Protein
- Genbank accession
- ANA49715.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPDFSLKDLYFDDVPVMNQDGSLNFQNVKAEFRPGSQTQDYIQGFTDTASEITVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGFTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAIDGAEYNEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPAFNERVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWKIINVPSNYDPISRTYSGSWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGEFTYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTVGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRLMEVNGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPEKPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGADGHPIVDEATLLTLVPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKANDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRIDQLTATFESEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNADSVGAMYGVKLGLRYNGQEYSAGMALSLVADGGGVKSQFLFDAGRFAIINNAQSGAFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIADQINSNNWQSGAAGWMINKNGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGTVYAEKIEGDVAKAVVLPFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGIHGYTYSGGTWGGGTVWVDSTYGGRLANVQATAMHGGSSGYVLLPAGNATTLSYGGNLNHANAVPILTVLLFKA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1258 AA molecular weight: 138885,66740 Da isoelectric point: 4,94854 aromaticity: 0,09380 hydropathy: -0,30819
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage phSE-2 [NCBI] |
1837218 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ANA49715.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX015770.1
[NCBI]
CDS location
range 20218 -> 23994
strand +
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATTAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCTGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAGACTTTTCATTAAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCAGGACGGGTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAAGCCGAATTCAGACCAGGATCACAAACGCAAGATTATATTCAGGGATTCACTGACACGGCGAGTGAGATTACTGTTGCTCGCGATCTGACGGCTGCAACTCCTTATATTATTTCCGTGACTAATAAAAACCTTTCCGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCGCGAGGGTTTACGCAGGAGGATAACGGAGACTTAACAGGCGTTCGCGTTGAATATGCCGTTGATATGGCTATTGATGGCGCTGAATATAACGAGGTTTTGCATGATGTGATCGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCCGAATTGATTTACCCGCTTTCAATGAGCGTGTTTTATTGCGCGTCCGTCGCCTGACAGACAGCACGTCAGCGAGAGTTACCGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCGGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTACCCACTGACTGGTTTAGTATATGTTGAGTTTGACAGCGAATTATTCCCTAATGCGTTGCCGAATATCAGCATTAAGAAAAAATGGAAAATCATTAATGTTCCGTCAAATTATGATCCTATTTCCCGCACTTACTCAGGGTCATGGGATGGAACATGGAAAAAGGCATGGAGTAATAACCCTGCTTTTGTTCTGTATGATTTGATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAATTAGGCATCGCGCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGCTATCTTTGCGACGTTGTGATCCAGAGTCAGGTAGAAGCGTATCAGCTTGTCCGTGATATTTGTTCAATCTTTCGAGGAATGAGTTTTTGGAACGGTGAGAGCCTTTCAATTGTGATCGATAAGCCGCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTGGTTAATGGTGAGTTTACTTACACGTTTGCCAGCGAGAAAAGCATGTACACGCAATGTAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGACGTTGAAGGTGTTTTTGAAACAGAGGCGGCATTACGCTTTGGATATAACAGCACGTCAATAACTGCTATCGGTTGCACACGACGCAGCGAAGCCAACCGCCGTGGACGCTGGATTTTAAAAACCAACGTCAAGAGCACAACAGTAAACTTTGCTACTGGCCTGGAAGGTATGATCCCAACGGTAGGCGATGTAATTGTTGTTTCGGATAACTTCTGGTCAAGCGCTTTGACGCTGAATCTATCAGGTCGCTTGATGGAGGTTAACGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTTGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCAGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTAAGTGATGACGGTAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGCTTTGACGTTCAGCCGGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACAGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCTAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCACCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTTCAGGGTGCGAGCGTGGAAACAATGCACGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGATAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCCAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGTATTTACGCAGGAAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCTAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCAGCAATTGTTAGCGCCGGATTAACTGGCAAAGTTGGCGAGCCAGAAAAGCCGATTAACCTTACAGCGTCTGACAATGAGGTTTTCGGCATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCGGAGGGTTCTGGTGATACAGCTTACATAGAGTTGCATCAAGCGCCGAACGGTGCTGATGGTCATCCTATAGTTGACGAAGCAACGCTATTAACGCTTGTTCCGTTCCCGCAATATGAGTATTGGCATTCAATACTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCAGTTGACAAAATCGGGAATGTGTCTGATTGGACTGACTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGATATAAGTGGTTACAGGAAAACGCAATAAAGGCCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTAGCGAATGATAAAGATGTGCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGCAAGCGTAAAGCGGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGACGAAACAGAAGCAAGGGTAACGCAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAATTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTGATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGAGCGAAATTGATGGTGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAGGCAATCACCAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGTGATACCCAATCAGCGGTTAACCAGAAACTTGATTCTTGGGTTAATGCCGATAGCGTAGGCGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGTTACGTTACAACGGGCAGGAATATAGCGCAGGTATGGCGCTTTCTCTTGTCGCTGATGGTGGTGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCTGGACGATTCGCGATCATCAACAATGCTCAAAGCGGAGCCTTTACATTGCCGTTTGTAGTTGAGAATAACCAGGTGTTTATCAATAGCTTGCTTGTGAAAAACGGCTCTATTGGAAATGCTCAGATTGCGGATCAGATTAACTCTAACAACTGGCAGAGCGGCGCGGCTGGATGGATGATTAATAAGAATGGTTATGCTGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACGGTGTACGCAAACGCCGGATCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACAGATGGTTGGTTTAGGGGTACTGTTTACGCTGAAAAAATTGAGGGTGACGTTGCAAAGGCTGTTGTTCTTCCGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCGGTTAACTACAACAGACATCTTGTGATCCCTTATGTTGGTATTCATGGTTACACATATTCAGGTGGTACATGGGGCGGCGGTACTGTTTGGGTTGATTCAACATATGGCGGTCGCCTTGCTAACGTTCAGGCAACTGCAATGCATGGCGGATCAAGTGGTTATGTTCTGTTGCCAGCAGGTAACGCAACTACGCTTTCATATGGTGGAAATCTAAACCACGCAAACGCAGTACCGATCTTAACAGTTCTGCTATTCAAAGCATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
13974c1d34d192f49233fdbb9cacc89a6e2a2beb2ee9d7f4382d87ea0af197c3
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Bacteriophages with potential to inactivate Salmonella Typhimurium: use of single phage suspensions and phage cocktails | Pereira,C., Moreirinha,C., Santos,L., Lewicka,M., Almeida,P., Clemente,C., Cunha,A., Delgadillo,I., Romalde,J.L., Nunes,M.L. and Almeida,A. | — | — | GenBank |