Protein

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Genbank accession
QBX31366.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,51
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MDIIIHDSKLRKVAYVDNELQDTLSFYDDKWSRYLDKASSTFEFTVYKSGIKSDSVKKRAYQTLSERSFISFEHNKRTYLFNVMKVKAKGKIITCYCENLNLELLNEEAAEFEATTEMSFVDYCNKFGLLIFGGITIGQNEIADRARTLKWTGTETKLKRLQSLANMFDAEIEFVTELNEDSSLKAFILNIYKKNDDKNQGVGKKRDDVILYHGHNFDDLEKEIDKTGIFNMITPIGKATIDVTVSKQNPKYIAPSLNQVNYSGGAISHAGHVISKDLANQILNYCVQHKLLPSGVFAQTYFESLWGSSYVARVDNNWGGLTWTGSSTRPSGVTVTQGTARPANEGGYYMHFASVSDYFKDYTYMLAEQGIYKVKGANTIADYTKGLFRYGGATYDYAIIQNNYSSQQRYEHYLTQLASVRNGINKDSNNAMDILDNQFKSAGTVGTAPISAVASKTKSALGALTAKKGQLVGSGQCYALSALHAYNLDGPWLGGGVTGQFRGRTGAGSAAAYIGEDYNWSQFGWKMVRPNKVADLIPGSIANIKANFNAGFIITGGWGHTVVIKAISGDTLTVLEQNFAGHQYVEERTYSASQYLGAIQSLCYPPEIVQGKRVDGTGSSTDTSGNIGNNEPKTISETQQKEVITTIPMDLYREWKNDKGVVEFYLKNGSIYAPLSKEMYPAVFTGEEIGDNWIKKTVQYETADIETLISGSIEEIRKRCYPAISYNLEGSAEFLDIGDTVKIDDEEFPDGLVLTARVTEQHLSFTKPEQNKTIFDNYRALENKLSSDLVNRQQELEELAKPYELRLLTDKGTQFKNSTGLSVLTAELWKSNKKFDATFLFRNFDTPLSSGFYHTVDGSTISPDAPLIITVDAFIGNELVATRQITFTNITDGQDGVGVNSTTVTYGISTSASIQPTSWTEALPAATPEQYLWTRKITDYTDPNKPDTIELTYSYQGKNGSAGTSVSVTKIEYQSGTSGTTAPSGTWITTIPSVPEGQFLWSKTTLSDGKIIYGIAKQGATGPQGPQGPKGDTGPQGPTGATGLQGPKGDQGIQGPKGADGQSSYTHIAYATNSTGTSGFSVSDNVGKTYIGMYVDQIATDSTDPTKYKWNLIKGQDGAQGIQGPKGADGKTPYWHTAYSNSADGKTDFSITDSTNKRYIGQYTDYTQSDSTDPTKYKWVDMTANVKAGNNNLLVNTKTLADNYFVANNTSETYLGGTVATGIAPSGSYRDIYRQAMKIAPESNEFIVSFYAKSSIDNVTINNHFYSPNRTIKGISSTGAVYNHATGGDGLIAIKLTTQWKRYWIKWIIRDANSDTENVPMTVILGRNFDSVNSVSIALPAMYAGNLNTEHSDAPEDTQTKIDSKADKALTQEQLNLLLETQNLMTAEMRTKATAEQVDALIASYNKYVSDEAVNKANVEAELIANAERIEAFRKDYDDKMLQLDFVSNYMRATDLGLEVSASDGSSSLLVQKDRISMFSAGKEVMYISQGFIHIDNGVFTKTLQIGNFRESQADGDPTTNLTIYVG
Physico‐chemical
properties
protein length:1527 AA
molecular weight: 167865,14270 Da
isoelectric point:5,41956
aromaticity:0,10151
hydropathy:-0,43635

Domains

Domains [InterPro]
DC_0558
ATT
1–397
DC_0558 G3DSA:3.90.1720.60 PTHR24637
IPR002901
ENZ
266–396
IPR002901 IPR007921 IPR008160
DC_1027
STR
310–1527
DC_1027
G3DSA:1.20.5.320
STR
1034–1081
G3DSA:1.20.5.320
QBX31366.1
1 1527
Architecture
ATT
STR
ATT 1-397 | STR 398-1527
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan636
[NCBI] 		2548291 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus uberis S6261
[NCBI] 		1450183 Bacillota > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Streptococcus > Streptococcus uberis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX31366.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448998.1 [NCBI]
CDS location
range 32416 -> 36999
strand +
CDS
TTGGATATTATTATTCACGATTCAAAGCTACGAAAAGTTGCTTATGTTGATAACGAGTTACAAGACACTTTATCTTTTTATGATGATAAGTGGTCTCGTTATCTAGATAAAGCTTCGTCAACATTTGAGTTCACTGTCTACAAAAGTGGTATTAAATCGGACTCTGTTAAAAAAAGGGCCTATCAGACACTGTCTGAGAGGTCTTTTATTTCGTTCGAACATAATAAACGGACATATTTATTTAATGTTATGAAGGTGAAGGCGAAGGGCAAGATAATAACTTGTTATTGTGAAAATCTAAACCTCGAATTGCTAAACGAAGAAGCAGCAGAATTTGAAGCAACTACTGAAATGTCGTTTGTCGACTACTGTAACAAGTTCGGATTATTAATTTTTGGCGGGATAACAATTGGCCAAAATGAAATTGCTGATCGTGCAAGAACATTAAAATGGACTGGCACAGAAACTAAATTGAAACGATTGCAGTCTCTAGCAAATATGTTTGATGCGGAAATTGAATTTGTAACAGAGTTAAACGAAGACTCAAGTCTGAAGGCGTTTATCTTGAATATCTACAAGAAAAACGACGATAAAAATCAGGGAGTCGGTAAAAAACGCGACGATGTCATTTTATACCATGGGCATAATTTTGATGATTTAGAAAAAGAAATTGATAAAACCGGAATCTTCAATATGATCACTCCGATCGGTAAAGCGACAATTGATGTTACTGTTAGCAAGCAGAATCCGAAGTATATTGCTCCTAGTCTAAATCAAGTGAATTATAGTGGAGGCGCAATCTCCCATGCCGGACATGTCATTAGTAAAGATTTAGCTAATCAAATTTTAAATTACTGTGTTCAACACAAACTTTTACCCTCTGGTGTTTTTGCTCAAACATATTTTGAAAGTCTTTGGGGAAGTTCGTATGTTGCGAGAGTAGACAACAACTGGGGTGGCTTGACGTGGACCGGTTCGAGCACACGACCTTCCGGTGTGACAGTAACACAAGGTACTGCACGCCCGGCAAACGAGGGCGGTTATTATATGCACTTCGCAAGTGTGTCAGATTACTTTAAAGACTATACTTATATGCTCGCTGAGCAAGGCATATATAAAGTAAAAGGCGCAAATACAATAGCTGATTATACAAAAGGTTTGTTTAGATATGGCGGTGCGACTTATGACTATGCCATAATTCAAAATAATTATAGCAGTCAGCAAAGATATGAACACTATCTTACACAATTAGCGAGTGTAAGAAATGGTATTAATAAAGATTCCAACAACGCAATGGACATCTTAGATAATCAGTTTAAATCAGCAGGTACCGTTGGAACTGCTCCAATTAGCGCAGTTGCAAGTAAAACTAAATCCGCATTAGGTGCCTTAACTGCAAAAAAAGGACAATTGGTTGGCTCTGGTCAATGTTACGCATTGTCCGCATTACACGCTTATAATCTTGACGGCCCGTGGCTTGGTGGTGGGGTTACAGGTCAGTTTAGAGGTAGAACTGGAGCTGGCTCTGCAGCTGCATATATTGGAGAAGATTATAATTGGTCGCAATTTGGTTGGAAGATGGTTAGGCCTAATAAAGTTGCTGATCTAATTCCTGGATCAATCGCAAATATCAAGGCTAATTTTAATGCAGGGTTTATCATCACTGGCGGTTGGGGTCACACAGTTGTTATCAAAGCAATTTCAGGCGATACTCTAACAGTCTTAGAGCAAAACTTCGCAGGCCATCAATATGTCGAAGAGAGGACCTACAGTGCTAGTCAGTACTTAGGTGCTATTCAATCATTGTGTTATCCTCCCGAAATAGTCCAAGGAAAGCGCGTAGATGGAACAGGAAGTTCAACGGATACATCCGGAAATATAGGCAACAACGAGCCTAAAACCATATCCGAGACGCAACAAAAAGAAGTCATTACTACAATTCCGATGGATTTATACAGAGAGTGGAAAAATGACAAAGGCGTTGTTGAATTTTACCTTAAAAATGGTTCTATATATGCCCCGCTTTCGAAAGAAATGTACCCTGCGGTTTTCACCGGAGAAGAAATAGGTGATAACTGGATTAAAAAAACTGTTCAGTACGAGACAGCTGATATTGAAACCCTTATCTCTGGATCTATTGAGGAAATTAGGAAACGTTGTTATCCAGCAATTTCTTACAACTTAGAAGGTAGTGCAGAGTTCTTAGATATCGGTGATACTGTAAAAATCGATGATGAAGAGTTTCCAGATGGATTGGTTTTAACAGCGAGGGTTACAGAACAGCATTTAAGCTTCACTAAGCCTGAGCAAAATAAAACAATATTTGATAATTACAGAGCATTAGAAAATAAATTAAGTTCTGATTTAGTTAACCGACAACAAGAGTTGGAGGAATTAGCTAAGCCGTACGAGCTAAGGTTGCTAACTGATAAAGGAACTCAATTTAAAAATTCAACAGGGCTGTCAGTTCTAACAGCAGAACTGTGGAAATCTAACAAGAAATTCGATGCGACTTTCTTGTTTAGAAATTTCGATACTCCACTTTCAAGCGGTTTTTACCATACAGTTGACGGTTCGACAATTAGTCCAGATGCACCTCTAATAATCACGGTTGATGCCTTTATTGGTAATGAATTAGTAGCAACACGACAAATCACGTTCACAAACATTACTGACGGACAGGATGGTGTCGGAGTTAACTCAACAACAGTAACTTACGGTATTTCTACGTCGGCATCAATTCAGCCCACATCTTGGACAGAAGCCTTGCCTGCAGCGACACCAGAACAGTATCTTTGGACACGTAAAATCACAGATTACACTGATCCAAACAAGCCAGACACTATTGAATTGACTTACAGTTACCAAGGGAAAAATGGCAGTGCTGGAACTTCAGTCTCTGTAACTAAGATTGAATATCAATCTGGTACATCGGGTACTACAGCGCCCTCAGGAACATGGATAACAACTATCCCTAGTGTTCCTGAAGGACAGTTCTTGTGGTCTAAAACAACATTGTCAGATGGAAAAATCATCTATGGTATAGCTAAACAAGGTGCTACTGGACCTCAAGGACCGCAGGGACCAAAAGGCGACACAGGACCTCAGGGTCCGACTGGGGCAACTGGTTTGCAAGGTCCAAAGGGTGACCAGGGTATACAAGGACCAAAAGGCGCAGATGGACAGTCAAGCTATACTCATATTGCTTACGCCACCAATTCCACTGGAACTAGTGGTTTTTCTGTGTCTGACAACGTCGGCAAAACCTATATTGGTATGTATGTCGACCAAATAGCAACTGACTCAACCGACCCTACCAAGTACAAGTGGAACTTGATTAAAGGTCAAGACGGTGCGCAGGGGATTCAGGGTCCTAAAGGGGCAGACGGCAAAACGCCTTACTGGCATACAGCCTATTCTAATTCTGCTGATGGCAAGACTGATTTTAGCATCACTGACAGCACTAATAAGCGGTATATTGGACAGTATACAGATTACACGCAATCCGACAGCACCGATCCAACTAAGTATAAATGGGTTGATATGACAGCTAATGTTAAGGCTGGAAACAACAATTTGTTGGTTAACACAAAAACGTTGGCCGACAACTATTTTGTAGCTAACAACACATCCGAAACTTATTTAGGTGGTACAGTTGCGACAGGAATTGCACCGAGTGGCTCATATAGAGACATTTACAGGCAAGCTATGAAAATAGCGCCAGAAAGCAATGAATTCATAGTTTCGTTTTACGCTAAAAGTTCAATTGATAATGTCACAATCAACAATCATTTTTATAGTCCGAACCGAACAATTAAAGGTATTTCTAGTACAGGTGCAGTCTACAATCACGCAACGGGCGGAGATGGGCTGATTGCCATCAAATTAACGACTCAGTGGAAACGATACTGGATAAAATGGATAATTCGTGATGCTAATTCTGATACCGAAAATGTGCCAATGACTGTAATTTTAGGCCGTAATTTTGACTCAGTTAACAGCGTGTCTATCGCATTACCAGCAATGTACGCTGGCAATCTAAACACAGAGCACTCAGATGCACCAGAGGACACACAGACTAAGATTGACTCAAAAGCAGACAAAGCCTTGACGCAAGAGCAATTGAACCTCTTGCTTGAAACTCAAAACTTAATGACTGCTGAAATGCGAACGAAAGCAACTGCAGAACAAGTAGATGCTTTAATCGCAAGCTACAACAAATATGTTTCTGACGAAGCAGTAAATAAAGCTAATGTTGAAGCAGAGTTAATCGCTAATGCTGAACGTATTGAAGCATTTAGGAAAGATTACGATGATAAGATGCTTCAATTGGACTTTGTTTCTAACTATATGAGAGCCACTGATTTAGGTCTTGAAGTATCAGCAAGCGATGGTTCGTCAAGTTTGTTAGTTCAAAAGGACAGAATATCAATGTTCAGTGCTGGTAAAGAAGTTATGTACATCAGCCAAGGATTTATTCATATTGATAACGGGGTATTTACTAAGACACTTCAAATTGGTAATTTCCGTGAGTCGCAAGCTGACGGAGACCCAACAACAAATCTTACAATTTATGTTGGTTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8838b9e3f1f3479cb528b38362d7a83632c24f84014c2f124ce0d3c5e5cea5b8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8092
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. 2018-12-20 — GenBank