Protein

Genbank accession
AIX34457.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MANQNFRVKKGIEVGLGATFLYADDSGVGINSASPRSNLDVRGRSQTEELLVDNYAEVQGPSTFVGLGTFGGDLYVGNDLYVKGNLSFTSFESETGNVTGVLTTRDFNVTGLSTFAGDATFQSDVNISGASSITGNLVVSGASTLTGIVTTGDDLYVGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWSSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDNVSGSYVTLTNAGVGTFTTPRNRTAKKVDFVNGAQLSTAQARFGTSSLDVTGAGTDNITVDSTSDFGFGTGDFTVEFWIYRTGNINGKVICDFRDTAATDQAITIQGDGGNETDVYIGTTSVVTGTVPTTLNAWNHIAVCRVGSTITQYIDGAVSGSGTAATDLGVARQLTFGDRYDNSNNGPTAYLDELRVTKGAAKYTGAFTSPSVALTGDKDTSILLHFDGINGATSTTDDIIVLQDIRITGGNTADKVTLADYSQFGADLRSIACAIEYGNQGMIGDGDGVTLRAISINFNHVGALGDITNDPNLAIQSNEVIELNGGQVSYVSIDQKGDFRVGEAFYVNQETGEVSFTDTVTDLTALSSLTITDGTNSSIITPTSGRFGNVLISGQSVESVTGDLNIKTGGSGEINIFGNTNVIGILTAQIIEINAIQKGDTAIALDDTGTDGTIRFITDGQEAQRITNQQRVGINTTTPVTQLEVKGGTQLENLNVTGIATLNGVGIATIGGDPDFRNLNITGLSTFAGVGTFLSDLYVGGNLSVLGDIKFDEVDARNANITGIATVGFASITDARVGSALTNLGHTQLNTLNVSGVSTLSLLEVSGNSVFTGISTFNNNVTINGDLTINGSQNVDSFGTGDLIVSGIASINQAKIATGIVTTLTATRTESAELKVTGLSTFVGVATFANDVFVAGNLNVLGDIAYDEVTGRNLNISGIATIGFASITDAKIGVATITKLDVTEINVDGGTGIDDNSVTTENLVVSGIATINSGILTTLQAEVGSITNLTAGVSTFTGIVTTTEDLYVGGNLYVFNDIFYDEITGRNLSISGVSTLGFASVRDLRVSGVATFLGDVEISGSQIVDSLITGDLEVTGVTTTKELRFTDAVGVGLTLTNLVVTGNAELNGSGIVTAGQDINFRNLEVAGLSTFVGLQSFRSAVGTALTVYNLRVPENGIVSLPGIPVQGGDAEFRNVNVTGVSSFSGVSTFGSDLYVDGNLFVSGLDFRETLAGENLLVAGVGTVNNLNSNIGIITHLQAGISTFTGITTFQSDASFLSDVYVDGNLNVTGDIRYDEVNGRNLNISGIATIGYSSITDAKIGVATISTLSFGDGVGTALTLTDLTVTGDANLNGSGIVTAGSDVAFRNLEVTGLSTFTGVGTFLSDLYVGGDLFVFNDIKYDEINGRNLNISGISTLGFTSISDIRVSGGSTFLGNVEIDGNLDVTGDLTFDEFDATNANITGIATIGNLLAGVGTITTLSSTDGEITTLTSTDTVVGTLTATDATITTLGVTDSIVGTSTITTLSVTDSVVGTSTITTLNFTDGVGVALTLTDLNVLGEANLNGSGIATAGSDIEFRNLSITGLSTFVGVATFQDDLYVAGNLNVLGDLTYDEVNGRNLNISGIATIGFASITDLRVSGVTTFLGPVNIDGGQQTDFIQTTDLIVTGVATIGYATVTKLIADHSDMRNLNVSGIATIGSLVSDGNGGIIVDGAVSISGIVTIGENSIILDGRKDVEAIYLGDTGRAIVSGISTDNKRTYVKFDDGRFDRLNVSGISTFNDVVSTSSTITNLDVTTATVGFLTATQGYVGVLTVGTFTNDGGGSVIGDDITTRNLNVTGVSTFAGIVTTTGDLYVGGDLFVFNDIFYDEINGRNLNITGVATIGYSSITDVRVSGVATFLGDVNISGVTSVTTLEATGIDAYRVTTQRLIVPDDGFVQLPGIPVSGGSAEFSELLITGISSFVGVATFKDDVYIDGDFIVGGSQVIDNVATENIIISGIATIRTGEITELNVGIATVGFLTATDGYIGVLTAQNYTSLSDERLKSNIETIDDALAGVLRLDGVMFQWNNTGKTDMGVIAQQVEAVFPEIVHGDDTKGVNYNGLIGVLIEAVKELKVENDSLRERLDRLE
Physico‐chemical
properties
protein length:2518 AA
molecular weight: 260629,24770 Da
isoelectric point:4,12182
aromaticity:0,07109
hydropathy:0,16267

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
347–647
IPR011050 IPR013320 IPR036388
G3DSA:2.60.120.200
634–811
G3DSA:2.60.120.200 IPR030392 Coil
PF13385
669–811
PF13385 IPR030392
AIX34457.1
1 2518
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX34457.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019111 [NCBI]
CDS location
range 197168 -> 204724
strand +
CDS
GTGGCGAATCAGAATTTTCGTGTCAAAAAAGGTATAGAAGTTGGCTTAGGTGCCACTTTTCTATACGCAGACGACAGTGGAGTTGGCATTAATAGTGCTAGCCCACGATCAAACCTAGACGTTCGAGGTAGATCCCAAACAGAGGAACTACTGGTAGACAACTATGCAGAGGTGCAAGGACCCTCTACATTCGTTGGACTAGGTACCTTTGGGGGTGATCTATATGTTGGGAATGATCTATATGTAAAGGGCAACCTATCATTCACCAGTTTTGAATCTGAGACTGGTAATGTAACAGGTGTTCTTACCACAAGAGACTTTAATGTAACCGGATTATCTACGTTTGCGGGAGACGCCACCTTCCAAAGTGACGTAAATATCTCTGGTGCTTCTTCAATTACTGGAAACTTAGTAGTTTCTGGTGCCTCTACGCTCACAGGTATCGTCACAACTGGCGATGACCTCTATGTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTAACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGTGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTACGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGCTATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGAGCTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTCTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTCAGACCGTCACAGGCAACCGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACCATTGATAATGTATCTGGTAGTTATGTAACACTAACCAACGCTGGTGTTGGTACATTCACAACTCCTAGAAATAGAACAGCCAAGAAGGTTGACTTTGTTAATGGAGCACAACTATCCACAGCACAGGCAAGGTTCGGTACATCCTCACTAGATGTAACTGGTGCCGGAACTGATAACATCACAGTTGATTCCACTTCAGACTTTGGGTTTGGAACTGGAGACTTCACCGTTGAATTCTGGATATACAGAACTGGTAATATTAATGGTAAGGTAATCTGTGACTTCAGAGATACCGCCGCTACAGATCAGGCAATTACTATCCAAGGTGATGGTGGTAATGAGACTGATGTTTATATTGGTACTACATCCGTTGTCACTGGTACAGTTCCTACCACACTGAATGCTTGGAACCATATCGCTGTTTGTAGAGTTGGTTCTACCATCACTCAGTATATTGATGGTGCTGTTTCTGGTAGTGGAACTGCTGCTACTGATCTAGGTGTTGCTAGACAACTAACCTTTGGTGATAGGTACGACAATAGTAACAACGGTCCTACAGCATACCTAGATGAACTTCGTGTCACTAAGGGGGCAGCAAAATACACAGGAGCATTCACTTCACCTTCAGTAGCACTCACAGGTGATAAGGATACTTCTATCCTACTACACTTTGATGGTATCAATGGAGCAACCTCCACTACAGATGATATCATTGTCCTCCAGGATATTCGTATCACTGGTGGCAACACAGCAGATAAAGTTACCCTAGCAGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGACCTCAGGTCTATCGCTTGTGCCATTGAATATGGTAACCAGGGTATGATTGGTGATGGTGATGGAGTAACTCTCCGTGCTATCTCTATCAACTTCAACCATGTAGGTGCTCTTGGTGATATCACTAACGATCCTAACCTAGCGATTCAATCGAACGAGGTTATCGAACTCAATGGTGGTCAAGTATCCTATGTAAGTATTGACCAGAAGGGTGACTTCAGAGTTGGTGAAGCATTCTATGTGAATCAGGAGACTGGTGAAGTATCCTTTACAGATACTGTAACAGACCTAACTGCTTTATCCTCACTCACTATTACTGATGGTACTAATAGTAGTATCATTACTCCTACTTCTGGTAGGTTTGGTAATGTTCTTATCAGTGGTCAGAGTGTAGAGAGTGTAACCGGAGACCTCAACATTAAGACTGGTGGTTCCGGTGAGATCAATATCTTTGGTAACACCAATGTTATTGGTATTCTAACCGCTCAGATCATTGAGATTAATGCTATTCAGAAGGGCGATACAGCAATCGCTCTAGATGATACTGGAACTGATGGGACTATCCGTTTCATCACAGACGGACAAGAAGCACAACGTATTACAAACCAACAGAGAGTTGGTATTAACACCACCACCCCAGTTACTCAGTTAGAAGTTAAGGGTGGAACACAACTAGAGAACTTAAATGTAACTGGCATTGCCACACTTAATGGTGTTGGTATTGCTACTATCGGTGGTGATCCTGACTTCAGAAACTTAAATATCACTGGACTATCGACGTTCGCTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGATTTGTATGTTGGTGGTAACCTCAGTGTCCTAGGTGATATCAAGTTTGATGAAGTTGATGCGAGAAACGCCAACATCACTGGTATTGCCACAGTTGGTTTCGCCTCTATCACAGATGCCAGAGTTGGAAGTGCCCTCACTAACTTGGGTCACACTCAACTCAATACTCTGAATGTAAGTGGAGTATCTACACTATCACTACTAGAAGTCAGTGGTAACTCAGTATTTACTGGTATCTCTACCTTCAACAACAATGTAACTATCAATGGTGACCTCACCATTAATGGTTCTCAGAATGTAGATAGTTTTGGAACTGGTGATTTAATAGTTAGTGGTATTGCTAGTATCAACCAGGCGAAGATCGCCACTGGTATTGTTACCACACTAACTGCCACTAGAACAGAGTCAGCAGAACTAAAAGTAACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTTGCTACCTTTGCTAACGATGTATTCGTGGCAGGTAACCTCAATGTTCTAGGAGATATTGCATATGATGAAGTCACTGGTAGAAACCTAAACATCTCCGGTATCGCAACCATCGGGTTCGCTTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTCGCCACTATTACAAAACTTGATGTCACTGAGATCAATGTAGATGGTGGAACAGGTATTGATGATAACTCAGTAACTACAGAGAACCTAGTTGTTAGTGGTATCGCTACCATCAACTCAGGTATCCTCACAACCCTCCAGGCGGAGGTAGGAAGTATCACAAACCTCACCGCTGGTGTTTCTACCTTTACTGGTATTGTAACCACTACAGAGGATCTATACGTTGGTGGAAACCTCTACGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAAATCACTGGTAGGAACCTTTCTATCTCTGGAGTATCTACATTAGGTTTCGCTTCTGTTAGAGATCTAAGAGTATCTGGTGTCGCTACATTCCTTGGTGATGTGGAGATCAGTGGATCACAGATTGTTGACTCACTAATAACTGGTGACTTGGAAGTTACTGGTGTTACTACAACTAAGGAACTAAGATTTACAGACGCTGTTGGTGTAGGACTCACACTCACCAATCTAGTTGTAACTGGTAACGCGGAACTCAATGGTTCTGGTATTGTTACCGCTGGTCAAGACATCAACTTCAGAAACCTAGAAGTTGCTGGTCTATCAACCTTTGTTGGTCTCCAGTCCTTCAGGTCAGCAGTTGGAACGGCACTCACAGTTTATAACCTAAGAGTTCCTGAAAATGGTATTGTTTCACTACCTGGTATTCCTGTTCAGGGTGGGGACGCTGAGTTTAGAAACGTCAATGTAACTGGTGTATCTTCCTTCAGTGGAGTATCAACTTTCGGTAGTGACCTCTATGTGGATGGAAACCTATTTGTTTCTGGTCTAGACTTCAGAGAGACACTTGCTGGTGAGAACCTATTAGTTGCTGGTGTTGGTACTGTTAATAATCTCAATAGTAATATTGGTATTATCACTCATCTACAGGCAGGTATATCAACCTTCACTGGTATCACCACCTTCCAGAGTGATGCCTCCTTCTT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank