Protein

Genbank accession
WNN13501.1 [GenBank]
Protein name
tail collar domain protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,70
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGTQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHQNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVSEGSFRVHYIDSTAPDNSKHWVFNRNGNFIVDSGSIEVRTGNISASGNINSANGIVSAPQVNTKTIVLDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGVNYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWTMPGTNAAFLSAQTQADGNTAGDGQTHIGYNSAGKMSHYFRGKGKTNINTQEGVEVNPGILKLITGANSISFNAATGNIDSTLAFRLNKGIIIDGPDNQGFQFNAPTAVDGTRSIYWNSGTRPGQNKSPVTVKAWGSAYSTGDKSRETVFEVGDGQGYYFYAQRVAPASGSTVGPIQFRIAGGLLTSGSIVASGSITTESSLNVNNGLSVNGQAKFGGTADALRIWDAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMVTVDNDNKLVVITSHSRISPNYRMQLGQSAYIDAECTDAARPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAVIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAELYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKNTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHSHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNSIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1080 AA
molecular weight: 114071,21980 Da
isoelectric point:8,48999
aromaticity:0,08241
hydropathy:-0,41787

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
510–634
IPR048390 IPR051934
SSF88874
821–952
SSF88874 SSF88874
IPR037053
828–881
IPR037053
IPR011083
833–880
IPR011083
WNN13501.1
1 1080
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PCM001
[NCBI] 		3076816 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNN13501.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR529306 [NCBI]
CDS location
range 676 -> 3918
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCTCAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACATATAATCTTAATGGAACCCAGTTTGTTTATGCAGGAAAGTATATTGAATTCTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATCAGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTGAGTTCAACTACTTCAACTTCTGAATACCACCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAGATGGTACTTTTTCAGTAGGTACATTAGTAAGCGAAGGCTCATTTAGAGTTCATTATATTGATTCTACAGCTCCAGACAATTCTAAACACTGGGTCTTTAACCGTAACGGTAATTTTATTGTAGATTCTGGTAGTATTGAGGTCCGCACAGGTAATATTTCTGCGTCAGGCAATATTAACTCCGCTAATGGTATAGTTTCTGCTCCACAAGTTAATACGAAAACCATTGTTTTAGACACAAAAGCATTTGGACAATATGATTCGCAATCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGCGAAGAAAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGCGCTAAATCAGGCGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACTGGAAATACACTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCACCGATGAAAATACTAACAACTATGGCTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTAGGTGATGCTGCCACTGGTTTAAAATATATTAAGCAAGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCTTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGCTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACCAACGCTGCATTTTTATCAGCTCAAACTCAGGCTGATGGGAATACAGCTGGTGACGGTCAGACACATATTGGTTATAACTCTGCCGGTAAAATGAGTCATTATTTCCGCGGTAAAGGAAAAACTAATATTAATACTCAGGAAGGTGTAGAAGTTAACCCTGGTATATTGAAGTTAATCACCGGTGCTAACAGTATTAGCTTTAACGCTGCAACAGGTAATATTGATTCTACATTAGCCTTTCGTCTTAATAAAGGCATAATTATTGATGGACCTGATAATCAGGGATTCCAATTTAATGCTCCGACGGCTGTAGATGGTACTAGAAGTATATACTGGAATAGTGGCACACGCCCAGGACAAAACAAAAGTCCTGTTACGGTTAAGGCATGGGGAAGTGCGTACAGCACAGGAGATAAATCTCGTGAAACTGTATTTGAAGTTGGCGACGGCCAAGGTTATTATTTTTATGCGCAGCGTGTAGCTCCCGCTTCAGGATCTACTGTCGGACCAATTCAATTTAGAATTGCTGGTGGTTTATTAACTTCAGGTAGTATTGTTGCTTCTGGTTCTATTACAACTGAATCTTCTTTAAATGTTAATAATGGATTATCTGTAAACGGACAAGCTAAATTCGGTGGAACTGCTGATGCGTTAAGAATTTGGGATGCCGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGCATCATTACATATTATCCCAACTCCTAAAGATGCTGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGTCCACTAAGTATTAGTCTTAATAATGGTATGGTTCAAATGCGCCATTCTGTTACGTTAGGTGATGATGGTGCTGGCGGTAATATGGTGACCGTTGATAATGATAATAAACTTGTTGTTATAACTAGCCATAGTCGCATTTCTCCTAATTACCGTATGCAGTTAGGTCAGTCGGCATACATTGATGCAGAATGTACTGATGCTGCACGACCTGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCGTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGTGACGGCGTTTCTACTGGTGCTGTTATAAAGGATCTTGGATGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTATTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACTGGCGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTACGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGAGTTGTATCCTAAGTTAGCTGCTGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAAAATACGTCAAGTTTTGATTATGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGCAACCATAGCCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCTGGTGCTCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAGCATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAATGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGATGGTGCCCACACTCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACGGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
b69aab35575846c0d041719dc671450556c1f08445f4e882f64d31675398693f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2508
Evidence 0,2508
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of Escherichia coli phages Magar,S.N., Ranjit Kumar,S., Anjali,P. and Govindrajan,S. 2022-08-29 — GenBank