Genbank accession
AIX34457.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MANQNFRVKKGIEVGLGATFLYADDSGVGINSASPRSNLDVRGRSQTEELLVDNYAEVQGPSTFVGLGTFGGDLYVGNDLYVKGNLSFTSFESETGNVTGVLTTRDFNVTGLSTFAGDATFQSDVNISGASSITGNLVVSGASTLTGIVTTGDDLYVGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWSSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDNVSGSYVTLTNAGVGTFTTPRNRTAKKVDFVNGAQLSTAQARFGTSSLDVTGAGTDNITVDSTSDFGFGTGDFTVEFWIYRTGNINGKVICDFRDTAATDQAITIQGDGGNETDVYIGTTSVVTGTVPTTLNAWNHIAVCRVGSTITQYIDGAVSGSGTAATDLGVARQLTFGDRYDNSNNGPTAYLDELRVTKGAAKYTGAFTSPSVALTGDKDTSILLHFDGINGATSTTDDIIVLQDIRITGGNTADKVTLADYSQFGADLRSIACAIEYGNQGMIGDGDGVTLRAISINFNHVGALGDITNDPNLAIQSNEVIELNGGQVSYVSIDQKGDFRVGEAFYVNQETGEVSFTDTVTDLTALSSLTITDGTNSSIITPTSGRFGNVLISGQSVESVTGDLNIKTGGSGEINIFGNTNVIGILTAQIIEINAIQKGDTAIALDDTGTDGTIRFITDGQEAQRITNQQRVGINTTTPVTQLEVKGGTQLENLNVTGIATLNGVGIATIGGDPDFRNLNITGLSTFAGVGTFLSDLYVGGNLSVLGDIKFDEVDARNANITGIATVGFASITDARVGSALTNLGHTQLNTLNVSGVSTLSLLEVSGNSVFTGISTFNNNVTINGDLTINGSQNVDSFGTGDLIVSGIASINQAKIATGIVTTLTATRTESAELKVTGLSTFVGVATFANDVFVAGNLNVLGDIAYDEVTGRNLNISGIATIGFASITDAKIGVATITKLDVTEINVDGGTGIDDNSVTTENLVVSGIATINSGILTTLQAEVGSITNLTAGVSTFTGIVTTTEDLYVGGNLYVFNDIFYDEITGRNLSISGVSTLGFASVRDLRVSGVATFLGDVEISGSQIVDSLITGDLEVTGVTTTKELRFTDAVGVGLTLTNLVVTGNAELNGSGIVTAGQDINFRNLEVAGLSTFVGLQSFRSAVGTALTVYNLRVPENGIVSLPGIPVQGGDAEFRNVNVTGVSSFSGVSTFGSDLYVDGNLFVSGLDFRETLAGENLLVAGVGTVNNLNSNIGIITHLQAGISTFTGITTFQSDASFLSDVYVDGNLNVTGDIRYDEVNGRNLNISGIATIGYSSITDAKIGVATISTLSFGDGVGTALTLTDLTVTGDANLNGSGIVTAGSDVAFRNLEVTGLSTFTGVGTFLSDLYVGGDLFVFNDIKYDEINGRNLNISGISTLGFTSISDIRVSGGSTFLGNVEIDGNLDVTGDLTFDEFDATNANITGIATIGNLLAGVGTITTLSSTDGEITTLTSTDTVVGTLTATDATITTLGVTDSIVGTSTITTLSVTDSVVGTSTITTLNFTDGVGVALTLTDLNVLGEANLNGSGIATAGSDIEFRNLSITGLSTFVGVATFQDDLYVAGNLNVLGDLTYDEVNGRNLNISGIATIGFASITDLRVSGVTTFLGPVNIDGGQQTDFIQTTDLIVTGVATIGYATVTKLIADHSDMRNLNVSGIATIGSLVSDGNGGIIVDGAVSISGIVTIGENSIILDGRKDVEAIYLGDTGRAIVSGISTDNKRTYVKFDDGRFDRLNVSGISTFNDVVSTSSTITNLDVTTATVGFLTATQGYVGVLTVGTFTNDGGGSVIGDDITTRNLNVTGVSTFAGIVTTTGDLYVGGDLFVFNDIFYDEINGRNLNITGVATIGYSSITDVRVSGVATFLGDVNISGVTSVTTLEATGIDAYRVTTQRLIVPDDGFVQLPGIPVSGGSAEFSELLITGISSFVGVATFKDDVYIDGDFIVGGSQVIDNVATENIIISGIATIRTGEITELNVGIATVGFLTATDGYIGVLTAQNYTSLSDERLKSNIETIDDALAGVLRLDGVMFQWNNTGKTDMGVIAQQVEAVFPEIVHGDDTKGVNYNGLIGVLIEAVKELKVENDSLRERLDRLE
Physico‐chemical
properties
protein length:2518 AA
molecular weight: 260629,24770 Da
isoelectric point:4,12182
aromaticity:0,07109
hydropathy:0,16267

Domains

Domains [InterPro]
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
AIX34457.1
1 2518
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 405 405 0,7930
Central domain 406 646 242 0,9869
C-terminal 647 2518 1871 0,0447
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-405
Central
406-646
C-terminal
647-2518

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI]
1493511 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI]
32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX34457.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019111 [NCBI]
CDS location
range 197168 -> 204724
strand +
CDS
GTGGCGAATCAGAATTTTCGTGTCAAAAAAGGTATAGAAGTTGGCTTAGGTGCCACTTTTCTATACGCAGACGACAGTGGAGTTGGCATTAATAGTGCTAGCCCACGATCAAACCTAGACGTTCGAGGTAGATCCCAAACAGAGGAACTACTGGTAGACAACTATGCAGAGGTGCAAGGACCCTCTACATTCGTTGGACTAGGTACCTTTGGGGGTGATCTATATGTTGGGAATGATCTATATGTAAAGGGCAACCTATCATTCACCAGTTTTGAATCTGAGACTGGTAATGTAACAGGTGTTCTTACCACAAGAGACTTTAATGTAACCGGATTATCTACGTTTGCGGGAGACGCCACCTTCCAAAGTGACGTAAATATCTCTGGTGCTTCTTCAATTACTGGAAACTTAGTAGTTTCTGGTGCCTCTACGCTCACAGGTATCGTCACAACTGGCGATGACCTCTATGTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTAACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGTGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTACGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGCTATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGAGCTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTCTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTCAGACCGTCACAGGCAACCGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACCATTGATAATGTATCTGGTAGTTATGTAACACTAACCAACGCTGGTGTTGGTACATTCACAACTCCTAGAAATAGAACAGCCAAGAAGGTTGACTTTGTTAATGGAGCACAACTATCCACAGCACAGGCAAGGTTCGGTACATCCTCACTAGATGTAACTGGTGCCGGAACTGATAACATCACAGTTGATTCCACTTCAGACTTTGGGTTTGGAACTGGAGACTTCACCGTTGAATTCTGGATATACAGAACTGGTAATATTAATGGTAAGGTAATCTGTGACTTCAGAGATACCGCCGCTACAGATCAGGCAATTACTATCCAAGGTGATGGTGGTAATGAGACTGATGTTTATATTGGTACTACATCCGTTGTCACTGGTACAGTTCCTACCACACTGAATGCTTGGAACCATATCGCTGTTTGTAGAGTTGGTTCTACCATCACTCAGTATATTGATGGTGCTGTTTCTGGTAGTGGAACTGCTGCTACTGATCTAGGTGTTGCTAGACAACTAACCTTTGGTGATAGGTACGACAATAGTAACAACGGTCCTACAGCATACCTAGATGAACTTCGTGTCACTAAGGGGGCAGCAAAATACACAGGAGCATTCACTTCACCTTCAGTAGCACTCACAGGTGATAAGGATACTTCTATCCTACTACACTTTGATGGTATCAATGGAGCAACCTCCACTACAGATGATATCATTGTCCTCCAGGATATTCGTATCACTGGTGGCAACACAGCAGATAAAGTTACCCTAGCAGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGACCTCAGGTCTATCGCTTGTGCCATTGAATATGGTAACCAGGGTATGATTGGTGATGGTGATGGAGTAACTCTCCGTGCTATCTCTATCAACTTCAACCATGTAGGTGCTCTTGGTGATATCACTAACGATCCTAACCTAGCGATTCAATCGAACGAGGTTATCGAACTCAATGGTGGTCAAGTATCCTATGTAAGTATTGACCAGAAGGGTGACTTCAGAGTTGGTGAAGCATTCTATGTGAATCAGGAGACTGGTGAAGTATCCTTTACAGATACTGTAACAGACCTAACTGCTTTATCCTCACTCACTATTACTGATGGTACTAATAGTAGTATCATTACTCCTACTTCTGGTAGGTTTGGTAATGTTCTTATCAGTGGTCAGAGTGTAGAGAGTGTAACCGGAGACCTCAACATTAAGACTGGTGGTTCCGGTGAGATCAATATCTTTGGTAACACCAATGTTATTGGTATTCTAACCGCTCAGATCATTGAGATTAATGCTATTCAGAAGGGCGATACAGCAATCGCTCTAGATGATACTGGAACTGATGGGACTATCCGTTTCATCACAGACGGACAAGAAGCACAACGTATTACAAACCAACAGAGAGTTGGTATTAACACCACCACCCCAGTTACTCAGTTAGAAGTTAAGGGTGGAACACAACTAGAGAACTTAAATGTAACTGGCATTGCCACACTTAATGGTGTTGGTATTGCTACTATCGGTGGTGATCCTGACTTCAGAAACTTAAATATCACTGGACTATCGACGTTCGCTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGATTTGTATGTTGGTGGTAACCTCAGTGTCCTAGGTGATATCAAGTTTGATGAAGTTGATGCGAGAAACGCCAACATCACTGGTATTGCCACAGTTGGTTTCGCCTCTATCACAGATGCCAGAGTTGGAAGTGCCCTCACTAACTTGGGTCACACTCAACTCAATACTCTGAATGTAAGTGGAGTATCTACACTATCACTACTAGAAGTCAGTGGTAACTCAGTATTTACTGGTATCTCTACCTTCAACAACAATGTAACTATCAATGGTGACCTCACCATTAATGGTTCTCAGAATGTAGATAGTTTTGGAACTGGTGATTTAATAGTTAGTGGTATTGCTAGTATCAACCAGGCGAAGATCGCCACTGGTATTGTTACCACACTAACTGCCACTAGAACAGAGTCAGCAGAACTAAAAGTAACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTTGCTACCTTTGCTAACGATGTATTCGTGGCAGGTAACCTCAATGTTCTAGGAGATATTGCATATGATGAAGTCACTGGTAGAAACCTAAACATCTCCGGTATCGCAACCATCGGGTTCGCTTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTCGCCACTATTACAAAACTTGATGTCACTGAGATCAATGTAGATGGTGGAACAGGTATTGATGATAACTCAGTAACTACAGAGAACCTAGTTGTTAGTGGTATCGCTACCATCAACTCAGGTATCCTCACAACCCTCCAGGCGGAGGTAGGAAGTATCACAAACCTCACCGCTGGTGTTTCTACCTTTACTGGTATTGTAACCACTACAGAGGATCTATACGTTGGTGGAAACCTCTACGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAAATCACTGGTAGGAACCTTTCTATCTCTGGAGTATCTACATTAGGTTTCGCTTCTGTTAGAGATCTAAGAGTATCTGGTGTCGCTACATTCCTTGGTGATGTGGAGATCAGTGGATCACAGATTGTTGACTCACTAATAACTGGTGACTTGGAAGTTACTGGTGTTACTACAACTAAGGAACTAAGATTTACAGACGCTGTTGGTGTAGGACTCACACTCACCAATCTAGTTGTAACTGGTAACGCGGAACTCAATGGTTCTGGTATTGTTACCGCTGGTCAAGACATCAACTTCAGAAACCTAGAAGTTGCTGGTCTATCAACCTTTGTTGGTCTCCAGTCCTTCAGGTCAGCAGTTGGAACGGCACTCACAGTTTATAACCTAAGAGTTCCTGAAAATGGTATTGTTTCACTACCTGGTATTCCTGTTCAGGGTGGGGACGCTGAGTTTAGAAACGTCAATGTAACTGGTGTATCTTCCTTCAGTGGAGTATCAACTTTCGGTAGTGACCTCTATGTGGATGGAAACCTATTTGTTTCTGGTCTAGACTTCAGAGAGACACTTGCTGGTGAGAACCTATTAGTTGCTGGTGTTGGTACTGTTAATAATCTCAATAGTAATATTGGTATTATCACTCATCTACAGGCAGGTATATCAACCTTCACTGGTATCACCACCTTCCAGAGTGATGCCTCCTTCTTGAGTGATGTATATGTAGATGGAAACCTTAATGTTACGGGTGACATCAGATATGATGAGGTGAATGGTAGGAACTTGAATATCAGTGGTATCGCTACCATTGGTTACTCCTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTTGCTACTATCTCCACACTATCCTTTGGTGATGGTGTTGGAACAGCACTCACACTTACAGACCTCACGGTAACAGGTGACGCCAACCTCAATGGTTCTGGTATTGTAACCGCTGGTTCTGATGTAGCGTTTAGAAATCTAGAAGTAACTGGACTATCTACCTTCACTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCAAGTATGATGAGATTAATGGTAGAAACCTAAACATCTCTGGTATCTCCACACTTGGTTTCACTTCTATCTCCGACATCAGAGTATCTGGTGGTTCTACCTTCTTAGGTAATGTAGAGATTGATGGAAACCTAGATGTAACTGGTGACCTAACCTTTGATGAGTTTGATGCCACTAACGCTAACATCACTGGTATTGCCACTATTGGTAACCTACTAGCGGGTGTGGGAACTATCACCACACTATCATCTACTGATGGTGAGATTACAACACTAACCTCTACTGATACTGTTGTTGGTACTCTAACCGCCACTGATGCCACTATCACTACACTAGGTGTTACTGATAGTATAGTTGGAACCTCTACCATTACAACACTCAGTGTTACTGATAGTGTAGTTGGAACTTCTACTATCACAACACTCAACTTCACTGATGGTGTTGGAGTAGCACTCACACTCACTGACCTCAATGTTCTAGGTGAAGCTAACCTCAATGGTTCTGGTATCGCAACCGCTGGTTCTGATATAGAGTTTAGGAACCTCAGTATTACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTAGCAACCTTCCAAGATGACTTGTATGTGGCAGGTAACCTGAATGTATTGGGTGACCTAACCTATGATGAGGTGAATGGTAGAAACCTTAACATCTCTGGTATCGCTACCATTGGTTTCGCTTCCATTACAGACCTAAGAGTATCTGGTGTAACTACCTTCCTCGGTCCTGTTAATATCGATGGTGGTCAGCAAACCGACTTCATTCAAACCACAGACTTGATTGTCACTGGTGTTGCCACTATTGGTTACGCAACTGTCACTAAGTTGATCGCTGATCACAGTGATATGAGGAACCTGAATGTATCAGGTATCGCCACTATTGGTAGTCTCGTATCAGATGGTAATGGTGGAATCATTGTAGATGGTGCTGTATCCATTAGTGGTATTGTTACTATTGGTGAAAACTCTATCATTCTCGATGGTAGAAAGGATGTAGAAGCAATCTACTTGGGTGATACAGGAAGAGCAATCGTCTCTGGTATATCTACTGATAATAAGAGAACCTACGTCAAGTTTGATGATGGTAGATTCGATAGACTAAATGTATCTGGTATCTCTACCTTCAATGATGTAGTATCCACATCATCTACTATCACTAACCTAGATGTAACCACAGCAACTGTTGGTTTCCTAACCGCAACTCAGGGTTATGTTGGAGTTCTAACTGTAGGAACATTCACCAATGATGGTGGTGGTTCTGTTATTGGTGACGATATCACAACCAGAAACCTGAATGTAACTGGTGTATCTACCTTCGCAGGTATTGTTACTACTACTGGTGACCTCTATGTGGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATCAATGGTAGAAACCTGAATATCACGGGTGTCGCCACTATCGGTTACTCCTCTATCACTGATGTTAGAGTATCTGGTGTAGCAACATTCCTAGGTGATGTGAATATCTCTGGTGTTACTTCTGTAACCACACTGGAGGCAACTGGCATTGATGCCTATCGGGTTACTACTCAGAGATTGATCGTACCTGATGATGGTTTCGTACAACTACCTGGTATCCCAGTTAGTGGTGGTTCCGCTGAGTTCTCAGAACTATTAATAACTGGTATATCTAGTTTCGTTGGAGTCGCCACCTTCAAGGATGATGTGTATATCGATGGTGACTTTATTGTTGGTGGATCTCAGGTTATTGATAATGTTGCTACTGAGAACATTATCATCAGTGGTATTGCTACAATAAGAACAGGTGAGATCACTGAACTAAATGTAGGAATTGCTACAGTTGGATTCCTCACAGCCACTGATGGATACATTGGAGTTCTAACAGCTCAGAACTACACTTCACTCTCTGATGAGAGACTCAAGTCTAACATTGAAACTATTGATGATGCTCTAGCGGGTGTTCTCAGACTCGATGGTGTAATGTTCCAGTGGAATAATACTGGCAAAACTGATATGGGTGTTATCGCCCAACAGGTGGAGGCGGTATTCCCCGAGATCGTACATGGGGATGATACAAAGGGAGTCAATTATAACGGTCTTATTGGTGTACTGATCGAAGCAGTCAAGGAACTCAAAGTAGAAAACGATAGTCTCAGAGAGAGACTAGACAGACTGGAGTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5a8323c1017d80b40844d4e233d297723cc6542f2b7f31b9e5cba0841fe99bb0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5033
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 GenBank