Protein

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Genbank accession
AGN33930.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGEIGIELDTTRLKIGDGVTAWNTLRYERPLESTTNTSNTLVQRDVDGNFSAGTITATLIGQSSTASRLASTRQVQITGDVTGTDNFDGSDNINLQSQLSIVDTLAHYDGTNTSLGTYTQVEVDAKGRIKRGFNPTSIADYGLDGSVEGSSAQPYDTDLQAIAQLNTTGLVARTSPGNAIARTINGTASQIVVNNGGGLTGNPVVDLAVTTVVAGDYNTESLTSVDALGSSNEPFGTETVNAAKFTVDDRGRLQSATNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSKVYQAITGIAAGGGAPTHTDATDAGGWRYLGAATVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTVQISASEADGKVHVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVIAGGAGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNLNVNTDKFNVIAASGNTSIAGTLGVTSIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITVLKNSGTGIWEIQSNDYGSLKVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATETESRLNWLQVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERSLHVGGTGTGEGLFVGKRYSGDTQKFSVLGASGNTTIEGTLTVNDNVNFNGTLDQDGDFAVRNGTTDKFFVAATSGNTNIEGTLTVDGHTELNSTLNVDNNVTLGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDAVQINDTLGVSDVVTFTRNTQQSITGNSISLDGAVRMSGGLGVSKNLAVGENLVVYGDFNIIGDTVVNGTTTYNAKIDITNTAEADSLGDSNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDDANSRNAFFVDVSTGDATLHNDLTVGGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDSTAKVGFFGLDRSSLEYVFLNDATNSSEVLSGTDGQLRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTSYVDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITITNADGVSGDITLNVASTSTNASNNLVLRDASGDFAANEITADLVGGVTGDVVGNVTGNVTGQTSDISNHDTGDLTEGSNLYYTDARADARIAAADTDALSEGSTNLYYTDARADARIAAADTGDLTEGSNLYYTNARADARIVAAGLDGGTLTGDVTGDVTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDADYIYICVATDTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1720 AA
molecular weight: 177259,79260 Da
isoelectric point:4,19446
aromaticity:0,05930
hydropathy:-0,20227

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
ATT
1–44
G3DSA:2.10.10.30 DC_1607 DC_0029
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_0574
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AGN33930.1
1 1720
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 1-44 | STR 45-242 | STR 329-942 | RBD 994-1720
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM8
[NCBI] 		754038 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Neritesvirus > Neritesvirus scam8
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33930.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634178 [NCBI]
CDS location
range 88333 -> 93495
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAAGGTGAGATCGGCATCGAACTCGATACAACTCGCCTCAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACTCTGAGGTATGAGCGTCCTCTTGAATCTACGACAAATACTTCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGTTGATGGTAATTTTTCTGCAGGTACAATCACAGCAACGTTGATTGGACAATCTTCTACTGCTAGTCGCCTTGCTTCTACAAGACAGGTTCAGATAACTGGTGATGTAACTGGTACAGATAACTTTGACGGTTCGGATAACATCAATCTGCAATCTCAACTCTCGATTGTTGATACTCTTGCTCATTATGATGGTACAAATACGTCTCTAGGAACATACACTCAAGTTGAGGTAGACGCAAAAGGTAGAATTAAGAGAGGTTTTAATCCAACATCAATTGCTGATTATGGTCTTGATGGTAGCGTCGAAGGATCTTCCGCACAACCTTATGATACCGATCTTCAGGCGATTGCTCAATTAAATACCACTGGTCTTGTTGCCAGAACTTCTCCTGGTAATGCCATTGCCAGAACAATCAATGGTACAGCATCTCAAATTGTTGTTAACAATGGTGGCGGTCTTACTGGTAATCCAGTTGTTGACTTGGCAGTTACAACTGTAGTTGCAGGTGACTATAACACTGAATCATTAACATCAGTTGATGCTCTTGGATCTAGCAACGAACCATTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGCAAAATTTACAGTTGACGATAGAGGTCGTTTACAAAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACGTATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAAAGTATATCAAGCAATCACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTACAGATGCTGGTGGATGGAGATATCTCGGTGCTGCAACAGTTGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGTCATGTAACTATTGCTGCAGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAGAATAATAGAGTTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCAACTTAACGTTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGGTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTGTACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGATGGTAAGGTACATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTCGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTTACAGTTGATGATCCTATTATCACTCTTGGTGGTGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATATTATGATACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACTGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATCTAGTTATTGCTGGTGGTGCTGGTATCACACAAGATGTAAATATCGGTGGATTGCTAGATGTTGATGGTACTTTCCGTGCTAATAGTACTTCTCGCTTTGACGATAATATCGTTCTACAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGCACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACCTTAACGTTAATACTGATAAGTTTAATGTTATTGCTGCTTCAGGTAATACATCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAGTATCGCAACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCCGAGAGCACCAATGATATCACAGTTCTTAAGAACTCAGGAACAGGTATTTGGGAGATTCAGTCTAATGACTATGGTTCGCTGAAAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTGATTGATGGCACACTCCATGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGACTGAATCTAGACTTAACTGGTTGCAAGTAAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACCACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGATCTCTACATGTTGGTGGCACAGGAACTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGAGATACTCAGAAGTTTTCTGTTCTTGGTGCATCTGGCAATACAACAATTGAAGGCACACTAACTGTTAATGATAATGTAAACTTCAATGGCACTCTTGATCAAGACGGTGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGCTGCTACCTCAGGCAATACAAATATTGAAGGCACACTGACTGTTGATGGTCACACTGAGTTAAATTCAACTCTTAATGTTGATAACAATGTCACACTTGGTGCTCAGTTAACAGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTTTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAACATCATTGGCACATTGACTGTTGGTGATGCGGTTCAGATCAATGATACCTTAGGCGTCTCCGATGTTGTAACCTTTACTAGAAACACACAACAATCTATCACTGGCAACTCCATCAGTCTGGATGGTGCCGTAAGAATGTCTGGTGGTCTTGGTGTTTCTAAGAACCTGGCAGTCGGTGAAAACTTAGTTGTTTATGGTGACTTTAATATCATTGGTGATACGGTAGTCAATGGTACTACCACTTATAATGCAAAAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGATTCTCTTGGTGATAGTAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATCAGGAAGAAACTCTGGGCAGGAGGAGACTTCACTGTATATGATGATGCAAACTCCAGAAATGCATTCTTTGTCGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTTTACACAATGACCTTACAGTTGGAGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCGACAACTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCACTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGACTCGACAGATCGTCGTTAGAATATGTCTTCCTTAATGATGCAACTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGATGGACAACTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTTACTGGCAGTGGCACATCTCTTGATGTTGATGCAAATGCAAACATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAGATTATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTAGTCATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGTATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTTAAAACGGCAAGAAATATTACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACGATCACTACATCATATGTTGACGCAGACATTACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGAACTGCTGCTAACACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTATTACCAACGCAGATGGGGTATCTGGCGATATCACCCTTAACGTCGCTTCTACGAGCACTAACGCATCCAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCAAACGAGATCACTGCTGATCTGGTTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTTACAGGACAAACTTCTGACATCAGCAACCATGATACTGGTGATCTTACAGAGGGATCCAATCTTTACTATACAGACGCTAGGGCAGATGCAAGAATTGCTGCTGCTGACACCGATGCATTGAGTGAGGGTTCTACCAACCTTTACTACACCGATGCTCGCGCTGATGCACGTATCGCTGCTGCTGATACTGGAGATCTTACAGAGGGATCTAACCTCTATTATACGAATGCTCGTGCTGATGCAAGAATTGTTGCTGCTGGACTTGACGGTGGCACTCTTACTGGTGATGTCACAGGTGATGTCACAGGTAATGTTGATGGTAATGTTTCTGGTGAAGTTACATTAGAGGGTGCTGCACCCGCCAGTGCTACTGCAACTGGAACTGCAGGTGATATTCGTTACGATGCTGATTATATCTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAGAGAGCAGCAATTTCTACCTGGAGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0fa5f21dff69f06034c5e1e227e69ef766f2a3f1189b398d0078e873132380e6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5835
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-CAM8 0608BI06 Henn,M.R., Martiny,J., Weihe,C., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank