Protein

Genbank accession
ADO98497.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANSNPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTITSTVIGNSSTASRLASSRQIQLSNEVTASGVFDGSQNLNLSAELALVSTLPHYDGTSSPSATYNKVTVDAKGRVTNAQDFTASNNGTLADYGLDGTNEGTSAQPYDLDLVALAGLTTTGMISRTASNTVATRAITGTATRISVSEGAGISGNPTIDMITTAVTAGNYNTESLTSVSGAGGNGEPFGTATVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATAAEGSKYASYNAGTTYVRYDIIANASKVYQAITGIAAGAGAPTHSSGDSGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIATAGVDNTQLQNNKLIFTDGNAVENFELDNELTTSTANTGFNKLNFIKINNTSGGLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGSVAQTLNKTGDGNLTFTTTQNSSSARSLTVSASNSGSGTSTVTITAEDVVDIDASDSNGKVHVEDSRFQDNYIATSNATMHLDPGDDRATSGLVRVHGDLQVDGTTTTINSTVTTIDDPIITLGGDTAPGSDDNKDRGVEFRYYDNQARIGFFGYDDSYTDLGGHVGGFTFLHNATNTSEVFSGTASGITAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLSLNNGSGTTKIQLHTTTGNVEIGGILTNTGAIDANSTLNVASTVRFEDTDEPTVAQNGGTGIYEIQSNDYGAFRFDGGGYVEGDTVFNSDVFINGVLNQRDSATESFGNRNYLNIRYKLRSGSSAAYTPSYASDNTSNLRIFGGAGIQTDLHIGDDLYIGKLNSGDSVSFQVLGESGNTTTQGTLTVEGQTNINDSLIVNASNENFKIQNGSAADKFTVDTDNGNTLIEGTLNVNGVTDIDADFAVRNGTTDKFFVASASGNTQIKGNLTADGHTELNSTLNVDSNTTLGAQLTVTGNSEFNGTVDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLVVAGQTTINDSLIVQSDNEVVNINNGSGTTKFSIDTDNGNTNIIGTLTVADATQINNTLGVSNVVTLTRNTQQTLTGSYSADGAFKLTGGAGIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDDVTITADNKMFKVQNASAANKFTVDTDNGNTDIQGTLDVAGDVTASSDLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTIDDPVITVGGDTAPASNDGKDRGIEFRYYDGSAKIGFFGFDRSSSQFQFLTSATNTSEVLSGTDGALRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTDKINNLNADLLDGATTATAATASTVVLRDSSGDFAANQITAASAAGSGAGFLGNASTADAWKTARTLTISGVVSGFVVIDGSENETLTTTYVDADITALAAMSGTGYVVRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVSGNTTINVASASSNSANNLVLRDGSGNFAAGTITAALTGNVTGNVTGNVTGQVSDISNHDTGDLTEGSNLYYTNERVDDRVNALITAGTGITKVYDDAANTYTLTVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNITEGSTNLFITNERVDDRVNALTVAGTGVSKTYDDAAGTLTLAVDFSEFNTGNITEGSNLYFTNTRADARADLKVAAATGSNLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQAKLDNAYEQLRAMLTNLATSTTLNLNLSGDPTPGAVVTTGVSVGGGGGFTAGTAVATSGSATGSGLTVDTTVDSDGNITAAAVNAGGSGYLITDTVTVTNPNAGKILTLNLATLSGGTGYSSATGVAVTGGDGSSATVDITASAGAITNVTVNNGGTGFAAGNTITIANANATGVKTLGSISAAGSGYSTGTAIATSASASGSGATLNITSVNASGGITGVAINDDGSGYAASEVLTITNANASGIATVGNIGAADASRTAGTYNLGTSDYGTEASGANATFTVVVDSNGAASITVTDDGSGFIANETITVADAQLGGGGGAALTFDVTAIHGSTATVPVSAIHGNGATVNVATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVNTVDGFFKKGEVVSANDVTTLTISSFS
Physico‐chemical
properties
protein length:2236 AA
molecular weight: 226908,34840 Da
isoelectric point:4,21929
aromaticity:0,05590
hydropathy:-0,15309

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–247
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
ADO98497.1
1 2236
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-RSM4
[NCBI] 		444862 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Prochlorococcus marinus str. MIT 9303
[NCBI] 		59922 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98497.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071099 [NCBI]
CDS location
range 95142 -> 101852
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCACAGGAATGGGCGAACTCTAACCCGACTCTTGCACAAGGTGAATTGGGTATCGAACTTGACACGGGTCGTTTTAAGATCGGTGATGGTGTATCTGCATGGAACACCTTAAGGTACGAACGTCCTGTAGAGTCTACATCTAATACTGCAAATACTTTAGTCCAAAGGGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCAGGTACCATTACTTCTACTGTTATTGGTAACTCGTCTACTGCGTCTAGACTTGCTTCATCTAGACAAATCCAACTCTCTAATGAGGTTACTGCTTCTGGTGTATTTGATGGTTCTCAAAACTTAAATCTATCTGCTGAATTAGCACTTGTTTCTACTTTACCACATTACGATGGTACATCATCTCCCTCAGCAACTTACAATAAGGTAACTGTTGATGCTAAAGGTAGAGTAACAAACGCACAAGATTTTACTGCTTCTAACAACGGTACTCTTGCTGATTATGGTCTTGATGGAACCAATGAAGGAACATCTGCACAACCATATGATTTAGACTTAGTTGCTTTAGCAGGTTTGACCACTACTGGTATGATCTCTAGAACTGCTTCTAATACTGTAGCAACTAGAGCAATTACTGGAACTGCCACAAGAATCTCTGTAAGTGAGGGTGCAGGTATTTCTGGTAACCCAACTATTGATATGATTACCACTGCTGTTACAGCAGGTAACTATAATACGGAATCCCTGACATCTGTATCTGGTGCAGGTGGAAATGGCGAACCCTTTGGTACCGCTACAGTTAACGCTACTAAGTTTACTGTTGATGCCTATGGTAGATTGACAAGTGCAACAAATGTGCCTATCGCTACTGCTGCAGAAGGTAGTAAGTATGCTAGCTATAATGCAGGTACTACTTACGTTAGATATGACATCATTGCTAACGCATCAAAAGTTTACCAAGCCATCACTGGCATTGCTGCAGGTGCAGGTGCACCTACTCATAGTAGCGGTGACTCTGGCGGGTGGAGATATCTCGCTGCCGAAGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTAGTTTTGCACAAGAAGATTTCGACGTTGACGCGAACGGGCACGTCACGATCGCCACCGCAGGAGTAGATAATACACAACTACAAAATAATAAACTTATTTTCACAGATGGAAATGCTGTTGAAAATTTTGAATTAGATAACGAACTTACAACTTCTACCGCCAACACTGGTTTTAATAAATTAAACTTTATTAAAATCAATAATACTTCTGGCGGTTTATTATTTGGTGCTAATAATACTGGTGATAGTGGTGCAGGTGAGATCGATGTAAACGTACGTTCTTACTTTAGCGATCCTGATATTACTTTAGATGGTTCAGTTGCACAAACTCTAAACAAAACTGGTGATGGTAATCTTACTTTCACAACTACTCAAAACTCATCATCTGCAAGATCTTTAACAGTTTCAGCATCAAACTCTGGTTCTGGAACTAGCACAGTTACAATTACTGCAGAAGATGTAGTTGATATTGATGCCTCAGATTCAAACGGAAAAGTTCATGTCGAAGATTCTAGATTCCAAGATAACTACATTGCTACGTCTAATGCCACTATGCACCTTGATCCTGGTGATGATCGTGCTACTAGTGGGTTAGTTCGTGTTCATGGAGATTTACAGGTAGATGGTACGACTACGACAATTAATTCAACAGTTACAACAATTGATGATCCCATTATTACTCTTGGTGGCGATACTGCTCCAGGTAGTGATGACAATAAAGATCGTGGAGTTGAATTCAGATACTACGACAATCAAGCAAGAATTGGATTCTTTGGTTACGATGATTCTTACACCGACCTCGGAGGACACGTCGGAGGATTTACATTTTTACACAACGCCACAAATACTTCAGAGGTCTTTAGTGGAACTGCGTCAGGTATAACTGCAGGTAATTTAAAACTTACAACAAATACTAACTCAACATCTAATACTACAGGAGACTTAGTAGTTGCAGGTGGTGTTGGTATTGGAGATGATGTTAATATTGGTGGATTGCTAGATGTCGATGGCACATTCCGTGCTAATAGCACATCTAGATTTGATGATAACATTGTATTCCAAGGTGCTTCTAAGACATTATCATTGAATAATGGTAGTGGCACAACTAAAATACAACTTCACACTACTACAGGTAATGTAGAAATTGGTGGTATCTTAACAAATACTGGTGCTATTGATGCAAACAGCACTTTAAATGTTGCATCCACAGTACGTTTTGAAGACACAGATGAACCAACTGTTGCACAGAATGGTGGAACTGGTATTTATGAAATTCAATCAAATGATTATGGTGCATTTAGATTTGATGGTGGTGGATATGTTGAAGGTGATACAGTATTCAATAGTGATGTTTTTATTAACGGTGTTCTAAACCAAAGAGACAGTGCTACAGAATCATTCGGTAATAGAAACTATCTAAACATCAGATATAAATTACGTTCTGGTTCAAGTGCAGCGTATACTCCTTCATATGCATCTGATAATACTTCTAACTTAAGAATCTTTGGTGGTGCAGGTATTCAAACTGACCTCCATATTGGTGATGATCTTTATATTGGTAAATTAAACTCTGGTGACAGTGTTTCATTCCAAGTATTAGGAGAGTCAGGTAATACAACTACTCAAGGAACATTAACAGTAGAAGGTCAAACAAATATTAATGACTCTCTAATTGTTAATGCTTCTAACGAAAACTTTAAGATTCAAAATGGATCTGCTGCAGATAAATTTACAGTTGATACTGATAATGGTAATACATTAATTGAAGGAACACTTAATGTAAACGGTGTAACTGATATTGACGCAGACTTCGCAGTTAGAAACGGAACGACTGATAAGTTCTTTGTCGCATCTGCCTCAGGTAATACTCAAATTAAAGGCAATCTGACTGCTGATGGTCATACTGAATTAAATTCAACACTTAATGTTGATAGTAATACAACACTTGGTGCACAACTTACAGTAACTGGTAACTCAGAGTTCAACGGAACTGTAGATGTTGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGAACTACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCTACAGGTAACATAGCAACTGATGGAACTCTAGTTGTTGCAGGTCAAACAACTATTAATGATTCTCTAATTGTTCAAAGTGATAACGAAGTAGTTAATATAAACAATGGTTCTGGCACAACTAAGTTCAGCATTGATACTGATAACGGTAATACAAATATTATCGGAACATTAACAGTTGCTGATGCTACTCAAATTAATAATACTCTTGGTGTTTCTAACGTTGTAACCTTAACAAGAAACACTCAGCAAACTCTGACTGGATCTTATTCTGCTGATGGTGCATTCAAACTAACTGGTGGTGCAGGTATCGGTAAAAACCTTGCTGTTGGTGAAGGTCTAAGAGTATATGGAGGCACTGAACTTACTGGTGCTCTTGATCTTAATAATAGTGCTGATATATCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATGATGTTACTATCACTGCAGATAATAAGATGTTCAAGGTGCAGAATGCTTCTGCAGCGAACAAGTTTACAGTCGATACCGATAATGGTAACACTGATATTCAAGGAACATTGGATGTTGCAGGTGATGTAACTGCATCATCTGACCTTACAGTCACAGGAAATCTTACAGTCAATGGAACAACAACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACAATCGATGACCCTGTTATTACTGTTGGTGGTGATACAGCACCCGCGTCTAATGATGGAAAGGATCGTGGTATTGAATTTCGTTATTATGATGGTTCTGCTAAAATCGGTTTCTTCGGTTTTGATAGATCATCCTCCCAATTCCAATTCTTAACAAGTGCAACAAATACTTCTGAAGTTCTCTCAGGAACAGATGGTGCTCTAAGAGCAGGTAGTTTAAATCTTACTGGTGCGGGCACATCTCTTGATGTTGATGCTAATGCAAACATTGATGGCACACTGACTGTAGATGGTCAGATTATTTCACAAGTATCTTCAGGTCCTGCTCTTGTTATCCCAACAACAGATAAGATTAATAATCTTAACGCAGACTTACTAGATGGTGCTACAACCGCAACTGCTGCAACTGCATCCACAGTTGTTCTTCGTGATTCATCTGGTGATTTTGCTGCCAATCAAATCACTGCTGCTAGTGCTGCAGGATCTGGTGCAGGTTTCTTAGGAAACGCATCCACTGCTGACGCATGGAAGACTGCTAGAACACTCACCATTAGCGGTGTTGTATCTGGTTTTGTAGTCATCGATGGAAGTGAAAATGAAACACTTACAACAACTTATGTTGATGCAGACATCACTGCTCTAGCAGCGATGAGTGGAACTGGTTATGTCGTACGAACTGCTGCTAACACTTATGCCCAAAGAACTCTCCAAGTCACCGCATCGTCTGGAATCACTCTTACTAACGCTGATGGCGTTTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTAGTGCATCTTCTAATTCTGCAAACAACCTCGTCCTAAGAGACGGATCTGGTAACTTTGCTGCAGGAACTATTACTGCTGCCTTAACTGGTAATGTCACAGGTAATGTAACTGGTAATGTAACTGGTCAGGTATCTGATATCTCAAACCATGATACTGGTGATCTTACTGAGGGATCTAACCTCTACTACACTAATGAAAGAGTTGACGATAGAGTCAATGCTCTTATTACTGCAGGAACTGGTATTACTAAGGTTTACGATGACGCTGCAAATACATATACACTGACTGTAACTCAGTCAGATATCAATACTGATAATGTAACAGAGGGATCAACAAATCTATTCACAACTGCTGCTAGAACTAGAACTCATTTCACATATGGAACTGGTATCACACATAGTTCTGGAACTTTATCAGTTACTCAGTCTGATATTAATACTGACAACGTAACTGAAGG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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f5968b7e8b0d3d735100b970ae87af9c54d62c5eae12955118af188025a3b6be
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4832
Evidence 0,4832
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage 9303-10a Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank