Protein
- Genbank accession
- QYW06111.1 [GenBank]
- Protein name
- tail protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MSFNIKPTRMLGQAVKEPPPEYLVSLYKTAGSTITYGSESNSHFIDVISLGPTGGIIDAYLDETPISSGEFPKSTIFFHDGSGAEKPWVGDFPFVERTISLGKNAEITEVGETNYSVTTFQRKVSSVGVEGIRVNFTSAGITHKDDKGREKTARSKFKVEAIDPNGIVIAVSDGQYKEFASKNPVAVQVYLQAPEGFKNTIWEYRVTMEVMGFNYSTSLSGNWSASTVTELYMDTQTYDNISYSSGTIVASDVSGKIPKRQYLLAGYKVLVPEYQDIGGTQVLTGTFTRAVSDSPAWNAMAVITDTLWGAGQPLDKVDIVSFDEFSKYCKQLVGGDQRYSFSQYLIKSDNYYKLASEMVGSADGRLYEDNSGRIGVLIDKQTSNRRVVTSYDIVDEMVKRTTVAEEKKINYVEAEFEDRDNQYKKTIIKIEDENAITKNGVISKNLKLDTCTKLSEAQRTIKKMLVTSQVATSSYVLKVGHTHEDVQIGEVLEVYDRKFANVNYCGKIAAGSTLNVIQIDARTPINLTGIKQPLFTIDTNRGVPIKIAINSWASNSITLATNLPSIPAEFTSFGVDDADATGIKPTLIRVLGVDDSSGVLSLEGVEYNDSLYSHVENGTPLVVHKYKYIPAQTTVEITGLQLVRTLTGITASWDSSGAGYGYGYNWKFTPVGGTTIYIGSGVTDNLQVSLLKPLGEGTYEIQVLATLNGESVGEYAIDTLYVGVDTGSTLPAPTGLASLLPDGTFSTDFVGRSFTIRWDQVEEVAGVTVSHFKLRVIQGATTYEVIVDKSSRQYRFSEEVLTSQFGSYTRYFTIQLVTVDSELKTAELRQIAIANPVPPLPVVTVNNTGSLTLSYGATLPTDLTGTLLRIWEGTSQFEPIPVDAVSLLSSETLEISLPDDVVKQDGTSYVFDAVWVDSFGSDGTNHGRVVFAFDPNAQIPVSPELYEAVPIDSQTVMVKYTHSGLYLKRIQVSYRRYGTTTWTTLAEVFTVPPVDSDSGYDIITGEGYVKVSGLVRNINYEFKLNVANTVGLYSEDSNYITGTPFLDVLKPSDIPNLDDIILGAELTDPRMLIVEGVSDVFGEGKNSAEIITVKKVVADEKQAQATAITRIEAKVGENTATILETQDALATETLARVVAISELTVKVGANTAGIVNAQQAIVDETNARVSSIQQLTVQVGEDIALVDQSAKAAIGYCSIGGSFSSHETKDLCQAAGGTWTNSTLATSVRTVQVSSGGSTATVGDFYSAYVDLEGNVVGKAVLGVDINGAFTGMEVVGGSTYSQLIFKGNTIKFQSTAGVDQLVYENTTNTWSFKGTIYAENIEGDVTDVDVMLTTGYTWGVGVSSTVNILKFKVNALPFFRKVRVDPIVIQPLSSATNIMSAELRYSATGVGDPLTWPVIDIVLFNQGGSRPTSQPLYGDTYLGVDGYFAVSLHRTQTSGSDSAQHDAQDLAISVFKSGSTLTQL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1465 AA molecular weight: 158699,24430 Da isoelectric point: 4,77160 aromaticity: 0,09010 hydropathy: -0,09017
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Shewanella phage vB_SspS_KASIA [NCBI] |
2866686 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QYW06111.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ568826
[NCBI]
CDS location
range 29265 -> 33662
strand -
strand -
CDS
ATGTCATTTAATATAAAACCCACTAGAATGCTAGGTCAAGCAGTAAAAGAGCCGCCACCAGAATACTTAGTCTCTCTATATAAGACAGCAGGGTCAACCATTACGTATGGAAGTGAAAGTAACTCACATTTTATAGATGTAATATCATTAGGGCCAACAGGTGGGATTATAGATGCGTACCTAGATGAAACACCCATAAGCTCTGGTGAGTTCCCTAAGTCAACTATATTCTTTCATGATGGGTCTGGAGCAGAAAAGCCTTGGGTTGGTGATTTCCCTTTCGTAGAGAGGACAATATCACTAGGTAAGAATGCAGAAATAACTGAAGTAGGTGAAACTAATTATTCAGTAACAACATTCCAGAGAAAGGTATCTAGTGTAGGTGTTGAGGGCATTCGTGTGAATTTCACCTCAGCAGGGATTACCCATAAGGATGATAAGGGAAGAGAAAAAACCGCTAGGTCTAAATTCAAAGTTGAAGCCATAGATCCTAATGGTATAGTCATAGCAGTATCTGACGGTCAATATAAGGAGTTTGCTTCAAAGAACCCAGTAGCTGTGCAGGTGTACTTGCAGGCACCAGAGGGATTTAAGAATACAATCTGGGAGTACAGGGTGACTATGGAAGTGATGGGTTTTAACTATAGTACATCATTGTCAGGGAACTGGTCTGCAAGTACAGTAACTGAGCTATATATGGATACCCAGACTTATGATAACATCTCCTACTCAAGTGGCACAATAGTGGCAAGTGATGTTAGTGGTAAAATACCTAAGAGGCAATACTTACTGGCTGGCTACAAGGTATTAGTTCCAGAATACCAAGATATAGGTGGCACTCAGGTGCTCACAGGTACATTCACAAGAGCTGTGTCAGATAGTCCAGCTTGGAATGCCATGGCAGTAATCACAGATACATTGTGGGGTGCAGGTCAGCCATTAGATAAAGTTGACATTGTTTCATTTGATGAGTTCTCTAAATATTGCAAACAACTAGTAGGGGGAGATCAAAGATATTCCTTTAGTCAATACCTAATAAAATCTGATAACTATTACAAGTTAGCATCAGAAATGGTTGGGTCAGCAGATGGTCGTCTGTATGAAGATAACAGTGGTCGTATTGGTGTATTGATAGACAAGCAGACAAGTAATAGACGAGTTGTGACCTCTTACGATATAGTTGATGAGATGGTTAAAAGAACCACTGTTGCTGAAGAGAAGAAGATTAACTATGTTGAGGCTGAGTTTGAGGATCGTGATAACCAGTACAAGAAGACAATTATCAAGATTGAAGATGAAAACGCTATCACCAAGAATGGTGTCATCTCCAAGAATTTAAAGTTAGACACTTGTACTAAGCTGAGTGAGGCACAGAGAACCATCAAGAAGATGCTTGTAACCTCACAGGTGGCGACATCTTCTTATGTGCTCAAGGTAGGTCACACTCACGAAGATGTGCAGATAGGGGAAGTCCTAGAGGTCTACGACCGCAAGTTTGCTAATGTAAACTATTGTGGCAAGATAGCTGCTGGTTCAACACTGAATGTTATTCAGATAGATGCTCGTACACCAATAAACCTAACTGGTATTAAACAGCCATTATTCACCATTGATACCAACCGTGGTGTGCCAATAAAGATTGCAATTAACTCTTGGGCAAGCAACTCGATCACACTGGCAACAAACCTACCATCAATCCCAGCAGAGTTCACCTCTTTTGGTGTTGATGATGCTGATGCTACTGGAATTAAACCGACACTAATACGTGTGCTTGGTGTGGATGACTCATCAGGTGTATTGTCACTTGAAGGTGTTGAGTATAATGACTCCCTGTACAGTCATGTTGAGAATGGCACTCCGCTGGTAGTTCACAAGTACAAGTATATCCCAGCACAAACAACTGTAGAGATCACAGGTTTACAATTAGTAAGGACACTCACAGGAATTACAGCATCTTGGGACTCATCAGGTGCAGGATATGGATATGGGTACAATTGGAAATTCACTCCAGTTGGTGGTACGACAATATATATTGGAAGTGGGGTAACAGATAACCTACAAGTATCACTCCTTAAACCATTGGGTGAGGGTACATATGAGATTCAAGTATTAGCTACCTTAAATGGTGAGTCTGTTGGTGAATATGCAATTGATACACTGTATGTTGGTGTAGATACTGGTTCAACACTGCCAGCACCAACTGGGTTAGCTTCATTACTTCCAGATGGGACGTTTAGTACAGATTTTGTTGGTAGATCATTCACCATAAGATGGGATCAAGTAGAAGAAGTTGCAGGTGTAACCGTAAGCCACTTCAAACTAAGAGTCATTCAAGGTGCAACAACATATGAAGTAATTGTTGATAAATCAAGTAGGCAATATAGGTTCTCAGAAGAAGTACTAACCTCACAGTTTGGTAGTTACACCCGTTACTTCACAATACAACTAGTCACAGTGGATAGTGAGCTAAAGACTGCTGAGTTACGCCAGATAGCTATAGCCAACCCAGTGCCACCATTGCCAGTGGTCACAGTAAACAACACAGGTAGTTTAACATTATCTTATGGTGCAACACTGCCAACTGATTTGACAGGTACATTGTTAAGGATATGGGAAGGTACATCACAGTTTGAACCCATCCCCGTTGATGCAGTTTCATTGCTGTCATCAGAAACTTTAGAAATATCACTACCTGATGATGTTGTCAAGCAAGATGGTACATCATATGTATTCGATGCAGTGTGGGTTGATTCATTTGGAAGTGATGGAACAAATCACGGAAGGGTTGTATTTGCATTTGACCCTAACGCTCAGATACCTGTATCCCCAGAGTTATATGAAGCAGTTCCAATTGATAGCCAAACAGTGATGGTTAAGTACACCCACAGTGGGTTGTATTTAAAGCGCATACAAGTGAGTTACAGACGTTATGGCACAACAACGTGGACTACTCTAGCTGAAGTGTTTACAGTTCCACCAGTTGATTCTGACAGCGGTTACGACATCATCACAGGAGAAGGTTATGTAAAGGTCTCTGGACTAGTTAGAAACATTAACTACGAGTTCAAATTAAATGTAGCTAACACTGTAGGTCTTTATTCTGAGGATTCTAACTATATCACAGGAACACCTTTCCTAGATGTGTTGAAGCCATCTGATATACCAAACCTTGATGATATAATACTTGGTGCAGAGTTAACTGATCCTCGTATGCTGATAGTCGAAGGTGTATCTGATGTATTTGGTGAAGGCAAGAACAGTGCTGAAATAATCACAGTTAAAAAAGTGGTTGCTGATGAGAAACAGGCACAGGCTACTGCTATCACTAGAATTGAAGCAAAGGTTGGTGAAAATACTGCAACAATCCTTGAGACACAGGATGCACTAGCTACTGAGACATTAGCAAGGGTGGTGGCAATATCTGAGTTAACTGTTAAGGTTGGTGCCAACACTGCTGGTATTGTGAATGCACAACAGGCAATTGTTGATGAGACTAATGCAAGGGTATCCTCAATACAACAATTGACAGTTCAGGTTGGTGAAGATATTGCTTTAGTTGATCAGTCTGCTAAAGCAGCGATTGGCTACTGTTCAATAGGTGGGAGTTTCTCATCTCACGAAACTAAAGACCTTTGCCAAGCAGCGGGTGGTACATGGACTAATAGCACATTAGCCACATCAGTGAGAACAGTTCAGGTTTCATCGGGTGGAAGTACAGCAACAGTTGGGGATTTCTACTCAGCATATGTAGACCTTGAAGGTAATGTGGTTGGTAAGGCTGTCCTCGGTGTGGATATAAATGGTGCCTTTACGGGTATGGAGGTTGTAGGTGGTAGTACATATAGCCAGCTAATCTTCAAAGGTAACACCATAAAGTTTCAAAGCACTGCGGGTGTAGACCAATTGGTTTATGAGAATACAACTAACACTTGGAGTTTCAAAGGCACAATATACGCTGAGAATATAGAAGGTGATGTTACTGACGTTGATGTGATGTTGACTACTGGGTACACATGGGGTGTAGGTGTATCCTCTACAGTTAATATTCTAAAATTCAAGGTTAATGCACTTCCTTTCTTCAGAAAGGTTAGGGTTGATCCTATAGTAATCCAGCCACTGAGCAGCGCAACTAACATTATGTCAGCAGAACTAAGGTACAGTGCTACTGGGGTAGGGGATCCATTGACATGGCCTGTTATTGATATTGTACTGTTCAACCAAGGCGGAAGTAGGCCAACATCACAACCTCTCTACGGAGATACATATCTAGGTGTTGACGGGTACTTTGCAGTATCCCTCCATAGAACACAAACAAGTGGATCAGACTCAGCACAACATGATGCACAAGACCTAGCTATTAGTGTTTTTAAGAGCGGTTCTACATTAACACAACTTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
09149be63f5b240e9226961a8e2dfa85d8c9738e9ddd3ef99c88f99d383b9e11
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Identification, Characterization, and Genomic Analysis of Novel Shewanella Virulent Phage from a Gold Mine | Bujak,K., Decewicz,P. and Radlinska,M. | 2020-09-13 | — | GenBank |