Protein

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Genbank accession
UOL50632.1 [GenBank]
Protein name
putative long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,77
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGXXXXVNVXXAXXXXXXBGXNXXXLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMIFTLPNAPVDGDTIVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATSYQAQANDFIVLRFTSAAPINITLPRNANNGDILSLVDLDKLNPLYHTIIKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIXEGDQKSRLRIIRTDSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILTGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATESRRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTASATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTVSPKALXXYKATXAXXGXVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFBSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQXEPXWXATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQSQRLRVXGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPINVNASATLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDGGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLSINNQSGQITIGEGLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 136272,99120 Da
isoelectric point:5,47100
aromaticity:0,07211
hydropathy:-0,31933

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
13–140
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
982–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1000–1276
DC_1209
UOL50632.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 13-140 | STR 343-981 | ATT 982-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1276 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_SCS57
[NCBI] 		2930396 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UOL50632.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM960734 [NCBI]
CDS location
range 31300 -> 35175
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGSSGRMRRGAKTGTTAACGTMRMATYAGCCGANNNTAMMRTMRGYRYTRATGGCGWAAACRTTRMSTTSCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGGGCCGGCAATGATATGATTTTCACATTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGACACTATTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGTCCGCGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCCGCGACATCATATCAAGCGCAAGCAAATGATTTTATTGTTCTTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATACTCAGCCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACGATTATTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGCGAAGTCGGGACTCATATYGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATKGGAAGGCGACCAGAAATCACGTCTTCGTATTATCCGTACAGATTCAAATATTCGCCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGYACAAATAACGCTACAACCGGAACTATTAATCTTACGCTTCCTACAGGAATTTTGACCGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGATTCTGACACCCATTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACAGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAATCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTGCTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTGTTTCTCCTAAAGCCCTTKACCMATATAAAGCMACGWATGCTCAMMAAGGTKCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCACAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAGAGCGACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGAYGATACTCGTATCTCRACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTRATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCWCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTYCARWMMGAACCAWCATGGRCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCYGGTTCTATTACATTYGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATWTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCATAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGAAACAAACTAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGGTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACAGCTACTCGTCTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAGACTGGAACTAACCCAGCACAGTCGCAGCGTTTGCGGGTTTKGGGAAATGAATTTGGTGGTGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGCGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAATGTTAACGCTTCAGCCACGTTAAATGCGAATGGTGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGCAATGATGGAGGCAGCACATATTTTATGCTTACTGCATCAGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTATCAATTAATAACCAATCCGGTCAGATTACAATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGATGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACGTCTGATTTATATACCCGTGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7c3f319aed762113e50ba2e81aed536efff31c195411b231ed69a0fa5210c352
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,9192
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome analysis of Escherichia phage SCS57 Alexyuk,M., Bogoyavlenskiy,A., Alexyuk,P. and Berezin,V. 2022-11-17 — GenBank