Protein

Genbank accession
AGH56301.1 [GenBank]
Protein name
fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESVTNTANTLVQRDADGNFSASTVTATLIGNASTAARLASTRQIQLSGDVQATGVFDGSTNLNLNTTVSLVSTLPHYDGTGDSSGTYRSVTVDAKGRVTNATNPTTLAGYGLDGNVEGSSAQPYDLDLQALANLTSTGIIARTSGGAMATRTVLGSATRIAITNGNGVAGNPVIDLITTAVTAAEYNTESLTSAAGSETVNATKFTVDAYGRLTDSNTVPIATATEGSKYASYNAGTTYARYDIIANASKVYQAYQAITAGSGAPTHTSGDNGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPNIDLDGAVDQVINKDGSGHFTISHTQNVATPRNLNILATNTGSGTSNIVIRAEDTVTINATEATGKVHVEDLRIQDNFLASTGQLNLDPGDDRAATGLVRIYGDLQIDGTTTTVNSTELTVDDVTILLGGDTAPTSDDNLDRGVQFRYYDSQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNNSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNMVLQGASKTLQLNNGSGTTKVEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTTVAGTLGVTGDTTLTGALDANSTLNVAGDVYLESTNDITVAKNSGTGVWEIQSNDYGALRLDGGFYTAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRNSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASSSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEIFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSDVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDVGGDVTAESNLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPSTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFVTDATNSSEVLAGTDGALRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIVSQVTSGAALVIPTTTKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVARDSSGDFSANQITAASGVGAAAGFLGNASSADILKTARVITIDGVVNGNVSFDGSQAVTITTTYDDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFAVTASSGITLTNPDGISGNTTINVASASTNAANNLVLRDASGGFSAEDVNVATLDATGNSTIGGTLGVTGVVTLSGQLNANSGILVDTNKFTVDGQNGSVSTQGTLNADGATTLGSTLTVTGATEFNSTVDVDGNFAVRTNLGVDKFTVLGASGNTSISGTLGVTGATTLSDTLAVTGTSAFTGAITASGGVIGNVTGTVSSIANHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALFVASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGELSVTQVDIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNSSLAAKTTDDVTEGSANLYYTDARADARIAAADTDALSEGSANLYYTDARAEASFDTKIAAASTDDLSEGSTNVYYTDARAEASFDTKIAAASTTNLSEGNNLYYTEARVQTKLDDAFAQLQAMLNNLATTTTLTLALSGDPTPGAVVTTAVDNGGGGGFTAGTAVATSGGTGSGLTVDTTVVGGVITAAAVNAGGSDYLISDTVTITNPNAGKVLSFNLATLTGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITAVAGAITNVTINDGGTGYAADETITIVQPTGADGSNPATGGTVDIATVATNATLSMTDITTMEVGAIVTGATSGTVGTITALGTNQITVDNVDGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2162 AA
molecular weight: 220618,45260 Da
isoelectric point:4,16837
aromaticity:0,05920
hydropathy:-0,11994

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AGH56301.1
1 2162
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage Syn2
[NCBI] 		536473 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH56301.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634190 [NCBI]
CDS location
range 23063 -> 29551
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCCTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGCTTTAAGATCGGTGATGGTGTTTCCGCATGGAACACGTTGAGGTATGAAAGACCTGTTGAATCCGTCACCAATACGGCGAATACGCTCGTACAGAGAGATGCTGATGGTAATTTTAGTGCTAGCACAGTCACTGCAACATTAATCGGTAATGCTTCAACCGCCGCTCGTCTTGCTTCGACTCGTCAGATTCAACTTTCAGGTGACGTTCAGGCAACAGGTGTCTTTGATGGTTCTACCAACCTGAACCTGAATACAACAGTTAGTCTTGTTTCAACCTTACCTCATTATGACGGCACAGGAGATTCATCAGGAACTTATCGTTCAGTAACTGTTGATGCAAAAGGTCGTGTTACTAATGCGACTAATCCTACAACTCTTGCTGGATACGGATTGGATGGTAATGTTGAGGGTTCTTCAGCACAACCATATGACCTTGACCTTCAAGCATTAGCAAACCTTACTTCTACTGGTATTATTGCCAGAACTTCTGGTGGTGCAATGGCAACCAGAACTGTTCTGGGTTCTGCTACCAGAATTGCTATTACTAATGGTAACGGTGTTGCAGGCAACCCTGTTATCGACTTAATTACAACTGCTGTAACTGCAGCAGAATATAACACCGAATCACTCACGTCTGCTGCTGGTAGTGAGACTGTAAACGCTACAAAATTTACAGTTGATGCATATGGTAGATTAACAGACTCTAATACTGTGCCTATCGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTACGCTAGCTATAATGCAGGCACGACATATGCTCGCTATGACATCATTGCTAATGCATCGAAGGTTTACCAGGCATATCAAGCAATTACTGCTGGTTCTGGTGCTCCTACTCATACCAGCGGCGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATCGCCGCACTAGGCGTAGATAATACACAATTACAAAATAATAGAGTCTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGACTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTTAAAGTTAACGATACGAGCGGTAATCTTTTGTTTGGGGCTAACAATACAGGGGATTCTGGCGCTGGCGAGATTGATGTCAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCCAATATCGATCTGGATGGCGCTGTCGATCAGGTCATTAATAAGGATGGATCTGGTCATTTCACCATAAGTCATACTCAGAATGTTGCAACACCTAGAAATCTCAACATTCTTGCAACAAACACTGGATCAGGAACTTCTAATATCGTAATTCGTGCAGAAGATACTGTTACAATTAACGCAACTGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATCTTAGAATTCAAGACAACTTCCTTGCTTCTACTGGTCAATTAAATCTTGACCCTGGTGATGACCGTGCTGCTACTGGTCTGGTTCGTATCTACGGTGACCTTCAGATTGATGGCACAACTACCACAGTTAATTCAACTGAACTGACAGTTGATGATGTTACTATCCTTCTCGGTGGTGACACTGCTCCTACATCTGATGACAACCTTGACCGTGGTGTTCAGTTCCGCTATTACGATAGTCAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATAATTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACAACTAATACAAACTCTACTTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAAGACGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACATTCCGTGCTAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTTCTGCAGGGTGCATCTAAGACTCTGCAACTGAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGGTTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATCCTCGATGTAACTGGTAATTTCAACGTTAATACGAATAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAATACAACCGTTGCTGGTACTCTTGGAGTTACTGGTGATACAACACTGACTGGTGCTCTGGATGCAAACAGCACTTTAAATGTTGCTGGTGATGTTTATCTTGAAAGCACTAATGACATCACAGTTGCTAAGAACTCTGGCACTGGTGTTTGGGAAATTCAGTCTAACGACTATGGTGCTCTTAGACTTGACGGTGGTTTCTACACCGCTGGCGATGCTCTGATTGATGGAACACTACACGTCAACGGTGCTATTGAAGTTAAAGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACTACAACCATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACGTTGGTGGCACGGGTTCTGGCGAAGGTCTGTTCGTTGGTAAGAGAAACTCTGGCGATACTGTTAAGTTCTCTGTCTTGGGTGCATCTGGTAACACAGATATTCAAGGCACACTCGATGTTGCTGGCAACTCTGAGTTCAACGGCACTGTCGATGTTGATGCAGATTTCGCTGTTAGAAACGGTACAACCGACAAGTTCTTCGTTGATAACGTAACTGGTAACACCGATATCCAAGGCACTTTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAACACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTTCTGGTCCAAGGCAACTCCGAGTTTAACGGCACAGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCCGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTTCCTCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAATCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAACGGTAATACAAACATCATCGGCACACTAACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTGGGTGTCTCTGATGTTGTAACCTTCACAAGAAACACTCAGCAAACCCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAACCTTGCTGTTGGCGAAGGTTTGAGAGTTTATGGTGGCACAGAACTAACTGGTGCTCTTGATCTCAATAACTCTGCAGATATCTCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATAATGTTACTATCACTGCAGATAACAAAACATTTGCTATTCAAAATGCATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGCAATACAGATATTCGTGGAACCCTGGATGTTGGTGGTGATGTAACTGCCGAATCTAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTGTTAATGGCACAACCACTACTGTCAATAGCACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCCTCGACTAACGATGGTAAGGATCGCGGTGTTGAATTCCGTTATTATGACGGCTCTGCTAAAATTGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAATTCGCGTTCGTAACTGATGCAACTAACTCCTCTGAAGTTCTTGCTGGTACAGATGGCGCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGGTCTGGAACATCTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACCCTGACTGTTGATGGACAGATTGTTTCTCAAGTTACATCTGGTGCAGCACTGGTCATTCCTACCACCACCAAAATTAATAATTTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCTGCGACACCGACTACTGTCGTTGCTCGTGATTCTAGCGGTGACTTCTCTGCTAATCAAATCACTGCTGCTAGTGGTGTAGGTGCTGCTGCAGGTTTCTTAGGTAATGCTTCGAGTGCAGATATCCTTAAGACTGCAAGAGTTATCACCATTGATGGTGTTGTCAACGGCAATGTTTCCTTTGATGGATCTCAAGCAGTAACCATTACTACCACATATGATGATGCTGACATTACTGCTTTGGCAGCACAGTCTGGCACTGGTTATATGGTCAGAACTGCTGCTAACACCTATGCACACCGCACGTTTGCTGTTACAGCATCTTCTGGTATTACTCTGACCAATCCTGATGGCATCTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTTCTGCATCCACTAACGCAGCAAACAACCTGGTTCTGCGTGATGCCAGCGGCGGTTTCTCCGCAGAAGACGTAAATGTTGCAACACTGGATGCTACAGGAAACTCCACCATCGGTGGAACACTTGGTGTAACGGGTGTAGTTACCCTTTCGGGTCAGTTGAACGCTAACAGTGGTATTTTAGTTGATACTAATAAATTCACTGTTGATGGACAGAACGGTTCTGTTTCTACTCAAGGCACACTGAATGCCGATGGTGCTACAACTCTTGGTAGCACACTGACAGTTACTGGTGCAACCGAATTTAATAGTACGGTTGATGTAGATGGTAACTTTGCAGTTAGAACTAATCTTGGTGTAGATAAATTTACCGTTCTGGGTGCATCGGGTAACACTAGTATTTCTGGTACTCTTGGAGTCACAGGTGCTACAACCTTGTCTGACACCCTGGCAGTAACTGGAACATCTGCATTCACTGGTGCAATCACCGCAAGTGGCGGCGTTATCGGTAA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage Syn2 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank