Protein

Genbank accession
QEG06093.1 [GenBank]
Protein name
large distal tail fiber subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIIASGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQSNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDAATGVSYKRSGVYDLVANGLSIASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWNMPGTNAAFLSVQTQADENTAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLVTGSNNVMFYADGGITSVKQLSIYNGIYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFNGQVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYITLSTGKVSMDHDVDIGGGRFKVEVAGTTAGQRIIVNAASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVNKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDSVDITKPLKVGNAQLGTDGNITNGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATSGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIVGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAALYTRTIGAAFKDIAVNNVSGDTYDIYVSAGTYCNQLACEWSCTENATVSVIGINSSTQSPYRRR
Physico‐chemical
properties
protein length:906 AA
molecular weight: 96629,22590 Da
isoelectric point:8,90265
aromaticity:0,09382
hydropathy:-0,28510

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
508–645
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10
IPR048388
686–759
IPR048388
QEG06093.1
1 906
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage JK38
[NCBI] 		2591061 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QEG06093.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK962755 [NCBI]
CDS location
range 153352 -> 156072
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAATTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGACGATTCAGGAAATATCATTGACTTAAGCATTTCCGCTGGCGGTAATATCAGTGGTAATATCACTCAAACTGGTGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGCCCGCAGATTATAGCAAGTGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACACACTGCAAAGGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGGTATTTAGTCGCTCAGAGTAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACGAAAGCGTTTGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACTGGTGAAACAAACGGAATTAATTACCTTCGTAAATTCCGTGCAAAATCTGGTGGTACGATTTATCATGAATTAGCTTCTGCACAAACCGGAAAAAGTGATGAACTGTCTTGGTGGACCGGTAATACAGCCGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGGTCTTTAGTGTTGCGACGCTCACTCGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATTAATAATTACGGCTCAACTGGAGCAATGGGTGAATGCTATATAGTCATTGGAGATGCCGCAACTGGTGTATCATATAAAAGATCTGGTGTATATGATTTAGTTGCTAATGGTCTTTCTATCGCGTCTATTACTCCTGACAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACATGGAATATGCCTGGAACGAACGCCGCGTTTTTATCGGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACACTGCTGGAGACGGTCAAACCCATATTGGATATAACTCTGGCGGTAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGAAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCGGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATATAACGGCATATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCTGGTCAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGATGGACAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAAGTGGCTCTGAAACTACTGGGCCTGTTGTAACCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTTCAAGGTGGTTCTTCTATTACAGGCCAAGTAAAAATTGGTGGAACAGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGGGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCGCAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTACTGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGTAGATTTAAAGTAGAAGTGGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGTATTATAGTTAATGCAGCGAGCGATGCTATTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATTCAAGGACGTAAGGCTGATGTGAATAAATGGTATTTGGGTATTGGCGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAGCTACACATATTCACATGGTATTGCATTAAATTCTGATTCTGTCGATATTACTAAGCCTCTTAAAGTCGGAAACGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAATGGTTCAGGAAACTTTGCCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACCTCTGGATGGTATAAGTTTGCAACTGTAACAATGCCACAATCCACTTCAACAGTCTTCTTTAAAATAGTTGGAGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACACAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGCATTATACACAAGAACAATTGGAGCTGCATTTAAAGATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTCTGCTGGAACATATTGTAATCAATTAGCTTGTGAGTGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGTGTTATTGGTATTAACTCATCTACACAATCACCATATCGGCGGCGGTAG

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
faa815332a3cdc486ea874143d4f7c6b893fe6e3670bf6ae51393ff372f36bd9
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5468
Evidence 0,5468
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
A quest of great importance - developing a broad spectrum Shigella ssp. and Escherichia coli phage collection Kaczorowska,J., Casey,E., Neve,H., Noben,J.-P., Lugli,G.A., Ventura,M., van Sinderen,D. and Mahony,J. 2019-09-26 — GenBank