Protein

Genbank accession
XRL28086.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVDTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAAVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSIQEVGTHSIEGRTTIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTGEFGGSLAANRTFTIRNTGLPTNIIFEKGPATGSNPVQSMSIRVWGNQYGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNITFSINGTVMPKNVTASGMLNVNGAAAFGSSVNVTGEIISRNTNAFRAISSQYGFFIRNDSSNVYFMLTDQGDQTGGYNALRPLTINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSNLYTRAPTSDTVGFWSIDVNDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140511,23900 Da
isoelectric point:5,55319
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,34407

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
XRL28086.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HMD-9
[NCBI] 		3411022 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XRL28086.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV287714 [NCBI]
CDS location
range 146755 -> 150624
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTCAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGCTGGAGAGCATTACGTACTGATGCTAATTGGACAACTGTTTCATCAGGACCTTATCAATTAAAGTCAGGCGAATCAATTTCAGTTGATACTGCAGCCGGTAATGACATTACATTTACTTTACCATCTTCCCCAATTGATGGAGATACTATCGTTCTCCAAGACATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTACAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCGCAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTAGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCAGTTGTAACACCGGCAAGTCTTTATCAGGCGCAATCTAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCTGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAATACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTATGATGATAATGAAAAATTATGGAGACTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGTATTATAACGACTAATTCAAACATTCGCCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGAGCGAATAACGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCAACTGATATTTCTATTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGCCAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCGCCTGAAACTAAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGCGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATAGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACACCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCCACAGAAACTCGTAGAGGCGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTAGACAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACCCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACTGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGATCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGCGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAGTGGATTGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTGCGGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTCGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAGCCATTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAGCAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGGTGAATTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATAGAACATTTACCATCCGTAATACCGGACTCCCGACCAATATCATTTTCGAAAAAGGTCCTGCAACCGGTTCAAACCCGGTTCAGTCAATGAGCATCCGTGTATGGGGTAACCAGTATGGCGGCGGCTCGGATACGACTCGTTCTACCGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGACGGGAATATAACGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAAAAAATGTAACTGCTTCGGGTATGTTGAATGTGAATGGCGCTGCAGCATTCGGTAGTTCAGTTAATGTAACCGGCGAAATTATTTCCAGAAATACAAACGCTTTCCGCGCTATCAGTAGCCAATACGGGTTCTTTATTCGTAATGATAGCTCTAATGTCTATTTTATGCTGACCGATCAAGGCGATCAGACTGGTGGATATAATGCATTACGTCCTTTAACCATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATTATTGCCAAAGGTGCAACTATTAACTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGCACTAAAACATCTAATTTATATACTCGTGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATGTTAATGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACGCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACCCGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAATCTGTTAAATTTGAATGGATTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f478f4a10982ddb53ddf75c55a092a37cb7901df36a267ed45c9c94ff5212d6c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2302
Evidence 0,2302
Download PDB

Literature

No literature entries available.