGGTTTACGTATCATCCCCAACTCTAGGTGGATTTTTATCCACTTTTAAATCATTAACCTTTACTGACGAGATAACATGTTACGCAGTTGGTGATTGTTCTTATAGCGTATTTTTCGATCAGACTGGAGCAACATTAAACTTTACTAATGCTGACTTTGAGCAAGGACTCTATGTTAAAGGGATGATACCGTTTAATGGTAAAAACTATGATAGGGTAGCGAGACTAAACAACCAAATCACATCAAATTCTCAATTATTCATTGATGATTTTTATATCTACTCTGAACAAGCAGGCGCATCAGCAGTCGTAAGTGATGACAATACACGATTGATGCGGTGTTATGTAGAGCATACTGGTGGAGCAAGTGCGTTAGGTATTGTTCAGATGAAGGATTATTCTACCTTAAGAAATTGTATAGTTAGATCATTAACACCATCACCTTTAGGGATAAATACATCCGAACCATCATTTATAGGAAACACAGTGGCGATTGGTTGTGATGTTAACATGAAGATCTCATCACCATCACCTAAATCATACGAGTATTTATTTGCAACTCAGTCAACTACATCTGACTTCGATATAACAAACTCATTTGTATTCAGATATGCGTCTGGTGATAATACTGGTCAATATACTGGCTACACTACTGCTGAGTTTGTAGATTTTGCTAACAAAGATTATAGGATAAAATACTCATCAGACTTGCATCCATTAAACATTGGTGCATTCTTTCAAGAATTTGTTGAAGGTGGTATATCTTATTTCTACGGTGACTCTTCGGTACTGACTCTGAACTCTGAACAGTCTTTCTACTCAAAGATAGCAAACTCTTATGTTAGCACTTTCTCGATAGTCGGTAATGGTAATGGTAATCACATAACAGTACCAAACAACCAAGTACCAACAATCTCTATCGATTTTAATAATGAACTTTACGCAAGCACTCATCAAGGCGGTACATCAGAGGTTGGTGTTGATTTTATACCAAACACATCAGCAGTCTCTCAGATTATAGAATCATCAAATGTTCAGGTAGATGATGTTCAATCTTTGATGGTTGAAATATCAAACAGTAATTTATCTAACATTGACATTTTATTTTATGCGAATGTATCAGCATATAACAACATAAACAACATATCAGAGTTAGTAATAGATGATATATCCAATACTAATGCGGTAATGACTAATAATAGTCTATCCAATATGCATATATCTAACATAGATAATACGTATATAGCAACTAATATATTTGATTATGGTGATATAAACATTAACAACATCGATCGTCACTCAGTCTTTAGTAATATTTCTAAGATAAGTGAGTTCAATTTTGAGACAGTGAGTAAGTTTAATTTCAGAATGAACTTCTTCCAAGACATTACCATGGACATTCAGACCATTGATGCTCACTCTGGCTATGCAAACTTTAATGATGTCTCACAGATAAACATTGTTAGTATAGACAATGTAGAAATCAATGTTGGATTTTCTGGTGTGTCTGTGTTTGATGTGAGTGTATTACCTAATACTTACGTGAGTGCCACGGTAGATAACAAATCAACATTTGACATTAGTGATGTTGAGTCATTCATAGTAAAATTCGAAATACAAGATAAATCGGTATTTGACATAGCAGATATTTCCAATGCATACATCAGTATGACCGTGGATAAGAGTTCTTCGTTTGATGTATCTAACATTGAAGCTGTACTTGCTAAATTTGAAGTGCAGGATAAGTCAACCTTTGATGTATCAGATATTGCGTCTGTCTTGTCCGAGTTCCAAATACAAGACAGATCAACATTCGACATTACTGGTCTATCTTCTAATCTGATAGAACATAATATCGTTGATGCGTCTACCCTGTTTGTTGATGGTGTTAGCGCTATAACACTACATGCGTCAAACCATGATAAGTCTACATTCAACATCTGGATTGATGGAGATGTGTTTAACTCAGTATCTATTTCTGACGTATATAGTATCTCTAATTTCAACCTGATAATGGGCGAAGAGTACCACATTGAGAATAACACTAATGTTGTTAGCTCATTCAATGTGCATGGTATTGTAAACTTCCATACCGAAGTCAACCATGCTGATATGTCTGGTATCTCTATCATTACTGGTGACAGTTACAATATTAATGTGACCAATAATAACGTGGTCGATATCAATGTAGAAAACATCACGAACACTCATATGGAGATGAACCAGCATGAAGAATCATTGATTGAGGTTGATGATCTGACTGCGAGTAATGTAGAGTTTAATGAGAATACAACCTCATTGATTAACATTGATGATGTACAGAGTCAGTACGTGGTAATCAGAACCTCACCAGTATCGGAACTTACTGTAGACCTTGTACCAACATATTCTGTTGAATTCAATGCGTATACTAATAGTGGTTTTAATCTTAGTTATACTGGTAACCCATTTATAGCCGCGATTATCATGGATAGAAGCATTATAGATCTAACCATCATAGATGAGATTGAGTATATAATTGCCAGCCCAGAGTTTAAATATTTCGATAAGTCAACTTTGCGTATTGATGGCGTGGACGCATCAACCATATTCTTTAACACATCAACCGTAGCAAATAATTTGGTAGATTTTGTTCCAGAGTTTAATACAGTTACCACCATCGCAAATGGATCGATGATTGATCTGGTTATGTCTGGTAATCCTATATTAGCCATTGAGTACGTTAGTACATCAGAGCTGACCATTGATATGGTTCAGAGTAGTGAGTTTGTTAGTCTTATTAGTAACGGTAGTGCTTTAGACATAACCACGATACAAGGACAAAATTTCATTGTGGCTGTAAAAGATGTCTCATACAATGATCTTACAATCGTTGAAAGTACAAATGT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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
cf0509bdce1ab76340b350bac5db22f2cb3973d475affab511e586d2b3e28761
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Ecogenomics reveals distinctive viral-bacterial communities in the surface microlayer of a natural surface slick | Rahlff,J., Wietz,M., Giebel,H.-A., Bayfield,O., Nilsson,E., Bergstrom,K., Kieft,K., Anantharaman,K., Ribas-Ribas,M., Schweitzer,H.D., Wurl,O., Hoetzinger,M., Antson,A. and Holmfeldt,K. | 2023 | — | GenBank |