Protein

Genbank accession
AGN33930.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGEIGIELDTTRLKIGDGVTAWNTLRYERPLESTTNTSNTLVQRDVDGNFSAGTITATLIGQSSTASRLASTRQVQITGDVTGTDNFDGSDNINLQSQLSIVDTLAHYDGTNTSLGTYTQVEVDAKGRIKRGFNPTSIADYGLDGSVEGSSAQPYDTDLQAIAQLNTTGLVARTSPGNAIARTINGTASQIVVNNGGGLTGNPVVDLAVTTVVAGDYNTESLTSVDALGSSNEPFGTETVNAAKFTVDDRGRLQSATNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSKVYQAITGIAAGGGAPTHTDATDAGGWRYLGAATVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTVQISASEADGKVHVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVIAGGAGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNLNVNTDKFNVIAASGNTSIAGTLGVTSIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITVLKNSGTGIWEIQSNDYGSLKVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATETESRLNWLQVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERSLHVGGTGTGEGLFVGKRYSGDTQKFSVLGASGNTTIEGTLTVNDNVNFNGTLDQDGDFAVRNGTTDKFFVAATSGNTNIEGTLTVDGHTELNSTLNVDNNVTLGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDAVQINDTLGVSDVVTFTRNTQQSITGNSISLDGAVRMSGGLGVSKNLAVGENLVVYGDFNIIGDTVVNGTTTYNAKIDITNTAEADSLGDSNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDDANSRNAFFVDVSTGDATLHNDLTVGGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDSTAKVGFFGLDRSSLEYVFLNDATNSSEVLSGTDGQLRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTSYVDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITITNADGVSGDITLNVASTSTNASNNLVLRDASGDFAANEITADLVGGVTGDVVGNVTGNVTGQTSDISNHDTGDLTEGSNLYYTDARADARIAAADTDALSEGSTNLYYTDARADARIAAADTGDLTEGSNLYYTNARADARIVAAGLDGGTLTGDVTGDVTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDADYIYICVATDTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1720 AA
molecular weight: 177259,79260 Da
isoelectric point:4,19446
aromaticity:0,05930
hydropathy:-0,20227

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
1–44
G3DSA:2.10.10.30
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AGN33930.1
1 1720
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM8
[NCBI] 		754038 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33930.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634178 [NCBI]
CDS location
range 88333 -> 93495
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAAGGTGAGATCGGCATCGAACTCGATACAACTCGCCTCAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACTCTGAGGTATGAGCGTCCTCTTGAATCTACGACAAATACTTCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGTTGATGGTAATTTTTCTGCAGGTACAATCACAGCAACGTTGATTGGACAATCTTCTACTGCTAGTCGCCTTGCTTCTACAAGACAGGTTCAGATAACTGGTGATGTAACTGGTACAGATAACTTTGACGGTTCGGATAACATCAATCTGCAATCTCAACTCTCGATTGTTGATACTCTTGCTCATTATGATGGTACAAATACGTCTCTAGGAACATACACTCAAGTTGAGGTAGACGCAAAAGGTAGAATTAAGAGAGGTTTTAATCCAACATCAATTGCTGATTATGGTCTTGATGGTAGCGTCGAAGGATCTTCCGCACAACCTTATGATACCGATCTTCAGGCGATTGCTCAATTAAATACCACTGGTCTTGTTGCCAGAACTTCTCCTGGTAATGCCATTGCCAGAACAATCAATGGTACAGCATCTCAAATTGTTGTTAACAATGGTGGCGGTCTTACTGGTAATCCAGTTGTTGACTTGGCAGTTACAACTGTAGTTGCAGGTGACTATAACACTGAATCATTAACATCAGTTGATGCTCTTGGATCTAGCAACGAACCATTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGCAAAATTTACAGTTGACGATAGAGGTCGTTTACAAAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACGTATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAAAGTATATCAAGCAATCACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTACAGATGCTGGTGGATGGAGATATCTCGGTGCTGCAACAGTTGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGTCATGTAACTATTGCTGCAGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAGAATAATAGAGTTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCAACTTAACGTTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGGTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTGTACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGATGGTAAGGTACATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTCGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTTACAGTTGATGATCCTATTATCACTCTTGGTGGTGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATATTATGATACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACTGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATCTAGTTATTGCTGGTGGTGCTGGTATCACACAAGATGTAAATATCGGTGGATTGCTAGATGTTGATGGTACTTTCCGTGCTAATAGTACTTCTCGCTTTGACGATAATATCGTTCTACAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGCACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACCTTAACGTTAATACTGATAAGTTTAATGTTATTGCTGCTTCAGGTAATACATCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAGTATCGCAACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCCGAGAGCACCAATGATATCACAGTTCTTAAGAACTCAGGAACAGGTATTTGGGAGATTCAGTCTAATGACTATGGTTCGCTGAAAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTGATTGATGGCACACTCCATGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGACTGAATCTAGACTTAACTGGTTGCAAGTAAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACCACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGATCTCTACATGTTGGTGGCACAGGAACTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGAGATACTCAGAAGTTTTCTGTTCTTGGTGCATCTGGCAATACAACAATTGAAGGCACACTAACTGTTAATGATAATGTAAACTTCAATGGCACTCTTGATCAAGACGGTGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGCTGCTACCTCAGGCAATACAAATATTGAAGGCACACTGACTGTTGATGGTCACACTGAGTTAAATTCAACTCTTAATGTTGATAACAATGTCACACTTGGTGCTCAGTTAACAGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTTTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAACATCATTGGCACATTGACTGTTGGTGATGCGGTTCAGATCAATGATACCTTAGGCGTCTCCGATGTTGTAACCTTTACTAGAAACACACAACAATCTATCACTGGCAACTCCATCAGTCTGGATGGTGCCGTAAGAATGTCTGGTGGTCTTGGTGTTTCTAAGAACCTGGCAGTCGGTGAAAACTTAGTTGTTTATGGTGACTTTAATATCATTGGTGATACGGTAGTCAATGGTACTACCACTTATAATGCAAAAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGATTCTCTTGGTGATAGTAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATCAGGAAGAAACTCTGGGCAGGAGGAGACTTCACTGTATATGATGATGCAAACTCCAGAAATGCATTCTTTGTCGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTTTACACAATGACCTTACAGTTGGAGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCGACAACTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCACTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGACTCGACAGATCGTCGTTAGAATATGTCTTCCTTAATGATGCAACTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGATGGACAACTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTTACTGGCAGTGGCACATCTCTTGATGTTGATGCAAATGCAAACATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAGATTATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTAGTCATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGTATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTTAAAACGGCAAGAAATATTACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACGATCACTACATCATATGTTGACGCAGACATTACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGAACTGCTGCTAACACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTATTACCAACGCAGATGGGGTATCTGGCGATATCACCCTTAACGTCGCTTCTACGAGCACTAACGCATCCAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCAAACGAGATCACTGCTGATCTGGTTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTTACAGGACAAACTTCTGACATCAGCAACCATGATACTGGTGATCTTACAGAGGGATCCAATCTTTACTATACAGACGCTAGGGCAGATGCAAGAATTGCTGCTGCTGACACCGATGCATTGAGTGAGGGTTCTACCAACCTTTACTACACCGATGCTCGCGCTGATGCACGTATCGCTGCTGCTGATACTGGAGATCTTACAGAGGGATCTAACCTCTATTATACGAATGCTCGTGCTGATGCAAGAATTGTTGCTGCTGGACTTGACGGTGGCACTCTTACTGGTGATGTCACAGGTGATGTCACAGGTAATGTTGATGGTAATGTTTCTGGTGAAGTTACATTAGAGGGTGCTGCACCCGCCAGTGCTACTGCAACTGGAACTGCAGGTGATATTCGTTACGATGCTGATTATATCTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAGAGAGCAGCAATTTCTACCTGGAGTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
0fa5f21dff69f06034c5e1e227e69ef766f2a3f1189b398d0078e873132380e6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5798
Evidence 0,5798
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-CAM8 0608BI06 Henn,M.R., Martiny,J., Weihe,C., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank