Protein

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Genbank accession
XEN38919.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,59
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVSSGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRSVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPAAPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNAATGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELSYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTIERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANADLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQSGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMSIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPININASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGNYGFLIRNDGSNTYFLLTNSGEQTGGFNGLRPIAINNASGLVSIAEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139328,50060 Da
isoelectric point:5,43559
aromaticity:0,07281
hydropathy:-0,29667

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–141
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
999–1274
DC_1209
XEN38919.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-141 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1274 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PNJ-9
[NCBI] 		3239045 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEN38919.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ100635.1 [NCBI]
CDS location
range 12629 -> 16504
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAACGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTCTCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGCGAATCGATTTCGGTTAACACTGGCGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCGACCACGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGGCACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAAATTAAACCCGCTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCGAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTGCAACCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTACCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCGTTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTATCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACGATAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGCTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCGTCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCCGAAACACTATCGGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCTGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCTCAGTCTGGATACTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACGTCAGCGAACACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAACGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAAAACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCGTATGAATTAAACCGTGTATTGGCAAATTACTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACGGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGACTTATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACCAACCCAGCACAGACGATGTCTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTGAATGGCGTTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAACGCATTTAGAGCTATTAGTGGTAATTACGGATTCTTAATTCGTAATGATGGTTCTAATACCTATTTTCTGCTAACTAATTCAGGTGAACAGACAGGTGGTTTTAATGGATTACGTCCTATCGCGATAAATAATGCCTCCGGTTTAGTATCTATTGCCGAAGGATTAATTATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCTAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGAGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0cc47647d05d5ad4931380c347c09c8f44c67655108459fd78b263ca2476ead3
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5555
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of novel Escherichia coli phage PNJ-9 Fu,K.L., Cui,J.Q. and Tang,F. 2019-10-08 — GenBank